(1)
OTHER.ip
(11)
OTHER.mut
(5)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(43)
TESTES

Sense strand
CTGTGAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGTTACTGTGACTCTACAGTAACCCTTTTTCTCGCATGCTGCACTCCAGCCAAGGTGACTGGGCTGTGTCTAGTGTAGGGGAAGCTGTTTGGGAGTGTGGTATCAGTGTGAACTCACTTCTAACATTTCCTGTCTCCTCTCCGGGCCCTCCTTGTCAACTTGACTAGCTGGAGATGGAGGATGAGGACACCATTGATGTATTCCAGCAGCAGACAGG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAA........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 39.00 39.00 7.00 8.00 - 3.00 7.00 3.00 2.00 3.00 - 1.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAAT......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 21.00 21.00 1.00 5.00 - 3.00 6.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAA........................................................................................................................................................................................................................... 25 1 20.00 20.00 9.00 - 2.00 - 1.00 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAAT......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 15.00 15.00 8.00 2.00 1.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATA............................................................................................................................................................................................................................ 25 1 15.00 15.00 4.00 2.00 1.00 2.00 - 4.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAA.......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 3.00 2.00 1.00 2.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......ATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAA.......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 11.00 11.00 4.00 2.00 - 1.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GTGTGAACTCACTTCTAACATTTCCTG..................................................................................... 27 1 8.00 8.00 - - - - - - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGTGAATCTTGTCAGAAGTCGGGTG................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 7.00 7.00 - 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TGAGGACACCATTGATGTATTCCAGC.......... 26 1 6.00 6.00 - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TGAGGACACCATTGATGTATTCCAGCA......... 27 1 6.00 6.00 - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATA........................................................................................................................................................................................................................ 29 1 5.00 5.00 - - - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......TCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAAT......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...........GTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGTT..................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGT...................................................................................................................................................................................................................... 30 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTGTCAACTTGACTAGCTGGAGATGG........................................ 26 1 4.00 4.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGAT............................................................................................................................................................................................................................. 24 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AGAAGTCGGGTGGATAAATAGTTAC................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGAT............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CAGAAGTCGGGTGGATAAATAGTTA.................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AGAAGTCGGGTGGATAAATAGTTA.................................................................................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TACAGTAACCCTTTTTCTCGCATGCT................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
....GAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATA............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATA............................................................................................................................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TACAGTAACCCTTTTTCTCGCATGCTG................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..........TGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGT...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGTT..................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................ACTTGACTAGCTGGAGATGGAGGATG.................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATt........................................................................................................................................................................................................................ 29 t 2.00 21.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGTTA.................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGACTGGGCTGTGTCTAGTGTAGGGG........................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TAACCCTTTTTCTCGCATGCTGCACT............................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................CCATTGATGTATTCCAGCAGCAGACA.. 26 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................CTCCGGGCCCTCCTTGTCAACTTGACTAG.................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GTGACTGGGCTGTGTCTAGTGTAGG.......................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................CACCATTGATGTATTCCAGCAGCAGA.... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGGAGATGGAGGATGAGGACACCATT....................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGTTTGGGAGTGTGGTATCAGTGTG........................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAt....................................................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGTTAC................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AGGATGAGGACACCATTG...................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGTATCAGTGTGAACTCAC.................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGatac................................................................................................................................................................................................................... 27 atac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTGTCAACTTGACTAGCTGGAGATGGAG...................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATA........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TTTTTCTCGCATGCTGCACTCCAGCC...................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GTCGGGTGGATAAATAGTTACTGTGAC............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................GACTCTACAGTAACCCTTTTTCTCGCAT.................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TGATGTATTCCAGCAGCAGA.... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................CCATTGATGTATTCCAGCAGCAGACAG. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATga........................................................................................................................................................................................................................... 26 ga 1.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGACTCTACAGTAACCCTTTTTCTCGCA..................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGTTAC................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TTTTCTCGCATGCTGCACTCCAGCC...................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGG............................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AACCCTTTTTCTCGCATGCTGCACTCCA......................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................AGCCAAGGTGACTGGGCTGTGTCTAGTG.............................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAt........................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 15.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....GAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATA........................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGGTGACTGGGCTGTGTCTAGTGTA............................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGA.............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAA........................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................AAGTCGGGTGGATAAATAGTTACTGT................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GTCGGGTGGATAAATAGTTACTGTGA.............................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TCTAGTGTAGGGGAAGCTGTTTGGGAGT......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAA........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGA.............................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGTGAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGA.............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGATGAGGACACCATT....................... 16 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGTGAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGt.............................................................................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GAAGTCGGGTGGATAAATAGTTAC................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAA........................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...............GAAGTCGGGTGGATAAATAGTTACTGTGAC............................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TGATGTATTCCAGCAGCAGACAGGagt 27 agt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
......ATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAt.......................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 20.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TACAGTAACCCTTTTTCTCGCATGCg................................................................................................................................................................................. 26 g 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TACAGTAACCCTTTTTCTCGCATGt.................................................................................................................................................................................. 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TACAGTAACCCTTTTTCTCGCATGCTGt............................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GGGTGGATAAATAGTTACTGTGA.............................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.TGTGAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGG............................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGAT............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GACACCATTGATGTATTCCAGCAGCAGAa... 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATt............................................................................................................................................................................................................................ 25 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAG....................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGAca............................................................................................................................................................................................................................ 25 ca 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGTT..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGtata............................................................................................................................................................................................................................ 25 tata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................CATTGATGTATTCCAGCAGCAGACAGG 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................ATGGAGGATGAGGACACC.......................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GATAAATAGTTACTGTGACTCTACAGT..................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TACAGTAACCCTTTTTCTCGCATGCTGC............................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTGTCAGAAGTCGGGTGGAT............................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GGTGGATAAATAGTTACTGTGACTCTAC........................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TTTTTCTCGCATGCTGCACTCCAGCCA..................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.................AGTCGGGTGGATAAATAGTTACTGTGA.............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGA.............................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAAT......................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGTTACTGT................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATtt....................................................................................................................................................................................................................... 29 tt 1.00 15.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AGGACACCATTGATGTATTCCAGCAGC....... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGT...................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TGAGGACACCATTGATGTATTCCAGt.......... 26 t 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GTGACTGGGCTGTGTCTAGTGTAGGG......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACTGGGCTGTGTCTAGTGTAGGGGA....................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GTGACTGGGCTGTGTCTAGTGTAGGGGAAGC.................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAc.......................................................................................................................................................................................................................... 27 c 1.00 39.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TAACCCTTTTTCTCGCATGCTG................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TGATGTATTCCAGCAGCAGACAGGaggt 28 aggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GTGACTGGGCTGTGTCTAGTGTAGGGG........................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGTTAt................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TGAGGACACCATTGATGTATTCCAGCAG........ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGTTA.................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAG....................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATCTTGTCAGAAGTCGGGT................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TGAGGACACCATTGATGTATTCCAG........... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTGTGAATCTTGTCAGAAGTCGGGTGGATAAATAGTTACTGTGACTCTACAGTAACCCTTTTTCTCGCATGCTGCACTCCAGCCAAGGTGACTGGGCTGTGTCTAGTGTAGGGGAAGCTGTTTGGGAGTGTGGTATCAGTGTGAACTCACTTCTAACATTTCCTGTCTCCTCTCCGGGCCCTCCTTGTCAACTTGACTAGCTGGAGATGGAGGATGAGGACACCATTGATGTATTCCAGCAGCAGACAGG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...TCTTGTCAGAAGTCgagc..................................................................................................................................................................................................................................... 18 gagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...TCTTGTCAGAAGTCGgagc.................................................................................................................................................................................................................................... 19 gagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -