(1)
OTHER.ip
(10)
OTHER.mut
(9)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(44)
TESTES

Sense strand
GATCCAGTCAAACTAGAAGTAGTTGAGTGTTGCACCAAAACACTGGTGTGCCTTGATTGTTAGAGCACATGCTCATTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTGTGTCCTATAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGTCTCGCTTTGCTGTCTGTACCCATGGTATGTCCTCCTCATTTCAGTTGTGGACAACAGCAGCAATTGGGCTGTGTGTGGGAAGAGCTGTGGTGTC
.......................................................................(((.(((((....((((...((.........))..)))).((((.(((....)))))))..((....))..))))).)))...................................................................................................
......................................................................71...................................................................................156............................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGT.................................................................................................................................................... 27 1 147.00 147.00 6.00 6.00 19.00 33.00 18.00 2.00 14.00 10.00 5.00 10.00 3.00 - 6.00 8.00 - 1.00 - - 2.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGA.................................................................................................. 25 1 130.00 130.00 25.00 30.00 13.00 16.00 - 8.00 2.00 - 4.00 3.00 4.00 8.00 1.00 - - 1.00 6.00 2.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - -
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCG..................................................................................................................................................... 26 1 106.00 106.00 31.00 21.00 2.00 - 8.00 6.00 2.00 6.00 1.00 - 4.00 6.00 - 2.00 7.00 1.00 - 2.00 2.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTG................................................................................................................................................. 27 1 67.00 67.00 11.00 9.00 10.00 6.00 - 3.00 3.00 - - 2.00 8.00 6.00 3.00 - - 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGC...................................................................................................................................................... 25 1 53.00 53.00 12.00 11.00 - - 4.00 2.00 - 4.00 - - 3.00 3.00 - - 11.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..............................................................................TAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTGT................................................................................................................................................ 28 1 45.00 45.00 1.00 1.00 18.00 11.00 - - 4.00 - - 3.00 - - 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGG................................................................................................... 24 1 36.00 36.00 13.00 13.00 1.00 - - 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 -
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTG................................................................................................................................................... 28 1 32.00 32.00 1.00 - 8.00 9.00 1.00 - - 2.00 - 1.00 - 1.00 5.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGG............................................................................................... 26 1 30.00 30.00 4.00 5.00 8.00 5.00 - 1.00 1.00 - - 2.00 - 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAG................................................................................................ 27 1 22.00 22.00 5.00 9.00 - 2.00 - 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGAGGACTGGAAAGGGAAGGTCTCGC......................................................................................... 26 1 21.00 21.00 4.00 3.00 5.00 4.00 - 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGT.................................................................................................................................................. 29 1 13.00 13.00 2.00 1.00 3.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCATTTCAGTTGTGGACAACAGCAGC................................. 26 1 13.00 13.00 5.00 1.00 1.00 - 2.00 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGT.............................................................................................. 27 1 12.00 12.00 5.00 - - 4.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTG................................................................................................................................................... 27 1 12.00 12.00 - 1.00 5.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TAGAAGTAGTTGAGTGTTGCACCAAAAC................................................................................................................................................................................................................. 28 1 11.00 11.00 - - 7.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGT.............................................................................................. 29 1 11.00 11.00 1.00 1.00 - - - 4.00 - - - - 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAA................................................................................................. 26 1 11.00 11.00 - 2.00 1.00 2.00 - - 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.........................................................................................TAACTTGAAGCGTGTGTGTCCTATAG....................................................................................................................................... 26 1 10.00 10.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGGTATGTCCTCCTCATTTCAGTTGT.............................................. 26 1 10.00 10.00 - - - - 5.00 - - 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGG............................................................................................... 28 1 9.00 9.00 1.00 3.00 1.00 - - 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTG................................................................................................................................................. 30 1 8.00 8.00 3.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AAACACTGGTGTGCCTTGATTGTTAGAGC........................................................................................................................................................................................ 29 1 7.00 7.00 2.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TATAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTG................................................................................................................. 27 1 7.00 7.00 1.00 2.00 - - - - - - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGATTGTTAGAGCACATGCTCATTCTAAGG....................................................................................................................................................................... 30 1 7.00 7.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TATAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGT.................................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGGACAACAGCAGCAATTGGGCTGTGTGT.................. 29 1 6.00 6.00 3.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGATTGTTAGAGCACATGCTCATTCTAAG........................................................................................................................................................................ 29 1 6.00 6.00 - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TGGTGTGCCTTGATTGTTAGAGCACATG................................................................................................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 2.00 - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGAGGACTGGAAAGGGAAGGTCTCG.......................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - 1.00 1.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TAGAAGTAGTTGAGTGTTGCACCAAA................................................................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TGCTGTCTGTACCCATGGTATGTCCTCC........................................................... 28 1 5.00 5.00 - - 1.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AAACACTGGTGTGCCTTGATTGTTAGAG......................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGt.................................................................................................. 25 t 4.00 36.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCCTCATTTCAGTTGTGGACAACAGCAGC................................. 29 1 4.00 4.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGTC............................................................................................. 28 1 4.00 4.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TAGAAGTAGTTGAGTGTTGCACCAAAA.................................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TCGCTTTGCTGTCTGTACCCATGGTAT.................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AGGGAAGGTCTCGCTTTGCTGTCTGT............................................................................. 26 1 4.00 4.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGG.................................................................................................... 23 1 4.00 4.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.....................................................................TGCTCATTCTAAGGTGGACTTAACTTG.......................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGAGGACTGGAAAGGGAAGGTCTCGCT........................................................................................ 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AAACACTGGTGTGCCTTGATTGTTAGA.......................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................AACACTGGTGTGCCTTGATTGTTAGA.......................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AGGGAAGGTCTCGCTTTGCTGTCTG.............................................................................. 25 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................AGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTGT................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGATTGTTAGAGCACATGCTCA............................................................................................................................................................................... 22 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAG....................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TAACTTGAAGCGTGTGTGTCCTATA........................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTG................................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TGGTGTGCCTTGATTGTTAGAGCACA..................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTGT................................................................................................................................................ 31 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAAC............................................................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TATAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTGA................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTGAGGAC............................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................AGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTG................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGAGTGTTGCACCAAAACACTGGTGTGCC...................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCCCCTGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGG................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TTGTTAGAGCACATGCTCATTCTAAGG....................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGT.................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................CAGCAATTGGGCTGTGTGTGGGAAG............ 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGTTGTGGACAACAGCAGCAATTGGGC......................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGAGGACTGGAAAGGGAAGGTCTCGCTT....................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTGTt............................................................................................................................................... 29 t 2.00 45.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGT.............................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GGACTGGAAAGGGAAGGTCTCGCTTT...................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TGTGTCCTATAGTGGGGTCTCCCCTGTG....................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TACCCATGGTATGTCCTCCTCATTTCAGT................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTTCAGTTGTGGACAACAGCAGCAATT............................. 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGGGCTGTGTGTGGGAAGAGCTGTa..... 25 a 2.00 0.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGA.................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGTTGTGGACAACAGCAGCAATTGGG.......................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGGACAACAGCAGCAATTGGGCTGTGTGTG................. 30 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTGAG............................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TATAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCG................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TTGTGGACAACAGCAGCAATTGGGCTGT...................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTGc................................................................................................................................................ 28 c 2.00 67.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGG............................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTGTG............................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTG................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CCAAAACACTGGTGTGCCTTGATTGT.............................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TGGTGTGCCTTGATTGTTAGAGCACAT.................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................TCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGT.................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGT.............................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GCAATTGGGCTGTGTGTGGG............... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................CACTGGTGTGCCTTGATTGTTAGAGC........................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TCGCTTTGCTGTCTGTACCCATGGTA................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................AACACTGGTGTGCCTTGATTGTTAGAGC........................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAACT............................................................................................................................................................ 19 1 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGTTGTGGACAACAGCAGCAATTGGGCT........................ 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AGCAATTGGGCTGTGTGTGGGAAGA........... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGTCT............................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AACTAGAAGTAGTTGAGTGTTGCAC....................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCG..................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TAACTTGAAGCGTGTGTGTCCTATAGTGc.................................................................................................................................... 29 c 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGTC............................................................................................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGCTCATTCTAAGGTGGACTTAACTTGA......................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TCATTCTAAGGTGGACTTAACTTGA......................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TAACTTGAAGCGTGTGTGTCC............................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...........................................................................................................................................................................................................................TTGGGCTGTGTGTGGGAAGAGCTGTGG.... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTGTGGGAAGAGCTGTGGTGTC 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................ACCAAAACACTGGTGTGCCTTGAatg............................................................................................................................................................................................... 26 atg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TCATTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGC...................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CGTGTGTGTCCTATAGTGGGGTCTCCat........................................................................................................................... 28 at 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCACCAAAACACTGGTGTGCCTa.................................................................................................................................................................................................... 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGG............................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AGCAATTGGGCTGTGTGTGGGAAG............ 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCACATGCTCATTCTAAGGTGGACTT................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAG................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGGACTTAACTTGAAGCGTGTGTGTCCT........................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................CTGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGT.............................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TGGTGTGCCTTGATTGTTAG........................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GTGGACAACAGCAGCAATTGGGCTGT...................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TCTGTACCCATGGTATGTCCTCCTC......................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGT.................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TTGAAGCGTGTGTGTCCTATAGgggg................................................................................................................................... 26 gggg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TACCCATGGTATGTCCTCCTCATTTCAG.................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTGAtg.............................................................................................................. 27 tg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TCCAGTCAAACTAGAAGTAGTTGAGT.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TATAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTa................................................................................................................. 27 a 1.00 6.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TACCCATGGTATGTCCTCCTCATTTC.................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TCAGTTGTGGACAACAGCAGCAATTGGGC......................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GCAATTGGGCTGTGTGTGGGAAGAGCT........ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................................................................TTGAAGCGTGTGTGTCCTg.......................................................................................................................................... 19 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................CGCTTTGCTGTCTGTACCCATGGTATG................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGCCTTGATTGTTAGAGCACATGCTCATTC............................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTTCAGTTGTGGACAACAGCAGCAATTGGGCTt....................... 33 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTGAGa.............................................................................................................. 28 a 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TATAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTGAGa.............................................................................................................. 30 a 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AACTTGAAGCGTGTGTGTCCTATAGTG..................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TTGGGCTGTGTGTGGGAAGAGCTGTG..... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TGGTGTGCCTTGATTGTTAGA.......................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................CCTCATTTCAGTTGTGGACAACAGCAG.................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGTC............................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCATTTCAGTTGTGGACAACAGCAGCAAT.............................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGTTGTGGACAACAGCAGCAATTGGGCTGT...................... 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TGCTGTCTGTACCCATGGTATGTCCTCCT.......................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................GCTGTGTGTGGGAAGAGCTGTGGa... 24 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGTCTC........................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TAGAAGTAGTTGAGTGTTGCACCAAAACAa............................................................................................................................................................................................................... 30 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAt................................................................................................. 26 t 1.00 130.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGa.............................................................................................. 29 a 1.00 9.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAagga.................................................................................................. 25 agga 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGAGTGTTGCACCAAAACACTGGTGTGCCTT.................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TTGAAGCGTGTGTGTCCTATAGTGGGG.................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGGGCTGTGTGTGGGAAGAGCTGTt..... 25 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TATAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTta................................................................................................................ 28 ta 1.00 6.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGg.................................................................................................. 25 g 1.00 36.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGa.................................................................................................................................................. 29 a 1.00 32.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAG................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TTTGCTGTCTGTACCCATGGTATGTCCTCC........................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGGACTTAACTTGAAGCGTGTGTGTCC............................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................CTTGATTGTTAGAGCACATGCTCA............................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAtggt.............................................................................................. 27 tggt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TAACTTGAAGCGTGTGTGTCCTA.......................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CAATTGGGCTGTGTGTGGGAAGAGCTaa...... 28 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAGCGTGTGTGTCCTATAGTGGGGTC................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................AGAGCACATGCTCATTCTAAGGTGGAC.................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCCCCTGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGt................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTTCAGTTGTGGACAACAGCAGCAA............................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAGCGTGTGTGTCCTATAGTGGGG.................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGAGGACTGGAAAGGGAAGGTCTCGt......................................................................................... 26 t 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................CAGCAATTGGGCTGTGTGTGGGAAGA........... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TTTGCTGTCTGTACCCATGGTATGTCC.............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGGACTTAACTTGAAGCGTGTGTGTC............................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TATAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTGAGGAC............................................................................................................ 32 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAGCGTGTGTGTCCTATAGT...................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTG................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGAGTGTTGCACCAAAACACTGGTGTGCCT..................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TATAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTGt................................................................................................................ 28 t 1.00 7.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TTGATTGTTAGAGCACATGCTCA............................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TTGATTGTTAGAGCACATGCTCATTC............................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGGGCTGTGTGTGGGAAGAGCTGTGGT... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGcg................................................................................................................................................. 27 cg 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................AAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTGTG............................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCATTTCAGTTGTGGACAACAGCAGCA................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCCTCATTTCAGTTGTGGACAACAGCAG.................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTCATTTCAGTTGTGGACAACAGCAGC................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTa................................................................................................................................................. 27 a 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................AAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTGT................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGATTGTTAGAGCACATGCTCATTCTAAGGTG..................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AAACACTGGTGTGCCTTGATTGTTAG........................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TTGTGGACAACAGCAGCAATTGGGatgt...................... 28 atgt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGATTGTTAGAGCACATGCTCATTCTAAGGTGG.................................................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGGGCTGTGTGTGGGAAGAGCTGTGG.... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GGAAAGGGAAGGTCTCGCTTTGCTGTC................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CAGCAGCAATTGGGCTGTGTGTGGGA.............. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GTGCCTTGATTGTTAGAGCACATGCTCA............................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TATAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTGAG............................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TTGTGGACAACAGCAGCAATTGGGCT........................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGAGGACTGGAAAGGGAAGGTCT............................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGT.................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AGAAGTAGTTGAGTGTTGCACCAAAA.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GTGGACTTAACTTGAAGCGTGTGTG............................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CTCGCTTTGCTGTCTGTACCCA........................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGGTATGTCCTCCTCATTTCAGTTGTG............................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAcc...................................................................................................................................................... 25 cc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ACCCATGGTATGTCCTCCTCATTTCA................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AGCAATTGGGCTGTGTGTGGGAAGAGC......... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TGGAAAGGGAAGGTCTCGCTTTGCTG.................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCCTGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGG................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GCAGCAATTGGGCTGTGTGTGGGAA............. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGcgt................................................................................................................................................ 28 cgt 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGgc............................................................................................. 30 gc 1.00 9.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GTGGACTTAACTTGAAGCGTGTGTGTCCT........................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................CACCAAAACACTGGTGTGCCTTGATTGT.............................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGagt.................................................................................................................................................... 27 agt 1.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................AAGGGAAGGTCTCGCTTTGCTGTCTGT............................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTTCAGTTGTGGACAACAGCAGCAATTG............................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................ACTGGAAAGGGAAGGT.............................................................................................. 16 9 0.11 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAAGAGCTGTGG.... 17 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................GTGGGAAGAGCTGTGG.... 16 14 0.07 0.07 - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GATCCAGTCAAACTAGAAGTAGTTGAGTGTTGCACCAAAACACTGGTGTGCCTTGATTGTTAGAGCACATGCTCATTCTAAGGTGGACTTAACTTGAAGCGTGTGTGTCCTATAGTGGGGTCTCCCCTGTGACCGTGAGGACTGGAAAGGGAAGGTCTCGCTTTGCTGTCTGTACCCATGGTATGTCCTCCTCATTTCAGTTGTGGACAACAGCAGCAATTGGGCTGTGTGTGGGAAGAGCTGTGGTGTC
.......................................................................(((.(((((....((((...((.........))..)))).((((.(((....)))))))..((....))..))))).)))...................................................................................................
......................................................................71...................................................................................156............................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...........................................................................................................................................................................GTACCCATGGTATGTCCTCCTCATTTCA................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................GCTGTCTGTACCCATGGTATGTCCTCCTCA........................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................CTTAACTTGAAGCGTGTGTGTCCTATA........................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -