| Gene: Sfi1 | ID: uc007hru.1_intron_12_0_chr11_3046296_r.3p | SPECIES: mm9 |
|
|
(5) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(6) PIWI.ip |
(4) PIWI.mut |
(28) TESTES |
| GAACTCAGGACCTCTGAAAGAGCAGTCAGTGCTTGCCATCTCTGAGCTGTCTCTCTAGCTCCTCATGGTATGTTTTTAACCTAGCAAACTGGTGAAGATCAAACATAACACTTCATTCTGTTCCTGCCTGTATGAGAAGCAGTCTCTCAGAAGAGTGTGCCTCTGAGCTTTCACAGAGGCATTTTGTTACTTTGTTTCAGTTATTGCGGGCCAGAGCAGATGGTCATTTCCAGCAGCGAGCACTGCCTGC |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ...................................................................................................................TTCTGTTCCTGCCTGTATGAGAAGC.............................................................................................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TCTGAAAGAGCAGTCAGTGCTTGCCA.................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TCAGGACCTCTGAAAGAGCAGTCAGcga.......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | cga | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TATGAGAAGCAGTCTCTCAGAAGAGTGTG........................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ACCTCTGAAAGAGCAGTCAGTGCTTGCCAT................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ACCTCTGAAAGAGCAGTCAGTGCTTGC...................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................TTCTGTTCCTGCCTGTATGAGAAGCA............................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................TGTTCCTGCCTGTATGAGAA................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................GTCAGTGCTTGCCATCTCTGAGCTGTa....................................................................................................................................................................................................... | 27 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TATGAGAAGCAGTCTCTCAGAAGAGTGT............................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................TGTTCCTGCCTGTATGAGAAGCAGTC.......................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................TGCCATCTCTGAGCTGTCTCTCTAGC............................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......AGGACCTCTGAAAGAGCAGTCAGTacgc........................................................................................................................................................................................................................ | 28 | acgc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGAGAAGCAGTCTCTCAGAAGAGTGTGt.......................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................ACTTCATTCTGTTCCTGCCTGTATGAG.................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................GCAGTCTCTCAGAAGAGTGTGCCTCTG..................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGAGAAGCAGTCTCTCAGAAGAGTGa............................................................................................ | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TCAGGACCTCTGAAAGAGCAGTCAGTGac......................................................................................................................................................................................................................... | 29 | ac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CAGAAGAGTGTGCCTCTGAGCTTTCACA........................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TCAGGACCTCTGAAAGAGCAGTtgaa............................................................................................................................................................................................................................ | 26 | tgaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................ATTGCGGGCCAGAGCAGATGGTCA........................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................TAGCAAACTGGTGAAGATCAAACATA............................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TATGAGAAGCAGTCTCTCAGAAGAGTGTGC.......................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................TAGCAAACTGGTGAAGATCAAACATAACACTT......................................................................................................................................... | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCTGCCTGTATGAGAAGCAGTCTCTCAG.................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ACCTCTGAAAGAGCAGTCAGTGCTTGCa..................................................................................................................................................................................................................... | 28 | a | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...CTCAGGACCTCTGAAAGAGCAGTCAGaa........................................................................................................................................................................................................................... | 28 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTCATTCTGTTCCTGCCTGTATGAGA................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................TAGCAAACTGGTGAAGATCAAACAT................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGAGAAGCAGTCTCTCAGAAGAGTGTGC.......................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ............................................................................................................................TGCCTGTATGAGAAGCAGTCTCTCAGA................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....CAGGACCTCTGAAAGAGCAGTCAGTGCTaa....................................................................................................................................................................................................................... | 30 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................TGCTTGCCATCTCTGAGCTGTCTCT.................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TAACACTTCATTCTGTTCCTGCCTGT....................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................TAGCAAACTGGTGAAGATCAAACATAAC............................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................GCGGGCCAGAGCAGATGGTCATTTCCAGC................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TCAGGACCTCTGAAAGAGCAGTCAGTGagaa....................................................................................................................................................................................................................... | 31 | agaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................TTTAACCTAGCAAACTGGTGAAGATC...................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................AAGCAGTCTCTCAGAAGA................................................................................................ | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 |
| GAACTCAGGACCTCTGAAAGAGCAGTCAGTGCTTGCCATCTCTGAGCTGTCTCTCTAGCTCCTCATGGTATGTTTTTAACCTAGCAAACTGGTGAAGATCAAACATAACACTTCATTCTGTTCCTGCCTGTATGAGAAGCAGTCTCTCAGAAGAGTGTGCCTCTGAGCTTTCACAGAGGCATTTTGTTACTTTGTTTCAGTTATTGCGGGCCAGAGCAGATGGTCATTTCCAGCAGCGAGCACTGCCTGC |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........CCTCTGAAAGAGCAGTCAGTGCTTGCCA.................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 11.00 | 11.00 | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................GCCTGTATGAGAAGCAGTCTCTCAGAAGA................................................................................................ | 29 | 1 | 7.00 | 7.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................TCTCTGAGCTGTCTCTCTAGCTCCTCA......................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GTTACTTTGTTTCAGTTATTGCGGGCCA..................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................CACTTCATTCTGTTCCTGCCT......................................................................................................................... | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................TGCCTGTATGAGAAGCAGTCTCTCAGA................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ACCTCTGAAAGAGCAGTCAGTGCTTGCCA.................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CAGTCTCTCAGAAGAGTGTGCCTCTGt..................................................................................... | 27 | t | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTCATTCTGTTCCTGCCTGTATGAGAA................................................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CAGGACCTCTGAAAGAGCAtaaa.................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | taaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ..............................GCTTGCCATCTCTGAGCTGTCTCTCTA................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................AACACTTCATTCTGTTCCTGCCTGTA...................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................AGTCAGTGCTTGCCATCTCTGAGCTGT........................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................CAAACATAACACTTCATTCTGTTCCTGCC.......................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................GAAGATCAAACATAACACTTCATTCTG.................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................CTTCATTCTGTTCCTGCCTGTAT..................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TAACACTTCATTCTGTTCCTG............................................................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................GCAAACTGGTGAAGATCAAACATAACA............................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................CAGTCAGTGCTTGCCATCTCaaa................................................................................................................................................................................................................ | 23 | aaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................GCCTGTATGAGAAGCAGTCTCTCAGA................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................CCTAGCAAACTGGTGAAGATCAAACA................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TCAGTGCTTGCCATCTCTGAGCTGTCTC..................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................GCCAGAGCAGATGGTCATTTCCAGCA............... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................CATAACACTTCATTCTGTTCCTG............................................................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................ATAACACTTCATTCTGTTCCTG............................................................................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CTGCCTGTATGAGAAGCAGTCTCTCA..................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................CCTGTATGAGAAGCAGTCTCTCAGAAGA................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TCTCTCTAGCTCCTCATGGTATGTTT............................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................CTCTGAGCTGTCTCTCTAGCTCCTCATGGTA.................................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................CACTTCATTCTGTTCCTGCCTGT....................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................CTGTTCCTGCCTGTATGt.................................................................................................................... | 18 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................CATAACACTTCATTCTGTTCCT............................................................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................GCTCCTCATGGTATGTTTTTAACCTAGCA.................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................ATCAAACATAACACTTCA....................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TCTCTCTAGCTCCTCATGGTATGTTTTTA............................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................AAAGAGCAGTCAGTGCTTGCCATCTCT............................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................CTTCATTCTGTTCCTGCCTGT....................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................TCATTCTGTTCCTGCCTGTAT..................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| .....................................................................................................................CTGTTCCTGCCTGTATGAGAAGC.............................................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................AGCTGTCTCTCTAGCTCCTCATGGTA.................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................AGAAGCAGTCTCTCAGAAGAG............................................................................................... | 21 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................CACTTCATTCTGTTCCT............................................................................................................................. | 17 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |