(1)
OTHER.ip
(11)
OTHER.mut
(6)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(38)
TESTES

Sense strand
GCAGACAGGCCAGCCTGAGGACGACCAGGCGTCCACCTCCACAGCCTCCGGTGAGCCTCGGCCCCTGTGCTCTTCCTGCCACTCTCAGATGTTCTTTTGGGCTTCTCTGAATAGGTTCTTCCCTGCTAGAAAAGAGGCCACCTGTCCTAGTCCCGACGTGTTCCCAGACTCCCAAGCACCCGTATGCCTCCAGCCAATTGTTTTCCAACCTCTTTTGACTTAGTCCTTGCCCTGTGCTCCCTGACAGAGGGCGAGGACAACGTTGACGAGGAGATGGAGGGAGACCGGGCAGGCCTG
..........................................................................................................((((.((((......))))....((((((((..((.((((........)))).))..............(((......))).....................))))))))...))))..........................................................................
......................................................................................................103.............................................................................................................................231................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGAGGGCGAGGACAACGTTGA............................... 25 1 13.00 13.00 1.00 1.00 - - 4.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................GGCGAGGACAACGTTGACGAGGAGATG..................... 27 1 9.00 9.00 4.00 - 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGAGGGCGAGGACAACGTTGAC.............................. 26 1 8.00 8.00 - 1.00 1.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTTCTTTTGGGCTTCTCTGAATAGG...................................................................................................................................................................................... 26 1 8.00 8.00 - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................CAACGTTGACGAGGAGATGGAGGGA............... 25 1 6.00 6.00 - 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................GAGGACAACGTTGACGAGGAGATGG.................... 25 1 5.00 5.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TGAATAGGTTCTTCCCTGCTAGAAAAG................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................ACAACGTTGACGAGGAGATGGAGGGA............... 26 1 4.00 4.00 - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAGGACGACCAGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 1 4.00 4.00 - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................GACAACGTTGACGAGGAGATGGAGGG................ 26 1 4.00 4.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGAGGGCGAGGACAACGTTG................................ 24 1 3.00 3.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TAGGTTCTTCCCTGCTAGAAAAGAGGCC.............................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TGAATAGGTTCTTCCCTGCTAGAAAA.................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...........................................................................................................................TGCTAGAAAAGAGGCCACCTGTCCTA.................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TGAATAGGTTCTTCCCTGCTAGAAAAGA.................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................AGGACAACGTTGACGAGGAGATGGAG.................. 26 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGTTTTCCAACCTCTTTTGACTTAGTCCT...................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TGAATAGGTTCTTCCCTGCTAGAAA..................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGACTTAGTCCTTGCCCTGTGCTCCC........................................................ 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAGGAGATGGAGGGAGACCGa......... 25 a 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................GGGCGAGGACAACGTTGACGAGGAGA....................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAGGAGATGGAGGGAGACCGGGC....... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................GGCGAGGACAACGTTGACGAGGAGATGG.................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................AGGACAACGTTGACGAGGAGA....................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................ACAACGTTGACGAGGAGATGGAGGG................ 25 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAGGAGATGGAGGGAGACCGGa........ 26 a 2.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGAGGGCGAGGACAACGTTGACG............................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGAGGGCGAGGACAACGTTta............................... 25 ta 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................GAGGGCGAGGACAACGTTGACGAGGA......................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GGACAACGTTGACGAGGAGATGGAG.................. 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCGAGGACAACGTTGACGAGGAG........................ 26 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGGGCTTCTCTGAATAGGTTCTTCCCTGC........................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................CAGAGGGCGAGGACAACGTTGACGAGG.......................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGAGGGCGAGGACAACGTTGACt............................. 27 t 2.00 8.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................CGAGGACAACGTTGACGAGGAGATGG.................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TAGTCCCGACGTGTTCCCAGACTC.............................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TTTTCCAACCTCTTTTGACTTcctt........................................................................ 25 cctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................AGGACAACGTTGACGAGGAGATGGAGG................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GGACAACGTTGACGAGGAGATGG.................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TCTTCCCTGCTAGAAAAGAGGCCACCT.......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................ATGCCTCCAGCCAATTGTTTTCCAACC....................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................CTCGGCCCCTGTGCcttt............................................................................................................................................................................................................................... 18 cttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................GGGCGAGGACAACGTTGACGAGGAG........................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TTGTTTTCCAACCTCTTTTGACTTAttc........................................................................ 28 ttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TCTCAGATGTTCTTTTGGGCTTCTCTGAAT......................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.........................................................................................TGTTCTTTTGGGCTTCTCTGAATAGGTT.................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAGGAGATGGAGGGAGA............. 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTCCAACCTCTTTTGACTTAGTCCTT..................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................GAGGGCGAGGACAACGTTGACGAGG.......................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TCCCTGACAGAGGGCGAGGACAACGT.................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................GAGGGCGAGGACAACGTTGACGAGGAGA....................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGCTAGAAAAGAGGCCACCTGTCCTc.................................................................................................................................................... 26 c 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TGAATAGGTTCTTCCCTGCTAGAA...................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................CCCTGACAGAGGGCGAGGACAACGTTGt............................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TCTTCCCTGCTAGAAAAGAGGCCACCTG......................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TATGCCTCCAGCCAATTGTTTTCCAACCTC..................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGAGGGCGAGGACAACGTTGACGA............................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................CCTGCCACTCTCAGATGTTCTTTTGGGt................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GCTAGAAAAGAGGCCACCTGTCCTAt................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TCCTAGTCCCGACGTGTTCCCAGAC................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................CAACGTTGACGAGGAGATGGAGGGAt.............. 26 t 1.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................CGTTGACGAGGAGATGGAGGGAGAg............ 25 g 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TCAGATGTTCTTTTGGGCTTCTCTG............................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................GGGCGAGGACAACGTTGACGAGGA......................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................................TCCTGCCACTCTCAGATGTTCTTTTG...................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTTCCAACCTCTTTTGACTTAGTCCT...................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGCCACTCTCAGATGTTCTTTTGGGC................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................CCTTGCCCTGTGCTCCCTGACAGAGG............................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................GCGAGGACAACGTTGACGAGGAGATGG.................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TTGACGAGGAGATGGAGGGAGACCGG......... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TTTTGGGCTTCTCTGAATAGGTTCTTC................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.........................................CAGCCTCCGGTGAGCCTCGGCCCCTG...................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TTGGGCTTCTCTGAATAGGTTCTTCCC.............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGAGGGCGAGGACAACGTTGACGt............................ 28 t 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................AGGACAACGTTGACGAGGAGATGGA................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TCAGATGTTCTTTTGGGCTTCTC.............................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTTCCAACCTCTTTTGACTTAGTCCTT..................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGAGGGCGAGGACAACGTTGAaa............................. 27 aa 1.00 13.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAGGACGACCAGGCGTCCACCTCCACA.............................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGAGGGCGAGGACAACGTT................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TTGGGCTTCTCTGAATAGGTTCTTCCCTG............................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGCGAGGACAACGTTGAC.............................. 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GGACAACGTTGACGAGGAGATG..................... 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TGAATAGGTTCTTCCCTGCTAGAAAAGAGGC............................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................GAGGACAACGTTGACGAGGAGATGGAG.................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................GACCAGGCGTCCACCTCCACAGCCTCC........................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TCCCTGCTAGAAAAGAGGCCACCTGTC....................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TCTCTGAATAGGTTCTTCCCTGCTAGA....................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................TCAGATGTTCTTTTGGGCTTCTCTGA........................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TAGGTTCTTCCCTGCTAGAAAAGAGGC............................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TCCTAGTCCCGACGTGTTCCCAGA................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTCCAACCTCTTTTGACTTAGTCCTTGC................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TTTTGGGCTTCTCTGAATAGGTTCTT................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................GACAGAGGGCGAGGACAACGTTGACGA............................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGAGGGCGAGGACAACGTTGACaa............................ 28 aa 1.00 8.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................GAGGGCGAGGACAACGTTGACGAGGAGAT...................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GGACAACGTTGACGAGGAGATGGAGGG................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTTCTTTTGGGCTTCTCTGAATAGGTTC................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................CTGACAGAGGGCGAGGACAACGTTGA............................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GGACAACGTTGACGAGGAGATGtagg................. 26 tagg 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAGGAGATGGAGGGAGACCGG......... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................GCGAGGACAACGTTGACGAGGAGATG..................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGCTAGAAAAGAGGCCACCTGTCCT..................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGTTCTTTTGGGCTTCTCTGAATA........................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TCCTAGTCCCGACGTGTTCCCAGACT............................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................GAGGGCGAGGACAACGTTGACGAGGAG........................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................GGCGAGGACAACGTTGACGAGGAGATGGt................... 29 t 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TTGGGCTTCTCTGAATAGGTTCTTCCCTt............................................................................................................................................................................ 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGCTAGAAAAGAGGCCACCTGT........................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TAGGTTCTTCCCTGCTAGAAAAGAGt................................................................................................................................................................ 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................AGGACAACGTTGACGAGGAGATGag................... 25 ag 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TCCCTGACAGAGGGCGAGGACAACGTTG................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAGGAGATGGAGGGAGACCGGG........ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................ATGCCTCCAGCCAATTGTTTTCCAACCTC..................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TCTTCCCTGCTAGAAAAGAGGCCACCTGT........................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
................................................................................ACTCTCAGATGTTCTTTTGGGCT.................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................GAGGACAACGTTGACGAGGAGATGGA................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TAGTCCCGACGTGTTCCCAGACTCCCAAGt........................................................................................................................ 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TCTGAATAGGTTCTTCCCTGCTAGA....................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GCAGACAGGCCAGCCTGAGGACGACCAGGCGTCCACCTCCACAGCCTCCGGTGAGCCTCGGCCCCTGTGCTCTTCCTGCCACTCTCAGATGTTCTTTTGGGCTTCTCTGAATAGGTTCTTCCCTGCTAGAAAAGAGGCCACCTGTCCTAGTCCCGACGTGTTCCCAGACTCCCAAGCACCCGTATGCCTCCAGCCAATTGTTTTCCAACCTCTTTTGACTTAGTCCTTGCCCTGTGCTCCCTGACAGAGGGCGAGGACAACGTTGACGAGGAGATGGAGGGAGACCGGGCAGGCCTG
..........................................................................................................((((.((((......))))....((((((((..((.((((........)))).))..............(((......))).....................))))))))...))))..........................................................................
......................................................................................................103.............................................................................................................................231................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
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18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029039(GSM433291)
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SRR029041(GSM433293)
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SRR029036(GSM433288)
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mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
...........................................................................................................................................ACCTGTCCTAGTCCCGACGTGTTCCCA................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GTCCCGACGTGTTCCCAGACTCCCA........................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................GCCACTCTCAGATGTTCTTTTGGGCTTCTC.............................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................AGTCCCGACGTGTTCCCAGACTCCCA........................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................CCTGTGCTCTTCCTGCCACTCTCA.................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................GGCTTCTCTGAATAGGTTCTTCCCTGCTA......................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CGACGTGTTCCCAGACTC.............................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -