(1)
OTHER.ip
(13)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(48)
TESTES

Sense strand
CACTGGGCAGCATCCTCATGACCCTGGGTAGTGTGTGTCCATCAGACTTCATCCCACCTGGGGCATGCAGCCCCCACAGTTGCTGGTCTGCCTTAGCAAAGTTCTCCCTTAGCTGGTCCCTGGGGACCTTATGGAGTGGGCTGAGTGGGTCTGTGGCATCTACCCCCACAAAGCCTGCCTCAATCACACTCTGTCCACAGGTCACAGAGGTGGTTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTCGAGG
.......................................................................................................................................((((((.((((((((.((.((((.................)))).))))).))))).))))))....................................................
...................................................................................................................................132.................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
...................................................................................................................................................................................TCAATCACACTCTGTCCACAGt................................................. 22 t 21.00 13.00 - - 1.00 3.00 - - 5.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 2.00 2.00 - - - 2.00 - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GTTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGC.......... 28 1 15.00 15.00 - 7.00 1.00 - 2.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGGCAT........................................................................................... 23 1 14.00 14.00 7.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TCAATCACACTCTGTCCACAG.................................................. 21 1 13.00 13.00 10.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGC.......... 27 1 13.00 13.00 - 1.00 1.00 - 2.00 - - 2.00 - - - - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGGCA............................................................................................ 22 1 9.00 9.00 - - - 3.00 - - - - 2.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AGTGGGCTGAGTGGGTCTGTGG.............................................................................................. 22 1 9.00 9.00 - - - - - 2.00 - - 4.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TCAATCACACTCTGTCCACAGa................................................. 22 a 8.00 13.00 - - - 1.00 - 3.00 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGGC............................................................................................. 21 1 8.00 8.00 3.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CACAGAGGTGGTTATGATCTATGATGCG.................... 28 1 7.00 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TCAATCACACTCTGTCCACA................................................... 20 1 7.00 7.00 6.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGC.......... 26 1 7.00 7.00 - 2.00 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGC....... 25 1 7.00 7.00 - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTC.... 28 1 6.00 6.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GTTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGG........ 30 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGCC...... 26 1 6.00 6.00 - 1.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCT..... 27 1 6.00 6.00 - 1.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GTTATGATCTATGATGCGGAGAAGC............. 25 1 5.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGGCAa........................................................................................... 23 a 5.00 9.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGGCATCTACCC..................................................................................... 29 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGTTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGC.......... 29 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGG.............................................................................................. 20 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GTTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAG........... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGGCATat......................................................................................... 25 at 3.00 14.00 - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTCGt.. 30 t 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGC....... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CCTCAATCACACTCTGTCCACA................................................... 22 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GTTATGATCTATGATGCGGAGAAGCA............ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAG........... 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGC....... 29 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CTCAATCACACTCTGTCCACAGt................................................. 23 t 2.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGGCATa.......................................................................................... 24 a 2.00 14.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTCGAG. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTCG... 29 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AGTGGGCTGAGTGGGTCTGTGGa............................................................................................. 23 a 2.00 9.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGGa............................................................................................. 21 a 2.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GTGGTTATGATCTATGATGCGGAGA................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGCG......... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GTTATGATCTATGATGCGGAGAAGaagt.......... 28 aagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGC....... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................GATGCGGAGAAGCAGCGGC....... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................GCGGAGAAGCAGCGGCCTCGA.. 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGt........ 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................CTATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTC.... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTCGAa. 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TCAATCACACTCTGTCCACAGttt............................................... 24 ttt 1.00 13.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGGTTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGC.......... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGcgta..... 27 cgta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GTTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGt.......... 28 t 1.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GTTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGt....... 31 t 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGTTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGt.......... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTC.... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGt....... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGGCATtt......................................................................................... 25 tt 1.00 14.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGATCTATGATGCGGAGAAGCAG........... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGTTATGATCTATGATGCGGAGAAGC............. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTCGA.. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................ATGCGGAGAAGCAGCGGCCTCGAG. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGGCATCTACCCC.................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AGTGGGCTGAGTGGGTCTGTGGC............................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGTTATGATCTATGATGCGGAGAAGCA............ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CCTCAATCACACTCTGTCCACAG.................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTt.... 28 t 1.00 6.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAGGTGGTTATGATCTATGATGCGGAGAAGC............. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTATGATGCGGAGAAGCA............ 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GGTGGTTATGATCTATGATGCGGAGAt............... 27 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGtcat........................................................................................... 23 tcat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.........................................................................................................................................................................................................................GATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGC....... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGGCTGAGTGGGTCTGTGGCATaa......................................................................................... 25 aa 1.00 14.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCat.... 28 at 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................ACAGAGGTGGTTATGATCTATGATGCG.................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TCAATCACACTCTGTCCAC.................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGG........ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTCGA.. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................ATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTCGAt. 27 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................ATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGC.......... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................CAAAGCCTGCCTCAATCACACTCTGTCCACAG.................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CCTCAATCACACTCTGTCCACt................................................... 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ATCTATGATGCGGAGAAGCAGC.......... 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTCGcgg 27 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -

Antisense strand
CACTGGGCAGCATCCTCATGACCCTGGGTAGTGTGTGTCCATCAGACTTCATCCCACCTGGGGCATGCAGCCCCCACAGTTGCTGGTCTGCCTTAGCAAAGTTCTCCCTTAGCTGGTCCCTGGGGACCTTATGGAGTGGGCTGAGTGGGTCTGTGGCATCTACCCCCACAAAGCCTGCCTCAATCACACTCTGTCCACAGGTCACAGAGGTGGTTATGATCTATGATGCGGAGAAGCAGCGGCCTCGAGG
.......................................................................................................................................((((((.((((((((.((.((((.................)))).))))).))))).))))))....................................................
...................................................................................................................................132.................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.......................................................................................GCCTTAGCAAAGTTCTta................................................................................................................................................. 18 ta 2.00 0.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -