(8)
OTHER.mut
(3)
PIWI.ip
(32)
TESTES

Sense strand
CAGGCTGGCCCCGAACTCACATAGATTGGCCTGCCTCTGCCTCCTGGGTGCTGGGATTAAAGGTATGCACTACCACACCCAACTCTTTATTAATGTTTTTAAAGTCCCTTTCAGAACACTGCATCTGCATGTTCCATAGATACATATATTATATACACACACACATGTGTAGGTGACTTGTATTTTTATTCTGTTAACAGTGTGTTTCCCACCAGAACCAGATGTGAATACCCTTTCACTGAAAACTCCA
.............................................................................................((((..((............(((((.(((....))))))))...(((((((....((((.((((((......)))))).))))..)))))))......))..))))...................................................
.............................................................................................94........................................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
...................................................TGGGATTAAAGGTATGCACTACCACACCCA......................................................................................................................................................................... 30 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAACAGTGTGTTTCCCACCAGAACCAGATGT......................... 31 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................AACCAGATGTGAATACCCTTTCACTGAAA...... 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TAGGTGACTTGTATTTTTATTCTGTTAAC.................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TTAAAGTCCCTTTCAGAACACTGCATCTGCAT........................................................................................................................ 32 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................CCAGAACCAGATGTGAATACCCTTTC............. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..................................................................................................................................................................................................TAACAGTGTGTTTCCCACCAGAACCAGATG.......................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTTCCCACCAGAACCAGATGTGAATACCCTTT.............. 32 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGGGATTAAAGGTATGCACTACtgaa............................................................................................................................................................................. 26 tgaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...................................................................................................TAAAGTCCCTTTCAGAACACTGCATCTGCAT........................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TGCATCTGCATGTTCCATAGATACATATtt..................................................................................................... 30 tt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGGGATTAAAGGTATGCACTACCACACC........................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GAACTCACATAGATTGGCCTGCCTCTGC.................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................TCTGCCTCCTGGGTGCTGGGAaga............................................................................................................................................................................................... 24 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ACCAGATGTGAATACCCTTTCACTGAAAAC.... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TACACACACACATGTGTAGGTGACTTGTAT................................................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGGGATTAAAGGTATGCACTACCACAC............................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CACCAGAACCAGATGTGAATACCCTTT.............. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TATACACACACACATGTGTAGGTGACTTGTA.................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.................................................................................................................................................................................................................CACCAGAACCAGATGTGAATACCCTTTC............. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................ACACACACATGTGTAGGTGACTTGTATTT................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TTTATTAATGTTTTTAAAGTCCCTTTCAGA....................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TTCCCACCAGAACCAGATGTGAATACCCTTT.............. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGCATGTTCCATAGATACATATATTATATAC.............................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TCCCACCAGAACCAGATGTGAATACCCTTT.............. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGGGATTAAAGGTATGCACTACCACACCC.......................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TTAAAGTCCCTTTCAGAACACTGCATCTGC.......................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CACACACATGTGTAGGTGACTTGTATTTTT............................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGTTTCCCACCAGAACCAGATGTGAATACCC................. 31 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................AACCAGATGTGAATACCCTTTCACTGAAAA..... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TATTTTTATTCTGTTAACAGTGTGTTTCC......................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TTTAAAGTCCCTTTCAGAACACTGCATCTGC.......................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................................................................................................................TGCATCTGCATGTTCCATAGATACATt........................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGTTCCATAGATACATATATTATATACACAC.......................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGTGTGTTTCCCACCAacc................................. 19 acc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGGGATTAAAGGTATGCAttt.................................................................................................................................................................................. 21 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TCTGCATGTTCCATAGATACATATATTATAT................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGTTTCCCACCAGAACCAGATGTGAATACtt................. 31 tt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGGGATTAAAGGTATGCACTACCACACCCAA........................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GAACTCACATAGATTGGCCTGCCTCTGCCT................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................ACACACATGTGTAGGTGACTTGTATTTTTA.............................................................. 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CCAGATGTGAATACCCTTTCACTGAAAAC.... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TTATATACACACACACATG................................................................................... 19 7 0.57 0.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - 0.29 - - - - - - - - - - - 0.14
...................................................TGGGATTAAAGGTATGCACTACCAC.............................................................................................................................................................................. 25 9 0.11 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CAGGCTGGCCCCGAACTCACATAGATTGGCCTGCCTCTGCCTCCTGGGTGCTGGGATTAAAGGTATGCACTACCACACCCAACTCTTTATTAATGTTTTTAAAGTCCCTTTCAGAACACTGCATCTGCATGTTCCATAGATACATATATTATATACACACACACATGTGTAGGTGACTTGTATTTTTATTCTGTTAACAGTGTGTTTCCCACCAGAACCAGATGTGAATACCCTTTCACTGAAAACTCCA
.............................................................................................((((..((............(((((.(((....))))))))...(((((((....((((.((((((......)))))).))))..)))))))......))..))))...................................................
.............................................................................................94........................................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
AGGCTGGCCCCGAACTCAata....................................................................................................................................................................................................................................... 21 ata 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTTCCCACCAGAACCAGAT........................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - -
AGGCTGGCCCCGAACTCAactc....................................................................................................................................................................................................................................... 22 actc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AGGCTGGCCCCGAACTtctc......................................................................................................................................................................................................................................... 20 tctc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CCAGATGTGAATACCCTTTCACTGAA....... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................GTTAACAGTGTGTTTCCCACCAGAACCAGAT........................... 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................ATGTGAATACCCTTTCACTG......... 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGCCTCCTGGGTGCTGGGATTAAaagt.............................................................................................................................................................................................. 27 aagt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GTGTTTCCCACCAGAACCA.............................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
AGGCTGGCCCCGAACTCAcctc....................................................................................................................................................................................................................................... 22 cctc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AGGCTGGCCCCGAACTCactc........................................................................................................................................................................................................................................ 21 actc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TATTTTTATTCTGTTAACAGTGTGTTTCCCAC...................................... 32 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CCAGATGTGAATACCCTTTCACTGAAAACTCC. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AGGCTGGCCCCGAACTCAtctc....................................................................................................................................................................................................................................... 22 tctc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -