(1)
OTHER.ip
(13)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(10)
PIWI.ip
(5)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(56)
TESTES

Sense strand
AACTGCGCAAGCGCAGCCCGTACTTCCTTTTCCGAGTAACCGCCAAGATGGTGAGTATTCGTGCACGGCGGTCTGTGCTCCCGGGTATCCGTCGCCATCCTCCCGGGGCCCTTTCGCAAGACTCTGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGGAGACTGCGGATGGCGGGTGCGGAAGGGCCCGGATGGCTGCGGGCGGCCGCGGGGCTGTGTGTCCCCTCGCCCGTCCGCCGTAGCTTAGAGGAGCGCGGCTCGCGCAGCTCAGGTCCCTGGGCTCCCGGGTAAGGTTGCCGAGCCCCTGCTAACCCCGACTCGCGCTCACGCAGGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCTACCG
......................................................(((((((.((((((....))))))...))))))).(((((((((((.((.(((((((..((....))....))....))).)).)))))))..))))))..............................................................................................................................................................................................................................................
..................................................51....................................................................................................153............................................................................................................................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCGGTCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 50.00 50.00 16.00 6.00 6.00 1.00 - 2.00 3.00 - 1.00 - 5.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 2.00 - - - - 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGC.................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 31.00 31.00 1.00 - 1.00 - 3.00 - 8.00 - 8.00 - 2.00 - - - - - 2.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTT......... 27 2 23.50 23.50 0.50 1.00 - 8.00 - 0.50 - - - 4.00 - 1.50 - - 0.50 1.00 - 0.50 1.50 - - 1.50 0.50 - - - - - 0.50 0.50 - 1.00 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGGTG.................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 18.00 18.00 - 3.00 2.00 - 10.00 - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTC................. 29 3 17.33 17.33 4.67 7.00 3.33 - - 1.67 - - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTC................. 28 3 16.33 16.33 3.00 4.00 3.33 - - 4.33 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTCGTGCACGGCGGTCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 16.00 16.00 - - - - 6.00 - - 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGCG................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 16.00 16.00 - - - 4.00 - - 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TGCCTGGGGATGTAGCGATGTGCTCGG....................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 15.00 15.00 3.00 3.00 4.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGCGt................................................................................................................................................................................................................................................ 27 t 15.00 16.00 1.00 3.00 - 1.00 - 3.00 1.00 - - 1.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCGGTCTGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 14.00 14.00 6.00 - - 1.00 - 1.00 2.00 - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGT.......... 26 2 13.50 13.50 - - - 1.00 - - - - - - 0.50 2.50 - - 1.00 1.00 - - 0.50 - - 0.50 3.00 - - - - 0.50 - - - 0.50 - 0.50 0.50 - - - 0.50 - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTCGTGCACGGCGGTCTGTG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 12.00 12.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCA............. 28 2 12.00 12.00 3.00 1.50 3.00 0.50 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTT......... 26 2 10.00 10.00 1.00 1.00 - 1.50 - - - - - 2.00 - 0.50 - - 0.50 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CAAGATGGTGAGTATTCGTGCACGGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 10.00 10.00 - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................CGTGCACGGCGGTCTGTG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 8.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GCGGTCTGTGCTCCCGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 8.00 8.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTC................. 27 3 7.00 7.00 0.33 2.00 1.00 - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CAAGATGGTGAGTATTCGTGCACGGCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TGCCTGGGGATGTAGCGATGTGCTCG........................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 7.00 7.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTC........ 27 2 7.00 7.00 - 1.00 - 2.00 - 0.50 - - - 0.50 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCC................ 27 3 6.33 6.33 0.33 2.33 1.67 0.33 - 0.67 - 0.67 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCC................ 29 3 6.33 6.33 2.00 1.67 1.67 - - 0.33 - - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAA............ 26 2 6.00 6.00 - 0.50 - - - - - 1.00 - 0.50 - - - - 2.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACC..... 28 2 6.00 6.00 - - - 0.50 - - - 1.00 - 0.50 - 0.50 - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCTGGACTCGCTGCCTGGGGATGTA.................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 6.00 6.00 2.00 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGGA.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 - - 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAG........... 27 2 6.00 6.00 0.50 1.50 0.50 0.50 - 0.50 - - - - 0.50 - - - 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCGGTCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGC....................... 28 3 5.33 5.33 2.00 1.00 1.00 - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTC........ 26 2 4.50 4.50 - - - 0.50 - - - - - 0.50 - 0.50 - - 0.50 0.50 - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTGCTCGGGTGCCCGGAGACTGCGG...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TGCCTGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGt...................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 4.00 15.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTC........ 28 2 4.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGT.......... 28 2 4.00 4.00 0.50 - 0.50 2.00 - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCC................ 30 3 3.00 3.00 2.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGG......................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTTCGCAAGACTCTGGACTCGCTGCC.............................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................AAGATGGTGAGTATTCGTGCACGGCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGCt................................................................................................................................................................................................................................................. 26 t 3.00 31.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGC.............. 27 2 3.00 3.00 - - - 0.50 - - - 0.50 - - - 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCGGTCTt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 t 3.00 6.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GCCTGGGGATGTAGCGATGTGCTCGG....................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................AAGATGGTGAGTATTCGTGCACGGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCGGgctg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 gctg 3.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTTCGCAAGACTCTGGACTCGCTGC............................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTT......... 25 2 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.50 - 0.50 - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCGGgct............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 gct 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCG............... 26 2 3.00 3.00 - - - 0.50 - - - - - 0.50 - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTATTCGTGCACGGCGGTCTGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTA.................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTC........ 25 2 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAG................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGGAGA............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGC....................... 26 3 2.67 2.67 0.33 0.33 1.00 - - - - - - - 0.67 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACC..... 27 2 2.50 2.50 - - - 0.50 - 0.50 - - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCA....... 26 2 2.50 2.50 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGC....................... 27 3 2.33 2.33 - 0.67 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCGAAGTGGAGaagt.................................. 17 aagt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCGGTC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TTCGCAAGACTCTGGACTCGCTGCCT............................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGGTGt................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 2.00 18.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCAC...... 27 2 2.00 2.00 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................TAGAGGAGCGCGGCTCGCGCAGCTCt................................................................................................................ 26 t 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGGTGC................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GAGACTGCGGATGGCGGGTGCGGAAG...................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTATTCGTGCACGGCGGTCTGTG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAcg........... 27 cg 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GCGGTCTGTGCTCCCGGGTATC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................AAGATGGTGAGTATTCGTGCACGGCGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................TAGCTTAGAGGAGCGCGGCTCGCGCA..................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TGCCTGGGGATGTAGCGATGTGCT.......................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGCGA................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTCACGCAGGCCGAAGTGGAGCAG................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CTCGGGTGCCCGGAGACTGCGGAT.................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGT.......... 25 2 2.00 2.00 - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CGGCGGTCTGTGCTCCCGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGtt............. 27 tt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGGAG............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................GCTCCCGGGTATCCGTCG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................AAGATGGTGAGTATTCGTGCACGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................ATGTAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGG............................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CGAGTAACCGCCAAGATGGTGAGTA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGGT..................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
............................................................................................................................................................TCGGGTGCCCGGAGACTGCGGATGGCGt............................................................................................................................................................................................................... 28 t 2.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCAC..................... 28 3 1.67 1.67 0.67 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTt........ 27 t 1.50 10.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAA............ 24 2 1.50 1.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCCTTTTCCGAGTAACCGCCAAGATG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 1.50 1.50 - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTT......... 24 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAG........... 25 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCA............. 27 2 1.50 1.50 - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTT......... 29 2 1.50 1.50 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAG........... 26 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCA...................... 28 3 1.33 1.33 0.33 - 0.67 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCA...................... 27 3 1.33 1.33 0.33 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACC.................... 27 3 1.33 1.33 - - - 0.33 - - - - - 0.33 - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTC................. 26 3 1.33 1.33 - - 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGC......................... 26 4 1.25 1.25 - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGAAGTGGAGCAGAAGAAGA............................ 21 5 1.20 1.20 - - - - - - - - - - - - - 1.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTCCGAGTAACCGCCAAcatg..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 catg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGCGCACCTTCCtcat............ 19 tcat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTCCGAGTAACCGCCAAGATGGTGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGGcg............................................................................................................................................................................................................................. 25 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TTTTCCGAGTAACCGCCAAGATGGTGAGTA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCGGgtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 gtt 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAcgtt......... 26 cgtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAG.......................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGTGCTCCCGGGTATCCGTCGCCATC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCTGGACTCGCTGCCTGGGGATGT..................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCCGAAGTGGAGCAGggt................................ 20 ggt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ACTTCCTTTTCCGAGTAACCGCCAAGATGt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GGCCCTTTCGCAAGACTCTGGACTCGCT................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCACCTTCCGCAAGTTCA....... 20 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCT................... 26 3 1.00 1.00 0.33 - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CTCTGGACTCGCTGCCTGGGGATG...................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGCTCGGGTGCCCGGAGACTGCGGATG................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAggtt......... 26 ggtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................ATTCGTGCACGGCGGTCTt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTATTCGTGCACGGCGGgctg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 gctg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCAGGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAG............................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCAtt.................... 27 tt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................CCTGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGttt.................................................................................................................................................................................................................................... 28 ttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GCCTGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGG...................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGGTGCC.................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCT.... 29 2 1.00 1.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GCCAAGATGGTGAGTATTCGTGCACGGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTGCTCGGGTGCCCGGAGACTGCGGA..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGaa................................................................................................................................................................................................................................................. 26 aa 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................ACCGCCAAGATGGTGAGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................CACGGCGGTCTGTGCTCC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................CTGTGCTCCCGGGTATCCGTCGCCATCtt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTCACGCAGGCCGAAGTGGAGCAGA.................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGa............................................................................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................ACCGCCAAGATGGTGAGTA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................ACGGCGGTCTGTGCTCCCGc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................AGCGATGTGCTCGGGTGCCCGGAGACT.......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCTAC.. 27 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCAGGCCGAAGTGGAGC..................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CCGCCAAGATGGTGAGTATTCGTGCAC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TCCTCCCGGGGCCCTTTCGCAAGcgtc........................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 cgtc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCGCTCACGCAGGCCGAAGTGGAGCAt................................... 28 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................ATGGTGAGTATTCGTGCACGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CGGCGGTCTGTGCTCCCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCCGTCGCCATCCTCCCGGGGCCCTga..................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GATGTGCTCGGGTGCCCG................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CCGGGGCCCTTTCGCAAGACTCTGGA....................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAA............ 29 2 1.00 1.00 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGAT....................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGCGtt............................................................................................................................................................................................................................................... 28 tt 1.00 16.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCCTTTTCCGAGTAACCGCCAAGATGGcct................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 cct 1.00 1.00 - - - - - - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................ATGGTGAGTATTCGTGCA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGGAGt............................................................................................................................................................................................................................ 26 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCTGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAG................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGTGGAGCAGAAag............................... 17 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGGAGACTGt........................................................................................................................................................................................................................ 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTAACCCCGACTCGCGCTCACGCAGG................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................AAGATGGTGAGTATTCGTGCACGGCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGgaga.................................................................................................................................................................................................................................................. 25 gaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTCCTTTTCCGAGTAACCGCCAAGATGGcct................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 cct 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGaaag........... 27 aaag 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGagc....................... 29 agc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACGCAGGCCGAAGTGGAGCAGAAGA............................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTa.................. 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCtgt.............. 27 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCGGTCTGTGCTC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCTACCG 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCGCTGCCTGGGGATGTAGC.................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAACCCCGACTCGCGCTCACGCAGGCCG.............................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GAGACTGCGGATGGCGGGTGCGGAAGt..................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCAC..................... 25 3 1.00 1.00 0.67 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GCGGTCTGTGCTCCCGGGTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTTCGCAAGACTCTGGACTCGCTGCCTGt........................................................................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GAGACTGCGGATGGCGGGTGCGGA........................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCCTGCTAACCCCGACTCGCGCTCACG..................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CAAGATGGTGAGTATTCG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCTTCCGCAAGTTCACCTACCGtggt 28 tggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGG............................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................GTATTCGTGCACGGCGGTCTGTGCTCC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCGGTCTtc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tc 1.00 6.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................TAGAGGAGCGCGGCTCGCGCAGCTC................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CAAGATGGTGAGTATTCGTGCACGGCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GCAAGACTCTGGACTCGCTGCCTGGGG......................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCCGAAGTGGAGC..................................... 15 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTATTCGTGCACGGCGGTCTGTG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TCGGGTGCCCGGAGACTGCGGATGGC................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................GCTTAGAGGAGCGCGGCTCGCGCAGCT.................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CTGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGC.................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TTCGCAAGACTCTGGACTCGCTGCCTG............................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CGCAAGACTCTGGACTCGCTGCCTGG........................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TCGGGTGCCCGGAGACTGCGGATGGCG................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TCCTCCCGGGGCCCTTTCGCAAGACTCTG......................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................GCGATGTGCTCGGGTGCCCGGAGA............................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTAGCGATGTGCTCGGGTGCCCG................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ACTTCCTTTTCCGAGTAACCGCtaag........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 taag 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGt.................................................................................................................................................................................................................................................. 25 t 1.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TGCCTGGGGATGTAGCGATGTGCTC......................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGCta................................................................................................................................................................................................................................................ 27 ta 1.00 31.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TCGCAAGACTCTGGACTCGCTGCCTGGG.......................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........AAGCGCAGCCCGTACTTCCTTTTCC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCG............... 28 2 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GTCTGTGCTCCCGGGTATCCGTCGCC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCTTCCGCAAGTTCACCTACCGtcg 27 tcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCTTCCGCAAGTTCACCTACCGctgc 28 ctgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTtt................ 33 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGC......................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTggc.................................................................................................................................................................................................................................................. 25 ggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGGAa............................................................................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 6.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TCGCAAGACTCTGGACTCGC.................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TCGCAAGACTCTGGACTCGCTGCCTG............................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................ATGTGCTCGGGTGCCCGGAGACTGt........................................................................................................................................................................................................................ 25 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCA............. 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CGCAAGACTCTGGACTCGCTGCCTGGcgc........................................................................................................................................................................................................................................................ 29 cgc 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GCGGTCTGTGCTCCCGGGTATCCGTCGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GGGCCCTTTCGCAAGACTCTGGACTC.................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................TTAGAGGAGCGCGGCTCGCGCAGCT.................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TCCCGGGTATCCGTCGCCATCCTCCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTGCTCGGGTGCCCGGAGACTGCG....................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TCGTGCACGGCGGTCTGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGGaa.................................................................................................................................................................................................................................... 26 aa 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................AAGATGGTGAGTATTCGTGCA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACGCAGGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAG............................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCt................ 29 t 1.00 16.33 0.33 - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGG...................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGCTCGGGTGCCCGGAGACTGCGGA..................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTATTCGTGCACGGCGGTCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGGTTGCCGAGCCCCTGCTAACCCCGt................................................................. 29 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGC.............. 24 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GCGGTCTGTGCTCCCGGGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGtgca...................... 28 tgca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CTCGGGTGCCCGGAGACTGCGGATGGC................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCGGTttg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 ttg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTCCTTTTCCGAGTAACCGCCAAGAT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTATTCGTGCACGGCGGTgtgt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 gtgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................CTGCCTGGGGATGTAGCGATGTGCTC......................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ACTTCCTTTTCCGAGTAACCGCCAAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTGCTCGGGTGCCCGGAGACTGCGt...................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCCGTCGCCATCCTCCCGGGGt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGTATTCGTGCACGGCGGTCTGTGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTTCGCAAGACTCTGGACTCGCTGCCT............................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACt..... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAGAAGAAGAAGCGCACCctcc................ 24 ctcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAt........... 29 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCCTTTTCCGAGTAACCGCCAAGATGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACGGCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................CGCCAAGATGGTGAGTATTCGTGCACG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GCGGTCTGTGCTCCCGGGTAT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAA........................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AGATGGTGAGTATTCGTGCACGGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GGCCCTTTCGCAAGACTCTGGACTCGCTGC............................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TATCCGTCGCCgcgc................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 gcgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGACTCGCTGCCTGGGGATGTcg................................................................................................................................................................................................................................................... 24 cg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TCGGGTGCCCGGAGACTGCGGATGG.................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGat......... 26 at 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGCGCACCTTCCGCcagt.......... 19 cagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGGCTGCGGGCGGCCGCGGG.......................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACGCAGGCCGAAGTGGAGCAGAAGAA.............................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TGCCTGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGc...................................................................................................................................................................................................................................... 28 c 1.00 15.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCTTCCGCAAGTTCACCTACCGcggc 28 cggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TGCCTGGGGATGTAGCGATGTGCccgg....................................................................................................................................................................................................................................... 27 ccgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................ATGGTGAGTATTCGTGCAC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCCCGACTCGCGCTCACGCAGGCCG.............................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCCGTAGCTTAGAGGAGCGCGGC............................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GCCTGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGt...................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCA....... 27 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CCCTTTCGCAAGACTCTGGACTCGC.................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TACTTCCTTTTCCGAGTAACCGCCAA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTGCTCGGGTGCCCGGAGACTGCGGtt.................................................................................................................................................................................................................... 28 tt 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCCGAAGTGGAGaaca.................................. 18 aaca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCTGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGC.................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGt......................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGGAGtat.......................................................................................................................................................................................................................... 28 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCCGTCGCCATCCTCCCGGGGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCCGTCGCCATCCTCCCGGGGCCCTTTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCctc................. 27 ctc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGCTCGGGTGCCCGGAGACTGCGGATGGC................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GCCAAGATGGTGAGTATTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGGcgc................................................................................................................................................................................................................................... 27 cgc 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................CGCCAAGATGGTGAGTATTCG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CAAGACTCTGGACTCGCTGCCTGGGG......................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTGCTCGGGTGCCCGGAGACTGCGGAT.................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTCGTGCACGGCGGTCTGcg.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 cg 1.00 16.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCG........................ 26 5 0.80 0.80 0.20 - 0.40 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCG........................ 27 4 0.75 0.75 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCaa............... 31 aa 0.67 17.33 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCA...................... 29 3 0.67 0.67 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCC................ 28 3 0.67 0.67 - - 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCa................ 29 a 0.67 16.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTT.................. 27 3 0.67 0.67 - - - 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTt................. 29 t 0.67 0.67 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTC................. 30 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCT................... 27 3 0.67 0.67 - - 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCA...................... 22 3 0.67 0.67 - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCt................ 30 t 0.67 17.33 - 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTT.................. 28 3 0.67 0.67 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCAC..................... 26 3 0.67 0.67 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTT.................. 26 3 0.67 0.67 - - - - - - - 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTtttt..... 31 tttt 0.50 23.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGC.............. 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAt........... 27 t 0.50 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGC.............. 29 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGAAGCGCACCTTCCG............... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACC..... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTacac...... 27 acac 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGat......... 27 at 0.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCAC...... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGCGCACCTTCCGCAAG........... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAt............ 29 t 0.50 12.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCt....... 29 t 0.50 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTgc........ 27 gc 0.50 2.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCgag........... 27 gag 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCT.... 30 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAG........... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGt.............. 31 t 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCta............ 26 ta 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACt..... 29 t 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCtag........... 27 tag 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCGCACCTTCCGCAAGT.......... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCT.... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTC........ 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAGCGCACCTTCCGCA............. 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGt.............. 27 t 0.50 3.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TCCGAGTAACCGCCAAGATGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGC.............. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGc.......... 28 c 0.50 6.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCG............... 29 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................GTACTTCCTTTTCCGAGTAACCGCCAA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGT.......... 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCGCACCTTCCGCAAGTTCAC...... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACC..... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCt....... 28 t 0.50 7.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCTA... 28 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCt............. 28 t 0.50 3.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTT......... 28 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCTAC.. 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTATTCGTGCACG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCG............... 30 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CTTTTCCGAGTAACCGCCAAGATGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 4 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCG........................ 25 5 0.40 0.40 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCt................ 28 t 0.33 7.00 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACC.................... 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACC.................... 28 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGC....................... 24 3 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTT.................. 20 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCa............... 26 a 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCtcat............ 29 tcat 0.33 0.33 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCC................ 31 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCAAGTTCACCTACCG 19 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCC................ 22 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCtcaa............ 26 tcaa 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTt................. 27 t 0.33 0.67 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CCTTTTCCGAGTAACCGCCAAGATGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCa............... 30 a 0.33 6.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACC.................... 29 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCT................... 29 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCAC..................... 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCa............... 28 a 0.33 6.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCc...................... 27 c 0.33 2.67 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCC................ 25 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTT.................. 23 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGt....................... 28 t 0.25 0.75 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCGAAGTGGAGCAGAA................................. 18 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGt....................... 27 t 0.20 0.80 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CGAGTAACCGCCAAGATG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GTAACCGCCAAGATG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 6 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGTGGAGCAGAAGAAGAAG.......................... 21 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGTGGAGCAGAAGAAGA............................ 19 8 0.12 0.12 - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AACTGCGCAAGCGCAGCCCGTACTTCCTTTTCCGAGTAACCGCCAAGATGGTGAGTATTCGTGCACGGCGGTCTGTGCTCCCGGGTATCCGTCGCCATCCTCCCGGGGCCCTTTCGCAAGACTCTGGACTCGCTGCCTGGGGATGTAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGGAGACTGCGGATGGCGGGTGCGGAAGGGCCCGGATGGCTGCGGGCGGCCGCGGGGCTGTGTGTCCCCTCGCCCGTCCGCCGTAGCTTAGAGGAGCGCGGCTCGCGCAGCTCAGGTCCCTGGGCTCCCGGGTAAGGTTGCCGAGCCCCTGCTAACCCCGACTCGCGCTCACGCAGGCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCTACCG
......................................................(((((((.((((((....))))))...))))))).(((((((((((.((.(((((((..((....))....))....))).)).)))))))..))))))..............................................................................................................................................................................................................................................
..................................................51....................................................................................................153............................................................................................................................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014236(GSM319960)
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SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
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SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509279(GSM509279)
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cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
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Mili-wt-associated. (testes)
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small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGCTAACCCCGACTCGCGCTCACGCA................................................... 28 1 6.00 6.00 - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCACCTTCCGCAAGTTCACCTACCG 25 1 4.00 4.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GCGCAGCCCGTACTTCCTTTTCCGAGTAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CGCAAGCGCAGCCCGTACTTCCTTTTCC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCTTCCGCAAGTTCACCTACCG 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GATGTAGCGATGTGCTCGGGTGCCCGGA.............................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACTCGCGCTCACGCAGGCCGAAGTGGA....................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GCGCAGCCCGTACTTCCTTTTCCGAGTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGTCCCTGGGCTCCCG................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCACCTTCCGCAAGTTCACCTACCG 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCACCTTCCGCAAGTTCACCTACCGcctt 29 cctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCCGCAAGTTCACCTACa.. 21 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCACCTTCCGCAAGTTCACCTAt... 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGCGCAAGCGCAGCCCGTACTTCCTTTtt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..............................GAGTAACCGCCAAGATtga...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 tga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTTCCGCAAGTTCACCTACCGa 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTTCCGCAAGTTCACCTACCGac 25 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GCGCAGCCCGTACTTCCTTTTCCGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCCGCAAGTTCACa...... 17 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTT......... 29 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCGCTCACGCAGGCCGAAGTGGAGCA.................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCTACCG 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCTACCG 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCA....... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCTA... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGCGCACCTTCCGCAAGTTCACCTA... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCACCTTCCGCAAGTTCACCTA... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGC.............. 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAA............ 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAAGAAGCGCACCTTCCGCAAGTTCA....... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - -
.......................TTCCTTTTCCGAGTAACCGCCA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGCGCACCTTCCGCAAGTT......... 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGAAGTGGAGCAGAAGAAGAAGCGCACC.................... 30 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTTCCGCAAGTTCACCTA... 20 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTCCGCAAGTTCACCTAC.. 19 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -