(7)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(5)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(32)
TESTES

Sense strand
CCTGGCGATGGCTTGGAGGACAAACCTTGCTTGCCTCATCAAGGCCGGAGGTAGGGTTCCTGAGCACGAGGTGGATTGCTTTCCAGTCACTAGCCTGTAACCGGGAGTGGTTCTCTTCTGCCCTGTGTCCGGTTGTCCAGCGTGGAGCTGTAGCGGAGCTGAGGGGCGTTCATGTCCCCCAGCCCCGGAGCCCGTCCGCTTTAATGGCCCGGGGTCCACGCGCGTGCGCCCCTTCCCGGGCCGGAGTAGC
.......................................................(((((...((...((((.(((((.....)))))....)))).((((((((((.(((........)))))...))))))))..((((.....))))..)))))))...........................................................................................
.......................................................56.........................................................................................................163.....................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.....................................................................................................................................TGTCCAGCGTGGAGCTGTAGCGGAGC........................................................................................... 26 1 8.00 8.00 - - 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
......................................TCAAGGCCGGAGGTAGGGTTCCTGA........................................................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - - 1.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TAGCCTGTAACCGGGAGTGGTTCTCTTC.................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGAGCACGAGGTGGATTGCTTTCCAG.................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCCAGCGTGGAGCTGTAGCGGAGCTGA........................................................................................ 27 1 3.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TCAAGGCCGGAGGTAGGGTTCCTGAGC......................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTGTCCGGTTGTCCAGCGTGGAGCTGT................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCCGGAGGTAGGGTTCCT............................................................................................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CAGCGTGGAGCTGTAGCGGAGC........................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCCGGAGGTAGGGTcca.............................................................................................................................................................................................. 17 cca 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................CCGGAGGTAGGGTTCa.............................................................................................................................................................................................. 16 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AGGCCGGAGGTAGGGTTCCTGAGCACGAGGTGG................................................................................................................................................................................ 33 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCGTGGAGCTGTAGCGGAGCTGAGG...................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AGGCCGGAGGTAGGGTTCCTGA........................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTGTCCGGTTGTCCAGCGTGGAGCT..................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................CCGGAGGTAGGGTTCCTGAGCACG...................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CATCAAGGCCGGAGGT...................................................................................................................................................................................................... 16 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCCGGAGGTAGGGTcc............................................................................................................................................................................................... 16 cc 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................CCGGAGGTAGGGTccag............................................................................................................................................................................................. 17 ccag 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTGTCCGGTTGTCCAGCGTGGA........................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCCTGAGCACGAGGTGGATTGCTTTC....................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TGGAGCTGTAGCGGAGCTGAGGG..................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GATGGCTTGGAGGACAAA.................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
......................................TCAAGGCCGGAGGTAGGGTTCC.............................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGGCGATGGCTTGGAGGAC..................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTGTCCGGTTGTCCAGCGTGGAc....................................................................................................... 24 c 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTGTCCGGTTGTCCAGCGTGGAGCTGTAGC................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TCCAGTCACTAGCCTGTAACCGGGAGT.............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTCCGGTTGTCCAGCGTGGAGC...................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CGGTTGTCCAGCGTGGAG....................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GGTTCCTGAGCACGAGGTGGATTGC........................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
........................................................TTCCTGAGCACGAGGTGGATTGCTTT........................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCCTGAGCACGAGGTGGATTGCTTT........................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGCTTGCCTCATCAAGGCCGGAGGg...................................................................................................................................................................................................... 25 g 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGGGTTCCTGAGCACGAGGTGGATT............................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TGTCCCCCAGCCCCGGAGCCCGTCCGC................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................TCCAGTCACTAGCCTGTAACCGGGAG............................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCCGGAGGTAGGGTccag............................................................................................................................................................................................. 18 ccag 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTGTCCGGTTGTCCAGCGTGGc........................................................................................................ 23 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...........................................................................................AGCCTGTAACCGGGAGTGG............................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...........................................................................................................................TGTGTCCGGTTGTCCAGCGTGGAGCTGTt.................................................................................................. 29 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GATGGCTTGGAGGACAAACC................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CTAGCCTGTAACCGGGAGTGG............................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...................................................................................................................TTCTGCCCTGTGTCCGGTTGTCCAGC............................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCCGGAGGTAGGGTTCCTG............................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGGCGATGGCTTGGAGGA...................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................GGGTTCCTGAGCACGAGGTGGATTGa........................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGCTTGCCTCATCAAGGCCGGAGGTA..................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TGTCCAGCGTGGAGCTGTAGCGGA............................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTCCGGTTGTCCAGCGTGGAGCTGTA.................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGCTTGCCTCATCAAGGCCGGAGG....................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTGTCCGGTTGTCCAGCGTGGAGC...................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AGGCCGGAGGTAGGGTTCCTGAGC......................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................................................................TCTTCTGCCCTGTGTCCGGTTGTCCAGC............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TGTCCCCCAGCCCCGGAGCCCGTCCGCT.................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCCGGAGGTAGGGTTCCTGAGCA........................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AAGGCCGGAGGTAGGGTTaa.............................................................................................................................................................................................. 20 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGAGCACGAGGTGGATTGCTTTCCAGT................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AGGGTTCCTGAGCACGAG.................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGCCCTGTGTCCGGTTGTCCAGCGccg......................................................................................................... 27 ccg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............................................CCGGAGGTAGGGTcc............................................................................................................................................................................................... 15 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TGTAACCGGGAGTGGTTCTCTTCTG.................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGAGCACGAGGTGGATTGCTTTCCAGTa.................................................................................................................................................................. 28 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GAGGTAGGGTTCCTGAGCACGAGGTGGA............................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................AGCACGAGGTGGATTGCTTTCCAGT................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....CGATGGCTTGGAGGACA.................................................................................................................................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CCTGGCGATGGCTTGGAGGACAAACCTTGCTTGCCTCATCAAGGCCGGAGGTAGGGTTCCTGAGCACGAGGTGGATTGCTTTCCAGTCACTAGCCTGTAACCGGGAGTGGTTCTCTTCTGCCCTGTGTCCGGTTGTCCAGCGTGGAGCTGTAGCGGAGCTGAGGGGCGTTCATGTCCCCCAGCCCCGGAGCCCGTCCGCTTTAATGGCCCGGGGTCCACGCGCGTGCGCCCCTTCCCGGGCCGGAGTAGC
.......................................................(((((...((...((((.(((((.....)))))....)))).((((((((((.(((........)))))...))))))))..((((.....))))..)))))))...........................................................................................
.......................................................56.........................................................................................................163.....................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.................................................................................................................TCTTCTGCCCTGTGTCCGGTTGTCCA............................................................................................................... 26 1 37.00 37.00 27.00 - - 2.00 - 1.00 1.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CTTCTGCCCTGTGTCCGGTTGTCCA............................................................................................................... 25 1 12.00 12.00 7.00 2.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................CAGCCCCGGAGCCCGcggg........................................................ 19 cggg 6.00 0.00 - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TCTCTTCTGCCCTGTGTCCGGTTGTCCA............................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CTCTTCTGCCCTGTGTCCGGTTGTCCA............................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
................................................................................................................................................................................CAGCCCCGGAGCCCGcgg........................................................ 18 cgg 3.00 0.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGATTGCTTTCCAGTCACTAGCCTGTA....................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTCCGGTTGTCCAGCGTGGAGCTGTA.................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GTTCTCTTCTGCCCTGTGTCCGGTTGTC................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TTTAATGGCCCGGGGTCCACGCGCG.......................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................AGGGTTCCTGAGCAtgcc........................................................................................................................................................................................ 18 tgcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.............................................................................................................................................................................GTCCCCCAGCCCCGGAGC........................................................... 18 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................AGTGGTTCTCTTCTGCCCTGTGTCCGGT..................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.............................................................................TCCAGTCACTAGCCgtga........................................................................................................................................................... 18 gtga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................................................................................................................................................GCCCCGGAGCCCGTCCggc..................................................... 19 ggc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CCGGGAGTGGTTCTCTTCTGCCCTGTct............................................................................................................................ 28 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TCCAGTCACTAGCCgtg........................................................................................................................................................... 17 gtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TGTCCCCCAGCCCCG............................................................... 15 5 0.20 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -