(1)
OTHER.ip
(11)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(9)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(44)
TESTES

Sense strand
GTTCCTTCTGCAACGGAAATAATAAAAGCCTCCAGCAAAGACGCCATCAGGTACAGTCTCTACCACCACCAAAGTCTGTTTTGATGCTGCTTCTTGGACCTTTAATTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCCGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCTGCCTCTCGAGTGCTGGG
..............................................................................................................................(((((..(((((((((..((..(((((((.........)))))))....))..))))).))))..)))))......................................................
....................................................................................................101................................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCT............................................................................................ 25 3 23.33 23.33 16.33 1.67 - 0.67 0.67 - - 0.33 - - 0.67 - - 0.33 0.33 1.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 0.33
.............................................................................................................................................TTCGAGACAGGGTTTCTCCGTGTAGa................................................................................... 26 a 3.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TTTCGAGACAGGGTTTCTCCGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTG.......................................................... 52 13 2.46 2.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTC........................................................................................... 26 3 2.33 2.33 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTC............................................................................................. 24 3 2.33 2.33 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCTGCCTgaaa......... 34 gaaa 2.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TTCTGCAACGGAAATAATAAAAGCCTCC......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CAGAAATCCGCCTGCCTCTGCCTCTtata....... 29 tata 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGGCTGGCgaga........................................ 26 gaga 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCgta......................................... 31 gta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CAGAAATCCGCCTGCCTCTGCCTCTttt........ 28 ttt 2.00 0.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCaaa............... 27 aaa 2.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTaa................. 25 aa 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGGTTT.............................................................................................. 23 3 1.67 1.67 0.33 - - 0.67 - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGGTT............................................................................................... 22 3 1.67 1.67 - 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - 0.33 - -
................................................................................................................................................................................................................CAAACTCAGAAATCCGCCTGtatt.................. 24 tatt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAAACTCAGAAATCCGCCTGCCata................. 25 ata 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGGT................................................................................................ 21 3 1.00 1.00 - - - - - - - - - 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - -
..............................................................................................................................................................CCGTGTAGCCCTGGCTGTCCTaata................................................................... 25 aata 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAACTCAGAAATCCGCCTGCCTatc................ 25 atc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TAAAAGCCTCCAGCAAAGACGCCATCAG........................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TTTCGAGACAGGGTTTCTCCGTGTAGaaa................................................................................. 29 aaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTCAAACTCAGAAATCCGCCTGCCacc................. 27 acc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCgta......................................... 26 gta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTatt......................................................................................... 26 att 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TCGAGACAGGGTTTCTCCGTGTAGCCCTGtc............................................................................. 31 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TAAAAGCCTCCAGCAAAGACGCCATC.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCAAACTCAGAAATCCGCCTGCCacta................ 27 acta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................GACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATgcaa......................... 31 gcaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTCAAACTCAGAAATCCGCCTGCaa................... 25 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CAGAAATCCGCCTGCCTCTGCCTCTtat........ 28 tat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................AGAAATCCGCCTGCCTCTGCCTCTCGgaag..... 30 gaag 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................ACTCTGTAGACCAGGCTGGCCgcgt....................................... 25 gcgt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCgta......................................... 29 gta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGGCTGGCgcta........................................ 26 gcta 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................CACTCTGTAGACCAGGCTGGCgatc........................................ 25 gatc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGGGTTTCTCCGTGTAGCCCTGGCTGTCa........................................................................ 29 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGGCCTCAAACTCAGAAATCCGCCatt..................... 27 att 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAAACTCAGAAATCCGCCTtta.................... 22 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TTCGAGACAGGGTTTCTCCGTGTAGCCttc............................................................................... 30 ttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AAGACGCCATCAGGctct................................................................................................................................................................................................... 18 ctct 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TAATAAAAGCCTCCAGCAAAGACGCCATC.......................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCaag............... 27 aag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCTGCCTaaa.......... 33 aaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTgtta............... 27 gtta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.............................................................................................................................................TTCGAGACAGGGTTTCTCCGTGcc..................................................................................... 24 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................AAATAATAAAAGCCTCCAGCAAAGACG............................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCgcag....................................... 27 gcag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTCAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTac................. 27 ac 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATaaga......................... 33 aaga 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCgaga........................................ 32 gaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GAAATAATAAAAGCCTCCAGCAAAGACGC.............................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCTGCaa............. 29 aa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TTTCGAGACAGGGTTTCTCCGTGTAGa................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AACTCAGAAATCCGCCTGCCTaaa................ 24 aaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................CACTCTGTAGACCAGGCTGGCgta......................................... 24 gta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTacaa............... 27 acaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCAAACTCAGAAATCCGCCTGCCatc................. 26 atc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCAACGGAAATAATAAAAGCCTCCAGC...................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AACTCAGAAATCCGCCTGCCTata................ 24 ata 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCgga........................................ 26 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCgaaa........................................ 27 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTaaaa........................................................................................ 27 aaaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGGCCTCAAACTCAGAAATCCGCCTGCaag.................. 30 aag 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAcata................................... 31 cata 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGGCTGGCgtac........................................ 26 gtac 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTataa............... 27 ataa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................CCGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGctgt................................................................. 27 ctgt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGGGTTTCTCCGTGTAGCCCTGGCTGgca........................................................................ 29 gca 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TTTCTCCGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGag.................................................................... 29 ag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAACTCAGAAATCCGCCTGCCTaaa................ 25 aaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TCTGCAACGGAAATAATAAAAGCCTCC......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCgaag.............. 29 gaag 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCgcgt....................................... 27 gcgt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CAAACTCAGAAATCCGCCTGttgc.................. 24 ttgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGGCTGGCgagt........................................ 26 gagt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TCTCCGTGTAGCCCTGGCTGTCCTttt.................................................................... 27 ttt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCgtt........................................ 26 gtt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGG.................................................................................................. 19 5 0.80 0.80 - - 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - -
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGG................................................................................................. 20 4 0.50 0.50 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - -
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCa............................................................................................ 25 a 0.33 2.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCtt......................................................................................... 28 tt 0.33 2.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTagt........................................................................................... 26 agt 0.33 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGGattc............................................................................................. 24 attc 0.25 0.50 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGGgttc............................................................................................. 24 gttc 0.25 0.50 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GTTCCTTCTGCAACGGAAATAATAAAAGCCTCCAGCAAAGACGCCATCAGGTACAGTCTCTACCACCACCAAAGTCTGTTTTGATGCTGCTTCTTGGACCTTTAATTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCCGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCTGCCTCTCGAGTGCTGGG
..............................................................................................................................(((((..(((((((((..((..(((((((.........)))))))....))..))))).))))..)))))......................................................
....................................................................................................101................................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
...............................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAaaaa................................ 27 aaaa 3.00 0.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CTCCGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAAt................................................................... 28 t 3.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAaaga................................ 26 aaga 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAaagt................................ 27 aagt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAagt................................ 26 agt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCGcaa.......................... 31 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................GACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCat........................... 31 at 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGaaga................................. 26 aaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGGCCTCAAACTCAGAAATCCGccca.......................... 26 ccca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AAACTCAGAAATCCGtta.......................... 18 tta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAAcc.............................. 32 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCgat........................... 27 gat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCaga............................ 30 aga 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAaaaa............................... 28 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CCTGCCTCTGCCTCTCGAggt........ 21 ggt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATgaa............................. 29 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAAagaa.............................. 29 agaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAaat................................ 26 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAatta................................ 27 atta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................GTACAGTCTCTACCAgt......................................................................................................................................................................................... 17 gt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GGCTGGCCTCAAACTCAGAggga................................ 23 ggga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCgggc........................... 28 gggc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCag........................... 30 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCgta........................... 27 gta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCGgta.......................... 33 gta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CGTGTAGCCCTGGCTGTttta.......................................................................... 21 ttta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TGCCTCTGCCTCTCGAGTGCTGGta. 25 ta 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAAaag.............................. 27 aag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................AGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATtatt............................. 27 tatt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AAACTCAGAAATCCGtaat.......................... 19 taat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GCCTCAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCTaaa................. 32 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAaaaa............................... 27 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CTCCGTGTAGCCCTGGCTGTCCTt....................................................................... 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AAAGCCTCCAGCAAAcacg................................................................................................................................................................................................................... 19 cacg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCatt........................... 31 att 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................GCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAgtt................................................... 31 gtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTtat................................................................. 29 tat 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AAACTCAGAAATCCGCCTGCCTtgat................... 26 tgat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CTCCGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAt.................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GGCTGGCCTCAAACTCAGAAgaga............................... 24 gaga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCgt........................... 26 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCGta.......................... 28 ta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAatc................................ 25 atc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................AGTGGTTTTTCGAGACAGGGggtt................................................................................................. 24 ggtt 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAAagt.............................. 28 agt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GGCTGGCCTCAAACTCAGAAAgggc.............................. 25 gggc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GTGTAGCCCTGGCTGTCCTGcgt...................................................................... 23 cgt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCatt............................ 31 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................GCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCgct.................................................... 30 gct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAata................................ 25 ata 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTac................................................................. 28 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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............................................................................................................................................................................................................................CCTGCCTCTGCCTCTCGAGTGCTGGgggg. 29 gggg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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