(10)
OTHER.mut
(5)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(34)
TESTES

Sense strand
CTGCCTTCCAAGCCTTTCTCATGTGGCCGGAGTGGAAAGGGACACAAAAGGTGTGCTGGTCACTTTATTCTGTTACTGAAAAACGATGAGGAGCTGCTAATGGTGATGGAATATGAGCTTGGGGTTCGTGGATTGGCATTATAGCAACCATACCCTGAATTGAGAAGTCTGTTATTCTAGGGGCATGGTGGCTTACCCCTGTAATCACAGCACTTAGGATGCTAAGGCAAGAGATCTGTTGTGAGTTCAA
...................................................................(((.......)))............((((.(((((.((((....(((((((.....))))))).)))).))))))))).(((((.((((((((..((....))...)))).))))..))))).............................................................
.................................................................66..........................................................................................................................190..........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
..................................................................................................................................................................................AGGGGCATGGTGGCTTACCCCTGTAATCACAGCACTTAGGATGCTAAGGCAA.................... 52 1 89.00 89.00 89.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGTTACTGAAAAACGATGAGGAGCTGC......................................................................................................................................................... 27 1 38.00 38.00 - 6.00 4.00 9.00 5.00 2.00 5.00 4.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TATTCTGTTACTGAAAAACGATGAGGAGC............................................................................................................................................................ 29 1 6.00 6.00 - 2.00 - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAGAAGTCTGTTATTCTAGGGGCAT................................................................ 26 1 6.00 6.00 - - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................................................................TTCTGTTACTGAAAAACGATGAGGAGC............................................................................................................................................................ 27 1 6.00 6.00 - 5.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGTTACTGAAAAACGATGAGGAGCTGCT........................................................................................................................................................ 28 1 5.00 5.00 - - 1.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAGAAGTCTGTTATTCTAGGGGCATG............................................................... 27 1 4.00 4.00 - - 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGTTACTGAAAAACGATGAGGAGCTG.......................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAATTGAGAAGTCTGTTATTCTAGGG.................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TATGAGCTTGGGGTTCGTGGATTGGC................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - -
................................TGGAAAGGGACACAAAAGG....................................................................................................................................................................................................... 19 2 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TCTGTTACTGAAAAACGATGAGGAGC............................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAGAAGTCTGTTATTCTAGGGGCA................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGTGATGGAATATGAGCTTGGGGTT............................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TATTCTGTTACTGAAAAACGATGAGGAG............................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TATGAGCTTGGGGTTCGTGGATTGG.................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AGCCTTTCTCATGTGGCCGG............................................................................................................................................................................................................................ 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGAGGAGCTGCTAATGGTGATGGAAT.......................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TAGGATGCTAAGGCAAGAGATCTGTTGT........ 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AGCCTTTCTCATGTGGCCGGAGTGGA...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGGCCGGAGTGGAAAGGGAC............................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
............................................................................TGAAAAACGATGAGGAGCTGCTAAT..................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
................................................................................................................................................................TGAGAAGTCTGTTATTCTAGGGGCATGG.............................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGTGGCCGGAGTGGAAAGGGACACA............................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GAAGTCTGTTATTCTAGGGGCATGGT............................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGGCCGGAGTGGAAAGGG................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGTGGCCGGAGTGGAAAGGGACACAA........................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........AGCCTTTCTCATGTGGCCGGAGTGGAAA.................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................................................................................................TGAGCTTGGGGTTCGTGGATTGGCATT.............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AGCCTTTCTCATGTGGCCGGAGTG........................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TCATGTGGCCGGAGTGGAAAGGGACACA............................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGAGCTTGGGGTTCGTGGATTGG.................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGAAAAACGATGAGGAGCTGCTAATG.................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGAAAAACGATGAGGAGCTGCTAATGGT.................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CATGTGGCCGGAGTGGAAAGGGAC............................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................TCTCATGTGGCCGGAGTGGAAAGGGA................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TATGAGCTTGGGGTTCGTGGATTGGCATT.............................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTCTCATGTGGCCGGAGTGGAAAGGGA................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AGCCTTTCTCATGTGGCCGGAGTGGt...................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
................TCTCATGTGGCCGGAGTGGAAAGGt................................................................................................................................................................................................................. 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TTATAGCAACCATACCCTGAATTGAGA..................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...............TTCTCATGTGGCCGGAGTGGAAAGGGt................................................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAATTGAGAAGTCTGTTATTCTAG...................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAATTGAGAAGTCTGTTATTCTAGG..................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGTTACTGAAAAACGATGAGGAGC............................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................CTGTTACTGAAAAACGATGAGGAGCTG.......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TAGCAACCATACCCTGAATTGAGAAG................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.TGCCTTCCAAGCCTTTCTCATGTGGCCG............................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGTTACTGAAAAACGATGAGGAGCTGt......................................................................................................................................................... 27 t 1.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CTCATGTGGCCGGAGTGGAAAGGGACAC............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TACTGAAAAACGATGAGGAGCTGC......................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGTTACTGAAAAACGATGAGGAGCTGCTA....................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAATTGAGAAGTCTGTTATTCTAGGGGCAT................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............TTCTCATGTGGCCGGAGTGGAAt.................................................................................................................................................................................................................... 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGTTACTGAAAAACGATGAGGAGCTGCTAA...................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TTGAGAAGTCTGTTATTCTAGGGGC.................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ATGTGGCCGGAGTGGAAAGGGAC............................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.TGCCTTCCAAGCCTTTCTCATGTGt................................................................................................................................................................................................................................ 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................AGCTTGGGGTTCGTGGATTGGCATT.............................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CTTTCTCATGTGGCCGGAG.......................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CCGGAGTGGAAAGGGACACAAAAGGaa..................................................................................................................................................................................................... 27 aa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TACTGAAAAACGATGAGGAGCTGCTAATGt................................................................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTGCCTTCCAAGCCTTTCTCATGTGGCCGGAGTGGAAAGGGACACAAAAGGTGTGCTGGTCACTTTATTCTGTTACTGAAAAACGATGAGGAGCTGCTAATGGTGATGGAATATGAGCTTGGGGTTCGTGGATTGGCATTATAGCAACCATACCCTGAATTGAGAAGTCTGTTATTCTAGGGGCATGGTGGCTTACCCCTGTAATCACAGCACTTAGGATGCTAAGGCAAGAGATCTGTTGTGAGTTCAA
...................................................................(((.......)))............((((.(((((.((((....(((((((.....))))))).)))).))))))))).(((((.((((((((..((....))...)))).))))..))))).............................................................
.................................................................66..........................................................................................................................190..........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
.........................................................................CTGAAAAACGATGAGGaa............................................................................................................................................................... 18 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -