chr11:77996439 77996688 -
(13)
OTHER.mut 		(3)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(5)
PIWI.mut 		(54)
TESTES

Sense strand
AAATGGGGTTATACGCACCCACGTGATGGTACAACGGGTTAATTATCTTTGCCTGTGGTATCGTGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGAGACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCACATGCTGGCAGGACGGCCGGAAGGGGTCACTTTACGAATGCCACACTTAATTTTAATTGTCCTCTCCCAGCTCCTGCCCCTCCCAAAGCCGAAGCCAAAGCGAAGGCCTTGAAAGCTAAG
...........................................................(((((....)))))..............((((....))))..(((((.(((((...((.....(((..((....))...))).....)).))))).)))))..........................................................................................
...........................................................60.......................................................................................................165...................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGAGACCTGTGATGTCTTCAAA....................................................................................................................................... 52 1 759.00 759.00 481.00 278.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAG.................................................................................................................................................................. 24 1 326.00 326.00 - - - 37.00 40.00 - 27.00 40.00 2.00 1.00 - 14.00 - 13.00 29.00 18.00 3.00 38.00 27.00 - - 2.00 1.00 1.00 5.00 1.00 - 1.00 1.00 4.00 1.00 1.00 8.00 7.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGAGACCTGTGATGTCTTCAAAG...................................................................................................................................... 52 1 236.00 236.00 210.00 26.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAG.................................................................................................................................................................. 25 1 206.00 206.00 - - - 21.00 11.00 2.00 20.00 32.00 3.00 3.00 - 17.00 1.00 19.00 20.00 16.00 5.00 8.00 12.00 - - 3.00 2.00 1.00 - - - 1.00 1.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 31 1 201.00 201.00 - - - - - 28.00 - - 11.00 3.00 11.00 31.00 18.00 - - 17.00 - - - 8.00 1.00 21.00 14.00 - - 14.00 11.00 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 - 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 20 1 106.00 106.00 - - 20.00 37.00 4.00 6.00 13.00 - 3.00 6.00 3.00 - - - - - - - - - 3.00 - 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - -
..............................................................................................................TCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 18 1 84.00 84.00 - - 25.00 2.00 2.00 3.00 8.00 - 16.00 3.00 7.00 - 8.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 19 1 83.00 83.00 - - 18.00 - 2.00 7.00 1.00 - 35.00 - 2.00 - 5.00 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - -
................................................................................................GACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 32 1 77.00 77.00 - - 9.00 - - 10.00 - - 20.00 - 14.00 - 9.00 - - - - - - 11.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGA............................................................................................................................ 30 1 66.00 66.00 - - 2.00 6.00 14.00 3.00 12.00 - - - 3.00 1.00 2.00 6.00 1.00 - 3.00 - - - 3.00 - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGA............................................................................................................................ 29 1 51.00 51.00 - - 5.00 3.00 5.00 1.00 5.00 - - 2.00 - 3.00 1.00 2.00 1.00 3.00 3.00 2.00 2.00 - - 2.00 1.00 6.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGAT........................................................................................................................... 30 1 45.00 45.00 - - - 2.00 5.00 3.00 6.00 - - - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - 5.00 - - - - 2.00 3.00 3.00 9.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAA................................................................................................................................................................... 23 1 39.00 39.00 - - - 1.00 1.00 - - 12.00 - - - - - - - - 1.00 7.00 7.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 2.00 1.00 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GATGTCTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 25 1 39.00 39.00 - - 2.00 - 5.00 7.00 - - - 1.00 10.00 1.00 1.00 - - - 2.00 - - - 2.00 3.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 17 3 30.67 30.67 - - 16.67 - 1.00 1.67 0.33 - 1.33 5.67 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TGTCTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 23 1 30.00 30.00 - - 5.00 - - 9.00 - - - 9.00 1.00 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ATGTCTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 24 1 30.00 30.00 - - 4.00 - 1.00 6.00 1.00 - - 4.00 5.00 - 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGAT........................................................................................................................... 31 1 29.00 29.00 - - - - - 3.00 1.00 - - - 2.00 3.00 4.00 1.00 1.00 3.00 - - - 6.00 - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 26 1 26.00 26.00 - - 1.00 - - 7.00 - - 8.00 2.00 2.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TCTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 21 1 21.00 21.00 - - 9.00 - - 4.00 - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TCAAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 20 1 21.00 21.00 - - 3.00 - 1.00 2.00 1.00 - - 5.00 1.00 - - - - - - - - 3.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAA................................................................................................................................................................... 24 1 20.00 20.00 - - - 1.00 2.00 - - 6.00 - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 2.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 27 1 19.00 19.00 - - - - - 5.00 - - - 10.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CTCCTGAGACCTGTGATGTC............................................................................................................................................. 20 1 17.00 17.00 - - - 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 9.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGAGA........................................................................................................................................................ 34 1 16.00 16.00 - - 6.00 - - 2.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGA.................................................................................................................................................................... 22 1 15.00 15.00 - - - - 4.00 - 1.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGA.................................................................................................................................................................... 23 1 13.00 13.00 - - - 1.00 - - 2.00 3.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGT................................................................................................................................................................. 25 1 12.00 12.00 - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - 2.00 - 1.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TCAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 19 1 12.00 12.00 - - 6.00 - 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGAACCACTGATGCAC....................................................................................................................... 18 1 11.00 11.00 - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................AAAGGAACCACTGATGCAC....................................................................................................................... 19 1 11.00 11.00 - - 6.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................AAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 18 2 11.00 11.00 - - 1.50 - - - - - - 6.50 - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................AAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 17 4 11.00 11.00 - - 4.50 0.25 1.50 - 1.00 - - 0.25 0.50 - 0.25 0.75 0.25 - - - - - 1.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CAAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 19 2 10.50 10.50 - - 2.50 - - 1.50 - - - 3.00 0.50 - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 27 1 10.00 10.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 7.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TGTCTTCAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 24 1 9.00 9.00 - - 8.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GTCTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 22 1 9.00 9.00 - - - - 1.00 1.00 - - - 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 25 1 9.00 9.00 - - 6.00 - - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTCAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 20 1 9.00 9.00 - - 4.00 - 2.00 - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGAGA........................................................................................................................................................ 31 1 9.00 9.00 - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GTCTCCTGAGACCTGTGATGTC............................................................................................................................................. 22 1 8.00 8.00 - - - 4.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAAT........................................................................................................................................................................ 19 1 8.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - -
......................................................................................................TGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 28 1 8.00 8.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 18 3 7.67 7.67 - - 5.00 - - - - - - 0.67 1.00 - - - 0.33 - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CTTCAAAGGAACCACTGATGCAC....................................................................................................................... 23 1 7.00 7.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAAT........................................................................................................................................................................ 18 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AAGTCTCCTGAGACCTGTGATGTC............................................................................................................................................. 24 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGAa........................................................................................................................... 30 a 7.00 51.00 - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................AGTCTCCTGAGACCTGTGATGTC............................................................................................................................................. 23 1 7.00 7.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGT................................................................................................................................................................. 26 1 7.00 7.00 - - - 1.00 - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 29 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTCAAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 21 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CTTCAAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 22 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................ATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGAGA........................................................................................................................................................ 30 1 6.00 6.00 - - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 30 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CTTCAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 21 1 6.00 6.00 - - - 4.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTC................................................................................................................................................................ 27 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................TGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AGGAACCACTGATGCAC....................................................................................................................... 17 1 5.00 5.00 - - - - 3.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGA.......................................................................................................................................................... 32 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...........................................................................................................TCTTCAAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 23 1 5.00 5.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................AAAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 16 7 4.43 4.43 - - 0.43 0.29 1.43 - 0.14 - - - 0.57 - 0.29 0.43 0.71 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTG............................................................................................................................. 29 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CAAAGGAACCACTGATGCAC....................................................................................................................... 20 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 17 4 3.50 3.50 - - 0.75 - - 0.25 - - - 1.25 0.25 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGAACCACTGATG.......................................................................................................................... 15 12 3.42 3.42 - - 0.33 - 1.00 0.25 0.08 - - - - - 0.08 0.42 0.42 - - - - 0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 16 7 3.29 3.29 - - 0.71 - 1.57 - 0.14 - - - 0.14 - - 0.43 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GTCTTCAAAGGAACCACTGATGCAC....................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTa................................................................................................................................................................ 27 a 3.00 7.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GGAACCACTGATGCAC....................................................................................................................... 16 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGATGGAAAAAATCTGAAG.................................................................................................................................................................. 19 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTGATGTCTTCAAAGGAAC.................................................................................................................................. 19 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGAGA........................................................................................................................................................ 35 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AGGAACCACTGATGCACATGCTGGC............................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GTCTTCAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTG............................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTG........................................................................................................................................................... 31 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................CTGAAGTCTCCTGAGACCTGTGATGTCTTC.......................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGAG......................................................................................................................................................... 33 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAa.................................................................................................................................................................. 24 a 3.00 39.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................AATCTGAAGTCTCCTGAGACCTGTGATGTC............................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TCGTGCATATGATGGAAAAAATCTGA.................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCT............................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................CTGAGACCTGTGATGTC............................................................................................................................................. 17 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TCTTCAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GTCTTCAAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................AAAAAATCTGAAGTCTCCTGAGA........................................................................................................................................................ 23 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GTGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGT................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTG..................................................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCC............................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTCAAAGGAACCACTGATGCACATGCT.................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CAAAGGAACCACTGATGCACATGCTGGC............................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TCAAAGGAACCACTGATGCACATGCTG................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..............................................................................................................TCAAAGGAACCACTGATGCAa....................................................................................................................... 21 a 2.00 21.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AAATCTGAAGTCTCCTGAGACCTGTGATGTC............................................................................................................................................. 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CTTCAAAGGAACCACTGATGCAa....................................................................................................................... 23 a 2.00 6.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CTTCAAAGGAACCACTG............................................................................................................................. 17 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CAAAGGAACCACTGATGCACATGC................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTCAAAGGAACCACTGAT........................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TATGATGGAAAAAATCTGA.................................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGATGTCTTCAAAGGAACCACTGAT........................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTC.............................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTC................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTG..................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTtatg.......................................................................................................................... 31 tatg 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 15 10 1.10 1.10 - - 0.10 - 0.70 - 0.10 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTtaag.................................................................................................................................................................. 25 taag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GTGCATATGATGGAAAAAATCTGAA................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CTCCTGAGACCTGTGATGTCTTa.......................................................................................................................................... 23 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TATGATGGAAAAAATCTG..................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 34 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................ATGATGGAAAAAATCTGAAG.................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ATGTCTTCAAAGGAACCACTGA............................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TGGAAAAAATCTGAAGT................................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................AGTCTCCTGAGACCTGTGATGTCT............................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGAGAC....................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TTATCTTTGCCTGTGGTATCGTGCAT...................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCT............................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCC............................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TCTGAAGTCTCCTGAGACCTGTGATGTC............................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TCTGAAGTCTCCTGAGACC...................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCAg....................................................................................................................... 30 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGA.......................................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTGATGTCTTCAAAGGAACCAC............................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CATATGATGGAAAAAATCTGAAG.................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGgag.................................................................................................................................................................. 25 gag 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGaa................................................................................................................................................................ 27 aa 1.00 206.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTCAAAGGAACCACTGATGCAC....................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GGAACCACTGATGCACATGCTGGCAGGAC.......................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAA.......................................................................................................................................................................... 16 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................CTGAAGTCTCCTGAGACC...................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTag............................................................................................................................................................... 27 ag 1.00 12.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTtat........................................................................................................................... 31 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTCAAAGGAACCACTGATGCAa....................................................................................................................... 22 a 1.00 6.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TCTTTGCCTGTGGTATCGTGCATAT.................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAA......................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................CCTGAGACCTGTGATGT.............................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CTCCTGAGACCTGTGATGT.............................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATC....................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAA......................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAAg........................................................................................................................................................................ 18 g 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGgtg.......................................................................................................................... 31 gtg 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................ATATGATGGAAAAAATCTGAAGT................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TGGAAAAAATCTGAAGTCTC.............................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCAg....................................................................................................................... 28 g 1.00 19.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAaa................................................................................................................................................................. 26 aa 1.00 20.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TCAAAGGAACCACTGAT........................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TGTCTTCAAAGGAACCACTGA............................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCAC............................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCAC....................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TCCTGAGACCTGTGATGTCT............................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGA............................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GTCTTCAAAGGAACCACTGAT........................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GATGTCTTCAAAGGAACCACT.............................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGA.......................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCAatga............................................................................................................................ 29 atga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................ATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGA.......................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................ATGATGGAAAAAATCTGAA................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TAATTTTAATTGTCCTCTCCCAG.................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAt.................................................................................................................................................................. 25 t 1.00 20.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................ATGGAAAAAATCTGAAGTC................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCA................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TGGTACAACGGGTTAATTATCTTTtccc.................................................................................................................................................................................................... 28 tccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TCTCCTGAGACCTGTGATG............................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGa................................................................................................................................................................. 26 a 1.00 206.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TATGATGGAAAAAATCTGAAG.................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGAT........................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCT............................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGA.................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCa............................................................................................................................................................... 27 a 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATa....................................................................................................................................................................... 20 a 1.00 8.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGC......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGgag.................................................................................................................................................................. 24 gag 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGGCAGGACGGCCGGAAGGGGTCACT......................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GACCTGTGATGTCTTCAA........................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATCTGAAGTCTCCTGAGACCTGTGATGTC............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATt.......................................................................................................................... 31 t 1.00 45.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAgg.................................................................................................................................................................. 24 gg 1.00 15.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CTTCAAAGGAACCACTGATGCACATGCTGGCAGG............................................................................................................ 34 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TCTTCAAAGGAACCACTGATGCAC....................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGCCACACTTAATTTTAATTGTCCTCTC...................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CTTCAAAGGAACCACTGAT........................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGcag.................................................................................................................................................................. 24 cag 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................ATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCT............................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCC............................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TCAAAGGAACCACTGATGCACATGC................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTa................................................................................................................................................................ 26 a 1.00 12.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGAGA........................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGATGCACATGCTGGCAGGACGGCCG..................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGAGA........................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AAATCTGAAGTCTCCTGAG......................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTG........................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TTATCTTTGCCTGTGGTATCGTGCATA..................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTaa............................................................................................................................................................... 27 aa 1.00 12.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GATGTCTTCAAAGGAACCACTGA............................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTcatg.......................................................................................................................... 31 catg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGctg.......................................................................................................................... 31 ctg 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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..................................................................................................................AGGAACCACTGATGCA........................................................................................................................ 16 4 0.50 0.50 - - 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................ATGATGGAAAAAATCTG..................................................................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...............................................................................................................CAAAGGAACCACTGATGCg........................................................................................................................ 19 g 0.33 7.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TCCCAAAGCCGAAGCCAAAGCGAAGGCCTT.......... 30 16 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 0.12 - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TCCCAAAGCCGAAGCCAAAGCGAAGGCCT........... 29 16 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 0.06 -
............................................................................................................................................................................................................TGCCCCTCCCAAAGCCGAAGCCAAAGC................... 27 17 0.12 0.12 - - - 0.06 - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGCCCCTCCCAAAGCCGAAGCCAAAGCG.................. 28 17 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GCCGAAGCCAAAGCGAAGGCCTTGAAAGC.... 29 15 0.07 0.07 - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AAAGCCGAAGCCAAAGCGAAGGC............. 23 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AAAGCCGAAGCCAAAGCGAAGGCC............ 24 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGCCCCTCCCAAAGCCGAAGCCAAAGCt.................. 28 t 0.06 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGCCCCTCCCAAAGCCGAAGCCAAAGCGAt................ 30 t 0.06 0.35 - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGCTCCTGCCCCTCCCAAAGCCGAAG.......................... 26 17 0.06 0.06 - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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..................................................................................................................................................................................................................TCCCAAAGCCGAAGCCAAAGCGAAGG.............. 26 17 0.06 0.06 - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTGCCCCTCCCAAAGCCGAAGCCAAAGCG.................. 29 17 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AGCCGAAGCCAAAGCGAAGG.............. 20 17 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGCCCCTCCCAAAGCCGAAGCCAAAGCGAA................ 30 17 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GCCCCTCCCAAAGCCGAAGCCAAAGCGA................. 28 17 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CCTGCCCCTCCCAAAGCCGAAGCC........................ 24 19 0.05 0.05 - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTGCCCCTCCCAAAGCCGAAGCCAAAG.................... 27 19 0.05 0.05 - - - - - - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AAATGGGGTTATACGCACCCACGTGATGGTACAACGGGTTAATTATCTTTGCCTGTGGTATCGTGCATATGATGGAAAAAATCTGAAGTCTCCTGAGACCTGTGATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCACATGCTGGCAGGACGGCCGGAAGGGGTCACTTTACGAATGCCACACTTAATTTTAATTGTCCTCTCCCAGCTCCTGCCCCTCCCAAAGCCGAAGCCAAAGCGAAGGCCTTGAAAGCTAAG
...........................................................(((((....)))))..............((((....))))..(((((.(((((...((.....(((..((....))...))).....)).))))).)))))..........................................................................................
...........................................................60.......................................................................................................165...................................................................................
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Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
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18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR037900(GSM510436)
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mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
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Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
.......................................................................................................GATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCAC....................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGCCCCTCCCAAAGCCGAAGCCAAAta..................... 27 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GCCTGTGGTATCGTGCATATGATGGA.............................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................AAAGCGAAGGCCTTGAAAGCTAAtt. 25 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................CCGAAGCCAAAGCGAAGGCCTTGAAA...... 26 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GCTCCTGCCCCTCCCAAAGCCGAAGCCAA...................... 29 19 0.05 0.05 - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -