chr11:101303721 101304086 +
(10)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(41)
TESTES

Sense strand
GCGGAAGTGCCCTCCTTTCCTTTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTGCTGTCGGTGAGTAAAGGCCTGGAGAGGGTCTTGCAATCCGCCGCCATCGCGGTCCCGGGGTCGGGTTGCTGGGCTCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTCACGGGGAGTCGCATCCCTCGAGCAGGACCTCCGGGCCGCGTGGCGGAGTCGGCAGCGGGTGATCTAAAGTCGCGGGCCTACGACCGGGGCTCGCAGGTAGACGTCGGCTCCGGGGCCTTCCGCTTTACACACTTGTGAGCGGCTCCTTCCTTGTCTTTGTCTCTGCAGAGATGGGCAAGTTCATGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGGTCCTGGCCGGA
............................................................................................................................((((.....(((....((((((...(((((.(((((.((....))))..))))))))))))))..)))(((((((...(((((((...(((((.((.(((((.....((((((((.((........)).)))))))))))))..)))))))..)))))))...)))))))......))))..............................................................
....................................................................................................................117........................................................................................................................................................................................304............................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
.........................................................................................................................TTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTCAC........................................................................................................................................................................................................................ 29 1 36.00 36.00 10.00 8.00 9.00 - 2.00 - 5.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTC.......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 19.00 19.00 9.00 1.00 6.00 - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAGATGGGCAAGTTCATGAAACCC........................... 28 1 15.00 15.00 4.00 5.00 - 1.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................TACACACTTGTGAGCGGCTCCTTCCTT.................................................................. 27 1 14.00 14.00 6.00 2.00 1.00 - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGGTC......... 26 6 8.83 8.83 0.17 0.33 - 0.33 - 3.50 - 0.17 - 1.00 - 0.17 - - 0.17 0.67 - 0.17 - 0.33 0.33 - 0.50 0.17 - - - - - - 0.17 - 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 0.17 -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGGTCC........ 27 6 8.50 8.50 0.83 1.00 - 1.50 1.00 1.17 - - 0.17 - - - - - - 1.00 - 0.83 0.17 - 0.50 - - 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CGGGGTCGGGTTGCTtggg........................................................................................................................................................................................................................................................ 19 tggg 8.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - 5.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAGATGGGCAAGTTCATGAAACC............................ 27 1 8.00 8.00 2.00 3.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCTGTCGGTGAGTAAAGGCCTGGAGAGGGT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 8.00 8.00 - - - - - - - - - 7.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................TACACACTTGTGAGCGGCTCCTTCCT................................................................... 26 1 8.00 8.00 - 3.00 1.00 - 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CGGGGTCGGGTTGCTtgg......................................................................................................................................................................................................................................................... 18 tgg 6.00 0.00 - - - - - - - 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTCA......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - - - 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTCAC........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 5.00 5.00 1.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CCGGGGTCGGGTTGCTtgg......................................................................................................................................................................................................................................................... 19 tgg 4.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TACGACCGGGGCTCGCAGGTAGACGT.................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTT........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCTGTCGGTGAGTAAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGAGATGGGCAAGTTCATGAAACC............................ 29 1 4.00 4.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................GCAGGTAGACGTCGGCTCCGGGGCCTT................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTC.......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GCTCATTCGGACTCTGAG........................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCGGCTCCTTCCTTGTCTTTGTCTC....................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTT........................................................................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCT............................................................................................................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TAAAGTCGCGGGCCTACGACCGGGGC................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCTCTGCAGAGATGGGCAAGTTC.................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TCTAAAGTCGCGGGCCTACGACCGG................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGGT.......... 25 6 3.00 3.00 - - - 0.83 - 0.50 - - - - - 0.17 - - - 0.50 - 0.17 - - 0.17 - - 0.17 - - 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - 0.17
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGGTCCT....... 28 6 2.83 2.83 0.17 0.17 - 0.17 0.83 0.67 - - 0.17 - - - - - - 0.17 - 0.17 - 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGAGCGGCTCCTTCCTTGTCTTTGT.......................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCTCTGCAGAGATGGGCAAGTTC.................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGATGGGCAAGTTCATGAAACCtgtc........................ 27 tgtc 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TGCCTGCTGTCGGTGAGT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGATGGGCAAGTTCATGAAACCCGGt........................ 28 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCTTTGTCTCTGCAGAGATGGGC.......................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCTGCAGAGATGGGCAAGTTCATG................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TTTACACACTTGTGAGCGGCTCCTTC..................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TGTCGGTGAGTAAAGGCCTGGAGAGGGT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................TTACACACTTGTGAGCGGCTCCTTCC.................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCGGCTCCTTCCTTGTCTTTGTCTa....................................................... 28 a 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGAGATGGGCAAGTTCATGA................................ 25 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CGGGGTCGGGTTGCTtg.......................................................................................................................................................................................................................................................... 17 tg 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTCt......................................................................................................................................................................................................................... 28 t 2.00 19.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TACGACCGGGGCTCGCAGGTAGACGTC................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CTCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTT........................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................GTCGGTGAGTAAAGGCCTGGAGAGGGTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGAGCCTCTGGCGGCTTCACGGGG.................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................TACACACTTGTGAGCGGCTCCTTCC.................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GCTGCCTGCTGTCGGTGAG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCCTTTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 1.50 1.50 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GGCGGAGTCGGCAGagtt............................................................................................................................................................... 18 agtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................CACACTTGTGAGCGGCTCCTTCCTTG................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CTTTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTGa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................CCCGGGGTCGGGTTGCTtgg......................................................................................................................................................................................................................................................... 20 tgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTTCATGAAACCCGGGAAAGTGGggc.............. 27 ggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTtaa........................................................................................................................................................................................................................ 29 taa 1.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TACGACCGGGGCTCGCAGGTAGACG................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CTGGGCTCATTCGGACTCTGAGC....................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTCA......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGGCTCCTTCCTTGTCTTTGTCTCTGCAG.................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................CCCGGGGTCGGGTTGCTtg.......................................................................................................................................................................................................................................................... 19 tg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................CTTTACACACTTGTGAGCGGCTCCTTC..................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................ACACACTTGTGAGCGGCTCCTTCCTTG................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTCACG....................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCTCTGCAGAGATGGGCAAGTTCA................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CCTTTCCTTTCTGCTGGGa.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................GTCGGTGAGTAAAGGCCTGGAGAGGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTGAGCGGCTCCTTCCTTGTCTTT............................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................CTACGACCGGGGCTCGCAGGTAGACG................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TGTCGGTGAGTAAAGGCCTGGAGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GCCTGGAGAGGGTCTTGCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................ACACTTGTGAGCGGCTCCTTCCTT.................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GGCTCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGC............................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCTGTCGGTGAGTAAAGGCCTGGAG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TCTAAAGTCGCGGGCCTACGACCGGGGg................................................................................................................................ 28 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTC.......................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTCAC........................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCTGTCGGTGAGTAAAGGCCTGGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TGCTGTCGGTGAGTAAAGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTGCTGGGCTCATTCGGACTCTGAGC....................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TCTAAAGTCGCGGGCCTACGACCGGG.................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AAGTCGCGGGCCTACGACCGGGGC................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GCTCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTT........................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTGCAGAGATGGGCAAGTTCATG................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAGATGGGCAAGTTCATGAAA.............................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGATCTAAAGTCGCGGGCCTACGACC..................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CATCCCTCGAGCAGGACCTCCGGGCC..................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCAGAGATGGGCAAGTTCATGAAACCC........................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCCGGGCCGCGTGGCGGAGTCGGa..................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GCCGCCATCGCGGTCCCGG........................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAGATGGGCAAGTTCATGAA............................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................................................................................ATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTT........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGCTGGGTGCCGGCTGCCTGCTGTCGta.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGAGCCTCTGGCGGCTTCACGGGGA................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GAGAGGGTCTTGCAATCCGCCGCCAT................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................AGTCGCGGGCCTACGACCGG................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GGTCGGGTTGCTGGGCTCATTCGGACTCTGAGCCTC.................................................................................................................................................................................................................................... 