| Gene: Atp5g1 | ID: uc007lbg.1_intron_3_0_chr11_95936348_r.5p | SPECIES: mm9 |
|
|
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(9) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(6) PIWI.ip |
(3) PIWI.mut |
(36) TESTES |
| ACACGTGGGTGGGGGAGCTGAGCGCTCAGACCAAGGGCTAAAGCTGGGAGGTGAGTCAGTCACCTTGAGCAGGGAGTGTGCTGTGGGCCGAGCAGGGGCTGCAGGGGAGTGGGAGTGCAGGTGACTTGGGGCTGGGAGACAGGGGTCCGCAAGGCCGTGGGTTGTGCCACGTGGAGCACCATTTGCCTCCAGGGATAGGGAAGGAGGACTAGAGTCTTTAAGCCTTATCAATTAATGTTAATTACCAACG ................................................................................((((((.((......)).)))))).......((((.(((((((.(((((((((..........))))).))))..(((((......)))))........)))))))))))............................................................ ........................................................................73.............................................................................................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) |
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| ..........................................................................AGTGTGCTGTGGGCCGAGCAGG.......................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..............................................................................TGCTGTGGGCCGAGCAGGGGCTGCAGG................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................................................................TGTGCTGTGGGCCGAGCAGGGGCTGC.................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .............................................................................GTGCTGTGGGCCGAGCAGGGGCTGCAGGGGAG............................................................................................................................................. | 32 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..ACGTGGGTGGGGGAGCTGAGCGCTCAGA............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................TCAGACCAAGGGCTAAAGCTGGGggat...................................................................................................................................................................................................... | 27 | ggat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................................................GTCAGTCACCTTGAGCAGGGAGTGTGCTG....................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................................................CACCTTGAGCAGGGAGTGTGCTG....................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................TGTGCTGTGGGCCGAGCAGGGGCTGt.................................................................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................CACCTTGAGCAGGGAGTG............................................................................................................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TTTGCCTCCAGGGATAGttt................................................. | 20 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ...CGTGGGTGGGGGAGCTGAGCGCTCAGACCAAG....................................................................................................................................................................................................................... | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............GAGCTGAGCGCTCAGACCAAGGGCTAA................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................AGTGTGCTGTGGGCCGAGCAGGGGCT...................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................GTCAGTCACCTTGAGCAGGGAG.............................................................................................................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................GAGTGTGCTGTGGGCCGAGCAGGGGCTt..................................................................................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................AGCAGGGAGTGTGCTGTGGG................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................GAGTGTGCTGTGGGCCGAGCAGGGGt....................................................................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ..................................GGGCTAAAGCTGGGAGGT...................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................TCAGACCAAGGGCTAAAGCTGGGAGatt..................................................................................................................................................................................................... | 28 | att | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................CCTTGAGCAGGGAGTGTGCTG....................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................GCTGCAGGGGAGTGGGAGTG..................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................................................................................GCCGAGCAGGGGCTGCAGGGGAGTGG.......................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TCAGACCAAGGGCTAAAGCTGGGAGta...................................................................................................................................................................................................... | 27 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................GGGAGTGTGCTGTGGGCCGAGCAG........................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................GGGCTGGGAGACAGGGGTCCGCAA.................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................GAGCAGGGAGTGTGCTGTGG.................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................AAGGGCTAAAGCTGGGAGGTG..................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................ACCTTGAGCAGGGAGTGTGCTG....................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................GCCGAGCAGGGGCTGCAGGG................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TTGAGCAGGGAGTGTGCTGTGG.................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................GGAGTGTGCTGTGGGCCGAGCAGGGG........................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................ACCTTGAGCAGGGAGTGTGCTGTGGGC.................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................................................................AGGGAGTGTGCTGTGGGCCGAGC............................................................................................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............AGCTGAGCGCTCAGACCAAGGGCTAA................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................AGGGGCTGCAGGGGAGTG........................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......................................................................................CCGAGCAGGGGCTGCAG.................................................................................................................................................. | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................CAGGGAGTGTGCTGTGGG................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TTGAGCAGGGAGTGTGCT........................................................................................................................................................................ | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................AGACCAAGGGCTAAAGCT............................................................................................................................................................................................................. | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 |
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Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) |
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