chr10:95003963 95004321 +
(1)
OTHER.ip 		(9)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(2)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(48)
TESTES

Sense strand
TTAAACTTGAACTATTCCTTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGACCAAAATTTATCATCCTAATGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGATATTTTGAAAGGTAAGTGTTGTTTGTCACCCTGTGCTTTATTAACGTGTCCTTTTTGTCCTAAGCATTCTACATTTAGAATGTAAGCATTGGAATCTCACTGTATGCTAACAGCCCCAGAGTGTGTGGGAGGGAAGTGCAGCAGTTCTGGGCCTGTTGTCCATGCTTTATCATATACTGGGCCTGTTACCTTCATAGATAAGTGGTCCCCAGCACTGCAGATCCGCACAGTTCTGCTATCAATCCAG
..................................................................((((.((((.(((((((........))))))).)).)).))))..........................................................................................................................................................................................................................................................
..................................................51...............................................................116.................................................................................................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGAC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 4 14.50 14.50 11.50 - - - 0.75 - 0.25 1.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGA....................................................................................................................................................................................................................................................... 28 4 6.50 6.50 0.25 3.00 0.50 1.50 - - 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - 0.25 0.25 - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGACC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 4 4.75 4.75 1.50 0.25 - 0.25 0.75 - - 0.75 - - - - 0.25 0.50 - 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 4 4.25 4.25 2.50 - - - 0.25 0.25 - 0.25 - - - 0.25 - 0.25 - 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTA......................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 4.25 4.25 - 0.50 1.00 1.50 - - 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - -
..............................................TAAAGTACGTTTCATGACCAAAATTTA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 4 3.50 3.50 0.25 - - - - - - - 0.50 - - 0.75 - 1.00 - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAG........................................................................................................................................................................................................................................................ 27 4 3.25 3.25 - 1.00 0.75 0.50 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGTT........................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 2.50 2.50 - 0.25 0.75 0.75 - - 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................ATGGCAGCACCTAAAGTtttc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 tttc 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CCAATGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 t 2.00 0.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTT.......................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 2.00 2.00 - 0.25 0.50 - - - - - - - - - 0.25 - - - - 0.25 - 0.25 - 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............ATTCCTTCCAGAAGAATt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAG........................................................................................................................................................................................................................................................ 26 5 1.80 1.80 0.20 0.60 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - -
......................................................................................GACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGA....................................................................................................................................................................................................................................................... 26 5 1.60 1.60 0.40 - 0.20 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TAAAGTACGTTTCATGACCAAAATTTATCATC......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 4 1.50 1.50 - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGAT...................................................................................................................................................................................................................................................... 27 5 1.40 1.40 - 0.20 - - - - 0.20 - 0.40 - - - - - - - - - 0.40 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TAAACTTGAACTATTCCTTCCAGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 5 1.40 1.40 - - - - - - 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 0.60 - - - - - - - - - - - -
.TAAACTTGAACTATTCCTTCCAGAAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 5 1.40 1.40 - - 0.60 0.60 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAATGTAGACAAGTTGGGAAGAATAT.............................................................................................................................................................................................................................................................. 26 4 1.25 1.25 - 0.75 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAATGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGTT........................................................................................................................................................................................................................................................... 29 4 1.00 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................GAGGGAAGTGCAGCAGTTCTGGGCC.............................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGAT...................................................................................................................................................................................................................................................... 29 4 1.00 1.00 - 0.75 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAATGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGT............................................................................................................................................................................................................................................................ 28 4 1.00 1.00 - 0.25 - 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................ACCCAATGGCAGCACCTAAAGTACGTTTta........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGTCCCCAGCACTGCAGATCCGCAa................... 28 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TTCATGACCAAAATTTATCATCCTAATGaagt............................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 aagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGATA..................................................................................................................................................................................................................................................... 29 5 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - -
..................TTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCACCTA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 6 1.00 1.00 - - - - - - - 0.17 - - 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................ACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGAat..................................................................................................................................................................................................................................................... 27 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTA......................................................................................................................................................................................................................................................... 28 4 1.00 1.00 - 0.25 0.50 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CTTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCACCTAt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTT.......................................................................................................................................................................................................................................................... 25 4 1.00 1.00 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - -
........................................................................................CAAGTTGGGAAGAATATGTTTAt........................................................................................................................................................................................................................................................ 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TAGACAAGTTGGGAAGAATATGTaa.......................................................................................................................................................................................................................................................... 25 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TAAACTTGAACTATTCCTTCCAGAAGAA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 5 0.80 0.80 - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TATCATCCTAATGTAGACAAGTTGG....................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 5 0.80 0.80 - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAATGTAGACAAGTTGGGAAGAATATG............................................................................................................................................................................................................................................................. 27 4 0.75 0.75 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGACCAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 4 0.75 0.75 - - - - 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................CACCTAAAGTACGTTTCATGAC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 4 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCACTGCAGATCCGCACAG................. 20 6 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGAT...................................................................................................................................................................................................................................................... 28 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTA......................................................................................................................................................................................................................................................... 25 5 0.60 0.60 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - -
.....................................................................................AGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGt....................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 0.60 1.80 - 0.40 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGA....................................................................................................................................................................................................................................................... 27 5 0.60 0.60 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TATCATCCTAATGTAGACAAGTTGGG...................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 -
.............................................................................................TGGGAAGAATATGTTTAGATATTTTGA............................................................................................................................................................................................................................................... 27 5 0.60 0.60 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................ATCATCCTAATGTAGACAAGTT......................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTCCTTCCAGAAGAATACCCAATGGCA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 7 0.57 0.57 0.14 - - - - - - 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTAC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 4 0.50 0.50 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - -
..............................................TAAAGTACGTTTCATGACCAAAATTTATCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 4 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 4 0.50 0.50 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ATGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGT............................................................................................................................................................................................................................................................ 26 4 0.50 0.50 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TAAAGTACGTTTCATGACCAAAATT................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 4 0.50 0.50 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TAAAGTACGTTTCATGACCAAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AGCACCTAAAGTACGTTTCATGACCAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 0.50 0.50 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGACCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 4 0.50 0.50 - - - - 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCACCTAt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 t 0.50 1.00 - - - - - - - - - - 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TACGTTTCATGACCAAAATTTATCATCCTA...................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGACt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 t 0.50 14.50 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.50 0.50 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................GGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGACC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 4 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGt....................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 0.50 3.25 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................AAAGTACGTTTCATGACCAAAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 4 0.50 0.50 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTCCTTCCAGAAGAATACCCAATGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 7 0.43 0.43 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................ATCATCCTAATGTAGACAAGTTGG....................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - -
......................................................................................GACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAG........................................................................................................................................................................................................................................................ 25 5 0.40 0.40 - - - - 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CAAGTTGGGAAGAATATGT............................................................................................................................................................................................................................................................ 19 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAt........................................................................................................................................................................................................................................................ 26 t 0.40 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - -
.....................................................................................AGACAAGTTGGGAAGAATATGTTT.......................................................................................................................................................................................................................................................... 24 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TTATCATCCTAATGTAGACAAGTTGG....................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 5 0.40 0.40 - - - 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCACCTA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.33 0.33 - - - - - 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCACC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTCCTTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 7 0.29 0.29 0.14 - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTCCTTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 7 0.29 0.29 0.14 - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TACCCAATGGCAGCACCTAAAGTAC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAG........................................................................................................................................................................................................................................................ 29 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CAGCACCTAAAGTACGTTTCATGACC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TCATCCTAATGTAGACAAGTTGGGAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 4 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAATGTAGACAAGTTGGGAAGAAT................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GCACCTAAAGTACGTTTCATGACCAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................ATCATCCTAATGTAGACAAGTTGGGAAGAA................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGATA..................................................................................................................................................................................................................................................... 30 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ATGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGTT........................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGACCAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TAAAGTACGTTTCATGACCAAttta................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 ttta 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................AATGTAGACAAGTTGGGAAGAATA............................................................................................................................................................................................................................................................... 24 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................CTAATGTAGACAAGTTGGGAAGAATATG............................................................................................................................................................................................................................................................. 28 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGACCt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 t 0.25 4.75 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................CCTAAAGTACGTTTCATGACCAAAATT................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GTAGACAAGTTGGGAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGACCAc.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 c 0.25 0.50 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAATGTAGACAAGTTGGGAAGAATA............................................................................................................................................................................................................................................................... 25 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................ACCTAAAGTACGTTTCATGACCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................AAAGTACGTTTCATGACCAAAATTTA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TCATCCTAATGTAGACAAGTTGGGAA.................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAATGTAGACAAGTTGGGAAG................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAATGTAGACAAGTTGGGAAGAAa................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 a 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAATGTAGACAAGTTGGGAAGAA................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 4 0.25 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGACCtt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 tt 0.25 4.75 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TACCCAATGGCAGCACCTAAAGTACGTTTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 4 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTACGTTTCATGACCAAAATT................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TAAAGTACGTTTCATGACCAAAATTTATC............................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TAAAGTACGTTTCATGACCAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 4 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGt....................................................................................................................................................................................................................................................... 30 t 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGAt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 0.25 4.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGT............................................................................................................................................................................................................................................................ 25 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................CTAAAGTACGTTTCATGACCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GAATACCCAATGGCAGCACCTAAAGTACGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCCTAATGTAGACAAGTTGGGAAGAATATG............................................................................................................................................................................................................................................................. 30 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................AATGTAGACAAGTTGGGAAGAATATG............................................................................................................................................................................................................................................................. 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GTAGACAAGTTGGGAAGAAT................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TACCCAATGGCAGCACCTAAAGTACGTT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CCAATGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TAATGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGTaaaa........................................................................................................................................................................................................................................................ 32 aaaa 0.25 1.00 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGAATACCCAATGGCAGCACCTAAAGTAC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGACCAAAATTTATCATCCTAATGTAGACA............................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................GGCAGCACCTAAAGTACGTTTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 4 0.25 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GTAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTA......................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TACCCAATGGCAGCACCTAAAGTACG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GCACCTAAAGTACGTTTCATGACCAAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TAAAGTACGTTTCATGACCAAAAT................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 4 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGATATTTT................................................................................................................................................................................................................................................. 32 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGATAa.................................................................................................................................................................................................................................................... 30 a 0.20 1.00 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGACCAAAATTTATCATCCTA...................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 5 0.20 0.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGGAAGAATATGTTTAGATATTTTGAAAG............................................................................................................................................................................................................................................ 30 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACTGCAGATCCGCACAGTTCTGC........... 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................ACAAGTTGGGAAGAATATGTT........................................................................................................................................................................................................................................................... 21 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - -
........................................................................................CAAGTTGGGAAGAATATG............................................................................................................................................................................................................................................................. 18 5 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TAAACTTGAACTATTCCTTCCAGAAGAATACC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGGAAGAATATGTTTAGATATTTTGAA.............................................................................................................................................................................................................................................. 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GGGAAGAATATGTTTAGATATTTTGAAAG............................................................................................................................................................................................................................................ 29 5 0.20 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................ACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGATATTTTGAAA............................................................................................................................................................................................................................................. 35 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGGGAAGAATATGTTTAGATATTTTGAA.............................................................................................................................................................................................................................................. 29 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGGAAGAATATGTTTAGATATTTTGAAA............................................................................................................................................................................................................................................. 29 5 0.20 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGATATT................................................................................................................................................................................................................................................... 30 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAACTTGAACTATTCCTTCCAGAAGAATAC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GACAAGTTGGGAAGAATATGTT........................................................................................................................................................................................................................................................... 22 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCATGACCAAAATTTATCATCCTAATGaagt............................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 aagt 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TTTATCATCCTAATGTAGACAAGTTG........................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TAAACTTGAACTATTCCTTCCAGAAGAAT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGATAT.................................................................................................................................................................................................................................................... 30 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCATGACCAAAATTTATCATCCTAATG................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AACTTGAACTATTCCTTCCAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TATCATCCTAATGTAGACAAGTTG........................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TAAACTTGAACTATTCCTTCCAGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGTGGTCCCCAGCACTGCAGATCCGC..................... 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCACCT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TACCCAATGGCAGCACCTA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17
................................................................................AATGTAGACAAGTTGG....................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................GGAAGAATATGTTTAGATATTTTGA............................................................................................................................................................................................................................................... 25 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTCCTTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 6 0.17 0.17 - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AATACCCAATGGCAGCACCT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 6 0.17 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GAAGAATACCCAATGGCAGCACCTAAA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................GGAAGAATATGTTTAGATATTTTGAA.............................................................................................................................................................................................................................................. 26 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCACCTAA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCCAGCACTGCAGATCCGCACAGTTC.............. 28 6 0.17 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCCCAGCACTGCAGATCCGCACAGTT............... 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCACCT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCCTTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 6 0.17 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AAGAATACCCAATGGCAGCACC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................GGAAGAATATGTTTAGATATTTTGAAA............................................................................................................................................................................................................................................. 27 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................GGAAGAATATGTTTAGATATTTTGAAAG............................................................................................................................................................................................................................................ 28 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCACTGCAGATCCGCACAGTTC.............. 22 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTCCTTCCAGAAGAATACCCAATGGCAt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 0.14 0.57 - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 7 0.14 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTCCTTCCAGAAGAATACCCAATGGCAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTCCTTCCAGAAGAATACCCAATGGCAtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 tt 0.14 0.57 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGAACTATTCCTTCCAGAAGAATACC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AATACCCAATGGCAGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCTATCAATCCAG 16 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AAGAATACCCAATGGCA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GTTTAGATATTTTGAA.............................................................................................................................................................................................................................................. 16 19 0.05 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TTAAACTTGAACTATTCCTTCCAGAAGAATACCCAATGGCAGCACCTAAAGTACGTTTCATGACCAAAATTTATCATCCTAATGTAGACAAGTTGGGAAGAATATGTTTAGATATTTTGAAAGGTAAGTGTTGTTTGTCACCCTGTGCTTTATTAACGTGTCCTTTTTGTCCTAAGCATTCTACATTTAGAATGTAAGCATTGGAATCTCACTGTATGCTAACAGCCCCAGAGTGTGTGGGAGGGAAGTGCAGCAGTTCTGGGCCTGTTGTCCATGCTTTATCATATACTGGGCCTGTTACCTTCATAGATAAGTGGTCCCCAGCACTGCAGATCCGCACAGTTCTGCTATCAATCCAG
..................................................................((((.((((.(((((((........))))))).)).)).))))..........................................................................................................................................................................................................................................................
..................................................51...............................................................116.................................................................................................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCGCACAGTTCTGCTATCAATCCA. 26 5 0.20 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -