(8)
OTHER.mut
(8)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(38)
TESTES

Sense strand
TGGAAAAGCTCCTATTCTGATTGCTACCGATGTGGCCTCCAGAGGGCTAGGTTAGTACAAACTCGAATTCATGGCTTGGTTTCCCAGAAGATCTCCATGTAGTTTTTTTTAAAGAAAGTTTATTGCTTTCTTTAACCTGCATTTTTTCTAAGTTTTTTTCACATAAAGGTGCAGTCTTTGTGGCAAGGCCTAGGCATGACAATCGGAGGACTCGAGGGGGATGGAGGACTAGTGATCGGCTGGCTGCTTC
..............................................................((((..(((((.((.(((((.((((((((.................(((((((((((.....))))))))))).((((((((((..................))))))))))))))).)))..))))).)).)))))...))))............................................
..................................................51...........................................................................................................................................................208........................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
..................................................GTTAGTACAAACTCGAATTCATGGCTTGGTTTCCCAGAAGATCTCCATGTAG.................................................................................................................................................... 52 1 90.00 90.00 90.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGGCATGACAATCGGAGGACTCGAGG................................. 27 1 21.00 21.00 - - 2.00 1.00 - 6.00 - - 10.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGACAATCGGAGGACTCGAGGGGGA............................. 25 1 18.00 18.00 - - 3.00 1.00 7.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGACAATCGGAGGACTCGAGGGGG.............................. 24 1 14.00 14.00 - - - 6.00 - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................GTTAGTACAAACTCGAATTCATGGCT.............................................................................................................................................................................. 26 1 14.00 14.00 - 6.00 - 2.00 1.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GGAGGACTAGTGATCGGC.......... 18 1 9.00 9.00 - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGGCATGACAATCGGAGGACTCGAGGG................................ 28 1 9.00 9.00 - - 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TTGTGGCAAGGCCTAGGCATGACAATC.............................................. 27 1 6.00 6.00 - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................TAGGTTAGTACAAACTCGAATTCATGGC............................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................GGCATGACAATCGGAGGACTCGAGGG................................ 26 1 5.00 5.00 - - 2.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AGGCATGACAATCGGAGGACTCGAGG................................. 26 1 5.00 5.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGACAATCGGAGGACTCGAGGGG............................... 23 1 5.00 5.00 - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................GTTAGTACAAACTCGAATTCATGGC............................................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGGCATGACAATCGGAGGACTCGAG.................................. 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCGGAGGACTCGAGGGGGATGG.......................... 22 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CAATCGGAGGACTCGAGGGGGATGG.......................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CAATCGGAGGACTCGAGGGGGATGGA......................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............TCTGATTGCTACCGATGTGGCCTC................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGGCAAGGCCTAGGCATGACAATCGG............................................ 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCGGAGGACTCGAGGGGGATGGAGGA...................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TTGTGGCAAGGCCTAGGCATGACAATtt............................................. 28 tt 2.00 0.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GGGGATGGAGGACTAGTGATCGGC.......... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TCTTTGTGGCAAGGCCTAGGCATGACAAT............................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGGAGGACTAGTGATCGGCTGGCTGC... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGTGGCAAGGCCTAGGCATGACAATC.............................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGGCAAGGCCTAGGCATGACAATCGGA........................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AATCGGAGGACTCGAGGGGG.............................. 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGACAATCGGAGGACTCGAGGGGGATG........................... 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TTTGTGGCAAGGCCTAGGCATGACAATC.............................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................GGCAAGGCCTAGGCATGACAATCGGAGGACTC..................................... 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................GGTTTCCCAGAAGATCTCCATGTAGTT.................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CCTAGGCATGACAATCGGA........................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTTAGTACAAACTCGAATTCA................................................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCGGAGGACTCGAGGGGGATGGAGGAC..................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CTGATTGCTACCGATGTGGCCTCCAG................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGACAATCGGAGGACTCGAGGGGGAT............................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................CGATGTGGCCTCCAGAGGGCTAGatg..................................................................................................................................................................................................... 26 atg 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................CGATGTGGCCTCCAGAGGGCTAG........................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........................................AGAGGGCTAGGTTAGTACAAACTCGAAT...................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AGTGATCGGCTGGCTGC... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AAGGCCTAGGCATGACAATCGG............................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGCTACCGATGTGGCCTCCAGAGGGCTAGtt...................................................................................................................................................................................................... 31 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........TCCTATTCTGATTGCTACCGATGTGGCC..................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CAGAGGGCTAGGTTAGTACAA.............................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..................................................GTTAGTACAAACTCGAATTCATGGCTT............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGACAATCGGAGGACTCGAGG................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................GAGGACTAGTGATCGGCTGGCT..... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GGGGATGGAGGACTAGTGATCG............ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AATCGGAGGACTCGAGGGGGATGGAGGACTAGT................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGGCATGACAATCGGAGGA........................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GTACAAACTCGAATTCATGGC............................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGGCAAGGCCTAGGCATGACAATCGGt........................................... 27 t 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GTTTTTTTCACATAAAGGTGCAGTCT......................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GGGGATGGAGGACTAGTGATCGGCTGGCTGC... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................GGACTAGTGATCGGCTG........ 17 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CAATCGGAGGACTCGAGGGGGATGGAGGA...................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................ACATAAAGGTGCAGTCTTTGTGGCA................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TACCGATGTGGCCTCCAGAG.............................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..............................................................................................................................................................................................................AGGACTCGAGGGGGATGGAGGACTA................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AGAGGGCTAGGTTAGTACAAACTCGA........................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGAAGATCTCCATGTAGTTTTTTTT............................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGTGGCAAGGCCTAGGCATGACAAT............................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
......................................................................................................................................................................................................................AGGGGGATGGAGGACTAGTGATCGGC.......... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CAATCGGAGGACTCGAGGGGGATGGAGt....................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................CTAGGCATGACAATCGGAGGACTCGAG.................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GGGATGGAGGACTAGTGATCGGCTGGCTGCT.. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGCTACCGATGTGGCCTCCAGAGGGCTAt........................................................................................................................................................................................................ 30 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CCTCCAGAGGGCTAGata..................................................................................................................................................................................................... 18 ata 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGACAATCGGAGGACTCGAGGGGGATt........................... 27 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................AGGACTAGTGATCGGCTG........ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TCTTTGTGGCAAGGCCTAGGCATGACAATC.............................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGGAGGACTAGTGATCGGCTGGCTG.... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGGCATGACAATCGGAGGACTCGAGGGG............................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GAAGATCTCCATGTAGTTTTTTTTAAAGAA...................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................ACTAGTGATCGGgtgg....... 16 gtgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CGGAGGACTCGAGGGGGATGGAGGA...................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................ATTGCTACCGATGTGGCCTCCAGAGG............................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................TGATTGCTACCGATGTGGCCTCCAGA............................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................AGGACTAGTGATCGGCTGGC...... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATGGAGGACTAGTGATCGGCTGGCT..... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGTGGCCTCCAGAGGGata......................................................................................................................................................................................................... 19 ata 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGAAGATCTCCATGTAGTTTT................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AACTCGAATTCATGGCTTGGTTTC....................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........................................AGAGGGCTAGGTTAGTACAAACTCGAA....................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGGCAAGGCCTAGGCATGACAATCGGAGGACTC..................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................GAGGACTAGTGATCGGC.......... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CGGAGGACTCGAGGGGGATGGA......................... 22 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TTTCCCAGAAGATCTCCATGTAGTTTT................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................ACTAGTGATCGGCTGGCTGCT.. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCGGAGGACTCGAGGGGGATGGA......................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGATTGCTACCGATGTGGCCTCCAGAG.............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCGGAGGACTCGAGGGGGATGGAGG....................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AGGCATGACAATCGGAGGACTCGAGGG................................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCTGATTGCTACCGATGTGGCCTCCAGAGG............................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCTGATTGCTACCGATGTGGCCTCCAGA............................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
......................................................................................................................................................................................................ACAATCGGAGGACTCGAGGGGGATGG.......................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TCTAAGTTTTTTTCACATAAAGGTGCAG............................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGCTACCGATGTGGCCTCCAGAGGGCTA......................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TTTCTAAGTTTTTTTCACATAAAGGTGC.............................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGCTACCGATGTGGCCTCa.................................................................................................................................................................................................................. 19 a 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TTTTCACATAAAGGTGCAG............................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGGAGGACTAGTGATCGGCT......... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................TACCGATGTGGCCTCCAGAGGGCTAG........................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.......................CTACCGATGTGGCCTCCAGAGG............................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CTATTCTGATTGCTACCGATGTGGCCT.................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TTTGTGGCAAGGCCTAGGCATGACAATCt............................................. 29 t 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGTGGCAAGGCCTAGGCATGACAATCG............................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................TGCTACCGATGTGGCCTCCAGAGGG............................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTGCTACCGATGTGGCCTCCAGAGGGt........................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...................................................................................................................................................................TAAAGGTGCAGTCTTTGTGGCAAGG.............................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CAAGGCCTAGGCATGACAATCGGAGG......................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................GAGGACTAGTGATCGGCTG........ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................ATGACAATCGGAGGACTCGAGG................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGCTACCGATGTGGCCTC................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AACTCGAATTCATGGCTTG............................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GAAGATCTCCATGTAGT................................................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................ATGTGGCCTCCAGAGGGCTAG........................................................................................................................................................................................................ 21 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGGAAAAGCTCCTATTCTGATTGCTACCGATGTGGCCTCCAGAGGGCTAGGTTAGTACAAACTCGAATTCATGGCTTGGTTTCCCAGAAGATCTCCATGTAGTTTTTTTTAAAGAAAGTTTATTGCTTTCTTTAACCTGCATTTTTTCTAAGTTTTTTTCACATAAAGGTGCAGTCTTTGTGGCAAGGCCTAGGCATGACAATCGGAGGACTCGAGGGGGATGGAGGACTAGTGATCGGCTGGCTGCTTC
..............................................................((((..(((((.((.(((((.((((((((.................(((((((((((.....))))))))))).((((((((((..................))))))))))))))).)))..))))).)).)))))...))))............................................
..................................................51...........................................................................................................................................................208........................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
........................................................................TGGTTTCCCAGAAGAcagt............................................................................................................................................................... 19 cagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00