| Gene: Mis12 | ID: uc007jxm.1_intron_0_0_chr11_70833692_f.5p | SPECIES: mm9 | 
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  (1)  OTHER.ip  | 
  
  
  (7)  OTHER.mut  | 
  
  
  (6)  PIWI.ip  | 
  
  
  (2)  PIWI.mut  | 
  
  
  (1)  TDRD1.ip  | 
  
  
  (34)  TESTES  | 
  
  
| ATTAGATTGGGCTGGAGCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACGTGTTCAGTAAGTTATAAAGAAGCTTTAAAAATTGTGGGACAAAAAAATGCGACCGTCAAGACTGGTAGGAACCAAGTAAAAAGTTGGAGAGAATGGCATTTAGAAGGAAGACTAGAAAGCTGAAAGTAGTTGAACCGACCTGTGGCTCCTAGCCACTCTGAAGGCTGAAGCCAGAGGATTTGTTCCATCCTGAAGTTCTAGGCCAG ..............................................................................................................................(((((...((...((.(((((.((.....))......))))).))..))...)))))................................................................... ...................................................................................................................116.....................................................................188............................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | 
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| ............................................................................................................................................................TAGAAAGCTGAAAGTAGTTGAACCGACCT................................................................. | 29 | 1 | 16.00 | 16.00 | 8.00 | 5.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................AAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACGTG............................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 7.00 | 7.00 | 4.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................CAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGAC............................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................TAAAAAGTTGGAGAGAATGGCATTTA........................................................................................................ | 26 | 1 | 6.00 | 6.00 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................CAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACG.............................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............TGGAGCAAAGACTATCCTGACCGTGGCA.................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................TAAAGAAGCTTTAAAAATTGTGGGACAA.................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................TGCGACCGTCAAGACTGGTAGGAACCAAG.................................................................................................................................. | 29 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................TAGAAAGCTGAAAGTAGTTGAACCGAC................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............TGGAGCAAAGACTATCCTGACCGTGG.................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................AAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACGT............................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................TAAAGAAGCTTTAAAAATTGTGGGACA..................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................CAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACGT............................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................GCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACGT............................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................GCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACG.............................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................AAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACGTGT........................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................GAAAGCTGAAAGTAGTTGAACCGACCT................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................TAGAAGGAAGACTAGAAAGCTGAAAGT............................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................TAAAAATTGTGGGACAAAAAAATGC............................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .TTAGATTGGGCTGGAGCAAAGACTATCCT............................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..TAGATTGGGCTGGAGCAAAGACTATCCT............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................TAAAGAAGCTTTAAAAATTGTGGGACAAA................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................TAGAAGGAAGACTAGAAAGCTGAAAGTA.............................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............AGCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGA................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................GCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACGTG............................................................................................................................................................................................................ | 30 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................GCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGAC............................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 
| ...............................................................................................................................................TTAGAAGGAAGACTAGAAAGCTGAAAGT............................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................TAAAAATTGTGGGACAAAAAAATGCGACC........................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .TTAGATTGGGCTGGAGCAAAGAC.................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................TTAAAAATTGTGGGACAAAAAAATGC............................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................TAAAAATTGTGGGACAAAAAAATGCGAC......................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................GCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACGTGT........................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................GACTATCCTGACCGTGGCAGACGTGTTC......................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................TATAAAGAAGCTTTAAAAATTGTGGGAC...................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................CAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGA................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................AGGAAGACTAGAAAGCTGAAAGTAGT............................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......TGGGCTGGAGCAAAGACTATCCTGACC........................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................TATCCTGACCGTGGCAGACGTGTTC......................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............AGCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGAC............................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................GGAAGACTAGAAAGCTGAAAGTAGTTGAA........................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................AGAAAGCTGAAAGTAGTTGAA........................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................CTAGAAAGCTGAAAGTAGTTGAACCGACCTG................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 
| ........................................................................................................................TAAAAAGTTGGAGAGAATGGCATTTAGAAa.................................................................................................... | 30 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| ............................................................................................................................................................TAGAAAGCTGAAAGTAGTTGAACCGACCTG................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .TTAGATTGGGCTGGAGCAAAGACTA................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| .................CAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACGTG............................................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................AGAGAATGGCATTTAGAAGGAAGACTAG........................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..TAGATTGGGCTGGAGCAAAGACTAT............................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................AAGACTATCCTGACCGTGGCAGACGTGT........................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................GCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAG................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 
| .....................GACTATCCTGACCGTGGCAGACGTGT........................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............TGGAGCAAAGACTATCCTGACCGTGGCt.................................................................................................................................................................................................................. | 28 | t | 1.00 | 29.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .TTAGATTGGGCTGGAGCAAAGACTATC.............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................TCCTGACCGTGGCAGACGTGTTCAGa...................................................................................................................................................................................................... | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................AGAAAGCTGAAAGTAGTTGAACCGACCT................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................TAAAAATTGTGGGACAAAAAAA............................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................TCCTGACCGTGGCAGACGTGTTCAGc...................................................................................................................................................................................................... | 26 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................TAGAAGGAAGACTAGAAAGCTGAAAGTAGT............................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 
| ........................................................................................................................TAAAAAGTTGGAGAGAATGGCATTTAt....................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................TAAAAAGTTGGAGAGAATGGCATTTAGA...................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....GATTGGGCTGGAGCAAAGACTATCCTGta......................................................................................................................................................................................................................... | 29 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................TCCTAGCCACTCTGAAGGCTGAAGCCAGA............................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........GCTGGAGCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAt................................................................................................................................................................................................................. | 31 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................GAAGGAAGACTAGAAAGCTGAAAGTAG............................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......TTGGGCTGGAGCAAAGACTATCCTGA.......................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................GAGAATGGCATTTAGAAGGAAGACTA............................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............TGGAGCAAAGACTATCCTGACCGTG..................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................CTAGAAAGCTGAAAGTAGTTGAACCGACC.................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................GAATGGCATTTAGAAGGAAGACTAGAt......................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............TGGAGCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGt................................................................................................................................................................................................................ | 30 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................TTAGAAGGAAGACTAGAAAGCTGAAAGTAGT............................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..TAGATTGGGCTGGAGCAAAGACTATCC............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............AGCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACGT............................................................................................................................................................................................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................GCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACt.............................................................................................................................................................................................................. | 28 | t | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....GATTGGGCTGGAGCAA...................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .TTAGATTGGGCTGGAGC........................................................................................................................................................................................................................................ | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................................CACTCTGAAGGCTGAAG.................................... | 17 | 10 | 0.30 | 0.30 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.30 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ATTAGATTGGGCTGGAGCAAAGACTATCCTGACCGTGGCAGACGTGTTCAGTAAGTTATAAAGAAGCTTTAAAAATTGTGGGACAAAAAAATGCGACCGTCAAGACTGGTAGGAACCAAGTAAAAAGTTGGAGAGAATGGCATTTAGAAGGAAGACTAGAAAGCTGAAAGTAGTTGAACCGACCTGTGGCTCCTAGCCACTCTGAAGGCTGAAGCCAGAGGATTTGTTCCATCCTGAAGTTCTAGGCCAG ..............................................................................................................................(((((...((...((.(((((.((.....))......))))).))..))...)))))................................................................... ...................................................................................................................116.....................................................................188............................................................  | 
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...............................................................................................................................................................AAAGCTGAAAGTAGTTGAACCGACCTGTGGC............................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |