(11)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(8)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(46)
TESTES

Sense strand
TGCAGAGAATGACCGGAACTGGATGTTAACCAGTTAGGATAACCAGAAACGTAAATATGTTTCTCTGCCGCTTTGGTCTTCGTCGCTGTCGTCCTTGACCCAAAATAATTCCTCATTCGCTCAACGTGCCCAGAGCCAAAAACAATCCTCGGGTCGAGGGCAGGGAAGGGCTAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGCGTGACCTTGGGTTAGAGTACATGGAAGCATTAGCTTCGGTGCAGGATAACACGTGCGGGTCCCCGCAGGGCAATGGGGAGGGATGAGACACGGTGCTGTTTCCATGGGAACCATGCGCCTCAACACTGTACCTGGAACGCAGATGCACAGGCAGTCGGTGTTGAAAAGTTGTAAGGGACATCTGCAGATGTTACATACAAATAAGTAAATAAGTGAGACTGCAATGGGGCCCAGTGGATTACAGTGTTTGCGGCCAAAGTGATGACCTAAATTAAGGTCCATAGGTGGAAGAAGTACCTTGTTCAATCACATCTTCACTAGCTTTCTGTTTTCCAAGGTTTCCTTTGCTGCTTAAGCTCGGCTGTCCTGGATCTTGCTCTGTAGACC
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((.......(((...(((((.(((((......)))))....(((.(((.(((...))).))).)))......))))).)))..))))..........................................................
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................436................................................................................................535................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 138.00 138.00 64.00 32.00 2.00 3.00 8.00 3.00 5.00 - 2.00 - - 5.00 1.00 - 1.00 5.00 4.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 71.00 71.00 12.00 11.00 - - 5.00 16.00 3.00 16.00 - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - 2.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 32.00 32.00 15.00 - 1.00 - 1.00 1.00 3.00 4.00 - - 1.00 - 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGGGTTAGAGTACATGGAAGCATTAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 18.00 18.00 9.00 3.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................AAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 17.00 17.00 7.00 2.00 - - 3.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 17.00 17.00 6.00 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 5.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TTGTGTGACTGCGGGAGAGCGTGAC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 15.00 15.00 8.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAACCAGTTAGGATAACCAGAAACGTA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 - - 4.00 1.00 - - - - - 1.00 2.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................AAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 12.00 12.00 5.00 3.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................GCTAAAGATTTGTGTGACT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 10.00 10.00 8.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGACTGCGGGAGAGCGTGACCTTGG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 9.00 9.00 - - 3.00 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................AGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGCGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 7.00 7.00 - 1.00 2.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCCTCAACACTGTACCTGGAACGC....................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 7.00 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAAATAAGTAAATAAGTGAGACTGC..................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TTAGCTTCGGTGCAGGATAACACGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGTGACTGCGGGAGAGCGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 5.00 5.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TGACCTTGGGTTAGAGTACATGGAAGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAAAGTTGTAAGGGACATCTGCAG........................................................................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TAGGATAACCAGAAACGTAAATATGTTTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACACTGTACCTGGAACGCAGATGCACA.............................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TAATTCCTCATTCGCTCAACGTGCCC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGCGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TTAGCTTCGGTGCAGGATAACACGTGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTACCTGGAACGCAGATGCACAGGC........................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGTAAATAAGTGAGACTGCAATGG................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTACAGTGTTTGCGGCCAAAGTGATG........................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGAAGCATTAGCTTCGGTGCAGGA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTTTCTCTGCCGCTTTGGTCTTCGT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGTGACTGCGGGAGAGCGTGACCTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TAGCTTCGGTGCAGGATAACACGTGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTACCTGGAACGCAGATGCACAGGCA.......................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................AAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGCGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.................................................................................................................................................................................TTTGTGTGACTGCGGGAGAGCGTGAC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GAGTACATGGAAGCATTAGCTTCGGTGg......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 g 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GAAGCATTAGCTTCGGTGCAGGATAACA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................TTCGGTGCAGGATAACACGTGCGGGT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAACCAGTTAGGATAACCAGAAACGTAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGTGTGACTGCGGGAGAGCGTGACCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................AGGGCTAAAGATTTGTGTGACTGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TCCTCATTCGCTCAACGTGCCCAGAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCCTCGGGTCGAGGGCAGGGAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGATTACAGTGTTTGCGGCCAAAGT............................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAAATAAGTAAATAAGTGAGACTGCA.................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGACTGCGGGAGAGCGTGACCTTGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGTGAGACTGCAATGGGGCCCAGT........................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................GATTTGTGTGACTGCGGGAGAGCGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAAAGTTGTAAGGGACATCTGCAGATGTT................................................................................................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAAAGTTGTAAGGGACATCTGCAGA....................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................ATTTGTGTGACTGCGGGAGAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GGGCTAAAGATTTGTGTGACT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGGCTGTCCTGGATCTTGCTCTGTAGACaa 31 aa 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGGTCTTCGTCGCTGTCGTCCTTGAC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................GCCGCTTTGGTCTTCGTCGCTGTCGTCCTT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TAGGATAACCAGAAACGTAAATATGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAACCAGTTAGGATAACCAGAAACGTAAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGCATTAGCTTCGGTtca........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 tca 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TAGGATAACCAGAAACGTAAATATGTTTCTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGCCTCAACACTGTACCTGGAACGC....................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTCCTCATTCGCTCAACGTGCCCAGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGc..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 c 1.00 71.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCATGGGAACCATGCGCCTCAACAC..................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ATAATTCCTCATTCGCTCAACGTGCC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTGAAAAGTTGTAAGGGACATCTGC.......................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 17.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TAGGATAACCAGAAACGTAAATATGTT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTTTCTCTGCCGCTTTGGTCTTCG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGGTCTTCGTCGCTGTCGTCCTTGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATACAAATAAGTAAATAAGTGAGACTG...................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAAATAAGTAAATAAGTGAGACTGCAA................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAAAGTTGTAAGGGACATCTGCAGAT...................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACGCAGATGCACAGGCAGTCGGT.................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................ATTCGCTCAACGTGCCCAGAGCCAAc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGCCTCAACACTGTACCTGGAACcc....................................................................................................................................................................................................................................................... 27 cc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TGCCGCTTTGGTCTTCGTCGCTGgc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 gc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAATAAGTGAGACTGCAATGGGGCCC........................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGATCTTGCTCTGTAGACCcggc 24 cggc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CAGAGAATGACCGGAACTGGATGTTAAC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................TAACCAGTTAGGATAACCAGAAACGTt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAGCTCGGCTGTCCTGGATattt........... 25 attt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGTAAATAAGTGAGACTGCAATGGG............................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................GTGACTGCGGGAGAGCGTGACCTTGGGTT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TAGCTTCGGTGCAGGATAACACGTGCGGGT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTTTCTCTGCCGCTTTGGTCTTCGTCGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................AAGGGCTAAAGATTTGTGTGACTGCGG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAGTGTTTGCGGCCAAAGTGATG........................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................GCTTCGGTGCAGGATAACACGggc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 ggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAAATAAGTAAATAAGTGAGACTGCAATG................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACGCAGATGCACAGGCAGgggg..................................................................................................................................................................................................................................... 26 gggg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAATAAGTGAGACTGCAATGGGGCC............................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GTTAGAGTACATGGAAGCA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGTCCATAGGTGGAAGAAGTACCT........................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAATATGTTTCTCTGCCGCTTTGGTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TTGTGTGACTGCGGGAGAGCGTGACCa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GTGTGACTGCGGGAGAGCGTGACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGCGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................ACCAGTTAGGATAACCAGAAA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TTCGTCGCTGTCGTCCTTGACCCAAAc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 c 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GCAGAGAATGACCGGAACTGGATG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................AGGATAACCAGAAACGTA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAAAGTTGTAAGGGACATCTGCAG........................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGGggg..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 ggg 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATTAAGGTCCATAGGTGGAAGAAGTAC.......................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACGCAGATGCACAGGCAGTCGGg.................................................................................................................................................................................................................................... 27 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAGTGTTTGCGGCCAAAGagat............................................................................................................................ 24 agat 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................CTCGGGTCGAGGGCAGGGAAGGGCTA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 t 1.00 71.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGTTAACCAGTTAGGATAACCAGAAACGT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAATGGGGCCCAGTGGA..................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGGTGGAAGAAGTACCTTGTTCAATC............................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GAGTACATGGAAGCATTAGCTTCGGTGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TAGCTTCGGTGCAGGATAACACGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGGTGGAAGAAGTACCTTGTTCAATCACA............................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGGAGGGATGAGACACGGTGCTGTT............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GAAGCATTAGCTTCGGTGCAGGA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCGGCCAAAGTGATGACCTAAATTA................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTACAGTGTTTGCGGCCAAAGTGATGAC......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTCCTCATTCGCTCAACGTGCCCAGAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAACCATGCGCCTCAACACTGTACCT.............................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TTCTCTGCCGCTTTGGTCTTCGTCG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATTACAGTGTTTGCGGCCAAAGTGAc............................................................................................................................ 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................AGTTAGGATAACCAGAAACG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGGAACGCAGATGCACAGGCAGTCGGTG................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TTCTCTGCCGCTTTGGTCTTCGTCGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGTAAATAAGTGAGACTGCAATGGt............................................................................................................................................................... 27 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.GCAGAGAATGACCGGAACTGGAT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................AGGGAAGGGCTAAAaatt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 aatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTTGCGGCCAAAGTGATGACCTAAAT................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GGGCTAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGCGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TTGTGTGACTGCGGGAGAGCG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................AGGGCTAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGCG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGGTCTTCGTCGCTGTCGTCCTTGACC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAGTGTTTGCGGCCAAAGTGAT............................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAACCATGCGCCTCAACACTGTAC................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAACCAGTTAGGATAACCAGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGGAGGGATGAGACACGGTGCTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTAAATAAGTGAGACTGCAATGG................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGGGACATCTGCAGA....................................................................................................................................................................................................... 17 2 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TATGTTTCTCTGCCGCTTTGGTCTTCttc..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 ttc 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TATGTTTCTCTGCCGCTTTGGTCTTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................AGGGAAGGGCTAAAGATTTGTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
......................................................................................................................................................................AGGGCTAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGag.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 33 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GGGCTAAAGATTTGTGTGACTGCGG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CCAGTTAGGATAACCAGAAACGTA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
............................................................................................................................................................................AAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGTGGAAGAAGTACCTTGTTCAAT................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TTTGTGTGACTGCGGGAGAGCGTGACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGACACGGTGCTGTTTCCATGGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGGgggg.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gggg 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TAGGATAACCAGAAACGTAAATATGTTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAACCAGTTAGGATAACCAGAAACtta.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGTGACTGCGGGAGAGCGTGACCTTG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGGCCAAAGTGATGACCTAAATTA................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TTGACCCAAAATAATTCCTCATTCGCTCA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCTTTCTGTTTTCCAAGGTTTCCTT.......................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................CTCTGCCGCTTTGGTCTTCGTCGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACACTGTACCTGGAACGCAGATGCA................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTTTCTCTGCCGCTTTGGTCTTCGTC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAAAGTTGTAAGGGACATCTGCAGATGT.................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGATTACAGTGTTTGCGGCCAAAG................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TAACACGTGCGGGTCCCCGCAGGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGGGTTAGAGTACATGGAAGCATTAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TGACCCAAAATAATTCCTCATTCGCTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................AAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAGTGTTTGCGGCCAAAGTGATGA.......................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTTTCTCTGCCGCTTTGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTGGGTTAGAGTACATGGAAGCATTAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TTGTGTGACTGCGGGAGAGCGTGACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACACTGTACCTGGAACGCA...................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAATAAGTAAATAAGTGAGACTGCAATGG................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGTGTGACTGCGGGAGAGCGTGACCTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GCTTTGGTCTTCGTCGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAATGGGGCCCAGTGGATTACAGTG............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATTACAGTGTTTGCGGCCAAAGTG.............................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTCTTCGTCGCTGTCGTCCTTGACCCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTAAATAAGTGAGACTGCAATGGt............................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................ACCAGTTAGGATAACCAGAAACGTAAAT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TAAAGATTTGTGTGACTGCGGGgg...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 gg 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATGGGAACCATGCGCCTCAACACTGT.................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGGTCCATAGGTGGAAGAAGTACtt........................................................................................ 27 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TAATTCCTCATTCGCTCAACGTGCCCAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGGGACATCTGCAGATGTTACAT............................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACGCAGATGCACAGGCAGTCGGTG................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAGTGTTTGCGGCCAAAGTGATGt.......................................................................................................................... 26 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTGTTTGCGGCCAAAGTGATtacc........................................................................................................................ 26 tacc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...AGAGAATGACCGGAACTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGCCAAAAACAATCCaac.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 aac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAACCATGCGCCTCAACACTGTACC............................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACCTGGAACGCAGATGCACAGGCAGT........................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAAGGTTTCCTTTGCTGCTTAAGCTC............................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TCCTCATTCGCTCAACGTGCCCAGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGCAGAGAATGACCGGAACTGGATGTTAACCAGTTAGGATAACCAGAAACGTAAATATGTTTCTCTGCCGCTTTGGTCTTCGTCGCTGTCGTCCTTGACCCAAAATAATTCCTCATTCGCTCAACGTGCCCAGAGCCAAAAACAATCCTCGGGTCGAGGGCAGGGAAGGGCTAAAGATTTGTGTGACTGCGGGAGAGCGTGACCTTGGGTTAGAGTACATGGAAGCATTAGCTTCGGTGCAGGATAACACGTGCGGGTCCCCGCAGGGCAATGGGGAGGGATGAGACACGGTGCTGTTTCCATGGGAACCATGCGCCTCAACACTGTACCTGGAACGCAGATGCACAGGCAGTCGGTGTTGAAAAGTTGTAAGGGACATCTGCAGATGTTACATACAAATAAGTAAATAAGTGAGACTGCAATGGGGCCCAGTGGATTACAGTGTTTGCGGCCAAAGTGATGACCTAAATTAAGGTCCATAGGTGGAAGAAGTACCTTGTTCAATCACATCTTCACTAGCTTTCTGTTTTCCAAGGTTTCCTTTGCTGCTTAAGCTCGGCTGTCCTGGATCTTGCTCTGTAGACC
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((.......(((...(((((.(((((......)))))....(((.(((.(((...))).))).)))......))))).)))..))))..........................................................
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................436................................................................................................535................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCTGGATCTTGCTCTGt...... 19 t 8.00 0.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCTGTCCTGGATCTTGCTCTGTAagat.... 28 agat 6.00 0.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTTTCTGTTTTCCAggaa.................................................... 20 ggaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCTGTCCTGGATCTTGCTCTGTaaaa..... 27 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCTGTCCTGGATCTTGCTCTGTAaacc.... 28 aacc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................CGGGAGAGCGTGACCac............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCTGGATCTTGCTCTGTAGatct... 26 atct 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCGGCTGTCCTGGATCTTGCTCTGTA.... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TGCCGCTTTGGTCTTCGTCGCTGTCG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCTTCGTCGCTGTCGTCCTTGACCCAAAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GTCGTCCTTGACCCAAAATAATTCCTCA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -