(1)
OTHER.ip
(6)
OTHER.mut
(2)
PIWI.ip
(1)
TDRD1.ip
(25)
TESTES

Sense strand
CCTGAGCGAGTCTTCCTTGTAGAAGGCTGATTCCTTTCACATGGTTTTTTATATTGGATAAAACAGGTTTGTTGTGGGTTTTGTTTTGTTTTTCAATAGATGTTGTGTAAGCTGCTTCCTAAAATATGTTTGCAAATGGATCTTGTTGTGTTGATTTTTGTTTTTCTTGGATTGTCTTCATAGCCTTGTTTCATCCGCAGGTGATTTCACTGTGAAAGGCTTCCTCCACAGACTGAGCATCATCAATGAC
....................................................................................................................(((..................)))....((((((..(((....((((.....)))).)))..))))))..................................................................
..................................................................................................................115..................................................................184................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
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.......................................................................................................................................................TGATTTTTGTTTTTCTTGGATTGTCTTC....................................................................... 28 1 16.00 16.00 11.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
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.......................................................................................................................TAAAATATGTTTGCAAATGGATCTTGTTGTG.................................................................................................... 31 1 5.00 5.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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................................................TTATATTGGATAAAACAGGTTTGTTGTGGG............................................................................................................................................................................ 30 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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..TGAGCGAGTCTTCCTTGTAGAAGGCTGATT.......................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
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...................TAGAAGGCTGATTCCTTTCACATGGTTTTT......................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...................TAGAAGGCTGATTCCTTTCACATGGTTTT.......................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TTCCTTTCACATGGTTTTTTATATTGGATA.............................................................................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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..........................................................................................TTTCAATAGATGTTGTGTAAGCTGt....................................................................................................................................... 25 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TTCCTCCACAGACTGAGCATC......... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - -
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.................TGTAGAAGGCTGATTCCTTTCACATGGTTT........................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGATTTTTGTTTTTCTTGGATTGTCTTCAa..................................................................... 30 a 1.00 17.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TAAAATATGTTTGCAAATGGATCTTGT........................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.................................................................................................................................TTGCAAATGGATCTTGTTGTGTTGATT.............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGCAAATGGATCTTGTTGTGTTGATT.............................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
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............................................................................................................................................................TTTGTTTTTCTTGGATTGTCTTCATAGCC................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTTGTGTAAGCTGCTTCC................................................................................................................................... 18 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - -
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.................................................TATATTGGATAAAACAGGTTTGTTGTGGGTT.......................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.....................................CACATGGTTTTTTATATTGGATAAAACAGt....................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TTGCAAATGGATCTTGTTGTGTTGATTTTT........................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGCAAATGGATCTTGTTGTGTTGATTTTTtt......................................................................................... 31 tt 1.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TTATATTGGATAAAACAGGTTTGTTGggt............................................................................................................................................................................. 29 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
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.......................................................................................................................TAAAATATGTTTGCAAATGGATCTTGTTGc..................................................................................................... 30 c 1.00 13.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCTTGGATTGTCTTCATAGCCTTGTTTCATC....................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TAAAATATGTTTGCAAATGGATCTTGTTt...................................................................................................... 29 t 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGTGTTGATTTTTGTTTTTCTTGGATTGT........................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TTATATTGGATAAAACAGGTTTGTTGTGGa............................................................................................................................................................................ 30 a 1.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGAAAGGCTTCCTCCACAGACTGAGCATC......... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TTTTGTTTTTCAATAGATGTTGTGTAAGCTGt....................................................................................................................................... 32 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TTGGATTGTCTTCATAGCCTTGTTTCATCCG..................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TTTGCAAATGGATCTTGTTGT..................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
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..............................TTCCTTTCACATGGTTTTTTATATTGGA................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TGTTTTTCTTGGATTGTCTTCATAGCCTT............................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TTTGTTTTGTTTTTCAATAGATGTTttgt.............................................................................................................................................. 29 ttgt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTTTTGTTTTTCAATAGATGTTGTGTAt............................................................................................................................................ 29 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGAGCGAGTCTTCCTTGTAGAAGGCTGAT........................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTTTTGTTTTTCAATAGATGTTGTGTAAGC.......................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGATTTCACTGTGAAAGGCTTCCTCt....................... 26 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TATTGGATAAAACAGGTTTGTTGTGGGTT.......................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTTATATTGGATAAAACAGGTTTGTTGTGt............................................................................................................................................................................. 30 t 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TAGATGTTGTGTAAGCTGCTTCCTAAAA.............................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TTCAATAGATGTTGTGTAAGCTGCTTCC................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GATTTCACTGTGAAAGGCTTCCTCCAC..................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TAGATGTTGTGTAAGCTGCTTCCTAAcata............................................................................................................................ 30 cata 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TATGTTTGCAAATGGATCTTGTTGTGTTGA................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GATTTCACTGTGAAAGGCTTCCTCCACA.................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TATTGGATAAAACAGGTTTGTTGTG.............................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGTGATTTCACTGTGAAAGGCTT............................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TCCTAAAATATGTTTGCAAATGGATCTTGT........................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TTGTTTTTCTTGGATTGTCTTCATA.................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGATTTTTGTTTTTCTTGGATTGTCTTCATA.................................................................... 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCCGCAGGTGATTTCACTGTGAAAGGCTT............................ 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGAAAGGCTTCCTCCACAGACTGAGCATCtt....... 31 tt 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..TGAGCGAGTCTTCCTTGTAGAAGGCTGATTt......................................................................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGTGATTTCACTGTGAAAGGCTTCCTCCA...................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCCGCAGGTGATTTCACTGTGAAAGGCTTC........................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TGTTTTTCTTGGATTGTCTTCATAGC.................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTGTAGAAGGCTGATTCC........................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTGTAGAAGGCTGATTCCTTTCACATGGT............................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTTATATTGGATAAAACAGGTTTGTTGTGa............................................................................................................................................................................. 30 a 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TTGGATTGTCTTCATAGCCTTGTTTCATCC...................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTTTTGTTTTTCAATAGATGTTGTGTAA............................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGTGTTGATTTTTGTTTTTCTTGGATTttc.......................................................................... 30 ttc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TTTCAATAGATGTTGTGTAAGCTGCTTCCT.................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................AAAATATGTTTGCAAATGGATCTTtgt....................................................................................................... 27 tgt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGTTTCATCCGCAGGTGATTTCAC........................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TTCACTGTGAAAGGCTTCC.......................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CCGCAGGTGATTTCACTGTGAAAGGttat........................... 29 ttat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TTATATTGGATAAAACAGGTTTGTTGTGt............................................................................................................................................................................. 29 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTTTTGTTTTTCAATAGATGTTGTGTAAG........................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTTGTTTTTCAATAGATGTTGTGTAAGCTGC....................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.........................................................................................................................AAATATGTTTGCAAATGGATCTTGTTGTGT................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTTGTTTTTCAATAGATGTTGTGTAAGCTG........................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGTGATTTCACTGTGAAAGGCTTCCT......................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTGTAGAAGGCTGATTCCTTTCACATGGTTT........................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TATGTTTGCAAATGGATCTTGTTGT..................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...................TAGAAGGCTGATTCCTTTCACATGattt........................................................................................................................................................................................................... 28 attt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................ATAGATGTTGTGTAAGCTGCTTCCTAAA............................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TTGGATAAAACAGGTTTGTTGTGGGTTTT........................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTGTCTTCATAGCCTatg............................................................. 18 atg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
....................................................................................................................................................TGTTGATTTTTGTTTTTCTTGGATTGTCTTC....................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................ATTTCACTGTGAAAGGCTTCCTCCA...................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GTTTTGTTTTTCAATAGAT..................................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50

Antisense strand
CCTGAGCGAGTCTTCCTTGTAGAAGGCTGATTCCTTTCACATGGTTTTTTATATTGGATAAAACAGGTTTGTTGTGGGTTTTGTTTTGTTTTTCAATAGATGTTGTGTAAGCTGCTTCCTAAAATATGTTTGCAAATGGATCTTGTTGTGTTGATTTTTGTTTTTCTTGGATTGTCTTCATAGCCTTGTTTCATCCGCAGGTGATTTCACTGTGAAAGGCTTCCTCCACAGACTGAGCATCATCAATGAC
....................................................................................................................(((..................)))....((((((..(((....((((.....)))).)))..))))))..................................................................
..................................................................................................................115..................................................................184................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
..................................................................................................TTGTGTAAGCTGCTaggt...................................................................................................................................... 18 aggt 2.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GGCTGATTCCTTggt...................................................................................................................................................................................................................... 15 ggt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCTTGGATTGTCTTCATAGCCTTGTTTCA......................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TAGATGTTGTGTAAGCTGCT...................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GGCTGATTCCTTggc...................................................................................................................................................................................................................... 15 ggc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -