chr11:5179715 5179964 -
(9)
OTHER.mut 		(7)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(35)
TESTES

Sense strand
TAGACTTGAGCTCCTCAGGAAAGGAGCCATTGCTGCCCCCTTTATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGAACTATCACATCCAAGGGCCCTATGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGGACCTTACCTGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTGCTGGCTCTCTCCAGACCCTTGATGACTGTTCTCCCTCTTTCTCCCAGGACCAGGATCTGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGCTTGAGCTCAAAAGGAA
...........................................................................................................................((((...............((((.((...)).)))).((..(((....)))..))...................)))).................................................
........................................................................................................................121...................................................................................207.........................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATTGT..................................................................................................................................................................................... 27 1 34.00 34.00 - 12.00 - 8.00 9.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGACTGTTCTCCCTCTTTCTCCCAGGACCAGGATCTGGCCCAGGCATCGGTA....................... 52 1 33.00 33.00 - - - - - - - 33.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTG................................................................................................. 28 1 25.00 25.00 6.00 8.00 1.00 - 4.00 - 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TTTATCACACAGAGCCAAATCACCATT....................................................................................................................................................................................... 27 1 25.00 25.00 - 9.00 - 5.00 7.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TACCTGATACGTACTACCCAAAGCCTGC..................................................................................................... 28 1 15.00 15.00 2.00 - 3.00 - - 7.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCTGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGCT............... 27 1 14.00 14.00 3.00 - 4.00 - - 4.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACCAGGATCTGGCCCAGGCATCGGTAC...................... 27 1 14.00 14.00 6.00 - 2.00 - - - 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGT.................................................................................................. 27 1 14.00 14.00 5.00 - 5.00 - - - 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AGGACCTTACCTGATACGTACTACCCAA............................................................................................................ 28 1 11.00 11.00 1.00 - 4.00 - - - 2.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................................................................................................TGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTG................................................................................................... 26 1 11.00 11.00 4.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCTGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGC................ 26 1 10.00 10.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TCCCAGGACCAGGATCTGGCCCAGGCATC........................... 29 1 9.00 9.00 2.00 - 1.00 - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGGACCT................................................................................................................................. 28 1 9.00 9.00 - - - 3.00 - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGACTGTTCTCCCTCTTTCTCCCAGGAC............................................... 28 1 9.00 9.00 1.00 1.00 3.00 - 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCGGTACGGGAGCTTGAGCTCAAAAGG.. 27 1 8.00 8.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................................................................................................AGGGATGCTCAAGGACCTTACCTGAT......................................................................................................................... 26 1 8.00 8.00 5.00 - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGCTT.............. 26 1 8.00 8.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGTGAACTATCACATCCAAGGGCCCTA............................................................................................................................................................. 27 1 6.00 6.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGA................................................................................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTGC................................................................................................ 29 1 6.00 6.00 - - 1.00 - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCTGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGCTT.............. 28 1 6.00 6.00 - - 2.00 - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TGATGACTGTTCTCCCTCTTTCTCCC.................................................... 26 1 6.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TAGGGATGCTCAAGGACCTTACCTGA.......................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACCAGGATCTGGCCCAGGCATCGGTA....................... 26 1 6.00 6.00 2.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...........................................................................................................................CCTGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTG................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCGGTACGGGAGCTTGAGCTCAAAAGGAA 29 1 5.00 5.00 1.00 - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTATCACACAGAGCCAAATCACCATTGT..................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTG.................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGAAC................................................................................................................................................................................. 31 1 4.00 4.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGACTGTTCTCCCTCTTTCTCCCAGGA................................................ 27 1 4.00 4.00 - - - - - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................AGGGATGCTCAAGGACCTTACCTGATA........................................................................................................................ 27 1 4.00 4.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TTTATCACACAGAGCCAAATCACCATTGT..................................................................................................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCGGTACGGGAGCTTGAGCTCAAAAGGA. 28 1 4.00 4.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AGGACCTTACCTGATACGTACTACCCA............................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................CAGGCATCGGTACGGGAGCTTGAGCTC........ 27 1 4.00 4.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTGATGACTGTTCTCCCTCTTTCTCCC.................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTGCTGG............................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TCCCAGGACCAGGATCTGGCCCAGGCAT............................ 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGTGAACTATCACATCCAAGGGCCCTAT............................................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGAAC................................................................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TATGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGG..................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTGATGACTGTTCTCCCTCTTTCTC...................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGGAC................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
............................................................................................................................................................................TGATGACTGTTCTCCCTCTTTCTCCCA................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCGGTACGGGAGCTTGAGCTCAAAAG... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TCCCAGGACCAGGATCTGGCCCAGGCA............................. 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................AGGGATGCTCAAGGACCTTACCTGA.......................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGCT............... 25 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TACCTGATACGTACTACCCAAAGCCTG...................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TCACACAGAGCCAAATCACCATTGTG.................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCGGTACGGGAGCTTGAGCTCAAAAGGt. 28 t 2.00 8.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTGCTGCCCCCTTTATCACACAGAGC................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CTACCCAAAGCCTGCTGTGCTGGCTCTCT....................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................ATCACACAGAGCCAAATCACCATTGT..................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TTGTGAACTATCACATCCAAGGGCCC............................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTCAAGGACCTTACCTGATACGTACTACC............................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTGCTG.............................................................................................. 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GACCAGGATCTGGCCCAGGCATCGGTAC...................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGGCTCTCTCCAGACCCTTGATGACTGT.................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTCAAGGACCTTACCTGATACGTACTA................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTCAAGGACCTTACCTGATACGTAC................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGAACTATCACATCCAAGGGCCCTATGG.......................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................ATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGAAC................................................................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGA................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCTGCCCCCTTTATCACACAGAGCC.................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCTGCCCCCTTTATCACACAGAGC................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTGATGACTGTTCTCCCTCTTTCTCC..................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACCAGGATCTGGCCCAGGCATCGGTAa...................... 27 a 2.00 6.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGAACTATCACATCCAAGGGCCCTATGGAT........................................................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTCAAGGACCTTACCTGATACGTACT.................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGAA.................................................................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TTACCTGATACGTACTACCCAAAGCCTG...................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGt................................................................................................................................................................................... 29 t 2.00 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCTGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGt................ 26 t 2.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CAGGAAAGGAGCCATTGCTGCCCCCTT................................................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TATGGATGGGCTAGGGATGCTCAAG...................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TTTATCACACAGAGCCAAATCACCATTG...................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................ATCCAAGGGCCCTATGGA......................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TCCAAGGGCCCTATGGATGGGCTAGGG............................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCTGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGCTTt............. 29 t 2.00 6.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGCCCCCTTTATCACACAGAGCCAAATCACC.......................................................................................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................ATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTGCTG.............................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTGCTGCCCCCTTTATCACACAGAGCCA................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TAGGGATGCTCAAGGACCTTACCTGAT......................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATTG...................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TTGTGAACTATCACATCCAAGGGCCCTt............................................................................................................................................................. 28 t 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................ATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTGg................................................................................................ 27 g 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................CAGGCATCGGTACGGGAGCTTGAGCTCAAAA.... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TCCCAGGACCAGGATCTGGCCCAGGC.............................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ACCTTACCTGATACGTACTACCCAAAG.......................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TATGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGt..................................................................................................................................... 26 t 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GGGATGCTCAAGGACCTTACCTGAT......................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GGATCTGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGCT............... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTCAAGGACCTTACCTGATACGTACT.................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTGt................................................................................................ 29 t 1.00 25.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGACCAGGATCTGGCCCAGGCATC........................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CAGGAAAGGAGCCATTGCTGCCCCCTTT............................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TCCCAGGACCAGGATCTGGCCCAGGCATa........................... 29 a 1.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GGCATCGGTACGGGAGCTTGAGCTCAAA..... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CTGTTCTCCCTCTTTCTCCCAGGACCAG............................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTtc................................................................................................ 29 tc 1.00 14.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGC................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTGCTGGC............................................................................................ 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGATGGGCTAGGGATGCTCAA....................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCTGGCCCAGGCATCGGTACGGG................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGACCTTACCTGATACGTACTACCC.............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TACCTGATACGTACTACCCAAA........................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TCCAAGGGCCCTATGGATGGGCTAGtg............................................................................................................................................... 27 tg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGACTGTTCTCCCTCTTTCTCCCAGGACC.............................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................AACTATCACATCCAAGGGCCCTATGGA......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGt................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................CCCAGGCATCGGTACGGGAGCTTGAG........... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CACAGAGCCAAATCACCATTGTGAACT................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGttt.............. 26 ttt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TCACCATTGTGAACTATCACATCCAAGGGC................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATCGGTACGGGAGCTTGAGCTCAAAAG... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AGGCATCGGTACGGGAGCTTGAGC.......... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGAACTATCACATCCAAGGGCCCTA............................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATTGaa.................................................................................................................................................................................... 28 aa 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AGGCATCGGTACGGGAGCTTGAGCTCA....... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATTGcg.................................................................................................................................................................................... 28 cg 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TCCAGACCCTTGATGACTGTTCTCCCT............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GGATCTGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGC................ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCTGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGCTaa............. 29 aa 1.00 14.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTGCTGCCCCCTTTATCACACAGAG.................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TACCTGATACGTACTACCCAAAGCC........................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGCTGTGCTGGCTCTCTCCAGAC................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCTGGCCCAGGCATCGGTACGGGAG................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TATGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGGt.................................................................................................................................... 27 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGGACCTT................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGACTGTTCTCCCTCTTTCTCCCAGG................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGggcc............................................................................................... 30 ggcc 1.00 11.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CTATGGATGGGCTAGGGATGCTCAA....................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TCTCCCTCTTTCTCCCAGGACCAGGATC........................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGCTGTGCTGGCTCTCTCCAGACCa............................................................................... 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTGCTG.............................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGG..................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
................................................................................................ATGGGCTAGGGATGCTCAAGGACCTT................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGGA.................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GACCAGGATCTGGCCCAGGCATCGGTAt...................... 28 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGAACT................................................................................................................................................................................ 32 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGACTGTTCTCCCTCTTTCTCCCAGGACa.............................................. 29 a 1.00 9.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TACCTGATACGTACTACCCAAAGCCcgc..................................................................................................... 28 cgc 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TTGTGAACTATCACATCCAAGGGCCCT.............................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CCCCTTTATCACACAGAGCCAAATCACC.......................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TCTCCAGACCCTTGATGACTGTTCTCCCTCT........................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGCCCCCTTTATCACACAGAGCCAAATCACa.......................................................................................................................................................................................... 31 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TTTCTCCCAGGACCAGGATCTGGCCCAG................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGAAC................................................................................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TCTCCAGACCCTTGATGACTGTTCTCCCT............................................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TCAAGGACCTTACCTGATACGTACTAC................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TCCAAGGGCCCTATGGATGGGCTAcg................................................................................................................................................ 26 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.................................................................................................................................................................................................CTCCCAGGACCAGGATCTGGCCCAGGC.............................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CCTGATACGTACTACCCAAAGCCTGC..................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TTTATCACACAGAGCCAAATCACCAT........................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................CCCTTTATCACACAGAGCCAAATCACC.......................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACCAGGATCTGGCCCAGGCATCGGT........................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CCTTGATGACTGTTCTCCCTCTTTCTC...................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GACCAGGATCTGGCCCAGGCATCGGTA....................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTCAAGGACCTTACCTGATACGTACTACCC.............................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TTGTGAACTATCACATCCAAGGGCC................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TCACATCCAAGGGCCCTATGGATGGGCT................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TACGTACTACCCAAAGCCTGCTG................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACCAGGATCTGGCCCAGGCATCGGTAt...................... 27 t 1.00 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGCa............... 25 a 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CCTGATACGTACTACCCAAAGCCTGCT.................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGAACTATCACATCCAAGGGCCCTATGGA......................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCGGTACGGGAGCTTGAGCTCAAAAGGAActa 32 cta 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CTTTATCACACAGAGCCAAATCAacat........................................................................................................................................................................................ 27 acat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGGCTCTCTCCAGACCCTTGATGACTGa.................................................................... 28 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGAAa................................................................................................................................................................................. 32 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GGCATCGGTACGGGAGCTTGAGCTCA....... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTATCACACAGAGCCAAATCACCATT....................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGACCAGGATCTGGCCCAGGCATCGGT........................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TATGGATGGGCTAGGGATGCTCAttt..................................................................................................................................... 26 ttt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TACTACCCAAAGCCTGCTGTGCTGGC............................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGGACt.................................................................................................................................. 27 t 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TTGTGAACTATCACATCCAAGGGCCCTA............................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGACCAGGATCTGGCCCAGGCATaa.......................... 27 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TAGGGATGCTCAAGGACCTTACCTGAaa........................................................................................................................ 28 aa 1.00 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TCACCATTGTGAACTATCACATCCAAGG................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATcgtg.................................................................................................................................................................................... 28 cgtg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGTGAACTATCACATCCAAGGGCCCTATG........................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TTACCTGATACGTACTACCCAAAGCCTGC..................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................CTATCACATCCAAGGGCCCTATGGATGGGCT................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TTGTGAACTATCACATCCAAGGGC................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGACTGTTCTCCCTCTTTCTCCCAGta................................................ 27 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................CCAGGACCAGGATCTGGCCCAGGCATC........................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TCCAAGGGCCCTATGGATGGGCTAGG................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TCACATCCAAGGGCCCTATGGATGGGCTAGt................................................................................................................................................ 31 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGCCCCCTTTATCACACAGAGCCAAATCA............................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CTGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGc.................................................................................................. 28 c 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................CACACAGAGCCAAATCACCATTGTGAACTAT.............................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTG................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TCACCATTGTGAACTATCACATCCAAGGG.................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CCCCCTTTATCACACAGAGCCAAATCACC.......................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCGGTACGGGAGCTTGAGC.......... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.........................................................................................CCTATGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGGA.................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTATCACACAGAGCCAAATCACCAgtgt..................................................................................................................................................................................... 28 gtgt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AGGACCTTACCTGATACGTACTACCC.............................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGGACa.................................................................................................................................. 27 a 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATTct..................................................................................................................................................................................... 27 ct 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTa.................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 34.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TCACCATTGTGAACTATCACATCCAAG.................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TAGGGATGCTCAAGGACCTTACCTGATA........................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCTGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGa................ 26 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTCAAGGACCTTACCTGATACGTACTAC................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................CTATCACATCCAAGG................................................................................................................................................................... 15 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.22
...........................................................................................................................................................................................................CAGGATCTGGCCCAGG............................... 16 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TAGACTTGAGCTCCTCAGGAAAGGAGCCATTGCTGCCCCCTTTATCACACAGAGCCAAATCACCATTGTGAACTATCACATCCAAGGGCCCTATGGATGGGCTAGGGATGCTCAAGGACCTTACCTGATACGTACTACCCAAAGCCTGCTGTGCTGGCTCTCTCCAGACCCTTGATGACTGTTCTCCCTCTTTCTCCCAGGACCAGGATCTGGCCCAGGCATCGGTACGGGAGCTTGAGCTCAAAAGGAA
...........................................................................................................................((((...............((((.((...)).)))).((..(((....)))..))...................)))).................................................
........................................................................................................................121...................................................................................207.........................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
...........................................................................................................................................................................................CTCTTTCTCCCAGGACCA............................................. 18 2 2.50 2.50 - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GAACTATCACATgtgg......................................................................................................................................................................... 16 gtgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GCTGCCCCCTTTATgctt............................................................................................................................................................................................................. 18 gctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -