chr11:97521312 97521561 -
(8)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(6)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(36)
TESTES

Sense strand
CTGCCGCGGGACGCGCTTCCGCGAAGTCTGGCTCACGGGTTCCCGGAACGGTGCGTGGGAGGCTGAAGAGTGTGGCGGGTTTCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGGGGTGCGACCTCTCCTCTGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGCGGGTGGCTGCGGGCGGGTTTGCGTTTCTTTTATGCCTCCTTCGGGAACTATTTTCAATCCCCCC
................................................................................................(((((((((..(((.(((....((((((((((...........))))))))))....))).)))..)))).....)))))..........................................................................
...............................................................................................96.................................................................................179.....................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAAC........................................................................... 27 1 113.00 113.00 59.00 39.00 - 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 5.00 - - 2.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGA............................................................................. 25 1 69.00 69.00 9.00 14.00 4.00 - 5.00 2.00 3.00 4.00 1.00 7.00 - 3.00 - - 8.00 2.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGC....................................................................... 28 1 65.00 65.00 21.00 14.00 15.00 5.00 7.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGC....................................................................... 26 1 59.00 59.00 19.00 20.00 - 5.00 3.00 - 1.00 - - - - 2.00 2.00 - - - 3.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAA............................................................................ 26 1 34.00 34.00 4.00 7.00 4.00 - - 4.00 - 4.00 3.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 1.00 - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TCTGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGC.................................................................................... 26 1 31.00 31.00 10.00 7.00 - - 1.00 3.00 4.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTGG................................................................................. 27 1 31.00 31.00 1.00 4.00 - - - 5.00 4.00 3.00 9.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGG........................................................................ 25 1 27.00 27.00 12.00 6.00 5.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGG............................................................................................................................ 26 1 18.00 18.00 2.00 2.00 6.00 - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGG........................................................................ 27 1 17.00 17.00 6.00 3.00 - 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCCTCTGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGC.................................................................................... 29 1 15.00 15.00 2.00 3.00 - 1.00 - 2.00 - 1.00 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00
.........................................................................................................................................TCCTCTGGGCTTAGTAGACAGACCTGG...................................................................................... 27 1 13.00 13.00 2.00 3.00 - 1.00 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAG.................................................................................................................................. 26 1 11.00 11.00 4.00 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGCGG.............................................................. 27 1 10.00 10.00 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGCG............................................................... 26 1 10.00 10.00 3.00 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGAAGAACGGGCTGCGCGCGGGTGGC......................................................... 27 1 10.00 10.00 - - 7.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................CCGGAACGGTGCacca................................................................................................................................................................................................ 16 acca 9.00 0.00 - 5.00 - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................GTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGC................................................................................................................................ 25 1 8.00 8.00 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTG.................................................................................. 26 1 8.00 8.00 - 3.00 - - - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGG......................................................................... 29 1 8.00 8.00 4.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAAC........................................................................... 26 1 7.00 7.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGC................................................................................................................................ 28 1 7.00 7.00 2.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAG.............................................................................. 24 1 7.00 7.00 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GACCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGC.................................................................. 27 1 7.00 7.00 - 1.00 - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCCTCTGGGCTTAGTAGACAGACCTG....................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGG................................................................................................................................. 27 1 5.00 5.00 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGCGGa............................................................. 28 a 5.00 10.00 - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGC................................................................ 25 1 5.00 5.00 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGCGa.............................................................. 27 a 5.00 10.00 - - - - - - 1.00 - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GACAGACCTGGGCTGGAAGAACGG......................................................................... 24 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGCTCACGGGTTCCCGGAACGGTGC.................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................CTGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGC.................................................................................... 25 1 4.00 4.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGG............................................................................................................................ 27 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCCTCTGGGCTTAGTAGACAGACCTGGG..................................................................................... 28 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGG......................................................................... 27 1 4.00 4.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGC....................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGCT...................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TTTTTGCCCTACGTTTGCTTTCGTC............................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGG......................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................ACCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGa.................................................................... 24 a 3.00 0.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGAAGAACGGGCTGCGCGCGGGT............................................................ 24 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGCGGG............................................................. 28 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGG......................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAtt........................................................................... 27 tt 3.00 69.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................CCGGAACGGTGCacc................................................................................................................................................................................................. 15 acc 3.00 0.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................ACCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGC.................................................................... 24 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGGG........................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACG.......................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTGGA................................................................................ 28 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGG........................................................................ 26 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAAC........................................................................... 28 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TCTGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCT................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGAAGAACGGGCTGCGCGCGGGTG........................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................ACCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCG................................................................. 27 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAAa........................................................................... 27 a 3.00 34.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACt.......................................................................... 28 t 2.00 113.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCCTCTGGGCTTAGTAGAC.............................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAa.............................................................................. 24 a 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCG............................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................ACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGG........................................................................ 24 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCCTCTGGGCTTAGTAGA............................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - -
.........................GTCTGGCTCACGGGTTCCCGGAACGGTG..................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TTTGCCCTACGTTTGCTTTCGTCGGT......................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGG............................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTGGA................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGGGG.......................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCTCCTCTGGGCTTAGTAGACAGACC......................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGAAGAGTGTGGCGGGTTTCGCTTT.................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................CCCGGAACGGTGCacca................................................................................................................................................................................................ 17 acca 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGG........................................................................ 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGt....................................................................... 27 t 2.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGA............................................................................. 24 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGGG........................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GACCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGC.................................................................... 25 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAA............................................................................... 23 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAaa............................................................................. 31 aa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................GGAACGGTGCGTGGGAGGCTGAAGA..................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGC................................................................................................................................ 22 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCTCCTCTGGGCTTAGTAGACAGACCT........................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGCCCTACGTTTGCTTTCGTCGGTCCC...................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................CTGGGCTTAGTAGACAGACCTGGG..................................................................................... 24 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TCCCGGAACGGTGCacca................................................................................................................................................................................................ 18 acca 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGGGGT......................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGCGt.............................................................. 27 t 1.00 10.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGt........................................................................ 25 t 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................AGAACGGGCTGCGCGCGGGTGGCTGC...................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ACGGGCTGCGCGCGGGT............................................................ 17 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GCGGGACGCGCTTCCGCGAAGTCTGG........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCC.............................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGG........................................................................ 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................AAGAACGGGCTGCGCGCGGGTGG.......................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGa.................................................................. 23 a 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................GTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAG.................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTTTGCCCTACGTTTGCTTTCGTCG........................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGCGACCTCTCCTCTGGGCTTAGTAat............................................................................................... 27 at 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GCTGCGGGCGGGTTTGCG......................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCCTCTGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCaa.................................................................................. 31 aa 1.00 15.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCa............................................................................................................................... 29 a 1.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGCGACCTCTCCTCTGGGCTTAGTAG................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGAAGAACGGGCTGCGCGCGGG............................................................. 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TTATGCCTCCTTCGGGAACTATTTTCAATC..... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................ACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGC....................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACG.......................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGCGACCTCTCCTCTGGGCTTAGTAGA............................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGACCTGGGCTGGAAGAACGGGC....................................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGCa...................................................................... 29 a 1.00 65.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CGGAACGGTGCGTGGGAGGCTGA........................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................CTGAAGAGTGTGGCGGGTTTCGCTTT.................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TTTATGCCTCCTTCGGGAACTATTTTC......... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GGGCTTAGTAGACAGACC......................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TTTGCCCTACGTTTGCTTTCGTCGGTC........................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGCGTTTCTTTTATGCCTCCTTCGGG................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..........................................................................................................................................CCTCTGGGCTTAGTAGACA............................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCCTCTGGGCTTAGTAGACAGACCTt....................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGAAGAACGGGCTGCGCGCGGGTGG.......................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGACCTGGGCTGGAAGAACGGGa....................................................................... 23 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................AACGGTGCGTGGGAGGCTGAAGAGTGT................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TGCGGGCGGGTTTGCGTTTCTTTTA................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TTTTATGCCTCCTTCGGGAACTATTTTC......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................CGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCa............................................................................................................................... 27 a 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCCTCTGGGCTTAGTAGACAGAC.......................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCG................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................CCGGAACGGTGCaaca................................................................................................................................................................................................ 16 aaca 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TTGCCCTACGTTTGCTTTCGTCGGTC........................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGGGGTGCG...................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GTTTCTTTTATGCCTCCTTCGGGAACT............... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................GGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTGGA................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACG.......................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGtt............................................................................................................................... 24 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................AACGGTGCGTGGGAGGCTGAAGAG.................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAG.............................................................................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................AACGGTGCGTGGGAGGC........................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TCTGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTt.................................................................................. 28 t 1.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TAGACAGACCTGGGCTGGAAGAA............................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGAAGAACGGGCTGCGCGC................................................................ 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................ACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGC................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTGG................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGG........................................................................ 17 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGGGG.......................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCTTTCG.............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGA................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
................................................................................TTCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCTTTCGTC............................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGcg.................................................................................................................................. 26 cg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................CGCTTTTTGCCCTACGTTTGCTTTCGTtg........................................................................................................................................... 29 tg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTac.................................................................... 21 ac 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GACCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGCG................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CTTAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGA............................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGGtt.......................................................................................................................... 28 tt 1.00 18.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGC.................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TCCCGGAACGGTGCGTGGGAGGCTGAAG...................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CTGGGCTGGAAGAACGGG........................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................CCGGAACGGTGCGTGGGAGGCTGAAG...................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................GCTGCGCGCGGGTGGCTGCGGGCGGGT.............................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GACCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGCt................................................................... 26 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CGAAGTCTGGCTCACGGGTTCCCGGAA.......................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGt....................................................................... 26 t 1.00 27.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAGACAGACCTGGGCTGGAAGA............................................................................. 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................CGTGGGAGGCTGAAGAGTGTGGCGGa........................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGCG................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGCTCACGGGTTCCCGGAACGGggc.................................................................................................................................................................................................... 26 ggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGC................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGCT...................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................CTACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGA................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GTCGGTCCCCGAGGCCCGGGGTG........................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................CTCTGGGCTTAGTAGACAGACCTGG...................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGa....................................................................... 28 a 1.00 17.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCgagg.................................................................................................................................. 26 gagg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGt.................................................................. 25 t 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGt............................................................................................................................ 26 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TTTCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCTTT................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GACCTCTCCTCTGGGCTTAGTAGACA............................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GACAGACCTGGGCTGGAAGAACG.......................................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGttgg................................................................................. 27 ttgg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGAAGAACGGGCTGCGCGCGG.............................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................GCTGGAAGAACGGGCTGC.................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGa................................................................ 25 a 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GACCTGGGCTGGAAGAACGGGCTG..................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGa........................................................................ 25 a 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TTTTTGCCCTACGTTTGCTTTCGTCtg.......................................................................................................................................... 27 tg 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TCTGGGCTTAGTAGACAGACCTGGG..................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GGGCTGGAAGAACGGGCTGCGC.................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGGCTGCGGGCGGGTTTGCGTTTCTTa.................................. 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................ACCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGC.................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ACGGGCTGCGCGCGGGTGGCTGCGG.................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAAC........................................................................... 32 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TGCGGGCGGGTTTGCGTTTCTTTTATGCC............................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................GAACGGTGCGTGGGAGGCTGAAGAG.................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................CGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGC................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGGGa.......................................................................................................................... 29 a 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGCT...................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CCTCTGGGCTTAGTAGACAGACC......................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................GTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGG................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................GTTTGCTTTCGTCGGTCCC...................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TTGCCCTACGTTTGCTTTCGTCGGT......................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GACCTGGGCTGGAAGAACGGGC....................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGta........................................................................................................................... 28 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTGCG................................................................... 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGt............................................................................. 25 t 1.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGC................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAA............................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAA............................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
......................GAAGTCTGGCTCACGGGTTCCCGGAA.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................GCTGGAAGAACGGGCTGCGCGCG............................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGACCTGGGCTGGAAGAACGGGCT...................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAAC........................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGACCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGC................................................................ 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGG................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGG......................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................CCGGAACGGTGCaccc................................................................................................................................................................................................ 16 accc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGCT...................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGAAGAGTGTGGCGGGTTTCGCTTTT................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAta........................................................................... 27 ta 1.00 69.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGCaa..................................................................... 28 aa 1.00 59.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGCGGt............................................................. 28 t 1.00 10.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TTCTTTTATGCCTCCTTCGGGAACTATTTTC......... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAAag.......................................................................... 27 ag 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TGGGCTTAGTAGACAGAC.......................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................GCTGGAAGAACGGGCTGCGCGCGGG............................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AGACAGACCTGGGCTGGAAGAACG.......................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGA............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTGa................................................................................. 26 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCT................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................AACGGGCTGCGCGCGG.............................................................. 16 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GTGCGACCTCTCCTCTGG......................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGACCTGGGCTGGAAGAA............................................................................ 18 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGACCTGGGCTGGAAG.............................................................................. 16 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTGCCGCGGGACGCGCTTCCGCGAAGTCTGGCTCACGGGTTCCCGGAACGGTGCGTGGGAGGCTGAAGAGTGTGGCGGGTTTCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGAGGCCCGGGGTGCGACCTCTCCTCTGGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTGGAAGAACGGGCTGCGCGCGGGTGGCTGCGGGCGGGTTTGCGTTTCTTTTATGCCTCCTTCGGGAACTATTTTCAATCCCCCC
................................................................................................(((((((((..(((.(((....((((((((((...........))))))))))....))).)))..)))).....)))))..........................................................................
...............................................................................................96.................................................................................179.....................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
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Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
............................................................................................CCTACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCGA................................................................................................................................... 27 1 9.00 9.00 - - 6.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GGGCTTAGTAGACAGACCTGGGCTGGAA............................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
............................................................................GGGTTTCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCT.................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCTTTCG.............................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCTTTCGT............................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCGAAGTCTGGCTCACGGGTTCCCGGA........................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TTTCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCTT................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCTTTC............................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TTCTTTTATGCCTCCTTCGGGAACTA.............. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........GACGCGCTTCCGCGAAGTCTGGCTCA....................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................CCTACGTTTGCTTTCGTCGGTCCCCG.................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GTTTCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCTT................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GTTTCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCT.................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................GGTGGCTGCGGGCGGGTTTGCGTTTCTT................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................CTCTCCTCTGGGCTTAGTAGACAaa............................................................................................. 25 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GCGGGTTTCGCTTTTTGCCCTACGTTTGCTT................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CGAAGTCTGGCTCACGGGTTCCCGGAa........................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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