chr11:69713259 69713854 -
(1)
OTHER.ip 		(9)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(46)
TESTES

Sense strand
CTAAAAAACAGCAGCTCCATTTTGATAAAGAAACCCCCCGGTTCGGAGAAGTAAGCAACTCAGCTGGTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTAATGGTTTTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGCGAGGGAAGGAGGGCTAGAGAGTAAGAAAGGTGAGAGCTTAAATAGCAGCAACTCAGCTTTTAGCCAGCAGCCCTGAGACGGGAGGGAGGGAGGAGTTCAGGACACCTTGAGCTGAAGCCAAGAAAAAAACAGAGTCCCAAGGCCCTGGTTAGGGAGAGGTGGTGAGGTCAAATAGGTTGGAAATCTGAAGTTCCATGACTTGGAGAGGGCAGCAGGTGTCACAGGAATCCTGGCCACACAGCACTGATTATCACTGGGTATCTGGCTCCCATCCTAGCCTCTACGAGGGAATATAAGAAGAATTTTTTGAATGCCGGGAAGAATGAAGGAGACCTCTCTGTTAGGAGAGGGTCGCCAGAAGAGCTTCCTCCTTTGCTCCTTCCCTCACCTTAGGAAGTCTCAGCGCTGGGATGAAATGAACATCTTGGCTACCTACCACCCTGCTGA
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((((.....(((((((..(((((((.(((((((....)))))))...((.......))...)))))))..)).))))).....)))))))...................................................
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................447................................................................................................546................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGagt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 agt 62.00 0.00 - - 25.00 11.00 2.00 8.00 3.00 4.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGaggt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 aggt 44.00 0.00 21.00 15.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 2.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGagtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 agtt 20.00 0.00 - - 8.00 3.00 - 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TAAGAAAGGTGAGAGCTTAAATAGCAGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 13.00 13.00 - - - - 5.00 - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 8.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGata....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ata 5.00 0.00 - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGagt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 agt 4.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCcgag........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 cgag 4.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 3.50 3.50 0.50 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGat..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 at 3.00 0.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAAGTTCCATGACTTGGAGAGGGC............................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGAAGAATTTTTTGAATGCCGGGA................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGaaaa...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 aaaa 3.00 0.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGTCAAATAGGTTGGAAATCTGA................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGAAGAATTTTTTGAATGCCGGGAA............................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGaggt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 aggt 3.00 0.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAATTTTTTGAATGCCGGGAA............................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGaatt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 aatt 3.00 0.00 - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGaggt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 aggt 3.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGaat............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 aat 3.00 0.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCgga......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gga 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGata.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 ata 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAATGAACATCTTGGCTACCTACCACC....... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGagt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 agt 2.00 0.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAGAAAGGCAGGGGGtag................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 tag 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGat........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 at 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TAGCCAGCAGCCCTGAGACGGGAGGGAGa...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGAATGCCGGGAAGAATGAAGGAG.................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGatag...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 atag 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TTTATTGTAGAAAGGCAGtat....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 tat 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGagc...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 agc 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGtt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCggag........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 ggag 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGaggt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 aggt 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATAAGAAGAATTTTTTGAATGCCGGG................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TTTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGaggt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 aggt 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................AGCTTTATTGTAGAAAGGCct.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 ct 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGGta.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 ta 2.00 0.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGacgg...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 acgg 2.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGTTTTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGtt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tt 2.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGtt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 tt 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAGAAAGGCAGGGGGAAAttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGtt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 tt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGtg.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 tg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAATGAACATCTTGGCTACCTACC.......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................ATGGTTTTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGtt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 tt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAATTTTTTGAATGCCGGGAAG.............................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACGAGGGAATATAAGAAGAATTTTTTa.......................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGatgg...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 atgg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGAATGCCGGGAAGAATGAAGGA..................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGgg.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 gg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCggtg........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 ggtg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGagt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 agt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAAAAACAGCAGCTCCATTTTGATAAAGAAACC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................................................................................TTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGatt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 att 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGtt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 tt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTGTAGAAAGGCAGGGGGAAcgg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 cgg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TAGAGAGTAAGAAAGGTGAGAGCcta....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 cta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGcgt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 cgt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTGTAGAAAGGCAGGGGGAgt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 gt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAtt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 tt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................ACGGGAGGGAGGGcaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 16 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCccag........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 ccag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GCTTTATTGTAGAAAGGCtttt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGGGAAGAATGAAGGAGACCTCTCT............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAAGTTCCATGACTTGGAGAGGG.............................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAATTTTTTGAATGCCGGGAAGAA............................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGTTAGGAGAGGGTCGCCAGAAG...................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTGTAGAAAGGCAGGGGGAAggt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 ggt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 aaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAAGTTCCATGACTTGGAGAGGGCA............................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................ATGGTTTTAGAGCTTTATTGTcgag................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 cgag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCcgc......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................AGAGTAAGAAAGGTGAGAGCTTAAATA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...............................................................................................................TTTTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCgga......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 gga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CTTTATTGTAGAAAGGCAGtat....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAtagt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 tagt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGagat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 agat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGcgcg...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 cgcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGcg..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 cg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGtttt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 tttt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................AGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGacc....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 acc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATGAAATGAACATCTTGGCTACCT............. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TTTATTGTAGAAAGGCAGtc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGcaa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGtt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................ATGGTTTTAGAGCTTTATTGTttaa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 ttaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAaaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGcagc...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 cagc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGtat............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAttt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ttt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAagaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 agaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTGAATGCCGGGAAGAATGAAGGA..................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGatt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 att 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GCTTTATTGTAGAAAGGCAct......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGTTTTAGAGCTTTATTGTAGAttg.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 ttg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAcgtt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 cgtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................ATGGTTTTAGAGCTTTATTGTAGAAcgc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAATGCCGGGAAGAATGAAGGAGACC................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGaat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAtt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 tt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGttt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGagc..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 agc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAGAAAGGCAGGGGGAAAtc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GCTTTATTGTAGAAAGGCAGGct....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 ct 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGtaa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGcagt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 cagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGct............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTTTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGaagt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 aagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGatt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 att 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................AGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGGtaa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGaat............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGatt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 att 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGacgg......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 acgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAtc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGaca.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 aca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGCGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGaagt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 aagt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................AGCTTTATTGTAGAAAGGCAcc......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGTTTTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGaaa.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGatta............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 atta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGagtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 agtt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAaaaa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 aaaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGgt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 gt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................AGCTTTATTGTAGAAAGGCAGat........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGaata..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 aata 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGcgg...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 cgg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................AGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGta.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 33 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGagta............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 agta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGCCAAGAAAAAAACAGAGTCC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCggc......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 ggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................AGAGCTTTATTGTAGAAggt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGTTTTAGAGCTTTATTGTAGcaac.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 caac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGTTTTAGAGCTTTATTGTAtt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGagtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 agtt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATAAGAAGAATTTTTTGAATGCCGGG................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAGAAAGGCAGGGGGttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TTTATTGTAGAAAGGCAtta........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGagt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 agt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAGAAAGGCAGGGGGAAgt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAATGCCGGGAAGAATGAAGGAGAC.................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACGAGGGAATATAAGAAGAATTTT............................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAGAAAGGCAGGGGGAtat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGaac....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 aac 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGTTTTAGAGCTTTATTGTAtgac............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 tgac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGcggg...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 cggg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GCTTTATTGTAGAAAGGCcat......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 cat 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TAAAAAACAGCAGCTCCATTTTGATA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAATGCCGGGAAGAATGAAGGAG.................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGttga..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 ttga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................AGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGaggt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 aggt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGctt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................AACAGAGTCCCAAGtatt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 tatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGggg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGactt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 actt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGTTTTAGAGCTTTATTGTAGAAAtgaa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tgaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GCTTTATTGTAGAAAGGCtat......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGgagt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 gagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGagag......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 agag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GAGCTTTATTGTAGAAAGacc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 acc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGaata................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 aata 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................AAAGAAACCCCCCGGgaag....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 gaag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGggaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 ggaa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TTTATTGTAGAAAGGCAGGGGctaa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 ctaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGata....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 ata 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TAAGAAAGGTGAGAGCTTAAATAGCAaca............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 aca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAccc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 ccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTATTGTAGAAAGGCAGGGcata.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 cata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAATTTTTTGAATGCCGGGAAGAATG.......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................ACTCAGCTGGTTTTTgggc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 gggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGacg....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 acg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAGAAAGGCAGGGGGtata.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 tata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGgagt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 gagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAata........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATAAGAAGAATTTTTTGAATGCCGG.................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGTTTTAGAGCTTTATTGTAGcaat.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 caat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................AGCTTTATTGTAGAAAGGCAGaagt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 aagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGCt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 0.50 3.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GAGTAAGAAAGGTGAGAGCTTAAAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTAAAAAACAGCAGCTCCATTTTGATAAAGAAACCCCCCGGTTCGGAGAAGTAAGCAACTCAGCTGGTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTAATGGTTTTAGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAAGAGCGAGGGAAGGAGGGCTAGAGAGTAAGAAAGGTGAGAGCTTAAATAGCAGCAACTCAGCTTTTAGCCAGCAGCCCTGAGACGGGAGGGAGGGAGGAGTTCAGGACACCTTGAGCTGAAGCCAAGAAAAAAACAGAGTCCCAAGGCCCTGGTTAGGGAGAGGTGGTGAGGTCAAATAGGTTGGAAATCTGAAGTTCCATGACTTGGAGAGGGCAGCAGGTGTCACAGGAATCCTGGCCACACAGCACTGATTATCACTGGGTATCTGGCTCCCATCCTAGCCTCTACGAGGGAATATAAGAAGAATTTTTTGAATGCCGGGAAGAATGAAGGAGACCTCTCTGTTAGGAGAGGGTCGCCAGAAGAGCTTCCTCCTTTGCTCCTTCCCTCACCTTAGGAAGTCTCAGCGCTGGGATGAAATGAACATCTTGGCTACCTACCACCCTGCTGA
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((((.....(((((((..(((((((.(((((((....)))))))...((.......))...)))))))..)).))))).....)))))))...................................................
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................447................................................................................................546................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
......................................................................................................................................................................................................................GCCCTGAGACGgcgc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 gcgc 5.00 0.00 - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAtt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 tt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAgt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 gt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GAGCGAGGGAAGGAGGGCTAGAGAGTAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GGTTTTAGAGCTTTATTGTAtgtc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 tgtc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CAGCTGGTTTTTTTTgga......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................AATGGTTTTAGAGCTTTATTctac...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 ctac 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAgt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AGAGCTTTATTGTAGAAAGGCAGGGGGAAgt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TTTTTTTTGTTTTTTTGTggt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CTTTATTGTAGAAAGGCttg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 ttg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTTTAGAGCTTTATTGTAGAAttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -