(1)
OTHER.ip
(11)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(50)
TESTES

Sense strand
TTTCTCCCTAGGTGCCAAGCCGGGAGATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCAGGTGAGGTTCCACAGGCCTTGCGTGGGTACTCTCTCAGCGCTCCTCAGTGGCCCTGCCCCAGTCACTGACCCTCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCACTTTAAGATGGAGAAGCCCCCAGCACCTCCCAG
.................................................................(((((.....(((..((((((((.....)))))))).((((......))))..)))..((((((((.........))))))))...))))).........................................................
...............................................................64.................................................................................................163................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
..................................................TGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGC....................................................................................................................................... 28 1 43.00 43.00 5.00 4.00 2.00 5.00 1.00 - 3.00 - - 3.00 - - - - 3.00 - 1.00 3.00 1.00 1.00 3.00 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - -
.................................................TTGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGC....................................................................................................................................... 29 1 30.00 30.00 5.00 4.00 - 4.00 3.00 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................TGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCA...................................................................................................................................... 29 1 26.00 26.00 4.00 3.00 1.00 6.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 2.00 - 1.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACC............................................................................................................................................................. 28 1 14.00 14.00 1.00 4.00 1.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGAC.............................................................................................................................................................. 27 1 13.00 13.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..............................ACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACC............................................................................................................................................................. 26 1 9.00 9.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TTGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCA...................................................................................................................................... 30 1 9.00 9.00 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGA............................................................................................................................................................... 26 1 8.00 8.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTT................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGCACC...... 24 1 6.00 6.00 - - - - - 2.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTT.................................................................................................................................................................. 27 1 5.00 5.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGCAC....... 23 1 5.00 5.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCACT......................................................................................................................................................... 32 1 5.00 5.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCC............................................................................................................................................................ 29 1 5.00 5.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................GATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTT.................................................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGt............................................................................................................................................................... 26 t 4.00 3.00 - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCA...................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TGGACCCACTGGAACAGAG................................................................................................................................................ 19 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................ACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGAC.............................................................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGCACCTC.... 26 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGG................................................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GGAGATTGACAAGGCTGAGGGCAAGT..................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTT................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CAAGTTTTGGACCCACTGGAACAGAGA............................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGGGCAAGTTTTGGACCCACTGG....................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGCACCTCCC.. 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGGGCAAGTTTTGGACCCACTGGAAC.................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................ACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGA............................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................TTTGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGC....................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGCCAAGCCGGGAGATTGACAAGGCTGA............................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CGGGAGATTGACAAGGCTGc............................................................................................................................................................................. 20 c 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GAGATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTT................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................ACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGG................................................................................................................................................................ 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAG.......... 20 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGATTGACAAGGCTGAGGG.......................................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CCAAGCCGGGAGATTGACAAGGCTGA............................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TTTAAGATGGAGAAGCCCCCAGCACCT..... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGGGCAAGTTTTGGACCCACTG........................................................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGCACCTCC... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGA............................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGA............................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................ACTGGAACAGAGAAACCAAGCAG..................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CAAGTTTTGGACCCACTGGAACAGAG................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................ACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCC............................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.....................................................ACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCAG..................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CAAGTTTTGGACCCACTGGAACAGA................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTt................................................................................................................................................................. 24 t 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GACCCACTGGAACAGAGAAACCAAG........................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAG........................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGCCAAGCCGGGAGATTGACAAGGCT............................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TTGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAG........................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CGGGAGATTGACAAGGCTGAGGGCAAG...................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGCCAAGCCGGGAGATTGACAAGGCTGAt............................................................................................................................................................................ 29 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................ACAAGGCTGAGGGCAAG...................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GATTGACAAGGCTGAagc.......................................................................................................................................................................... 18 agc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..................................GGCTGAGGGCAAGTTTTGGAC.............................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCAt.......................................................................................................................................................... 31 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGA............................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TTTAAGATGGAGAAGCCCCCAG.......... 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GGAGATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTT................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGGGCAAGTTTTGGAC.............................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCAGt.................................................................................................................................... 31 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................AAGGCTGAGGGCAAGTTTTGG................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................TTTGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAA......................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGaccc............................................................................................................................................................. 28 accc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GGGCAAGTTTTGGACCCACTGGAACAGA................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TTGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCAa..................................................................................................................................... 31 a 1.00 9.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCAG..................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AGTTTTGGACCCACTGGAACAG.................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................AAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCACT......................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGGAGAAGCCCCCAGCACCTCC... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GAGGGCAAGTTTTGGACCCACTGGAAC.................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCAa..................................................................................................................................... 30 a 1.00 26.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................TTGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCAt..................................................................................................................................... 31 t 1.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGAgcca........................................................................................................................................................... 27 gcca 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGCCAAGCCGGGAGATTGACAAGGC................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................CCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCAGt.................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................CAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGG................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..............................................GTTTTGGACCCACTGGAACAGAG................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AGGCTGAGGGCAAGTTTT.................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGt................................................................................................................................................................ 26 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGGGCAAGTTTTGGACCCACT......................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCAttt........................................................................................................................................................ 33 ttt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........................................GGGCAAGTTTTGGACCCACTGGAAC.................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................ATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTT.................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGt......... 21 t 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TTGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAcc....................................................................................................................................... 29 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGCACCTCa... 27 a 1.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCACT......................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GAGATTGACAAGGCTGAGGGCAAGT..................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............TGCCAAGCCGGGAGATTGACAAGGCTGAa............................................................................................................................................................................ 29 a 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................AAGCCGGGAGATTGACAAGGCTGAGGGC......................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTG................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGCCGGGAGATTGACAAGGCTGAGGG.......................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...............................CAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCA........................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGCAtctc.... 26 tctc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................ACTGGAACAGAGAAACCAAGCAtt.................................................................................................................................... 24 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAA......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................ACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCAta......................................................................................................................................................... 30 ta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCAGttt.................................................................................................................................. 33 ttt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGCCAAGCCGGGAGATTGACAAGGCTt.............................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................AAGCCGGGAGATTGACAAGGCTGAGGGCt........................................................................................................................................................................ 29 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTT.................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GGAGATTGACAAGGCTGAGGGCAAG...................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCA........................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TTTCTTCAGTTCCACTTTAAGATGGAGAAGt................ 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GGGAGATTGACAAGGCTGAGGGCAA....................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCAta......................................................................................................................................................... 32 ta 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GAGATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTT.................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCC............................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CCACTTTAAGATGGAGAAGCCCCCAGC......... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGC......... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................AAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCA........................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACa............................................................................................................................................................. 28 a 1.00 13.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCACTGG....................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTa................................................................................................................................................................... 22 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGCACat..... 25 at 1.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TTCAGTTCCACTTTAAGATGGAGAAGC................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................ATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGG................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TTGGACCCACTGGAACAGAGAAACCA.......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................AGATGGAGAAGCCCCCAGCACCTCCCA. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................CACTGGAACAGAGAAACCAAGCAG..................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TTCTTCAGTTCCACTTTAAGATGGAGAAGC................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGCACa...... 24 a 1.00 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGCACCTatt.. 28 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................AGGGCAAGTTTTGGACCCACTGGA...................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTaa................................................................................................................................................................ 26 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GCCGGGAGATTGACAAGGCTGAGGG.......................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................CCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCAGtttt................................................................................................................................. 30 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GGAACAGAGAAACCAAGCAGtt................................................................................................................................... 22 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CCGGGAGATTGACAAGGCTGAGGGCAA....................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGGGCAAGTTTTGGACCCACTGGttt.................................................................................................................................................... 28 ttt 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTTTGGACCCACTGGAACAGAGAAACC........................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TTGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCtt..................................................................................................................................... 31 tt 1.00 30.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................GGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCAG..................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGGGCAAGTTTTGGACC............................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGCCAAGCCGGGAGATTGACAAGGCTG.............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AGGCTGAGGGCAAGTTTTGG................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCAC.......................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTTTAAGATGGAGAAGCCCCCAGC......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGG................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGC....................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................CTTTAAGATGGAGAAGCCCCCAGCAC....... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGCACCTa.... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTTTGGACCCACTGGAACAGAGAAAC............................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................GGGCAAGTTTTGGACCCACTGGA...................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGAt.............................................................................................................................................................. 27 t 1.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCAtt......................................................................................................................................................... 32 tt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GCCAAGCCGGGAGATTGACAAGGCTt.............................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TTGGACCCACTGGAACAGAGAAAC............................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................ACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTG................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCAGCAttt..... 25 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GGAGATTGACAAGGCTGAGGGCAA....................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGACAAGGCTGAGGGCAAGTT.................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTt................................................................................................................................................................. 28 t 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................ATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTT................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CAAGGCTGAGGGCAActtt................................................................................................................................................................... 19 cttt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAAGATGGAGAAGCCCCCA........... 19 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TTCTTCAGTTCCACTTTAAGATGGAGA................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -

Antisense strand
TTTCTCCCTAGGTGCCAAGCCGGGAGATTGACAAGGCTGAGGGCAAGTTTTGGACCCACTGGAACAGAGAAACCAAGCAGGTGAGGTTCCACAGGCCTTGCGTGGGTACTCTCTCAGCGCTCCTCAGTGGCCCTGCCCCAGTCACTGACCCTCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCACTTTAAGATGGAGAAGCCCCCAGCACCTCCCAG
.................................................................(((((.....(((..((((((((.....)))))))).((((......))))..)))..((((((((.........))))))))...))))).........................................................
...............................................................64.................................................................................................163................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
.......................................................................................................................................................TCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCA................................. 29 1 11.00 11.00 2.00 - 1.00 - 4.00 - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TCTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCA................................. 27 1 8.00 8.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CCTCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCA....................................... 25 1 4.00 4.00 - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................ACCCTCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCA....................................... 27 1 4.00 4.00 - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CCCTCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCA....................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GACCCTCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCA....................................... 28 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TCTCAGCGCTCCTCAagac....................................................................................... 19 agac 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCACTT.............................. 27 1 3.00 3.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GTTTTTTCTTCAGTTCCACTTTAAGA......................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCACTT.............................. 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTC................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCACTTTA............................ 29 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GACCCTCTCTCCTACAGTTTTTTCTT......................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CTCTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCA................................. 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TGACCCTCTCTCCTACAGTTTTTTC........................................... 25 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TCTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCAC................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TCTCAGCGCTCCTCAaga....................................................................................... 18 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CTCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTT.................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CCTCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCA................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................GGACCCACTGGAACAGAGAAACCAA......................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTTTGGACCCACTGGAACAGAGAAA............................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CCTCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCAt....................................... 26 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCAC................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................GCGTGGGTACTCTCTCAGCGCTCCTCA....................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................AGTTTTTTCTTCAGTTCCACTT.............................. 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCA................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................CCCCAGTCACTGACCCTCTCTCCTA..................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TCCTCAGTGGCCCTGCCCCAGTCACTGA................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TTTTTTCTTCAGTTCCACTTTAAGA......................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GACCCTCTCTCCTACAGTTTTTTC........................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TTTTGGACCCACTGGAAt..................................................................................................................................................... 18 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AGTCACTGACCCTCTCTCCTAtgg..................................................... 24 tgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................ACAGTTTTTTCTTCAGTTCCACTTTAA........................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCACT............................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CCAGTCACTGACCCTCTCTCCTACAGTT................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CTCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTC................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCTCTCCTACAGTTTTTTCTTCAGTTCCAC................................ 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................GCAAGTTTTGGACCCACTGGAACAGA................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GTCACTGACCCTCTCTCCTACAGTTTTT............................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................ACAGTTTTTTCTTCAGTTCCACTTTA............................ 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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