chr11:97643154 97643707 -
(12)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(5)
PIWI.mut 		(46)
TESTES

Sense strand
TACTAACTTCCTTTCTGACCCTTTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGGTGAGGAATTTTGAGTTTGGGGATCCGTTGGCATCTGCCGCGCGGGATGGCCCGCCCATCCCTTGGCGACGGCCCCCGGCGGCGGTGATAGTTTACAGTCCCGGGGCCGGAGATAGAGAAGATGGGGGCACCGCGGAGGCCTAGAGGGAGCCCTGAAAGAGGGCGATGCCAATGGTGTTGAGCTGGTGTAGGAGCGGAGCATGGGGCCGAACGGAGAACGTGGGGTCGACGGGACTGCGCGATATCTGCGGTCCCCGCAAATGCAGACGAGGTTGGAGCCTCGCAGTCTCCTTCTTCCGCAGGAGGATGCAAATAATGGGCACGGCCGGGTCCCGTGACAAGTGCGTGGTAGCCGGGGAGCGGCCGGCCCTCGCCGAAGCGTGTGCGGTGGGTTATAGTTGGGAACTGTGAGACCGAATGTGGACCCTTGTCCTGTCTGTTTCCCTCCCCGCAGGACGCGGTGGGTCCTCCGGGGCGAAATTCCGGATTTCCCTGGGTCTTCCG
..........................................................................(((((((((((.(((.(((((....(((..((((((.(((.....(((.((((((.(((.((((....)))).))))))))))))......)))..))))))))).)))))..))).........(((((.....)))))))))))))))).(((..(((........)))..)))................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
..................................................51......................................................................................................................................................................................................251.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 43.50 43.50 17.00 11.50 8.50 - 0.50 - 1.50 - - 2.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 2 28.50 28.50 8.50 10.00 2.50 0.50 2.00 - 1.50 - 0.50 2.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 2 12.00 12.00 3.50 3.00 3.00 - - 1.00 0.50 - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 11.50 11.50 2.00 2.50 1.50 0.50 - 0.50 1.00 - 0.50 1.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.....................TTTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 10.50 10.50 - 0.50 0.50 0.50 0.50 1.00 0.50 0.50 1.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - 1.00 0.50 - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - 0.50 - -
..................................................GTGAGGAATTTTGAGTTTGGGGATCC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 10.00 10.00 - - - 2.00 2.00 5.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 2 9.00 9.00 2.50 2.00 2.00 0.50 - 0.50 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 6.00 6.00 0.50 0.50 - - - 0.50 1.00 - 0.50 0.50 - - - - - 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TGGTGTTGAGCTGGTGTAGGAGCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 6.00 6.00 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 5.50 28.50 0.50 2.50 1.50 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 4.50 4.50 0.50 2.00 0.50 - - - 0.50 - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 2 4.00 4.00 - - 3.00 - - - - - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAACTGTGAGACCGAATGTGGACC.............................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGCCAATGGTGTTGAGCTGGTGTA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAGCTGGTGTAGGAGCGGAGCATG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAATTTTGAGTTTGGGGATC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 2 2.50 2.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 2 2.50 2.50 - 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CGTTCAAGATGTCGAAGCGAGGTGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGCCAATGGTGTTGAGCTGGTGTAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GTCGAAGCGAGGTGAGGAATTTTGAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................GGTGTTGAGCTGGTGTAGGAGCGGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 g 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGAGACCGAATGTGGACCCTTGTC........................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................GAACGGAGAACGTGGGGTCGACGGGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 2.00 2.00 - - 0.50 - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................GCGAGGTGAGGAATTTTG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GTCGAAGCGAGGTGAGGAATTTTG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TAACTTCCTTTCTGACCCTTTCCGGGCGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAATTTTGAGTTTGGGGATCCGTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAATTTTGAGTTTGGGGATCCGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GAGGTGAGGAATTTTGAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGCACGGCCGGGTCCCG......................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGCCAATGGTGTTGAGCTGGTGTAGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.50 4.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - -
.........................CGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 1.50 1.50 - - 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.50 6.00 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TTTCTGACCCTTTCCGGGCGTTCAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCGACGGGACTGCGCGATATCTGCGG............................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGGAATTTTGAGTTTGGGGATCCGTTGG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGGT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAAATAATGGGCACGGCCGGGTC............................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 2.00 - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................TGTAGGAGCGGAGCATGGGGCCGAA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAACTGTGAGACCGAATGTGG................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAGTTTGGGGATCCGTTGGCATCTGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TTGAGCTGGTGTAGGAGCGGAGCATG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGGAATTTTGAGTTTGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TCGAAGCGAGGTGAGGAATT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TTCAAGATGTCGAAGCGAGGTGAGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................ATGTCGAAGCGAGGTGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TGTTGAGCTGGTGTAGGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GAGTTTGGGGATCCGTTGGCAT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 -
.......................................................................................................................................................................................................................................GCTGGTGTAGGAGCGGAGCATGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGAGGATGCAAATAATGGGCACGGt.................................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATAGTTGGGAACTGTGAGACCGAAT..................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGAATGTGGACCCTTGTCCTGTC................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAATTTTGAGTTTGGGGATCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................TGGGGCCGAACGGAGAACGTGGGaga..................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 aga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GCCCTGAAAGAGGGCGATGCCAATGGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GTTCAAGATGTCGAAGCGAGGTGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTCCGGGCGTTCAAGAaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 aa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGGAATTTTGAGTTTGGGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTGAGGAATTTTGAGTTTGGGat................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCGCAGGAGGATGCAAATAATGGGC....................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCAGGAGGATGCAAATAATGGGCAC..................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TGAGCTGGTGTAGGAGCGGAGCATGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGGATTTCCCTGtt....... 16 tt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CTTTCCGGGCGTTCAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 1.00 1.00 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATGGGCACGGCCGGGTCCCGTGA...................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGACCCTTGTCCTGTCTGTTTCCCTCCCCG..................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGGGGCGAAATTCCGGATTTCCCTGt........ 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTTCCGCAGGAGGATGCAAATAAT........................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AAAGAGGGCGATGCCAATGGTGTTGAGCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GATGTCGAAGCGAGGTGAGGAATTTTGAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTTGGGAACTGTGAGACCGAATGT................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TGTCGAAGCGAGGTGAGGAATTTTGAGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAATGCAGACGAGGTTGGAGCCTC.............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GAGATAGAGAAGATGGGGGCACCGCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................CGAACGGAGAACGTGGGGTCGACGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................TGGTGTAGGAGCGGAGCATGGGGCCG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GTCGAAGCGAGGTGAGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAATTTTGAGTTTGGGGATCCGTTGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGGTAGCCGGGGAGCGGCC........................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTATAGTTGGGAACTGTGAGA........................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTTGGGAACTGTGAGACCGAATGTGG................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................AGGGAGCCCTGAAAGAGGGCGATGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................AGATGTCGAAGCGAGGTGAGGAAT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................GCGAGGTGAGGAATTTTGAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGGACTGCGCGATATCTG................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TTCCTTTCTGACCCTTTCCGGGCGTT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....ACTTCCTTTCTGACCCTTTCCGGGCGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................CGAGGTGAGGAATTTTGAGTTTGGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCAGGAGGATGCAAATAATGGGCACGG................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGAGGATGCAAATAATGGGCACGG................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
........................CCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGgg.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 gg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................GATGTCGAAGCGAGGTGAGGAATTTTGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GCCGGAGATAGAGAAGATGGGGGCACCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TCCTTTCTGACCCTTTCCGGGCGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGAAAGAGGGCGATGCCAATGGTGTTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TGGTGTTGAGCTGGTGTAGGAGCGGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................GAACGTGGGGTCGACGGGACTGCGCG....................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TGGTGTTGAGCTGGTGTAGGAGCGGt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAATTTTGAGTTTGGGGATt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TCTGACCCTTTCCGGGCGTTCAAGATttta............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 ttta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................TGGGGCCGAACGGAGAACGTGGGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCTGTTTCCCTCCCCGCAGt................................................. 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAAATAATGGGCACGGCCGGGTCC........................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AGCTGGTGTAGGAGCGGAGCATGGa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAGTTTGGGGATCCaaa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGGT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TAGAGAAGATGGGGGCACCGCGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCTGTTTCCCTCCCCGCAGGACGCGGTG......................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................AACGGAGAACGTGGGGTCGACGGGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCGTTCAAGATGTCGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TCCTTTCTGACCCTTTCCGGGCGTT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAGTTTGGGGATCCGTTGGCATCTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TTCAAGATGTCGAAGCGAGGTGAGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CTTTCTGACCCTTTCCGGGCGTTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AGCTGGTGTAGGAGCGGAGCATGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AACTTCCTTTCTGACCCTTTCCGGGCGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGAAAGAGGGCGATGCCAATGGTGTT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TACAGTCCCGGGGCCGGAGATAGAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGGCCGAACGGAGAACGTGGGGTCGACGGGACT............................................................................................................................................................................................................................................................................ 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................ACCCTTTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................CTGGTGTAGGAGCGGAGCATGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCTCCTTCTTCCGCAG.......................................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AGCTGGTGTAGGAGCGGAGCATGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGAACTGTGAGACC......................................................................................... 15 4 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGtt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 tt 0.50 9.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTCCGGGCGTTCAAGATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 a 0.50 43.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGACCCTTTCCGGGCGTTCAAGATGTCGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................ACCCTTTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGTCGAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
..........CTTTCTGACCCTTTCCGGGCG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCGTTCAAGATGTCGAAGCGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGtt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tt 0.50 28.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
..................................AAGATGTCGAAGCGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 16 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CCTTTCCGGGCGTTCAAGATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - -
.....................TTTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 t 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CTTTCTGACCCTTTCCGGGCGTTCAAGATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCCGGGCGTTCAAGATGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCGGTGGGTCCTCCGGGGCGAAATTC..................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CCGGGCGTTCAAGATGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CTTTCTGACCCTTTCCGGGCGTTCAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTTCCGGGCGTTCAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GTTCAAGATGTCGAAGCG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGAGGAATTTTGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 3 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGATTTCCCTGGGTCTTC.. 19 5 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................AGGAGCGGAGCATGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 15 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAATTTTGAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 7 0.14 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TACTAACTTCCTTTCTGACCCTTTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGGTGAGGAATTTTGAGTTTGGGGATCCGTTGGCATCTGCCGCGCGGGATGGCCCGCCCATCCCTTGGCGACGGCCCCCGGCGGCGGTGATAGTTTACAGTCCCGGGGCCGGAGATAGAGAAGATGGGGGCACCGCGGAGGCCTAGAGGGAGCCCTGAAAGAGGGCGATGCCAATGGTGTTGAGCTGGTGTAGGAGCGGAGCATGGGGCCGAACGGAGAACGTGGGGTCGACGGGACTGCGCGATATCTGCGGTCCCCGCAAATGCAGACGAGGTTGGAGCCTCGCAGTCTCCTTCTTCCGCAGGAGGATGCAAATAATGGGCACGGCCGGGTCCCGTGACAAGTGCGTGGTAGCCGGGGAGCGGCCGGCCCTCGCCGAAGCGTGTGCGGTGGGTTATAGTTGGGAACTGTGAGACCGAATGTGGACCCTTGTCCTGTCTGTTTCCCTCCCCGCAGGACGCGGTGGGTCCTCCGGGGCGAAATTCCGGATTTCCCTGGGTCTTCCG
..........................................................................(((((((((((.(((.(((((....(((..((((((.(((.....(((.((((((.(((.((((....)))).))))))))))))......)))..))))))))).)))))..))).........(((((.....)))))))))))))))).(((..(((........)))..)))................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
..................................................51......................................................................................................................................................................................................251.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCGGGTCCCGTGACAAGTGCGTGGTA......................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................ATGCCAATGGTGTTGAGCTGGTGTAGGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGTCCCGTGACAAGTGCGTGGTAtacc......................................................................................................................................................... 28 tacc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TTTGGGGATCCGTTGaccg.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 accg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGCAGTCTCCTagag.................................................................................................................................................................................................................... 17 agag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCCTCGCCGAAGCGTGTGCGGTGGGTTA............................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCTGCGGTCCCCGCAAATGCAGACG........................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTTCTTCCGCAGGAGGATGCAAA............................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GCCAATGGTGTTGAGCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGCAGTCTCCTTCTTCCGCAG.......................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CTTTCTGACCCTTTCCGGGCGTTCAAGAa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................GGAGCGGAGCATGGGGCCGAACGGAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCGTTCAAGATGTCGAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCGTTCAAGATGTCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTCCGGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGACCCTTTCCGGGCGTTCAAGATGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GCGTTCAAGATGTCGaca............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 aca 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -