(9)
OTHER.mut
(8)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(46)
TESTES

Sense strand
TAATGGCTATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGGTAAGGTAAGAATTGAATTTCTCAATTGAAGGATATTTACACATTTGTCCATCTAGACCTCAATTATTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCACAGATATGGGGACGGT
............................................................((((((.....))))))...(((((..........)))))........................................................
..................................................51.....................................................106................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
.....................................................................................TTTACACATTTGTCCATCTAG.................................................. 21 1 79.00 79.00 - - 21.00 - 7.00 7.00 13.00 5.00 - 1.00 1.00 4.00 1.00 5.00 - 2.00 - - - - - 6.00 1.00 - - 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TATAATGATGGCTATGGATTTGGTTC........................................................................................................................... 26 1 58.00 58.00 14.00 20.00 - 12.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - 3.00 - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
....................................................................................ATTTACACATTTGTCCATCTAG.................................................. 22 1 52.00 52.00 - - 23.00 - 3.00 3.00 3.00 5.00 - 1.00 2.00 5.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGA........................................................................................................... 28 1 25.00 25.00 6.00 7.00 1.00 9.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAG............................................................................................................ 27 1 22.00 22.00 9.00 6.00 - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTTCA.......................................................................................................................... 25 1 19.00 19.00 4.00 4.00 - 2.00 - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAG......................................................................................................................... 26 1 15.00 15.00 4.00 5.00 - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGt........................................................................................................................ 27 t 15.00 15.00 3.00 8.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGt........................................................................................................... 28 t 10.00 22.00 2.00 3.00 - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........ATAATGATGGCTATGGATTTGGTTC........................................................................................................................... 25 1 8.00 8.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TATTTACACATTTGTCCATCTAG.................................................. 23 1 8.00 8.00 - - 6.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAA............................................................................................................. 26 1 8.00 8.00 6.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGA........................................................................................................................ 27 1 7.00 7.00 1.00 2.00 - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGAT....................................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 - 1.00 - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTTC........................................................................................................................... 24 1 6.00 6.00 - - - - - - - - 4.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGATA...................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...................TATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGA.............................................................................................................. 27 1 6.00 6.00 1.00 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................TATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGG............................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 3.00 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GCTATAATGATGGCTATGGATTTGGTTC........................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........ATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCA.......................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GGAATGTCTGACCACAGATATGGGGACG.. 28 1 5.00 5.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCA.......................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAA............................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CTATAATGATGGCTATGGATTTGGTTC........................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TTTACACATTTGTCCATCTAGA................................................. 22 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......TATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGA........................................................................................................................ 29 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.......TATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGAT....................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..................................................................................................................................TGTCTGACCACAGATATGGGGACGGTgt 28 gt 3.00 0.00 - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGA........................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................ATTTACACATTTGTCCATCTAGA................................................. 23 1 3.00 3.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCACAGt............ 28 t 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TCAGGAATGTCTGACCACAGATATGGG...... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGG.............................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................ATTTACACATTTGTCCATttag.................................................. 22 ttag 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCACAG............. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........ATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGAT....................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CTATGGATTTGGTTCAGt........................................................................................................................ 18 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.................................................................................GATATTTACACATTTGTCCATCTAG.................................................. 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TACACATTTGTCCATCTAG.................................................. 19 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CTATAATGATGGCTATGGATTTGGTT............................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAG............................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGAT....................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................GAAGGATATTTACACATTTGTCCATCTAG.................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AGATAGATTTGGAAGAG.......................................................................................................... 17 2 2.00 2.00 - - - - - 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
............TGATGGCTATGGATTTGGTTCAGATA...................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAG......................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCACA.............. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GGAATGTCTGACCACAGATATGGGGAC... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TTTACACATTTGTCCATCTA................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................ATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGA.............................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGacc....................................................................................................... 29 acc 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGA........................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGtt....................................................................................................................... 28 tt 2.00 15.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GGAATGTCTGACCACAGAT........... 19 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAG.......................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TTTTCAGGAATGTCTGACCACAGATATGG....... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTTt........................................................................................................................... 24 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCACAGA............ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GGCTATGGATTTGGTTCAGATAGATTTG................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTTaa.......................................................................................................................... 25 aa 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCt.......................................................................................................................... 27 t 1.00 58.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTT............................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TATTTACACATTTGTCCATCTAGA................................................. 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TTCAGGAATGTCTGACCACAGATATGGt...... 28 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................AGGAATGTCTGACCACAGATATGGGGAC... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TATTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCACAGAT........... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GCTATAATGATGGCTATGGATTTG............................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................GGATATTTACACATTTGTCCATCTAG.................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AATGATGGCTATGGATTTGGTTCAG......................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGt.............................................................................................................. 27 t 1.00 6.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGATt...................................................................................................................... 28 t 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CAGATAGATTTGGAAGAG.......................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGTTCAGATAGATTTGGAAGAGacc....................................................................................................... 25 acc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGtt.......................................................................................................... 29 tt 1.00 22.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GGCTATAATGATGGCTATGGATTTGGTTC........................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGATt...................................................................................................................... 29 t 1.00 6.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TCAGGAATGTCTGACCACAGATA.......... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TCAGGAATGTCTGACCACAGATATGGGG..... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTTGGTTCAGATAGATTTGGAA............................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CTATAATGATGGCTATGGATTT................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGTCTGACCACAGATATGGGGACGGa 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGac........................................................................................................ 25 ac 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................ACACATTTGTCCATCTAGA................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGATGGCTATGGATTTGGTTCAGAT....................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTGAAGGATATTTACACATTTGTCCATCTAG.................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CTATAATGATGGCTATGGATTTGGT............................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GTTTTTCAGGAATGTCTGACCACAGATATGGGG..... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGa......................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAG.......................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TTCAGGAATGTCTGACCACAGATATGGGG..... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........ATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGATA...................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGa......................................................................................................... 27 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGt........................................................................................................................ 29 t 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAG.......................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TGACCACAGATATGGGGACGGg 22 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGt........................................................................................................................ 26 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................ATGTCTGACCACAGATATGGGG..... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGa......................................................................................................... 30 a 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TATAATGATGGCTATGGATTTG............................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TATAATGATGGCTATGGATTTGGT............................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
....................ATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGG............................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GGAATGTCTGACCACAGATATGGGGA.... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGCTATAATGATGGCTATGGATTTG............................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTACACATTTGTCCATCTAG.................................................. 20 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GCTATAATGATGGCTATGGATTTGGT............................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TATTGTTTTTCAGGAATGTCTGACC................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..................................................GTAAGGTAAGAATTGAATTTCTCAATT............................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTATTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCAC............... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGcag............................................................................................................ 27 cag 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................ACACATTTGTCCATCTAG.................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TTTTTCAGGAATGTCTGACCACAGAT........... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGta............................................................................................................. 26 ta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTTCAGGAATGTCTGACCACAGATATGGGttt... 32 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAt.......................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAta........................................................................................................................ 27 ta 1.00 19.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CAGGAATGTCTGACCACAGATATGGGG..... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGA........................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................AGGAATGTCTGACCACAGATATGGGGA.... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAt.......................................................................................................... 27 t 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAA............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TATTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCA................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGCTATAATGATGGCTATGGATTTGt.............................................................................................................................. 27 t 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCAC............... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGt......................................................................................................... 30 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGA........................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGac........................................................................................................ 31 ac 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAG............................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGA.............................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TTTTTCAGGAATGTCTGACCACAGATt.......... 27 t 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAt............................................................................................................. 26 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGCTATAATGATGGCTATGGATTTGGT............................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGGCTATGGATTTGGTTCAGATAGATT.................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................GGCTATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGG............................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TTCAGGAATGTCTGACCACA.............. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TTTACACATTTGTCCATCTAGAa................................................ 23 a 1.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ATTTGGTTCAGATAGATTTGG............................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACATTTGTCCATCTAG.................................................. 16 3 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................CATTTGTCCATCTAG.................................................. 15 9 0.22 0.22 - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GTAAGAATTGAATTT...................................................................................... 15 17 0.06 0.06 - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TAATGGCTATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGGTAAGGTAAGAATTGAATTTCTCAATTGAAGGATATTTACACATTTGTCCATCTAGACCTCAATTATTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCACAGATATGGGGACGGT
............................................................((((((.....))))))...(((((..........)))))........................................................
..................................................51.....................................................106................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
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Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)