(3)
OTHER.mut
(6)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(28)
TESTES

Sense strand
AGCCTGACCTGTACAAGTCTGAGATGGAGGTTCAAGATGCAGAGCTGAAGGTTAGTGTTGAATGGAATATGAACATGGGACATTTGTGGACGTCCTGGAAAGATTTCCAAAGTACTGCACTTTATGATCCCACATTGCTCAGGACGCCTGCTTCTGTTTTCCAGGCTCTTCTCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCCAGAAAAAGAAGAAAAA
.....................................................((((((..(((.........)))..))))))..((((.((.((....)))).)))).........................................................................................................
..................................................51............................................................113...................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
....TGACCTGTACAAGTCTGAGATGGAGGTT...................................................................................................................................................................................... 28 1 25.00 25.00 3.00 7.00 6.00 5.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCCA............... 28 1 16.00 16.00 6.00 5.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTTAGTGTTGAATGGAATATGAACATG......................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 - - - - 2.00 - 4.00 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGCAAGTAGAAAAACCCAGAAAAAGAAG..... 28 1 8.00 8.00 3.00 1.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TACAAGTCTGAGATGGAGGTTCAAGA................................................................................................................................................................................. 26 1 8.00 8.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - -
...........................................................................................................................................................................TCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCC................ 27 1 7.00 7.00 1.00 1.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....TGACCTGTACAAGTCTGAGATGGAGGT....................................................................................................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 2.00 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............ACAAGTCTGAGATGGAGGTTCAAGAT................................................................................................................................................................................ 26 1 7.00 7.00 - 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TACAAGTCTGAGATGGAGGTTCAAGAT................................................................................................................................................................................ 27 1 7.00 7.00 - 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............ACAAGTCTGAGATGGAGGTTCAAGA................................................................................................................................................................................. 25 1 6.00 6.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGCAAGTAGAAAAACCCAGAAAAAGAAGA.... 29 1 5.00 5.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
....TGACCTGTACAAGTCTGAGATGGAGGTTC..................................................................................................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 2.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGAGATGGAGGTTCAAGATGCAGAGC......................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TTCTCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACC................. 29 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................CAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCCA............... 26 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....GACCTGTACAAGTCTGAGATGGAGGTT...................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGCAAGTAGAAAAACCCAGAAAAAGAAGt.... 29 t 3.00 8.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TCTCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCCA............... 30 1 3.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TTCTCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCC................ 30 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTTAGTGTTGAATGGAATATGAAC............................................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CAAGTAGAAAAACCCAGAAAAAGAAGAAAt. 30 t 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AAGTAGAAAAACCCAGAAAAAGAAGAAA.. 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TATGAACATGGGACATTTGTGGACGT......................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGACCTGTACAAGTCTGAGATGGAGGTTt..................................................................................................................................................................................... 29 t 2.00 25.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ACCTGTACAAGTCTGAGATGGAGGTT...................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CCTGTACAAGTCTGAGATGGAGGTTC..................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................AATATGAACATGGaagg.................................................................................................................................... 17 aagg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................GAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCCA............... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GTCTGAGATGGAGGTTCAA................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..............................................................................................................................................................................AGAGTTCTGCAAGTAGAA...................... 18 2 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCCAt.............. 29 t 1.00 16.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AAGTAGAAAAACCCAGAAAAAGAAGAA... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...................................................................................TTGTGGACGTCCTGGAAAGATTTCCA......................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TCTCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCC................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TCTCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAA..................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TTCTCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCCA............... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
........CTGTACAAGTCTGAGATGGAGGTTC..................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TAGTGTTGAATGGAAcaa................................................................................................................................................ 18 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................GTTAGTGTTGAATGGAATATGAACAT.......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGCAAGTAGAAAAACCCAGAAAAAGAA...... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................CCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACC................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGTACAAGTCTGAGATGGAGGTTCAA................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................GAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCC................ 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCCAG.............. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAA................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......ACCTGTACAAGTCTGAGATGGAGGTTt..................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GTACAAGTCTGAGATGGAGGTTCA.................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CTCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCCA............... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TTCTCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAA................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAA.................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
....................GAGATGGAGGTTCAAGATGCcgag.......................................................................................................................................................................... 24 cgag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCTTCTCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAA..................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGCAAGTAGAAAAACCCAGAAAAAGA....... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGTACAAGTCTGAGATGGAGGTTCAAGt................................................................................................................................................................................. 28 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGACCTGTACAAGTCTGAGATGGAGGTa...................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 7.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCTGAGATGGAGGTTCAAGATt............................................................................................................................................................................... 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAAC.................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TACAAGTCTGAGATGGAGGTTCAAGAaa............................................................................................................................................................................... 28 aa 1.00 8.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ACCTGTACAAGTCTGAGATGGAGGTTC..................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CTCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCC................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGTACAAGTCTGAGATGGAGGTT...................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TGAATGGAATATGAACATGGGACATT.................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGGACGTCCTGGAAAGATTTC........................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AAGATGCAGAGCTGAAG.................................................................................................................................................................... 17 5 0.60 0.60 - - - - - - 0.20 - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - -
.GCCTGACCTGTACAAGTCTGAGATGGt.......................................................................................................................................................................................... 27 t 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GCCTGACCTGTACAAGTCTGAGATGG........................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GCCTGACCTGTACAAGTCTGAGATGGA.......................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGACCTGTACAAGTCTGAGATGGA.......................................................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGACCTGTACAAGTCTGAGATGGAG......................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGACCTGTACAAGTCTGAGATGG........................................................................................................................................................................................... 23 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGCCTGACCTGTACAAGTCTGAGATGGAGGTTCAAGATGCAGAGCTGAAGGTTAGTGTTGAATGGAATATGAACATGGGACATTTGTGGACGTCCTGGAAAGATTTCCAAAGTACTGCACTTTATGATCCCACATTGCTCAGGACGCCTGCTTCTGTTTTCCAGGCTCTTCTCCAGAGTTCTGCAAGTAGAAAAACCCAGAAAAAGAAGAAAAA
.....................................................((((((..(((.........)))..))))))..((((.((.((....)))).)))).........................................................................................................
..................................................51............................................................113...................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)