chr11:77995046 77995295 -
(13)
OTHER.mut 		(4)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(53)
TESTES

Sense strand
TTGACTGTAAATGGGAAGTTGAGCCCATAGTGGTTTGGGTGCATGTGATGACATTATTTAGCGACCAAAGTCTGATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCACCTATTCTTTCCTAGTCTGGTTCTAAAGTAAACCATGTGTTGAATGCTGGCACCAGGGCAGCTAACTCCATTTTCCTCTCCCATCTCTCCCTAGGCTTGACCACTATGCTATCATCAAATTCCCACTGACCACGGAGTCAGCCA
...................................................((((.((((..(((....)))...))))))))...((((((........))).)))...............................................................................................................................................
..................................................51.......................................................108............................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 29 1 1030.00 1030.00 83.00 169.00 113.00 122.00 170.00 5.00 20.00 57.00 36.00 2.00 48.00 16.00 10.00 20.00 20.00 33.00 15.00 2.00 - 13.00 19.00 12.00 1.00 11.00 1.00 8.00 9.00 - - 1.00 1.00 6.00 - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 28 1 501.00 501.00 36.00 63.00 40.00 64.00 36.00 6.00 4.00 18.00 23.00 - 30.00 6.00 51.00 21.00 4.00 18.00 11.00 - - 14.00 13.00 8.00 1.00 - 4.00 11.00 4.00 - - 5.00 1.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 24 1 155.00 155.00 42.00 - 14.00 9.00 1.00 3.00 25.00 - 8.00 - - 13.00 2.00 12.00 5.00 - 2.00 - - 3.00 - - 1.00 14.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 30 1 80.00 80.00 12.00 4.00 22.00 14.00 2.00 2.00 10.00 5.00 - - - - 1.00 2.00 1.00 1.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................AAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 27 1 68.00 68.00 35.00 - 10.00 2.00 1.00 - - 3.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - 2.00 2.00 2.00 - 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GATGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 25 1 68.00 68.00 8.00 - 7.00 11.00 - 1.00 13.00 - 12.00 - - 4.00 1.00 6.00 - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 21 1 67.00 67.00 10.00 - 8.00 - - 7.00 17.00 1.00 1.00 - - 8.00 - 5.00 4.00 1.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 23 1 65.00 65.00 11.00 - 7.00 2.00 - 3.00 6.00 - 8.00 3.00 1.00 5.00 - 4.00 4.00 - 7.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 22 1 56.00 56.00 - - 2.00 1.00 - 25.00 2.00 - - 7.00 1.00 8.00 - 1.00 4.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 21 1 44.00 44.00 - - 4.00 6.00 - 4.00 - - - 18.00 1.00 3.00 - 1.00 3.00 - 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGCGACCAAAGTCTGATAAAGATGATTGTGATC.............................................................................................................................................................. 52 1 41.00 41.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 39.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 29 1 37.00 37.00 6.00 - 7.00 15.00 2.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GATTGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 24 1 34.00 34.00 - - - - - 10.00 - - - 12.00 - 1.00 - - - 1.00 - 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGATTGTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 25 1 33.00 33.00 1.00 - 3.00 1.00 - 12.00 6.00 - 5.00 - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTtatg.................................................................................................................................................. 29 tatg 32.00 1.00 - 7.00 - - 12.00 - - 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 19 1 30.00 30.00 2.00 - 2.00 3.00 - - 3.00 1.00 2.00 1.00 1.00 7.00 2.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 20 1 30.00 30.00 - - 1.00 2.00 - - 7.00 3.00 - 3.00 - 9.00 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................ATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 30 1 29.00 29.00 9.00 1.00 8.00 - - - - 1.00 - - - 3.00 - - 1.00 - 2.00 - - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGATTGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 25 1 28.00 28.00 - - - - - 3.00 - - 6.00 9.00 - 3.00 - - 2.00 - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGAT................................................................................................................................................... 28 1 27.00 27.00 2.00 3.00 2.00 7.00 3.00 - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................TGATTGTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 24 1 26.00 26.00 - - 1.00 - - 14.00 8.00 - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 30 1 25.00 25.00 1.00 - - 2.00 1.00 5.00 - 6.00 4.00 - - 2.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 22 1 25.00 25.00 5.00 - 2.00 - - - 5.00 - - - 2.00 6.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATt.................................................................................................................................................. 29 t 21.00 27.00 - 9.00 - - 6.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCAa............................................................................................................................................... 31 a 19.00 25.00 - 3.00 4.00 1.00 2.00 - - 4.00 - - 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 18 1 18.00 18.00 - - 2.00 1.00 - 3.00 - - - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 3.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATTGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 23 1 15.00 15.00 - - 1.00 - - 1.00 2.00 - - 7.00 - - - 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 19 1 15.00 15.00 - - - - - 8.00 - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GATGATTGTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 26 1 14.00 14.00 - - - - - 6.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 26 1 13.00 13.00 - - 1.00 - - - - - - 5.00 - - 2.00 - - - - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTGTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 21 1 12.00 12.00 - - - - - 7.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATTGTGATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 24 1 11.00 11.00 - - - - - 4.00 - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATt.................................................................................................................................................. 28 t 11.00 6.00 - 3.00 - - 5.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGCGACCAAAGTCTGA............................................................................................................................................................................... 35 1 10.00 10.00 - - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 31 1 10.00 10.00 1.00 - 3.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 32 1 10.00 10.00 - - - - - - - - 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 27 1 9.00 9.00 - - 4.00 - - 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTT............................................................................................................................................................................................... 20 1 9.00 9.00 - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGa................................................................................................................................................. 30 a 9.00 1030.00 1.00 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTTA.............................................................................................................................................................................................. 21 1 9.00 9.00 - - - - - - - - - - 2.00 - 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTT............................................................................................................................................................................................... 19 1 9.00 9.00 - - - - - - - 4.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGCGAC......................................................................................................................................................................................... 25 1 8.00 8.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGCG........................................................................................................................................................................................... 23 1 8.00 8.00 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTAT................................................................................................................................................................................................. 18 1 8.00 8.00 - - - - - - - 4.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATT................................................................................................................................................................................................ 19 1 8.00 8.00 - - - - - - - 4.00 - - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 19 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - 3.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GATTGTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 23 1 7.00 7.00 1.00 - - - - - 3.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGCGACCAAAG.................................................................................................................................................................................... 30 1 7.00 7.00 1.00 1.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 27 1 7.00 7.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGA.................................................................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTTAGCGACCAAAGTCTGATAAAGATGATTGTGAT............................................................................................................................................................... 52 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTtatg.................................................................................................................................................. 28 tatg 6.00 2.00 - 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGAT................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTA.............................................................................................................................................................................................. 20 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
........................................................................................GATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 19 1 6.00 6.00 - - - - - 4.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTG......................................................................................................................................................... 21 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGTGATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 22 1 5.00 5.00 - - - 1.00 - 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 20 1 5.00 5.00 - - - - - 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCAa............................................................................................................................................... 27 a 5.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATa................................................................................................................................................................................................ 19 a 5.00 8.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - 1.00 - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 16 3 5.00 5.00 0.67 - - 1.00 - 0.33 - - - - - 0.33 - 1.67 0.33 - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATTGTGATCTATTGTCTGAT................................................................................................................................................... 20 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGATTGTGATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - - - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGA.................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTG..................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTGTGATCTATTGTCTGATGCAa............................................................................................................................................... 23 a 4.00 56.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATa.................................................................................................................................................. 29 a 4.00 27.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................ACCAAAGTCTGATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 41 1 4.00 4.00 - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................ATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 32 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GATTGTGATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTA.................................................................................................................................................................................................. 17 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAG............................................................................................................................................................................................. 21 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GATAAAGATGATTGTGAT............................................................................................................................................................... 18 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGCGA.......................................................................................................................................................................................... 24 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 15 6 3.33 3.33 0.17 - 1.50 1.33 - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCAa............................................................................................................................................... 28 a 3.00 7.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTtatt.................................................................................................................................................. 28 tatt 3.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTTAGC............................................................................................................................................................................................ 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GTCTGATAAAGATGATTGTGATCTAT........................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................AAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GATGATTGTGATCTATTGTCTGA.................................................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGttg.................................................................................................................................................. 29 ttg 3.00 4.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATT................................................................................................................................................................................................ 18 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTTAGCGAC......................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATTGTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 22 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGATTGTGATCTATTGTCTGA.................................................................................................................................................... 21 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTGTGATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 31 1 3.00 3.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GTCTGATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 35 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................CTGATAAAGATGATTGTGATCT............................................................................................................................................................. 22 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGATTGTGATCTATTGTC....................................................................................................................................................... 21 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................ATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 31 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTcatg.................................................................................................................................................. 29 catg 3.00 1.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 17 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 31 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTtatt.................................................................................................................................................. 29 tatt 3.00 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGCGACCAAAGTCTGAT.............................................................................................................................................................................. 36 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGttt.................................................................................................................................................. 29 ttt 2.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATc.................................................................................................................................................. 29 c 2.00 27.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATtc................................................................................................................................................. 30 tc 2.00 27.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTTAGCGACCAAAG.................................................................................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................ATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCT...................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................AAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATc.................................................................................................................................................. 27 c 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTTAG............................................................................................................................................................................................. 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTAGCGACCAAAGTCTGA............................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTAT........................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GATAAAGATGATTGTGATC.............................................................................................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGa................................................................................................................................................. 29 a 2.00 501.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTTAGCGACCAAAGTCT................................................................................................................................................................................. 34 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGT........................................................................................................................................................ 22 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTC....................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................ATTTAGCGACCAAAGTCTGATA............................................................................................................................................................................. 22 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................ATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 15 5 1.20 1.20 0.20 - - 0.60 - - - - - - - - - 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGATTGTGATCTATTGTCTGAcg.................................................................................................................................................. 24 cg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGaa........................................................................................................................................................................................... 23 aa 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GACCAAAGTCTGATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 42 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GATTGTGATCTATTGTCTGATGCcc............................................................................................................................................... 25 cc 1.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GATTGTGATCTATTGTCTGATt.................................................................................................................................................. 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..........................................ATGTGATGACATTATTTAGC............................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGATCTATTGTCTGATGa................................................................................................................................................. 18 a 1.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGAa................................................................................................................................................... 27 a 1.00 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTtttg.................................................................................................................................................. 29 tttg 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGatg...................................................................................................................................................... 25 atg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGCGACC........................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................AAAGTCTGATAAAGATGATTGTG................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................ATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 16 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TGATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTtat................................................................................................................................................... 31 tat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGATTGTGATCTATTGTCTGATGaac............................................................................................................................................... 27 aac 1.00 155.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................AAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGAag.................................................................................................................................................. 29 ag 1.00 7.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTGTGATCTATTGTCTGATGaa................................................................................................................................................ 22 aa 1.00 30.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCg................................................................................................................................................ 31 g 1.00 80.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTatg................................................................................................................................................... 28 atg 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGCGACCAA...................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GATGATTGTGATCTATTGTCTGATGaaa............................................................................................................................................... 28 aaa 1.00 68.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTtttt.................................................................................................................................................. 29 tttt 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GATCTATTGTCTGATGCAa............................................................................................................................................... 19 a 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTGTGATCTATTGTCTG..................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTGTGATCTATTGTCTGATt.................................................................................................................................................. 20 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCatg.................................................................................................................................................... 26 atg 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 33 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTt......................................................................................................................................................... 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TTATTTAGCGACCAAAGTCTGAaa............................................................................................................................................................................. 24 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGTGTTGAATGCTGGCACCAGGGCAG................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GATAAAGATGATTGTGATCT............................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................CCAAAGTCTGATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATG.................................................................................................................................................. 40 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GATGATTGTGATCTATTGTCTGAT................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTTAGCG........................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGCGAacaa...................................................................................................................................................................................... 28 acaa 1.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................GATGACATTATTTAGCGACCAAAGTCTGATA............................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGCGACCA....................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCAa............................................................................................................................................... 29 a 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGaaa.......................................................................................................................................................................................... 24 aaa 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GCGACCAAAGTCTGATAAAGATG....................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGATTGTGATCTATTGTCTGATGCACCTATT.......................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GTCTGATAAAGATGATTGTG................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................AGTCTGATAAAGATGATTGTGATCTAT........................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGCGACCAAAa.................................................................................................................................................................................... 30 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................AAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCagat................................................................................................................................................... 28 agat 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................ACCAAAGTCTGATAAAGATGATTGTG................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTTAGCGACC........................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................AAGATGATTGTGATCTATT.......................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCAg............................................................................................................................................... 31 g 1.00 25.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GTGCATGTGATGACATTATa................................................................................................................................................................................................ 20 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................AAGATGATTGTGATCTATTGTCTG..................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTtt........................................................................................................................................................ 23 tt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................AAGATGATTGTGATCTATTGTCTtatg.................................................................................................................................................. 27 tatg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTa............................................................................................................................................................................................... 20 a 1.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGATCTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAtcg........................................................................................................................................................................................... 23 tcg 1.00 6.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGATTGTGATCTATTGTCTGATt.................................................................................................................................................. 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGATCTATTGTCTGATGC................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGgtgc................................................................................................................................................. 30 gtgc 1.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGttgc................................................................................................................................................. 30 ttgc 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTGTGATCTATTGTCTGAT................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATtcac............................................................................................................................................... 31 tcac 1.00 6.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTG..................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................CTGATAAAGATGATTGTGATC.............................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TTATTTAGCGACCAAAGTCTGAT.............................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GTGATCTATTGTCTGAT................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GCGACCAAAGTCTGATAAAGAT........................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TCTGATAAAGATGATTGTGATCTATT.......................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTgatg......................................................................................................................................................... 22 gatg 1.00 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GCGACCAAAGTCTGATAAAGA......................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGAcg.................................................................................................................................................. 29 cg 1.00 7.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................ACATTATTTAGCGACCAAAGTCTGATAAAG.......................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATTTAGa............................................................................................................................................................................................ 22 a 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCatg.................................................................................................................................................... 27 atg 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GATGATTGTGATCTATTG......................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCACC.............................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTaatg.................................................................................................................................................. 29 aatg 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATTGTGATCTATTGTCTGATt.................................................................................................................................................. 21 t 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCT...................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTaatt.................................................................................................................................................. 28 aatt 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATTGTGATCTATTGTCTGATGCACCTATT.......................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCA................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GTCTGATAAAGATGATTGTGATa.............................................................................................................................................................. 23 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGttg.................................................................................................................................................. 28 ttg 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GTCTGATAAAGATGATTGTGAaaa............................................................................................................................................................. 24 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TTTAGCGACCAAAGTCTGATAAAGATGATTGTG................................................................................................................................................................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................ATTTAGCGACCAAAGTCTGATg............................................................................................................................................................................. 22 g 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGATTGTGATCTATTGTCTGAT................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGctg.................................................................................................................................................. 29 ctg 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATTGTGATCTATTGTCTGctg.................................................................................................................................................. 21 ctg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTTAGCGACCA....................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCT............................................................................................................................................................. 17 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATtca................................................................................................................................................ 31 tca 1.00 27.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................AAGATGATTGTGATCTATTGTCTGAT................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GTGCATGTGATGACATTATTTAG............................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TGCATGTGATGACATTATTTAGCGACCAAAGTC.................................................................................................................................................................................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTAT................................................................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TGGGTGCATGTGATGACATTATTT............................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GTGCATGTGATGACATTATTTAGCGACC........................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................AAAGTCTGATAAAGATGATTGTGATCTA............................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATTATaa............................................................................................................................................................................................... 19 aa 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................ATAAAGATGATTGTGATCTATTG......................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGgtg.................................................................................................................................................. 28 gtg 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTATTGTC....................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TCATCAAATTCCCACTGACCACGGAGTC..... 28 4 0.75 0.75 - - - - - - - 0.50 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGCTATCATCAAATTCCCACTGACCACGGA........ 30 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATC.............................................................................................................................................................. 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TATTGTCTGATGCACC.............................................................................................................................................. 16 4 0.50 0.50 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................CTGATAAAGATGATTGT.................................................................................................................................................................. 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGACATTATTTAGCGA.......................................................................................................................................................................................... 16 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................CTATTGTCTGATGCAC............................................................................................................................................... 16 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................ATAAAGATGATTGTGAT............................................................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GTGTTGAATGCTGGCA............................................................................................ 16 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAAAGATGATTGTGATCT............................................................................................................................................................. 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGATCTgttg......................................................................................................................................................... 21 gttg 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................ATAAAGATGATTGTGA................................................................................................................................................................ 16 5 0.40 0.40 - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGCTATCATCAAATTCCCACTGACCACGG......... 29 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TATGCTATCATCAAATTCCCACTGACC............. 27 15 0.27 0.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................ATCAAATTCCCACTGACCACGGAGTC..... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 -
................................................................................................................................................................................................................................ATTCCCACTGACCACGGAG....... 19 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CTATCATCAAATTCCCACTGACCACGGA........ 28 4 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................CCACTGACCACGGAGTCAGCC. 21 4 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TATCATCAAATTCCCACTGACCACGGAGTC..... 30 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGCTATCATCAAATTCCCACTGACCAC........... 27 16 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - 0.06
.......................................TGCATGTGATGACAT.................................................................................................................................................................................................... 15 12 0.25 0.25 0.08 - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TATCATCAAATTCCCACTGACCACGGAGT...... 29 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................ATCAAATTCCCACTGACCACGG......... 22 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TATGCTATCATCAAATTCCCACTGACCA............ 28 15 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - 0.07 - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - -
...................................................................................ATTGTGATCTATTGT........................................................................................................................................................ 15 7 0.14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TATGCTATCATCAAATTCCCACTGACCAC........... 29 14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCATGTGATGACATT................................................................................................................................................................................................... 15 7 0.14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CCACTATGCTATCATCAAATTCCCACTG................ 28 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTGACCACTATGCTATCATCAAATTCCCA................... 29 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CCACTATGCTATCATCAAATTCCCACT................. 27 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AAAGATGATTGTGAT............................................................................................................................................................... 15 17 0.06 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................ATGCTATCATCAAATTCCCA................... 20 18 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TTGACTGTAAATGGGAAGTTGAGCCCATAGTGGTTTGGGTGCATGTGATGACATTATTTAGCGACCAAAGTCTGATAAAGATGATTGTGATCTATTGTCTGATGCACCTATTCTTTCCTAGTCTGGTTCTAAAGTAAACCATGTGTTGAATGCTGGCACCAGGGCAGCTAACTCCATTTTCCTCTCCCATCTCTCCCTAGGCTTGACCACTATGCTATCATCAAATTCCCACTGACCACGGAGTCAGCCA
...................................................((((.((((..(((....)))...))))))))...((((((........))).)))...............................................................................................................................................
..................................................51.......................................................108............................................................................................................................................
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small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
..............................................................................................TTGTCTGATGCACCTATTCTTTCCTA.................................................................................................................................. 26 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................CACCTATTCTTTCCTAGTCTGGTTCTA....................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...............................................................................................................TCTTTCCTAGTCTGGTTCTAAAGTAAACCA............................................................................................................. 30 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.................................................................................................................TTTCCTAGTCTGGTTCTAAAGTAAACCA............................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGCACCTATTCTTTCCTAGTCTGGTTCTA....................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................GATGCACCTATTCTTTCCTAGTCTGGTTCTA....................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...........................................................................................CTATTGTCTGATGCACCTATTCTTTCCTA.................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TTGACCACTATGCTATCATCAAATTacat....................... 29 acat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGCTTGACCACTATGCTATCATC............................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GCACCAGGGCAGCTAtttt................................................................................ 19 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................ACCTATTCTTTCCTAGTCTGGTTCTA....................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GTCTGATGCACCTATTCTTTCCTAGTC............................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................................................................................................CCTATTCTTTCCTAGTCTGGTTCTAAA..................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GTCTGATGCACCTATTCTTTCCTAGTCTGG............................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GCAGCTAACTCCATTTTCCTCTCCCA............................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................CTAGGCTTGACCACTATGCTATCATC............................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GTCTGATGCACCTATTCTTTCCTA.................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TCTTTCCTAGTCTGGTTCTAAAGT................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................AATGCTGGCACCAGGGCAGCTAACTCCA.......................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.........................................................................................................CTATTCTTTCCTAGTCTGGTTCTAAAGTAaa.................................................................................................................. 31 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................CCAGGGCAGCTAACTCCATTTTCCTC.................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TTCTTTCCTAGTCTGGTTCTAAAGTAAACCA............................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TATTCTTTCCTAGTCTGGTTCTA....................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CACCTATTCTTTCCTAGTCTGGTTCTAt....................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ATGCTGGCACCAGGGCAGCTAACTCCA.......................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GCTATCATCAAATTCCCACTGACCAga............ 27 ga 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................CACCTATTCTTTCCTAGTCTGGTTCTAAA..................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.............................................................................................................................GTTCTAAAGTAAACCATGTGTTGAATGCT................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGAGCCCATAGTGGTTTGGGTGCATGTGAT......................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GACCAAAGTCTGATAAAGATGATTGTGATC.............................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................ATGCACCTATTCTTTCCTAGTCTGGTTCTA....................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................ATGCTATCATCAAATTCCCACTGACCACGG......... 30 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GCTATCATCAAATTCCCACTGACCAC........... 26 17 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GCTTGACCACTATGCTATCATCAAATT....................... 27 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CCACTATGCTATCATCAAATTCCCAC.................. 26 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -