(1)
OTHER.ip
(3)
OTHER.mut
(5)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(29)
TESTES

Sense strand
TCTATAAAGTTTAAATAGTCTTTTGAGTGAATTTTCTGGTCATTGCCTATACAAATAAATGTAAGAAATCTGGCTTTAAATATTAGTCAGTTTCATGGCTATGACTAAATTGTTTTTCTTGTATAACAAAGTAATTGTATGACATGAACTAATGTTTTCTCTCCCCTCCCCATTCCCCTTCCTTTTGGACAATGCTTTAGGTATATTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCATTATG
............................................................((.((....)).))...((((((((((..((.((((.((....(((...(((((..........))))))))....)))))).))..)))))))))).............................................................................................
.......................................................56...................................................................................................157...........................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
............................................................GTAAGAAATCTGGCTTTAAATATTAGTCAGTTTCATGGCTATGACTAAATTG.......................................................................................................................................... 52 1 120.00 120.00 120.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTC...... 29 1 5.00 5.00 - 2.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACT....... 27 1 5.00 5.00 - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................ACAAAGTAATTGTATGACATGA....................................................................................................... 22 1 5.00 5.00 - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TCGAGCTGAAGTTAGAACTCAT.... 22 1 4.00 4.00 - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAAC........ 27 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCA..... 29 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCA..... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................ATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAA................ 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAA......... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - -
..............................................................................................................................................................................................................TGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGt................. 27 t 2.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TATTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGt................. 30 t 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TATTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTG.................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTC...... 30 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAAC........ 31 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCA..... 30 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TATTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGA................. 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGA................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTC...... 24 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................ATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTT............. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................GTCGAGCTGAAGTTAGAACTCATTATG 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTT............. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................ATTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGA................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................AGAGCAGTCGAGCTGAAG............... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACctc..... 32 ctc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GCAGTCGAGCTGAAGTTAGAAC........ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACT....... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTC...... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................AACAAAGTAATTGTATGACATGAAC..................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAG............... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TATATTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGt................. 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGA.......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....................................................AAATAAATGTAAGAAATCTGG................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
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.............................................................................................................................................................................................................TTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAG............... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.........................................................................................................................................................................................................TATATTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGC.................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TATTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGC.................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAA......... 33 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACT....... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAAC........ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TATTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAG..................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTC...... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTC...... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAG........... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................ATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAG........... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCA..... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAG........... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................ATATTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTt.................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTA............ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................ATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTT............. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TATATTGAAATATTTAAGAGCAGTCGA...................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAA................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTT............. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TTTTCTCTCCCCTCCagt.............................................................................. 18 agt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.....................................................................................................................................................................................................................TTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCA..... 32 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCATT... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGT.............. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCATTA.. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................................................................................................................................TGAACTAATGTTTTCTCTCCCCTCC................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGA................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TCTATAAAGTTTAAATAGTCTTTTGAGTGAATTTTCTGGTCATTGCCTATACAAATAAATGTAAGAAATCTGGCTTTAAATATTAGTCAGTTTCATGGCTATGACTAAATTGTTTTTCTTGTATAACAAAGTAATTGTATGACATGAACTAATGTTTTCTCTCCCCTCCCCATTCCCCTTCCTTTTGGACAATGCTTTAGGTATATTGAAATATTTAAGAGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCATTATG
............................................................((.((....)).))...((((((((((..((.((((.((....(((...(((((..........))))))))....)))))).))..)))))))))).............................................................................................
.......................................................56...................................................................................................157...........................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
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mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
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SRR363958(GSM822760)
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mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
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mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
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SRR363959(GSM822761)
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SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
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SRR029043(GSM433295)
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SRR051939(GSM545783)
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GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509279(GSM509279)
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SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
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.....................................................................................................................................................................................................................TTTAAGAGCAGTCG....................... 14 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17