36 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAGATGGGCAAGTTCATGAAcct............................ 27 cct 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GGCTCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGgggg............................................................................................................................................................................................................................. 30 gggg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TACGACCGGGGCTCGCAGGTAGACGcc................................................................................................................. 27 cc 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTGAGCGGCTCCTTCC.................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................TTACACACTTGTGAGCGGCTCCTTCCT................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGGCAAGTTCAaacg............................... 18 aacg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGTAAAGGCCTGGAGAGGGT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAGATGGGCAAGTTCATGAAAC............................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TAGACGTCGGCTCCGGGGCCTTCCGCTT............................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TCGAGCAGGACCTCCGGGCCGCGTGGCGt............................................................................................................................................................................ 29 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGAGCGGCTCCTTCCTTGTCTTT............................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGAGCCTCTGGCGGCTTCACGG...................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TGTCGGTGAGTAAAGGCCTGGAGAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCCTTCCTTGTCTTTGTCTCTGCAG.................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TAAAGTCGCGGGCCTACGACCGGGG................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGCTGGGTGCCGGCTGCCTGCTGTCGGTGAG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGCAATCCGCCGCCATCGCGGTCCCG......................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGC............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................ATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTC.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................GGTAGACGTCGGCTCCGGGGCCTTCaa................................................................................................ 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CTTTCCTTTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................CGACCGGGGCTCGCAGGTAGACGTCGGC.............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GAGCAGGACCTCCGGGCCGCGTGGCGGg........................................................................................................................................................................... 28 g 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................TACACACTTGTGAGCGGCTCCTTCCTTG................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCAGAGATGGGCAAGTTCATGAA............................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TCACGGGGAGTCGCATCCCTCGAGCcgg................................................................................................................................................................................................ 28 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GGCTCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGgggc............................................................................................................................................................................................................................. 30 gggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TCTAAAGTCGCGGGCCTACGACCGGt.................................................................................................................................. 26 t 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCTGTCGGTGAGTAAAGGCCTGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGAGCCTCTGGCGGCTTCACGGGGAG.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTTGTCTTTGTCTCTGCAGAGATGGt........................................... 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................CTCTGAGCCTCTGGCGGCTTCACGGG..................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TGCCTGCTGTCGGTGAGTAAAGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTCA......................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GCTCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGC............................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TTTACACACTTGTGAGCGGCTCCTTCC.................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TAGACGTCGGCTCCGGGGCCTTCCGCT.............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GGCTCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGG.............................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GCTCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCT............................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCT............................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTGCa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGATGGGCAAGTTCATGAAACCCGGGAAt..................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCATGAAACCCGGGAAAGTGGTGCT............. 25 6 1.00 1.00 - - - 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - 0.17 - 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCATGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTG............ 26 6 1.00 1.00 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - 0.17 0.17 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAGTTCATGAAACCCGGGAAA..................... 26 6 0.83 0.83 - - - 0.50 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGGTCt........ 27 t 0.83 8.83 - - - 0.17 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGG........... 24 6 0.83 0.83 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - -
......................TCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTGCTGTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 4 0.75 0.75 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGGTGCTGGTCCTGGCCGG. 22 7 0.71 0.71 - - - - - - - - - - - - 0.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTG............ 25 6 0.67 0.67 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGGCAAGTTCATGAAACCCGGGA....................... 26 5 0.60 0.60 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GCTGGGTGCCGGCTGCCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 4 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGGTGCCGGCTGCCTGCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 4 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAGTTCATGAAACCCGGGAAAGT................... 28 6 0.50 0.50 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - -
.................TCCTTTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTGCTGGGCTCATTCGGACT............................................................................................................................................................................................................................................. 20 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTGTCTTTGTCTCTGCAG.................................................. 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGTAAAGGCCTGGAG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTG............ 23 6 0.33 0.33 - - - - - 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTG............ 24 6 0.33 0.33 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGGGCAAGTTCATGAAACCCGGGA....................... 25 6 0.33 0.33 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTtgtc......... 26 tgtc 0.29 0.29 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTG............... 20 7 0.29 0.29 - - - - - 0.14 - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCT............. 22 7 0.29 0.29 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGTGCTGGTCCTGGCCGGA 21 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 4 0.25 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTCCTTTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTGCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTGCTGTCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTGCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGCTGGGTGCCGGCTGCCTGCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCCTTTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTGa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 a 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGATGGGCAAGTTCATGAAACCCGGGA....................... 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - -
............................GGGTGCCGGCTGCCTGCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCTGCTGGGTGCCGGCTGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - -
................TTCCTTTCTGCTGGGTGCCGGCTGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGGGCAAGTTCATGAAACCCGGGA....................... 27 5 0.20 0.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTTCCTTTCTGCTGGGTGCCGGCTGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCCTTTCCTTTCTGCTGGGTGCCGGCT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCCTTTCCTTTCTGCTGGGTGCCGG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGTTCATGAAACCCGGGAAAGTGG................. 26 5 0.20 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGGAAAGTGGTGCTGGTCCTGGC.... 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCCGGGAAAGTGGTGCTGGTCCT....... 26 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTTCATGAAACCCGGGAAAGTGGTGC.............. 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGG........... 26 6 0.17 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCATGAAACCCGGGAAAGTGGTGC.............. 26 6 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAGTTCATGAAACCCGGGA....................... 24 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCATGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGt........... 27 t 0.17 1.00 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGGcc......... 26 cc 0.17 0.83 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGAAACCCGGGAAAGTGGT................ 20 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTTCATGAAACCCGGGAAAGTGGT................ 26 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCATGAAACCCGGGAAAGTGGTGC.............. 25 6 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAGTTCATGAAACCCGGGAAAG.................... 27 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGGGAAAGTGGTGCTGGTC......... 21 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGGTCCTa...... 29 a 0.17 2.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGG........... 25 6 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGGGCAAGTTCATGAAACCCGGGAA...................... 26 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCATGAAACCCGGGAAAGTGGTGC.............. 24 6 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGGTg......... 26 g 0.17 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGGCAAGTTCATGAAAC............................. 20 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTagtc......... 26 agtc 0.14 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCCGGGAAAGTGGTGC.............. 18 7 0.14 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGGGCAAGTTCATGAA............................... 19 7 0.14 0.14 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGTGCTGGTCCTGGCCGG. 20 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGCAAGTTCATGAAACCCGG......................... 21 7 0.14 0.14 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAGTTCATGAAACCC........................... 20 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAAGTGGTGCTGGTCCTGGC.... 20 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GCGGAAGTGCCCTCCTTTCCTTTCTGCTGGGTGCCGGCTGCCTGCTGTCGGTGAGTAAAGGCCTGGAGAGGGTCTTGCAATCCGCCGCCATCGCGGTCCCGGGGTCGGGTTGCTGGGCTCATTCGGACTCTGAGCCTCTGGCGGCTTCACGGGGAGTCGCATCCCTCGAGCAGGACCTCCGGGCCGCGTGGCGGAGTCGGCAGCGGGTGATCTAAAGTCGCGGGCCTACGACCGGGGCTCGCAGGTAGACGTCGGCTCCGGGGCCTTCCGCTTTACACACTTGTGAGCGGCTCCTTCCTTGTCTTTGTCTCTGCAGAGATGGGCAAGTTCATGAAACCCGGGAAAGTGGTGCTGGTCCTGGCCGGA
............................................................................................................................((((.....(((....((((((...(((((.(((((.((....))))..))))))))))))))..)))(((((((...(((((((...(((((.((.(((((.....((((((((.((........)).)))))))))))))..)))))))..)))))))...)))))))......))))..............................................................
....................................................................................................................117........................................................................................................................................................................................304............................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGCCTTCCGCTTTACACACTTGTGA................................................................................ 28 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGATCTAAAGTCGCGgacg................................................................................................................................................ 19 gacg 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTTCCTTGTCTTTGTagt.......................................................... 20 agt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGGGCCTTCCGCTTTACAC........................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGATCTAAAGTCGCGga................................................................................................................................................ 17 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TTGCAATCCGCttgt......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 ttgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGCTCCTTCCTTGTCTTTGTCTCTGCA................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCTCTGCAGAGATGGGCAAGTTCATGA................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................TTTACACACTTGTGAagat................................................................................ 19 agat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -