chr11:106649724 106650062 -
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(45)
TESTES

Sense strand
AAGGGCGTCGGGGCGAGGCATTCTAGTGGTGTCACCCAGTCGTGAAGCGAGTAATAAACGGGCGCCGGGGAGGGAGCGCCCGCCCGCGGAGGGGGAGGGGCGAGAACATGGCGGATTCCGGAACCCGGGCGGGCGGGCGTTGAGGGCCTCCGAGCCAGGGGGGCGGGGTGATTAGGTCATAGAGCGGCTCCCAGCGTGCTTTGCGGCGAGGAGGCGGTCCAGACTATAAAAGCGGCTGCCGGGACGCAGCCGGCACCTCATTCATTTCCATCGGTCCTTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACCGGCCCCTCCGCTGGTGACGCCCCCGCAGAG
......................................................................................................................(((...))).(((((((((..((((((.(((((......)))))..((((((....((((...((.((.((((..((.(((...)))))..)))).)).))..)))).......(((((((......))))))).))))))........)).))))..)))))))..))....................................................
......................................................................................................................119.......................................................................................................................................................................289................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACAC.................................. 27 1 52.00 52.00 26.00 16.00 3.00 - - - - - - 4.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................ATCGGTCCTTGCCCTCGC.................................................... 18 1 29.00 29.00 - - - 14.00 - - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - 3.00 3.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACAC.................................. 28 1 27.00 27.00 11.00 9.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACC................................. 28 1 20.00 20.00 9.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACA................................... 27 1 11.00 11.00 5.00 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACC.............................. 26 1 10.00 10.00 - 2.00 4.00 - 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGAC.................................... 26 1 9.00 9.00 - 1.00 4.00 - 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACCG............................. 27 1 9.00 9.00 - 3.00 - - 1.00 2.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGAC.................................... 25 1 7.00 7.00 - - 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................ATCGGTCCTTGCCCTCGCA................................................... 19 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - 4.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACA................................... 26 1 7.00 7.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATCGGTCCTTGCCCTCGCAGCTC............................................... 26 1 6.00 6.00 - - 2.00 - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGGTGACGCCCCCGCAG.. 21 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACC................................. 29 1 6.00 6.00 2.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACCGt............................ 28 t 5.00 9.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCAC............................... 30 1 4.00 4.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACt................................. 28 t 4.00 52.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAATAAACGGGCGCCGGGGAGGGA........................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCAC............................... 25 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACt................................. 29 t 3.00 27.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................ATCGGTCCTTGCCCTCGCAGCTCCGGC........................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCA................................ 29 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACa................................. 28 a 3.00 52.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACAa.................................. 28 a 2.00 11.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCCATCGGTCCTTGCCCT....................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCC......................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GGGGCGAGAACATGGCGG................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGt..................................... 28 t 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACAt.................................. 27 t 2.00 7.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCA................................ 30 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GAACATGGCGGATTCCGGAACCCGGGC................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACC.............................. 31 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATCGGTCCTTGCCCTCGCAGC................................................. 24 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGCAGCTCCGGCCCTCGACAC.................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCAC............................... 31 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCATCGGTCCTTGCCCTC...................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCC.......................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................ATCGGTCCTTGCCCTCGCAG.................................................. 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................ATCGGTCCTTGCCCTCGCcgct................................................ 22 cgct 1.00 29.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACAt.................................. 28 t 1.00 11.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTCTAGTGGTGTCACCCAGTCGTG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TTCATTTCCATCGGTCCTTGCCCTCGCA................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AGGGGGAGGGGCGAGAACATGGCGGATTC............................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCAC............................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................ATTTCCATCGGTCCTTGCC......................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACt................................... 27 t 1.00 9.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CCCGGGCGGGCGGGCGTTGAGGGC................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
............................................................................................................TGGCGGATTCCGGAACCCGGGC................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GAGGGGCGAGAACATGGCGGATTCCGt.......................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACc................................... 26 c 1.00 7.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGCAGCTCCGGCCCTCGAC.................................... 21 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCt................................ 30 t 1.00 6.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGCAGCTCCGGCCCTCG...................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGtaa................................... 29 taa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATCGGTCCTTGCCCTCGCAGCTCCGGC........................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................AGGGCCTCCGAGCCAGGGGGGCGGGG........................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGAta................................... 26 ta 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................CATTTCCATCGGTCCTTGCCCTC...................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGcca................................... 27 cca 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACccca................................ 30 ccca 1.00 9.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TAGTGGTGTCACCCAGTCGTGAAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGACACCACCGGCCCCTC...................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..............................................................................................................................................................................................................................................................ACCTCATTCATTTCCATCGGTCCT............................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACa.............................. 26 a 1.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GTGATTAGGTCATAGAGCGGCTCCCAGt................................................................................................................................................ 28 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTTGCCCTCGCAGCTC............................................... 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATCGGTCCTTGCCCTCGC.................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACCGtt........................... 29 tt 1.00 9.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCGGCCCTCGACACCACt.............................. 20 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGA..................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCAtt.............................. 26 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCACCGGCCCCTCtcg................... 18 tcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GCCCGCGGAGGGGGAGGGGCGAG........................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................TCATTTCCATCGGTCCTTGCCCTCG..................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGAaaa.................................. 27 aaa 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACt................................... 26 t 1.00 7.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATCGGTCCTTGCCCTCGCAGCT................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGAt.................................... 26 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTCTAGTGGTGTCACCCAGTCGTGAA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGAaaa.................................. 28 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TAGTGGTGTCACCCAGTCGTGAAGCGAc................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 c 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGGCCCTCGACACCACCGGCCCC........................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATCGGTCCTTGCCCTCGCAGCTCCG............................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................CCTCATTCATTTCCATCGGT................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GTGATTAGGTCATAGAGCGGCTCCCAG................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................CCATCGGTCCTTGCCCTCGC.................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................CATTTCCATCGGTCCTTGCCCTCGCA................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................ATCGGTCCTTGCCCTCGCAGCTCC.............................................. 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TTCATTTCCATCGGTCCTTGCCCTCGC.................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................ATTCATTTCCATCGGTCCTTGCC......................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCc................................ 24 c 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACAC.................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCATTCATTTCCATCGGTCCTTGCCCTC...................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................ACCTCATTCATTTCCATCGGTCCTTGC.......................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCATTCATTTCCATCGGTCCTTGCCCT....................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................GTCATAGAGCGGCTCCCAGCGTGC............................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................CATCGGTCCTTGCCCTCGCAGCTCCGGC........................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACCtt............................ 28 tt 1.00 10.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTCGCAGCTCCGGCCCTC....................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATCGGTCCTTGCCCT....................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACtt................................ 30 tt 1.00 27.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................ACCTCATTCATTTCCATCGGTCCTTGCCCT....................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCGCTGGTGACGCCCCCGCAGA. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TTCATTTCCATCGGTCCTTGCCCT....................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TAGTGGTGTCACCCAGTCGTGAAGCGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCAGCTCCGGCCCTCGACAC.................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACCG............................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACCta............................ 28 ta 1.00 10.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TTCATTTCCATCGGTCC.............................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCTCCGGCCCTCGACACCACCG............................. 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCGGTCCTTGCCCTCGCAG.................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TTCATTTCCATCGGTCCTTGCCCTC...................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACAtt................................. 28 tt 1.00 7.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................ATCGGTCCTTGCCCTCGCAGCTC............................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................ATTTCCATCGGTCCTTGCCCTC...................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCCGGCCCTCGACACCACCGGC........................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCAaaa............................. 27 aaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CACCCAGTCGTGAAGCGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCACCGGCCCCTCCGCTGG................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCccc.............................. 26 ccc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................ATCGGTCCTTGCCCTCGCAGt................................................. 21 t 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................CCATCGGTCCTTGCCCTCGCAGCT................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCGGTCCTTGCCCTCGCAGCTCCGGC........................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TCGTGAAGCGAGTAATAAACGGGCGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................ACCTCATTCATTTCCATCGGTCCTTGCCCTC...................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GGGCGTCGGGGCGAGGCt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................ATTTCCATCGGTCCTTG........................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................CGGGACGCAGCCGGCAC................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGAtt................................... 26 tt 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................ATTCATTTCCATCGGTCCTT............................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCTCGCAGCTCCGGCCCTC....................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCG...................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGAaac.................................. 28 aac 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGGCCCTCGACACCACCGGCCC......................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................AGAACATGGCGGATTCCGGAACCCGGGC................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACCa............................. 27 a 1.00 10.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................CCATCGGTCCTTGCCCTCGCAGC................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCGCAGCTCCGGCa.......................................... 19 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TAAAAGCGGCTGatca................................................................................................. 16 atca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACCG............................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCCGGCCCTCGACACCACCGGCCCCT....................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................CGCAGCCGGCACCTCATTCATTTC....................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -

Antisense strand
AAGGGCGTCGGGGCGAGGCATTCTAGTGGTGTCACCCAGTCGTGAAGCGAGTAATAAACGGGCGCCGGGGAGGGAGCGCCCGCCCGCGGAGGGGGAGGGGCGAGAACATGGCGGATTCCGGAACCCGGGCGGGCGGGCGTTGAGGGCCTCCGAGCCAGGGGGGCGGGGTGATTAGGTCATAGAGCGGCTCCCAGCGTGCTTTGCGGCGAGGAGGCGGTCCAGACTATAAAAGCGGCTGCCGGGACGCAGCCGGCACCTCATTCATTTCCATCGGTCCTTGCCCTCGCAGCTCCGGCCCTCGACACCACCGGCCCCTCCGCTGGTGACGCCCCCGCAGAG
......................................................................................................................(((...))).(((((((((..((((((.(((((......)))))..((((((....((((...((.((.((((..((.(((...)))))..)))).)).))..)))).......(((((((......))))))).))))))........)).))))..)))))))..))....................................................
......................................................................................................................119.......................................................................................................................................................................289................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
.............................................................................................................................................................................................................GCGAGGAGGCGGTCCAGACTATAAAA............................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................GCAGCCGGCACCTCATTCATTTCCA..................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CGAGGAGGCGGTCCAGACTATA............................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................CATTTCCATCGGTCCTTGCCCTCGCA................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CACCCAGTCGTGAAGCGAGTAATAA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GCGAGGCATTCTAGTGGTGTCACCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..............................CACCCAGTCGTGAAGCGAGTAATAAcc.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..GGGCGTCGGGGCGAGGCATTCTAGTGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GGAGGCGGTCCAGACTATAAAA............................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GTCACCCAGTCGTGAAGCGAGTAATA........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................AGGGAGCGCCCGCggaa................................................................................................................................................................................................................................................................ 17 ggaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TAGTGGTGTCACCCAGTCGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................GGCACCTCATTCATTTCCATCGGTC............................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................GCCGGCACCTCATTCATTTCCATCGGTC............................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................CCGGGACGCAGCCGGCACCTCATTCA........................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................TCATTTCCATCGGTCCTTGCCCT....................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................CGCAGCCGGCACCTCATTCATTTCCA..................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................GATTAGGTCATAGAGCGGCTCCCAGCGT.............................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GCGCCCGCCCGCGGAGgac........................................................................................................................................................................................................................................................ 19 gac 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................ACGCAGCCGGCACCTCATTCATTTC....................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................CAGCCGGCACCTCATTCATTTCCA..................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GTGGTGTCACCCAGTCGTGAAGCGAGTAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................CATTTCCATCGGTCCTTGCCCTCGC.................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GTGGTGTCACCCAGTCGTGAAGCGAGTAATA........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................CAGCCGGCACCTCATTCATTTCCAT.................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CATTCTAGTGGTGTCACCCAGTCGTG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................GGACGCAGCCGGCACCTCATTCATTTC....................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................GCCGGCACCTCATTCATTTCCATCGG................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CATTCATTTCCATCGGTCCT............................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GGCGTCGGGGCGAGGCATTCTA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CACCCAGTCGTGAAGCG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CGGGGCGAGGCATTCTAGTGGTGTcc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 cc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTGCCCTCGCAGCTCCG............................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -