chr10:80317404 80317975 -
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(6)
PIWI.ip 		(5)
PIWI.mut 		(46)
TESTES

Sense strand
AAAGGGCGGGGCGGCGCCTGCGCAGAGCGACGTGAGGCGACAAGATGGCGGTGAGCATGTCTAGATCGTGGAAAGCAGGGCCGCGGGATCGAGGGTCTGTGGAAGCGAGAGCAGAAAGACTGAAAGGAGAGTGACGGACGCCCTAGAGTAGGGAGACAGGGTGCTGAAGGATGGGAGCCACGTGGGACTGCAGACGGAAGCCATGGGTACAGACCAGGTGACATGAAAAACAGACGACCGACATGAGGATGCAGACGCGGAACGTGGGGGTTGCAGACCAGGCAGACAGGGGTGCGTACAGGAAACAGTGCAGATGGGGTATCCAGGGATGCAGATGAGGACGTGGGCATGCAGACAGAAATGCAGACTCGGGCATAGCATTCAATTAGGCAGACACTGGAGGTGAGGATGCACCCAGGGTTCTGGGAGCCTGAGTTGGAAAGGAGTCCCTGGGTGCCATGCCCAGGCTACAGGGATATGGGGAGGCTGGACCTCTCTCCTCAGCGCCCCACCTCCCAGCAGGACAAAGAGAAAAAGAAGAAAGAAAGCATCTTGGACCTCTCCAAGTACAT
.....................................................................................................................................................................................................................(((..((.(((...........((((..((((....(((....)))...))))..))))(((..((.........))..)))............)))))..))).(((((....)))))...........((((..((((........))))..)))).........................................................................................................................................................................................................
.....................................................................................................................................................................................................................214..................................................................................................................................................................379...............................................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
..........................................................................................................................................................................................................................TGACATGAAAAACAGACGACCGACATG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGCAGAAAGACTGAAAGGAGAGTGACG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGAGCGACGTGAGGCGACAAGATGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................GTCTAGATCGTGGAAAGCAGGGCC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 6.00 6.00 - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................GTCTAGATCGTGGAAAGCAGGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 6.00 6.00 - - - 5.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................ACCGACATGAGGATGCAGACGCGGAAC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................GTCTAGATCGTGGAAAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 5.00 5.00 - - - - 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GCGGGATCGAGGGTCTG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 5.00 5.00 - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TGGAAGCGAGAGCAGAAAGACTGAAAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 5.00 5.00 - 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................GTCTAGATCGTGGAAAGCAGGGCCGCGGGATCGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 34 1 5.00 5.00 - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................GTCTAGATCGTGGAAAGCAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 4.00 4.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................ACAGGGTGCTGAAGGctt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 ctt 4.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TGGAAGCGAGAGCAGAAAGACTGAAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGATGCAGACGCGGAACGTGGGGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................GACGACCGACATGAGGATGCAGACGCG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................AAAAACAGACGACCGACATGAGGATG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGAGCGACGTGAGGCGACAAGATGGCt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 3.00 6.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGCATGTCTAGATCGTGGAAAGCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...................................................................................................TGGAAGCGAGAGCAGAAAGACTGAAAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTCTGTGGAAGCGAGAGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGACAGAAATGCAGACTCGGGCA..................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AAAGGAGAGTGACGGACGCCCTAGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGATGAGGACGTGGGCATGCAGA......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGACAGAAATGCAGACTCGGGCATA................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................ATGAGGATGCAGACGCGGAACGTGGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GCAGAGCGACGTGAGGCGACAAGAT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................ACTGAAAGGAGAGTGACGGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GAAGCGAGAGCAGAAAGACTGAAAGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGACTCGGGCATAGCATTCAATTA........................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGAGCGACGTGAGGCGACAAGATGGCG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................AACAGACGACCGACATGAGGATGCAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ACGGACGCCCTAGAGTAGGGAGACAGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTGAGCATGTCTAGATCGTGGAAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................ACAGGGTGCTGAAGGcttt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 cttt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAATGCAGACTCGGGCATAGCATTC............................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGACAGAAATGCAGACTCGGGCATt................................................................................................................................................................................................... 28 t 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGCCTGAGTTGGAAAGGAGTCC........................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ACATGAAAAACAGACGACCGACATGAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTCCTCAGCGCCCCACCTCCCAGCAG.................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GACTGAAAGGAGAGTGACGGACGCCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGAGCGACGTGAGGCGACAAGATGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGCAGACGGAAGCCATGGGTACAGACCAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AAAGGAGAGTGACGGACGCCCTAGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCATTCAATTAGGCAGACACTGGAG.......................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................ACTGAAAGGAGAGTGACGGACGCCCTAtt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GAGCAGAAAGACTGAAAGGAGAGTGACG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTGAGCATGTCTAGATCGTGGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................CTGAAGGATGGGAGCCACGTGGGAC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ACATGAAAAACAGACGACCGACATGAGt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................ATGTCTAGATCGTGGAAAGCAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GACTGAAAGGAGAGTGACGGACGCCCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATCCAGGGATGCAGATGAGGACGTG................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGCAGAAAGACTGAAAGGAGAGTGA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGACGTGGGCATGCAGACAGAAAT.................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GTGGAAAGCAGGGCCGCGGGATCGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
........................................................ATGTCTAGATCGTGGAAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AAAGGAGAGTGACGGACGCCCTA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAAGAAAGCATCTTGGACCTCTCC........ 26 2 1.00 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGAAAAACAGACGACCGACATGAGGATG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GAGCAGAAAGACTGAAAGGAGAGTGAaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GTGACGGACGCCCTAGAGTAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCAGCAGGACAAAGAGAAAAAGAAGA............................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................CAAGATGGCGGTGAcagc.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 cagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................AGATCGTGGAAAGCAGGGCCG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................CTAGAGTAGGGAGACAGGGTGCTGAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGCATGTCTAGATCGTGGAAAGCAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................CTAGATCGTGGAAAGCAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GAAGCGAGAGCAGAAAGACTGAAAGGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGACAAAGAGAAAAAGAAGAAAGAAAG........................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCTAGATCGTGGAAAGCAGGGCCGCGGGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GATGGCGGTGAGCATGTCTAGAT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGAAAAACAGACGACCGACATGAGGAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................CCGACATGAGGATGCAGACGCGGAAC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................ATCGAGGGTCTGTGGAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACAGGGATATGGGGAGGCTGGACCTC............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGACTCGGGCATAGCATTCAATTAGGC..................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGACGTGGGCATGCAGACAGAAA................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGACAGAAATGCAGACTCGGGCAat................................................................................................................................................................................................... 28 at 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GACGTGAGGCGACAAGATGGCGGaaa...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGCATGTCTAGATCGTGGAAAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCAATTAGGCAGACACTGGAGGTGAG..................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GACCAGGTGACATGAAAAACAGACGAC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGGGAGCCACGTGGGACTGCAGACGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGCAGACGGAAGCCATGGGTACAGAC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GAGTAGGGAGACAGGGTGCTGAAGGAT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................GATGCAGACGCGGAACGTGGGGGTT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................ACTGAAAGGAGAGTGACGGACGCCCTAGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................CCAGGTGACATGAAAAACAGACGACCGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGCAGATGAGGACGTGGGCAT.............................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................CGACGTGAGGCGACAAGATGGCGGata...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ata 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGAAAGGAGAGTGACGGACGCCCTAG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................AGAAAGACTGAAAGGAGAGTGACGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGCATGTCTAGATCGTGGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTCGGGCATAGCATTCAAT.......................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGCAGAAAGACTGAAAGGAGAGTGAC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGCATGTCTAGATCGTGGAAAGCAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGAGCGACGTGAGGCGACggc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 ggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GACGGACGCCCTAGAGTAGGGAGACAGGGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCAATTAGGCAGACACTGGAGGTGAGG.................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................AAAAACAGACGACCGACATGAGGATGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................AAACAGACGACCGACATGAGGATGCAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AAAGGAGAGTGACGGACGCCCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ACGGACGCCCTAGAGTAGGGAGACAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAAGAAAGCATCTTGGACCTCTC......... 28 2 1.00 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - -
.......................AGAGCGACGTGAGGCGACA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGCATGTCTAGATCGTGGAAAGCAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTGAGCATGTCTAGATCGTGGAAAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................AGCGAGAGCAGAAAGACTGAAAGGAGAGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................AGGATGCAGACGCGGAACGTGGGGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................AGGGTCTGTGGAAGCGAGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCTAGATCGTGGAAAGCAGGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAGGACAAAGAGAAAAAGAAGAAA............................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................AAACAGACGACCGACATGAGGATGCAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GAAAGACTGAAAGGAGAGTGACGGACGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGTTGGAAAGGAGTCCCTGGGTGCC.................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AAAGACTGAAAGGAGAGTGACGGACGCCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCATGCAGACAGAAATGCAGACTCGG........................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................AGACTGAAAGGAGAGTGACGGACGCCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGTGGAAGCGAGAGCAGAAAGACTGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GAAAGACTGAAAGGAGAGTGACGGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................CTAGATCGTGGAAAGCAGGGCCG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................CTGCAGACGGAAGCCATGGGa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCAGGCTACAGGGATATGGGGA........................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................ATCGAGGGTCTGTGGAAGCGAGAGCAGAA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GCATGTCTAGATCGTGGAAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGCATGTCTAGATCGTGGAAAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................AGGCGACAAGATGGCGGTG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................CTAGATCGTGGAAAGCAGGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................ATGAGGATGCAGACGCGGAACGTGGGGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................ACAGGGTGCTGAAGGcta............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 cta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGGGATGCAGATGAGGACGTGGGC................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGGGATGCAGATGAGGACGTGGG................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGCAGACGGAAGCCATGGGTACAGACC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCAGACACTGGAGGTGAGGATGC................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................ACAGACCAGGTGACATGAAAAACAGAa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGCGTACAGGAAACAGTGCAGATGG............................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGCATGTCTAGATCGTGGAAAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGCGACGTGAGGCGACAAGATGGCGGa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGCATGTCTAGATCGTGGAAAGCAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................AGTAGGGAGACAGGGTGCTGAAGGATGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................GAGCCACGTGGGACTGCAGACGGAAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................ACCGACATGAGGATGCAGACGCGGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................ACAGGGTGCTGAAGGctta.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 ctta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................AAAAACAGACGACCGACATGAGGATGCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GACGCGGAACGTGGGGGTTGCAGACC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGTTGGAAAGGAGTCCCTGGGTGCCc................................................................................................................. 28 c 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................AAACAGACGACCGACATGAGGATGCAGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................AGAAAGACTGAAAGGAGAGTGACGGACGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCTAGATCGTGGAAAGCAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACCAGGCAGACAGGGGTGCGTA.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGCTGAAGGATGGGAGCCACGT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AAAGACTGAAAGGAGAGTGACGGACGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AAAGACTGAAAGGAGAGTGACGGACGCC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGCGACGTGAGGCGACAAGATGGCGG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGACGCGGAACGTGGGGGTTGCAt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGACGCGGAACGTGGGGGTTGCA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TGGCGGTGAGCATGTCTAGATCGTGGAAAGCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................ACAGGGTGCTGAAGGATGGGAGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGACATGAAAAACAGACGACCGACATGAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TGGGACTGCAGACGGAAGCCATGGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTCTGTGGAAGCGAGAGCAGAAAGAC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAAGCATCTTGGACCTCTCCAAGTA... 27 2 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................AGGATGCAGACGCGGAACGTGGGGt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GAGCGACGTGAGGCGACAAGATGGCGcca....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 cca 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAAAAGAAGAAAGAAAGCATCTTGGACCT............ 29 4 0.75 0.75 0.50 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAAGAAAGCATCTTGGACCTCT.......... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAAGAAGAAAGAAAGCATCTTGGACCTC........... 28 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGACGTGGGCATGCAG.......................................................................................................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................AGATCGTGGAAAGCAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................CTGAAGGATGGGAGCCAC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GTGAGGCGACAAGATGGCG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
..............................................................AGATCGTGGAAAGCAGGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAAGAAAGCATCTTGGACCTCTCCAA...... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GACGTGAGGCGACAAGATGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGAAAAAGAAGAAAGAAAGCATCTTGGACC............. 31 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - -
................................................................ATCGTGGAAAGCAGGGCC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACAAAGAGAAAAAGAAGAAAGAAAGC....................... 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACAAAGAGAAAAAGAAGAAAGAAAGCATCTT.................. 31 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGAAAAAGAAGAAAGAAAGCATCTTGGAC.............. 31 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGAAAAAGAAGAAAGAAAGCATCTTG................. 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGGGGAGGCTGGACC............................................................................... 16 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGAAAAAGAAGAAAGAAAGCATCTTGGAC.............. 30 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAAAAGAAGAAAGAAAGCATCTTGGAC.............. 29 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAAGAGAAAAAGAAGAAAGAAAGCATC.................... 28 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAAAAGAAGAAAGAAAGCATCTTGGACC............. 29 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACAAAGAGAAAAAGAAGAAAGA........................... 23 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAAAAGAAGAAAGAAAGCATCTTGGACCT............ 30 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAAAGAAGAAAGAAAGCATCTTGGACC............. 27 4 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AAAGGGCGGGGCGGCGCCTGCGCAGAGCGACGTGAGGCGACAAGATGGCGGTGAGCATGTCTAGATCGTGGAAAGCAGGGCCGCGGGATCGAGGGTCTGTGGAAGCGAGAGCAGAAAGACTGAAAGGAGAGTGACGGACGCCCTAGAGTAGGGAGACAGGGTGCTGAAGGATGGGAGCCACGTGGGACTGCAGACGGAAGCCATGGGTACAGACCAGGTGACATGAAAAACAGACGACCGACATGAGGATGCAGACGCGGAACGTGGGGGTTGCAGACCAGGCAGACAGGGGTGCGTACAGGAAACAGTGCAGATGGGGTATCCAGGGATGCAGATGAGGACGTGGGCATGCAGACAGAAATGCAGACTCGGGCATAGCATTCAATTAGGCAGACACTGGAGGTGAGGATGCACCCAGGGTTCTGGGAGCCTGAGTTGGAAAGGAGTCCCTGGGTGCCATGCCCAGGCTACAGGGATATGGGGAGGCTGGACCTCTCTCCTCAGCGCCCCACCTCCCAGCAGGACAAAGAGAAAAAGAAGAAAGAAAGCATCTTGGACCTCTCCAAGTACAT
.....................................................................................................................................................................................................................(((..((.(((...........((((..((((....(((....)))...))))..))))(((..((.........))..)))............)))))..))).(((((....)))))...........((((..((((........))))..)))).........................................................................................................................................................................................................
.....................................................................................................................................................................................................................214..................................................................................................................................................................379...............................................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
..................TGCGCAGAGCGACGTGAGGCGACAAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CGTGGGACTGCAGAatac.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 atac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................GTGGGACTGCAGACatac......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 atac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCATGCAGACAgctt....................................................................................................................................................................................................................... 18 gctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CTGCGCAGAGCGACGTGAGGCGACAAa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -