(1)
OTHER.ip
(9)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(44)
TESTES

Sense strand
GTATCCGTCTAGCCGCCTCTGCCGCCATCTTTGTTGAGGGCGGATAAACTGTAAGCCAGGACTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTCTCTGTACTGTTCCCCTTTTCTGCTCCACGCTTCACGTTCAGAATCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGGGCAAAAGAGTCAACTTTGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTCGCGCTGCCGACGTCACGGCCGGCGTCTCTGCTGTCTTAG
...............................................................................................................................................(((((...(((.........(((((....(((......))).))))).........))).)))))..........................................
.......................................................................................................................................136......................................................................209.......................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
............................................................................................................................................TAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTC................................................................................. 29 1 22.00 22.00 2.00 4.00 3.00 1.00 5.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAA...................................................................................... 26 1 10.00 10.00 - 2.00 4.00 - - 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGGGCAA......................................................................... 26 1 9.00 9.00 - 2.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTCGCGC................................... 26 1 8.00 8.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................AAGAAGAAAGAGTCGGGGGCAAAAGA..................................................................... 26 1 6.00 6.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAG................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 -
............................................................................................................................................TAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGT.................................................................................. 28 1 5.00 5.00 - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAG..................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TCAGAATCTAGGCTGGACAAGAAAAG............................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTCGCGa................................... 26 a 4.00 0.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTCGCGCT.................................. 27 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TCAGAATCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGA........................................................................................ 30 1 4.00 4.00 - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAGCCGCCTCTGCCGCCATCTTTGTT....................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCGG............................................................................... 26 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGGGCA.......................................................................... 25 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................ATCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAG..................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCGt............................................................................... 31 t 3.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTTGTTGAGGGCGGATAAACTGccgg................................................................................................................................................................................................... 26 ccgg 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGGGCAAAAGA..................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TCAGAATCTAGGCTGGACAAGAAAAGAA.......................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCGGG.............................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAGCCGCCTCTGCCGCCATCTTTGT........................................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGGG............................................................................ 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TCAGAATCTAGGCTGGACAAGAAAAGA........................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...TCCGTCTAGCCGCCTCTGCCGCCATC............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................GAGTCAACTTTGCTGTGAAGTCTGTC............................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGAAAAGAAGAAAGAGTCGGG.............................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCt................................................................................ 30 t 2.00 22.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGA.................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TTCACGTTCAGAATCTAGGCTGGACAAGAA............................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCG................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GCGGATAAACTGTAAGCCAGGACTTT......................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGTTGAGGGCGGATAAACTGTAAG................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGGGCGGATAAACTGT...................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTCGC..................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAGCCGCCTCTGCCGCCATCTTT.......................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGG............................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................CGGATAAACTGTAAGCCAGGA............................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................ATCTTTGTTGAGGGCGGATAAACTGT...................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAGCCGCCTCTGCCGCCATCTTTG......................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTTGTTGAGGGCGGATAAA.......................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................GTGAAGTCTGTCAGTGTCGCGCTGCCGtt............................ 29 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................GAGTCAACTTTGCTGTGAAGTCTGTCAGTG......................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TCTCTGTACTGTTCCCCTTTTCTGCTCC................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................AGTCAACTTTGCTGTGAAGTCTGTCAGTGT........................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGTAAGCCAGGACTTTTTGTTTGTT................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TCAGAATCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAA....................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGGGCAt......................................................................... 26 t 1.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTCGCGCTGCC............................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGGGC........................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGAATCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAtt..................................................................................... 32 tt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTCGC..................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TTCAGAATCTAGGCTGGACAAGAAAAGAt.......................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTCGCGC................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CTCTGCCGCCATCTTTGTTGAGGGCG................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GAAAAGAAGAAAGAGTCGGGG............................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GAGGGCGGATAAACTGTAAGCCAGGA............................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...............................TGTTGAGGGCGGATAAA.......................................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCGGt.............................................................................. 32 t 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCGGa.............................................................................. 27 a 1.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTTGTTGAGGGCGGATAAACTGccg.................................................................................................................................................................................................... 25 ccg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAt...................................................................................... 26 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAA....................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
......................................................................................................................TCCACGCTTCACGTTCAGAATCTAGGCT........................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAta.................................................................................... 28 ta 1.00 10.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGAAAAGAAGAAAGAGTCGG............................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................AGTCTGTCAGTGTCGCGCTGCCGACG........................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTCGCGCTG................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................TGTTGAGGGCGGATAAACTGTAAGC.................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAG................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCAGTGTCGCGCTGCCGACGTCACGGCCGGt................ 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................GAGTCAACTTTGCTGTGAAGTCTGTCAGT.......................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGCTCCACGCTTCACGTTCAGAATCTA............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCt................................................................................ 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGCTCCACGCTTCACGTTCAGAATCTAGGC......................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTTGTTGAGGGCGGATAAACTGaag.................................................................................................................................................................................................... 25 aag 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GCGGATAAACTGTAAGCC................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGGGCAAA........................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GAGGGCGGATAAACTGTAAGCCAG............................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGGG............................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTCGCGt................................... 26 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGT.................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGAATCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAA....................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGa............................................................................. 31 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGCCGACGTCACGGCCGG................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTCGCGC................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................CTAGGCTGGACAAGAAAAGA........................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GCGGATAAACTGTAAGCCAG............................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TCAGAATCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGt........................................................................................ 30 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAGCCGCCTCTGCCGCCATCTT........................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TTGAGGGCGGATAAACTGTAAGCCAGG.............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TGTTTGTTTGTTTGTTTTTTCTCaga...................................................................................................................................................... 26 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...................................................................................................................TGCTCCACGCTTCACGTTCAGAATCTAGGCT........................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................GTGAAGTCTGTCAGTGTCGCGCcgg................................ 25 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
............................................................................TTTGTTTGTTTGTTTTTTCTCTGTACTGT................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AACTTTGCTGTGAAGTCTGTCAGTGT........................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGGGCta......................................................................... 26 ta 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGCTGTGAAGTCTGTCAG........................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GAATCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAG......................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCGG............................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GTATCCGTCTAGCCGCCTCTGCCGCCATCTTTGTTGAGGGCGGATAAACTGTAAGCCAGGACTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTCTCTGTACTGTTCCCCTTTTCTGCTCCACGCTTCACGTTCAGAATCTAGGCTGGACAAGAAAAGAAGAAAGAGTCGGGGGCAAAAGAGTCAACTTTGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTCGCGCTGCCGACGTCACGGCCGGCGTCTCTGCTGTCTTAG
...............................................................................................................................................(((((...(((.........(((((....(((......))).))))).........))).)))))..........................................
.......................................................................................................................................136......................................................................209.......................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...............................................................................................................TTTCTGCTCCACGCTTCACGTTCAGA................................................................................................................. 26 1 10.00 10.00 9.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GCTCCACGCTTCACGTTCAGAATCTA............................................................................................................ 26 1 5.00 5.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................GGCAAAAGAGTCAACTTTaagg............................................................ 22 aagg 4.00 0.00 - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CTCCACGCTTCACGTTCAGAATCTA............................................................................................................ 25 1 4.00 4.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
TCCGTCTAGCCGCaaga.......................................................................................................................................................................................................................................... 17 aaga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CGTCACGGCCGGgtgg................. 16 gtgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CCTTTTCTGCTCCACGCTTCACGTTCA................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGTTTTTTCTCTGTACTGTTCCCCTTTTC....................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................CGTCACGGCCGGgtg................. 15 gtg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CTGCTCCACGCTTCACGTTCAGAA................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................AGTCAACTTTGCTGTGAAGTCTGTCAGTGTC....................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................CGTTCAGAATCTAgcaa............................................................................................................ 17 gcaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGCTCCACGCTTCACGTTCAGAATCT............................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................CACGGCCGGCGTCTCTGCTGTCTTA. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGCTCCACGCTTCACGTTCAGAATCTAt............................................................................................................ 28 t 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGCTCCACGCTTCACGTTCAGAATCTA............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCTCTGTACTGTTCCCCT........................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCCACGCTTCACGTTCAGAATCTA............................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GCTCCACGCTTCACGTTCAGAATCTAc............................................................................................................ 27 c 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CTCCACGCTTCACGTTCA................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CTGCTCCACGCTTCACGTTCAGAATCTA............................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TTCTGCTCCACGCTTCACGTTCAGA................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -