(1)
OTHER.ip
(9)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(9)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(42)
TESTES

Sense strand
CTGACACAGAGTTAAAGAAACTCGATGACACAATTCAGCATGTCTATGAGGTAAAAGTGAAGGAGGTAGTGGGACCTGGCTGCCGGAGGGGCTGAGGAGCATGGCTCCGGTTCTCAGCCTGACTACTTTTTTTTTTTTTTAAAGATTTATTTATTTATTATATGAAAGTACACTGTAGCTGTCCTCTGAGGGAGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGCTGCTGGGACTTGAACTCAGGATCTTCGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTAACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTCAGCCTGACTTCTTACAGTGGCTTCATTTTCACTTTTCCAGCATCACAGGCCAGGAGCTTTGGCTTCAGGCTTGTGATTCAGAACTGTTTTCTGTCTCTTCCCAGACTCTGTTGTCTATCCCAGAGACTATGAAGAGTTGCAAGGAGTTACAAGG
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((.....(((((.(((................))).(((((((((.(((((....))))).)))))))))......))))).....)))...........................................................
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................312................................................................................................411................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
............TAAAGAAACTCGATGACACAATTCAGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 12.00 12.00 4.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAAAGTGAAGGAGGTAGTGGGAC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 7.00 7.00 1.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TTAAAGAAACTCGATGACACAATTCAGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAAAGTGAAGGAGGTAGTGGGACC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 - 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................CTCAGGATCTTCGGAAGAACAGG............................................................................................................................................................................................... 23 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AAGAAACTCGATGACACAATTCAGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCTATCCCAGAGACTATGAAGAGTTGC.............. 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGACTATGAAGAGTTGCAAGGAGTT...... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAGAAACTCGATGACACAATTCAGCAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................TTCGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTAACC................................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATGAAGAGTTGCAAGGAGTTACAAGG 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTATCCCAGAGACTATGAAGAGTTGC.............. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGACTATGAAGAGTTGCAAGGAGTTA..... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................TGGGACTTGAACTCAGGATCTTCGGAAG..................................................................................................................................................................................................... 28 2 1.50 1.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................AAGTACACTGTAGCTGgcct.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 gcct 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGACACAATTCAGCATGTCTATGAGactc....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 actc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................GCTGTCCTCTGAGGGAGTCAG....................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCTCATTACAGATGGTTGTGAGCgag............................................................................................................................................................................................................................................ 26 gag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAAAGTGAAGGAGGTAGTGGGACCc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 c 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TGGCTGCTGGGACTTGAACTtag................................................................................................................................................................................................................. 23 tag 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TTAAAGAAACTCGATGACACAATTCAGCAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGATCTTCGGAAGAACAGGC.............................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GGAGTCAGATCTCATTACAGATGGTata................................................................................................................................................................................................................................................... 28 ata 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCTCATTACAGATGGTata................................................................................................................................................................................................................................................... 19 ata 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATCCCAGAGACTATGAAGAGTTGCA............. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AAACTCGATGACACAATTCAGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTAAC.................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAAAGTGAAGGAGGTAGTGGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CTCGATGACACAATTCAGCATGTCTATGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.TGACACAGAGTTAAAGAAACTCGATGAC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGAAACTCGATGACACAATTCAGCAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................ATCTTCGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTAAC.................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................CTTCGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTAA................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................GTAGCTGTCCTCTGAGGGAGg.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TGGTTGTGAGCCACCATGTGGCTGgaa............................................................................................................................................................................................................................... 27 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................GTCAGATCTCATTACAGATGGTgta................................................................................................................................................................................................................................................... 25 gta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAAAGTGAAGGAGGTAGTGGGACCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................ATCTTCGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTA.................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................TGCTGGGACTTGAACTCAaaca.............................................................................................................................................................................................................. 22 aaca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CGATGACACAATTCAGCATGTCTA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................GTCAGATCTCATTACAGATGGatga................................................................................................................................................................................................................................................... 25 atga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................AGTACACTGTAGCTGTCCTCTGAGGt............................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAGAAACTCGATGACACAATTCAGCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................GTCAGATCTCATTACAGATGGagt.................................................................................................................................................................................................................................................... 24 agt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................TTGAACTCAGGATCTTCGGAAGAACAaa............................................................................................................................................................................................... 28 aa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AAGAAACTCGATGACACAATTCAGCATG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AAGAAACTCGATGACACAATTCAGCAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TGTGGCTGCTGGGACTTGAACTtgaa................................................................................................................................................................................................................ 26 tgaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCTCATTACAGATGGTTGTGtgtg.............................................................................................................................................................................................................................................. 24 tgtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GTACACTGTAGCTGTCCTCTGAGGt............................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................GGGACTTGAACTCAGGATCTTCGGAAGAA................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTTGTGATTCAGAACTGTTTa................................................................ 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................ACTGTAGCTGTCCTCTGAGGGAGTC......................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................CTTCGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTAACC................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................CAGGATCTTCGGAAGAACAGtaaa............................................................................................................................................................................................ 24 taaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TATTTATTTATTATATGAAAGTACAtagt............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAGAAACTCGATGACACAATTCAGCATG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCTCATTACAGATGGTTGTGAGCCACCctc........................................................................................................................................................................................................................................ 30 ctc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTAACCG................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TCATTACAGATGGTTGTcaga............................................................................................................................................................................................................................................... 21 caga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................ATCTTCGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTt.................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGcgct.............................................................................................................................................................................................................................................. 29 cgct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGGCTTGTGATTCAGAACT..................................................................... 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCTCATTACAGATGGTTGTGAGCgact........................................................................................................................................................................................................................................... 27 gact 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TGGCTGCTGGGACTTGAACTCAGa................................................................................................................................................................................................................ 24 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCAGAGACTATGAAGAGTTGCA............. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTGTCTATCCCAGAGACTATGAAGA................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TCATTACAGATGGTTGTGAGCCACCttaa....................................................................................................................................................................................................................................... 29 ttaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATCCCAGAGACTATGAAGAGTTGCAA............ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................CTTCGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTA.................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..................................................GTAAAAGTGAAGGAGGTAGTGGGACCTGt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 t 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTATCCCAGAGACTATGAAGAGTTGCA............. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TCAGATCTCATTACAGATGGTaga................................................................................................................................................................................................................................................... 24 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GTACACTGTAGCTGTCCTCTGAGGGAGTCAGAT..................................................................................................................................................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................AGGGAGTCAGATCTCATTACAGgtgt....................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gtgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AAGAAACTCGATGACACAATTCAGCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGAGACTATGAtta................... 16 tta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TGAAAGTACACTGTAGCTGggg..................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 ggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTAACCGCT.............................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCAGAGACTATGAAGAGTTGCAAG........... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................TCTTCGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTAA................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGAGTTGCAAGGAGTTACAAGG 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...............AGAAACTCGATGACACAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................TGGGACTTGAACTCAGGATCTTCGGAA...................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GTACACTGTAGCTGTCCTCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 10 0.30 0.30 - - - - - - - - - - - - 0.30 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................AACTCAGGATCTTCGGAAGAACA................................................................................................................................................................................................. 23 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................GAACTCAGGATCTTCGGAAGAACAG................................................................................................................................................................................................ 25 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGATCTTCGGAAGAAg.................................................................................................................................................................................................. 24 g 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGATCTTCGGAAGAA................................................................................................................................................................................................... 23 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TACACTGTAGCTGTCCTCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 10 0.20 0.20 0.10 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................ACACTGTAGCTGTCCTCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 11 0.09 0.09 - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TATTATATGAAAGTACACTGTAGCTGTCCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGAGCCACCATGTGGCTGCTGGGACTTGAA...................................................................................................................................................................................................................... 30 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGCCACCATGTGGCTGCTGGGACTTGAA...................................................................................................................................................................................................................... 28 14 0.07 0.07 - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTGACACAGAGTTAAAGAAACTCGATGACACAATTCAGCATGTCTATGAGGTAAAAGTGAAGGAGGTAGTGGGACCTGGCTGCCGGAGGGGCTGAGGAGCATGGCTCCGGTTCTCAGCCTGACTACTTTTTTTTTTTTTTAAAGATTTATTTATTTATTATATGAAAGTACACTGTAGCTGTCCTCTGAGGGAGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGCTGCTGGGACTTGAACTCAGGATCTTCGGAAGAACAGGCAGTGCTCCTAACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTCAGCCTGACTTCTTACAGTGGCTTCATTTTCACTTTTCCAGCATCACAGGCCAGGAGCTTTGGCTTCAGGCTTGTGATTCAGAACTGTTTTCTGTCTCTTCCCAGACTCTGTTGTCTATCCCAGAGACTATGAAGAGTTGCAAGGAGTTACAAGG
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((.....(((((.(((................))).(((((((((.(((((....))))).)))))))))......))))).....)))...........................................................
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................312................................................................................................411................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaa........................................................................................................................................................... 25 aa 34.00 0.00 6.00 6.00 7.00 4.00 2.00 - - 1.00 - 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaaa........................................................................................................................................................... 26 aaa 26.00 0.00 3.00 1.00 9.00 - - 1.00 - 1.00 - 2.00 1.00 2.00 2.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaaa........................................................................................................................................................... 27 aaa 20.00 0.00 6.00 9.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAa................................................................................................................................................................................................................................................. 29 a 10.00 0.00 - - - - 4.00 - 2.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTag........................................................................................................................................................... 27 ag 10.00 0.00 - - - 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaaaa........................................................................................................................................................... 27 aaaa 9.00 0.00 - 4.00 3.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................AGTCAGATCTCATTACAGAtctt.......................................................................................................................................................................................................................................................... 23 tctt 9.00 0.00 7.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGTCCTCTGAGGGAGTCAGATCTCATTACA............................................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 7.00 7.00 1.00 - - - 2.00 - 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTat........................................................................................................................................................... 27 at 7.00 0.00 2.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTgtat........................................................................................................................................................... 28 gtat 5.00 0.00 - 2.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaaaa........................................................................................................................................................... 28 aaaa 5.00 0.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCATCTCTCCAGCCCTCAGat........................................................................................................................................................ 23 at 4.00 0.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTtaaa........................................................................................................................................................... 27 taaa 4.00 0.00 1.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................AGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAaa................................................................................................................................................................................................................................................. 30 aa 4.00 0.00 - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GAGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAaa................................................................................................................................................................................................................................................. 31 aa 4.00 0.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTtaa........................................................................................................................................................... 26 taa 4.00 0.00 - 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaga........................................................................................................................................................... 26 aga 4.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTgg........................................................................................................................................................... 26 gg 3.00 0.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GTCCTCTGAGGGAGTCAGATCTCATTA.............................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGGGAGTCAGATCTCATTACAttct............................................................................................................................................................................................................................................................ 25 ttct 3.00 0.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTTTGGCTTCAGGCTTGTGATTCAGA........................................................................ 27 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCatt............................................................................................................................................................. 25 att 3.00 0.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTCAaa......................................................................................................................................................... 27 aa 3.00 0.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGAGCCATCTCTCCAGCCCTCaaa.......................................................................................................................................................... 25 aaa 3.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................AGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAaaa................................................................................................................................................................................................................................................. 31 aaa 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGGGAGTCAGATCTCATTACtttt............................................................................................................................................................................................................................................................. 24 tttt 2.00 0.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTCaaa.......................................................................................................................................................... 28 aaa 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TAACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTtt........................................................................................................................................................... 29 tt 2.00 0.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTag........................................................................................................................................................... 26 ag 2.00 0.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTtt........................................................................................................................................................... 28 tt 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTata........................................................................................................................................................... 26 ata 2.00 0.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTCaa.......................................................................................................................................................... 26 aa 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................CCTCTGAGGGAGTCAGATCTCATTACAGA.......................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GGGAGTCAGATCTCATTACAGActtt.......................................................................................................................................................................................................................................................... 26 cttt 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTagt........................................................................................................................................................... 27 agt 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTcttt........................................................................................................................................................... 28 cttt 2.00 0.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GTCCTCTGAGGGAGTCAGATCTCATTACA............................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaat........................................................................................................................................................... 27 aat 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGa.................................................................................................................................................................................................................................................. 28 a 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCATCTCTCCAGCCCaaaa............................................................................................................................................................ 21 aaaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTta........................................................................................................................................................... 25 ta 2.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................GGGAGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGg.................................................................................................................................................................................................................................................. 31 g 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGGGAGTCAGATCTCATTACAtcta............................................................................................................................................................................................................................................................ 25 tcta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................GAGGGAGTCAGATCTCATTACAcctg............................................................................................................................................................................................................................................................ 26 cctg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCata............................................................................................................................................................ 27 ata 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCaaa............................................................................................................................................................ 26 aaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGGGAGTCAGATCTCATTACAtctg............................................................................................................................................................................................................................................................ 25 tctg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGAGCCATCTCTCCAGCCCTCagaa.......................................................................................................................................................... 26 agaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCAGCCCTCAGCCTGACTTCTTA............................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................AGTCAGATCTCATTACAGAttt.......................................................................................................................................................................................................................................................... 22 ttt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTataa........................................................................................................................................................... 27 ataa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTAACCGCTGAGCCATCTCTactg................................................................................................................................................................... 27 actg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TAGCTGTCCTCTGAGGGAGTCAGATCTCA................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGGGAGTCAGATCTCATTACAGAttaa.......................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ttaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTgaaa........................................................................................................................................................... 30 gaaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGTCCTCTGAGGGAGTCAGATCTCATTAC............................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTggaa........................................................................................................................................................... 28 ggaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTgga........................................................................................................................................................... 27 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaag........................................................................................................................................................... 26 aag 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................GGGAGTCAGATCTCATTACAGActg.......................................................................................................................................................................................................................................................... 25 ctg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................GGAGTCAGATCTCATTACAaa............................................................................................................................................................................................................................................................ 21 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GGGAGTCAGATCTCATTACAagca............................................................................................................................................................................................................................................................ 24 agca 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTata........................................................................................................................................................... 28 ata 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGATCTTCGGAAGct..................................................................................................................................................................................................... 23 ct 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGGGAGTCAGATCTCATTACAaaaa............................................................................................................................................................................................................................................................ 25 aaaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................CCTCTGAGGGAGTCAGATCTCATTACA............................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTAACCGCTGAGCCATCTCactg.................................................................................................................................................................... 26 actg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaaat........................................................................................................................................................... 28 aaat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTGCTCCTAACCGCTGAGCCATCgt...................................................................................................................................................................... 27 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTagaa........................................................................................................................................................... 27 agaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TAACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTtc........................................................................................................................................................... 29 tc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTtc........................................................................................................................................................... 28 tc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GAGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGaa.................................................................................................................................................................................................................................................. 30 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................AGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAac................................................................................................................................................................................................................................................. 30 ac 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATCTCTCCAGCCCTga........................................................................................................................................................... 18 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................CTTGAACTCAGGATCTTCGGAAGAA................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGCTTTGGCTTCAGGCTTGTGATTCA.......................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GTTAAAGAAACTCGATGACACAATTCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GGGAGTCAGATCTCATTACAGATGGTaaaa...................................................................................................................................................................................................................................................... 30 aaaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCaat............................................................................................................................................................ 26 aat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................TAACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTtta........................................................................................................................................................... 30 tta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaat........................................................................................................................................................... 26 aat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTttt........................................................................................................................................................... 29 ttt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCaaaa............................................................................................................................................................ 27 aaaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................AGGGAGTCAGATCTCATTACAttc............................................................................................................................................................................................................................................................ 24 ttc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TAACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTta........................................................................................................................................................... 29 ta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................GAGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGgga.................................................................................................................................................................................................................................................... 29 gga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTtac........................................................................................................................................................... 25 tac 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTCAa......................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCaga............................................................................................................................................................. 26 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTatg........................................................................................................................................................... 27 atg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................AGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAag................................................................................................................................................................................................................................................. 30 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCGCTGAGCCATCTCTCcac.................................................................................................................................................................. 22 cac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................GAACTCAGGATCTTCGGAAGAACAGGCA............................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................AGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAat................................................................................................................................................................................................................................................. 30 at 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCTTTGGCTTCAGGCTTGTGATTCAGA........................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CTCAGCCTGACTACcatt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 catt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................GTCCTCTGAGGGAGTCAGATCTCATTACAt............................................................................................................................................................................................................................................................ 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GCTCCGGTTCTCAGCCTGACTACTT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGGGAGTCAGATCTCATTACAGAtctg.......................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tctg 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTAACCGCTGAGCCATCTCTCCAga................................................................................................................................................................ 28 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTgag........................................................................................................................................................... 27 gag 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTatc........................................................................................................................................................... 27 atc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTAACCGCTGAGCCATCTCTgac................................................................................................................................................................... 26 gac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaac........................................................................................................................................................... 27 aac 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................AGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGaaa.................................................................................................................................................................................................................................................... 28 aaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCATCTCTCCAGCCCaaag............................................................................................................................................................ 21 aaag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................AAAGTACACTGTAGCTGTCCTt.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGTa................................................................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTgcat........................................................................................................................................................... 28 gcat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................AGGGAGTCAGATCTCATTACAGAtg.......................................................................................................................................................................................................................................................... 25 tg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCagaa............................................................................................................................................................ 27 agaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTtga........................................................................................................................................................... 25 tga 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCTCTTCCCAGACTCTGTTGTCTA..................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTCtga.......................................................................................................................................................... 26 tga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCCTGACTTCTTAcggc............................................................................................................................................ 19 cggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGTCCTCTGAGGGAGTCAGATCTCATTA.............................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaaag........................................................................................................................................................... 27 aaag 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCtaa............................................................................................................................................................ 25 taa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TTAAAGAAACTCGATGACACAATTCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGCCCTCAGCCTGACTTCTTAa............................................................................................................................................ 25 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTAACCGCTGAGCCATCTCTCCaaca................................................................................................................................................................. 29 aaca 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTaaat........................................................................................................................................................... 27 aaat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTgta........................................................................................................................................................... 28 gta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................GGGACTTGAACTCAGGATCTTCGGAA...................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGAGGGAGTCAGATCTCATTACAGA.......................................................................................................................................................................................................................................................... 25 6 0.50 0.50 0.33 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGAGGGAGTCAGATCTCATTACAGATGG....................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGAGGGAGTCAGATCTCATTACA............................................................................................................................................................................................................................................................ 23 6 0.17 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGAGGGAGTCAGATCTCATTACAGATGGT...................................................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.17 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGAGGGAGTCAGATCTCATTACAG........................................................................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TATATGAAAGTACACTGTAGCTGTCCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGAGGGAGTCAGATCTCAT................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 9 0.11 0.11 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................CATGTGGCTGCTGGGACTTGAACTCAGGA............................................................................................................................................................................................................... 29 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10
.................................................................................................................................................................................................................................CATGTGGCTGCTGGGACTTGAACTCA.................................................................................................................................................................................................................. 26 11 0.09 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................CATGTGGCTGCTGGGACTTGAACTCAt.................................................................................................................................................................................................................. 27 t 0.09 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCCATCTCTCCAGCCCTCAGCCT..................................................................................................................................................... 26 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -