(1)
OTHER.ip
(9)
OTHER.mut
(7)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(42)
TESTES

Sense strand
GGATGTGCTGCAGGACACGAGCCAGGAGCCCATGGTGCGTCATGAGGCAGGTGAGGAAGGGCAGCCCAGTGCTGTGTTCAGCTCTGTCCCTGGGGCACAGATGGGTGCCGCACAGGGCTATGGACAGCGCACGGGGGTGGTCTCCCCAGCAGAGATTTTGCTTCTGAGTTGGGACCTATGCCAACCTGTTCTTCAGGGACTTGGAATGCTGTCCCTCTGCCCAAAGTCTAGTGATGACTTGTCACTCCACCCAGGGGCACTGGCTGGGGTGGGTGGCTTTAGACCCGGCGGGCCAACTTCTTGAGTTAAGGATTCGGATTGACCAGCTCAGAGGCTGTTGGCCCAGCTGTGACCTGGGAGACCAGTCAGGTGTTGGGCATCAAGCAAGCTCCTCTCTACTGATTTGTCTCCTCAGGGGAAGCCCTGGGGGCGATTGGTAACCCGGAAGTTCTAGGCCTCCTGAAG
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((((((.((((((.....((((.........)).))......)))))).)))))).)))..................................................
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................350..............................................................415................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGACCAGTCAGGTGTTGG......................................................................................... 22 1 5.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTAACCCGGAAGTTCTAGGCCTCC..... 26 1 5.00 5.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........TGCAGGACACGAGCCAGGAGCCCATGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGATTGGTAACCCGGAAGTTCTAGGCCT....... 28 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCAGGACACGAGCCAGGAGCCCATGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCTACTGATTTGTCTCCTCAGt................................................. 24 t 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...TGTGCTGCAGGACACGAGCCAGGAGCCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGTTAAGGATTCGGATTGACCAGC.......................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TGCTGCAGGACACGAGCCAGGA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GGTGCGTCATGAGGCAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCAGGACACGAGCCAGGAGCCCATG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................ACAGGGCTATGGACAGCGCACGGGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGGATTCGGATTGACCAGCTCAG...................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCTACTGATTTGTCTCCTCAG.................................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAGTTAAGGATTCGGATTGACCAGC.......................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGACCAGTCAGGTGTTGGG........................................................................................ 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGACCAGTCAGGTGTTGGGt....................................................................................... 24 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCCCAGCTGTGACCTGGGAGACCAGTC.................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCAGGACACGAGCCAGGAGCCCATGa.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTAACCCGGAAGTTCTAGGCCTCCTG... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.....TGCTGCAGGACACGAGCCAGGAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGTGCTGCAGGACACGAGCCAGGAGCCCg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 g 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAAGGGCAGCCCAGTGCTGT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGACCAGTCAGGTGTTGGGa....................................................................................... 24 a 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGATTGGTAACCCGGAAGTTCTAGGC......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGTGCTGCAGGACACGAGCCAGGAGCCCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCTACTGATTTGTCTCC...................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTACTGATTTGTCTCCTCAGt................................................. 23 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTAACCCGGAAGTTCTAGGCCTCCTG... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTAACCCGGAAGTTCTAGGCC........ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGACCAGTCAGGTGTTGGtaa...................................................................................... 25 taa 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCTACTGATTTGTCTCCTCt................................................... 22 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTAACCCGGAAGTTCTAGGCCTCCTGAA. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGCCAACCTGTTCTTa............................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 a 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTAACCCGGAAGTTCTAGGCCTCCT.... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GGACACGAGCCAGGAGCCCATGGTGCGTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCTACTGATTTGTCTCCTtag.................................................. 23 tag 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GCTGCAGGACACGAGCCAGGAGCCCATGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....TGCTGCAGGACACGAGCCAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTACTGATTTGTCTCCTCAG.................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGTAACCCGGAAGTTCTAGGCCTC...... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGATTGGTAACCCGGAAGTTCTAGG.......... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........AGGACACGAGCCAGGAGCCCATGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATTGGTAACCCGGAAGTTCTAGGCCTC...... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GCTGCAGGACACGAGCCAGGAGCCCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGATTGGTAACCCGGAAGTTCTAGGCC........ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATTGGTAACCCGGAAGTTCTAGGC......... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................AACCTGTTCTTCAGGGACTTGGAATGC................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTGGGAGACCAGTCAGGTGTTGGGCA...................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATTCGGATTGACCAGCTCAGAGGC.................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGGATTCGGATTGACCAGCTCAGA..................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GCAGGACACGAGCCAGGAGCCCATGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..ATGTGCTGCAGGACACGAGCCAGGAGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TGCTGCAGGACACGAGCCAGGAGCCCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCAGGACACGAGCCAGGAGCCCATa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CAGGACACGAGCCAGGAGCCCATGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAAGGGCAGCCCAGTGCTGTGTTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTAACCCGGAAGTTCTAGGCCT....... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGATGTGCTGCAGGACACGAGCCAGGAGCCCATGGTGCGTCATGAGGCAGGTGAGGAAGGGCAGCCCAGTGCTGTGTTCAGCTCTGTCCCTGGGGCACAGATGGGTGCCGCACAGGGCTATGGACAGCGCACGGGGGTGGTCTCCCCAGCAGAGATTTTGCTTCTGAGTTGGGACCTATGCCAACCTGTTCTTCAGGGACTTGGAATGCTGTCCCTCTGCCCAAAGTCTAGTGATGACTTGTCACTCCACCCAGGGGCACTGGCTGGGGTGGGTGGCTTTAGACCCGGCGGGCCAACTTCTTGAGTTAAGGATTCGGATTGACCAGCTCAGAGGCTGTTGGCCCAGCTGTGACCTGGGAGACCAGTCAGGTGTTGGGCATCAAGCAAGCTCCTCTCTACTGATTTGTCTCCTCAGGGGAAGCCCTGGGGGCGATTGGTAACCCGGAAGTTCTAGGCCTCCTGAAG
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((((((.((((((.....((((.........)).))......)))))).)))))).)))..................................................
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................350..............................................................415................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
......................................................................GCTGTGTTCAGCTCTGTCCCTGGGGCACAGATGGGTGCCGCACAGGGCTATG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 52 1 35.00 35.00 35.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AATGCTGTCCCTCTGCCCAAAGTCTA........................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 7.00 7.00 - 3.00 - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGCTGTCCCTCTGCCCAAAGTCTA........................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 5.00 5.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCCTCTCTACTGATTTGTCTCCTCA................................................... 27 1 5.00 5.00 - 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GCTGTCCCTCTGCCCAAAGTCTAGTGA....................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GCACGGGGGTGGTCTCCCCAGCAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTTGAGTTAAGGATTCGGATTGACCA............................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.......................................................GAAGGGCAGCCCAGTGCTGTGTTCAGCTCTGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTAAGGATTCGGATTGACCAGCTCAGA..................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGCATCAAGCAAGCTCCTCTCTACTGA............................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GTCCCTCTGCCCAAAGTCTAGTGATGA.................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCTCTACTGATTTGTCTCCTCA................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCCAGCTGTGACCTGGGAGACCAGTCA................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTCTCTACTGATTTGTCTCCTCAt................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GTCCCTCTGCCCAAAGTCTAGTGA....................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................AATGCTGTCCCTCTGCCCAAAGTCTAa........................................................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................GGCAGCCCAGTGCTGTGTTCAGCTCTGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................CTCTGCCCAAAGTCTAGTGATGACTTGTCt.............................................................................................................................................................................................................................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CCAGCAGAGATTTTGCTTCTGAGTTG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCGATTGGTAACCCGGAAGTTCt.............. 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGCCGCACAGGGCTagtt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 agtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGGCGATTGGTAACCCGGAAGTTCTA............ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGATTGGTAACCCGGAAGTT............... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAATGCTGTCCCTCTGCCCAAAGTCTA........................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GCTGTCCCTCTGCCCAAAGTCTAGTG........................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................CCAACCTGTTCTTCAGGGACTTGGAA................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATCAAGCAAGCTCCTCTCTAC.................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................GCCAACCTGTTCTTCAGGGACTTGGAA................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGCCCAAAGTCTAGTGATGACTTGTCA............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCTGTGACCTGGGAGACCAGTCAt................................................................................................. 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGCGGGCCAACTTCTTGAGTTA............................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GCTGTCCCTCTGCCCAAAGTCTAGT......................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................AAGGGCAGCCCAGTGCTGTGTTCAGCTCTGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAGGATTCGGATTGACCAGCTCA....................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GGTCTCCCCAGCAGAGATTTTGCTTCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................GGGACCTATGCCAACCTGTTCTTCA.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................ATGCTGTCCCTCTGCCCAAAGTCTA........................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................AACCTGTTCTTCAGGGACTTGGAATGC................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CTGCCCAAAGTCTAGTGATGACTTGTCA............................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTTGAGTTAAGGATTCGGATTGACCAG........................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGTCCCTCTGCCCAAAGTCTAGTG........................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................ATGGTGCGTCATGAGGCAGGTGAGGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTCTCTACTGATTTGTCTCCT..................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGCGGGCCAACTcatt....................................................................................................................................................................... 17 catt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TCCCCAGCAGAGATTTTGCTTCTGAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TCCCTCTGCCCAAAGTCTA........................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -