(12)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(8)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(40)
TESTES

Sense strand
GGGTGGCCCTACAGCGTGGAAGGGATGACCGAGCTTTGGGACATGTCCTGGTAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGTGGCCGGTGAAGCCAAACTCCGTATCTTGAATTCATTTTCAGGACTAATTCTCTCCCCTAGACTTCTGGGGACTGGGAGACTGCAGTATGGGTCGTGCAGGATTGGAGTGATATACTTAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGTCTGCAGTGACCCTGTGCATTCCTACAGTGCTTGCC
.......................................................((((((.....)))).)).((((.(((..((...........(((((((......))))))).....((((((((((((....))))))...))))))..))..))).))))...................................................................................
..................................................51...................................................................................................................168................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
..................................................GTAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGTG............................................................................................................................................................................... 25 1 37.00 37.00 - 18.00 - - 6.00 6.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGTCTGCAGTGACCCTGTGCATTCCTACAG........ 52 1 30.00 30.00 30.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGTCTG................................ 28 1 27.00 27.00 - - 2.00 3.00 - - - 9.00 6.00 - 1.00 - - - - - - 2.00 - - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TACAGCGTGGAAGGGATGACCGAGC........................................................................................................................................................................................................................ 25 1 26.00 26.00 - - 1.00 - 1.00 - 7.00 2.00 - - 1.00 1.00 - 2.00 - - - 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGT................................... 25 1 13.00 13.00 - - - - - - - - - - - 6.00 1.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - -
.........TACAGCGTGGAAGGGATGACCGAGCT....................................................................................................................................................................................................................... 26 1 7.00 7.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGTCTGC............................... 29 1 6.00 6.00 - - 3.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..........................................................................................................................................................................CAGGATTGGAGTGATATACTTAGCAAGC.................................................... 28 1 5.00 5.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGGAAGGGATGACCGAGCTTTGGGACt............................................................................................................................................................................................................... 27 t 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGT................................................................................................................................................................................ 24 1 5.00 5.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGGGGACTGGGAGACTGCAGTATGG...................................................................................... 25 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGTGGC............................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGG................................................................................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGTGG.............................................................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........................TGACCGAGCTTTGGGACATGTCCTGG....................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................ACCGAGCTTTGGGACATGTCCTGGaa..................................................................................................................................................................................................... 26 aa 3.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGACCGAGCTTTGGGACATGTCCTGGa...................................................................................................................................................................................................... 27 a 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GTATGGGTCGTGCAGGATTGGAGTGATA................................................................ 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GGATGACCGAGCTTTGGGACATGTC........................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGCAGTATGGGTCGTGCAGGATTGGAGTGATA................................................................ 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGTC.................................. 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGG.................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......CCCTACAGCGTGGAAGGGATGACCGAGC........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
......................GGATGACCGAGCTTTGGGACATGTCC.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGG..................................... 23 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGTGt.............................................................................................................................................................................. 26 t 2.00 37.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CTACAGCGTGGAAGGGATGACCGAGC........................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................GCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGT................................... 23 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TACAGCGTGGAAGGGATGACC............................................................................................................................................................................................................................ 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GATGACCGAGCTTTGGGACATGTCCTGt....................................................................................................................................................................................................... 28 t 2.00 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGC......................................... 19 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GAAGGGATGACCGAGCTTTGGGACATG............................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AGCGTGCTTGGGTCTGCAGTGAC......................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGTCT................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CCCTACAGCGTGGAAGGGATGACCGA.......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGTGGCC............................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..................................................GTAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGggg.............................................................................................................................................................................. 26 ggg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTG...................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGTGGg............................................................................................................................................................................. 25 g 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTcc......................................... 19 cc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CAGGACTAATTCTCTCCCCTAGAC.................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGGAAGGGATGACCGAGCTTgg.................................................................................................................................................................................................................... 22 gg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CCTACAGCGTGGAAGGGATGACCGAGC........................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AGCGTGCTTGGGTCTGCAGTGA.......................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TTCTGGGGACTGGGAGACTGCAGT.......................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GACTTCTGGGGACTGGGAGAC................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CCGAGCTTTGGGACATGTCCTGGaaac................................................................................................................................................................................................... 27 aaac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........ACAGCGTGGAAGGGATGACCGAGCT....................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........TACAGCGTGGAAGGGATGACCGAGCc....................................................................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 26.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GCAGTATGGGTCGTGCAGGATTGG....................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGGGAGACTGCAGTATGGGTCGTGCA.............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGTG............................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TTAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGTCTG................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GCGTGGAAGGGATGACCGAGCTa...................................................................................................................................................................................................................... 23 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........TACAGCGTGGAAGGGATGACCaagc........................................................................................................................................................................................................................ 25 aagc 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GTGGAAGGGATGACCGAGCTTTGGGACA............................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGTCTGCAGTG........................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGGGTCGTGCAGGATTGGAGTGATA................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GACTTCTGGGGACTGGGAGACTGCA............................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGTCTGa............................... 29 a 1.00 27.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGTgtga............................... 29 gtga 1.00 13.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................ACCGAGCTTTGGGACATGTCCTGGaaa.................................................................................................................................................................................................... 27 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGCAGGATTGGAGTGATATACTTAGC........................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..................................................GTAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGgg............................................................................................................................................................................... 25 gg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TAGACTTCTGGGGACTGGGAGACTG.............................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TGGAAGCTCGGTGGCCGGTGAAGC.................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CAGTATGGGTCGTGCAGGATTGGAGTGATA................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................CAGTTGTGGAAGCTCGGTGGCCGGTGAAG..................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGACCGAGCTTTGGGACATGTCCTGGT...................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TACAGCGTGGAAGGGATGACCGAG......................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GATGACCGAGCTTTGG................................................................................................................................................................................................................... 16 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CAGTATGGGTCGcca............................................................................... 15 cca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGTCTGCAGTGA.......................... 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TTCTGGGGACTGGGAGACTGCAGTA......................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GATGACCGAGCTTTGGGACATGTCCTG........................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGGAAGGGATGACCGAGCTTTGGGAC................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCCAGCGTGCTTGGGTCTGCAGT............................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TACAGCGTGGAAGGGATGACCGggct....................................................................................................................................................................................................................... 26 ggct 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CGTGGAAGGGATGACCGAGCTTTGG................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGTG............................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTT....................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.....................................................................................................................................GACTTCTGGGGACTGGGAGACTGCAG........................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGTGGAAGCTCGGTGGCCGGTGAAGC.................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGGGGACTGGGAGACTGCAGTATG....................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGACCGAGCTTTGGGACATGTCCTGGaa..................................................................................................................................................................................................... 28 aa 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGtgt................................... 25 tgt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GCTTGGGTCTGCAGTGA.......................... 17 4 0.75 0.75 - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAGCAAGCCTCCAGCG............................................ 16 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TTGGGTCTGCAGTGACCCTGTGCATTC.............. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGGTGGCCCTACAGCGTGGAAGGGATGACCGAGCTTTGGGACATGTCCTGGTAAGTCAGTTGTGGAAGCTCGGTGGCCGGTGAAGCCAAACTCCGTATCTTGAATTCATTTTCAGGACTAATTCTCTCCCCTAGACTTCTGGGGACTGGGAGACTGCAGTATGGGTCGTGCAGGATTGGAGTGATATACTTAGCAAGCCTCCAGCGTGCTTGGGTCTGCAGTGACCCTGTGCATTCCTACAGTGCTTGCC
.......................................................((((((.....)))).)).((((.(((..((...........(((((((......))))))).....((((((((((((....))))))...))))))..))..))).))))...................................................................................
..................................................51...................................................................................................................168................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
..............................................................................................................................................................TGGGTCGTGCAGGATcca.......................................................................... 18 cca 35.00 0.00 - - 7.00 9.00 - - - - - 7.00 - - 2.00 - 4.00 - - - 2.00 - - - - - - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TGGGTCGTGCAGGATTcca......................................................................... 19 cca 26.00 0.00 - - 7.00 3.00 - - 7.00 - - 4.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...............................................................................................................................................................TGGGTCGTGCAGGATTcc......................................................................... 18 cc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GGGTCGTGCAGGATgcca.......................................................................... 18 gcca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................CATTTTCAGGACTAATTCTCTCCCCTA..................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -