(8)
OTHER.mut
(4)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(30)
TESTES

Sense strand
AGTTTATTGAAATTGCTGCCCGTAAGAAGCGAAATTTTATTCTGGATCAGGTAAGTAGTAGCTTTGAAGTTAAAGAGAGAAATCAACTGATAATTGGTAAGGTGTAACATTAACGTCTTTAACATTTTCCCCTCAAGACAAATGTGTCTGCTGCTGCCCAGAGAAGAAAAATGTGCCTGTTTGCAGG
....................................................((((....))))....((((((((((....)).(((.......))).................))))))))................................................................
..................................................51....................................................................................137................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
..................................................GTAAGTAGTAGCTTTGAAGTTAAAGAGAGAAATCAACTGATAATTGGTAAGG..................................................................................... 52 1 87.00 87.00 66.00 21.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................CGTCTTTAACATTTTCCCCTCAAGA................................................. 25 1 7.00 7.00 - - 1.00 - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................GTCTTTAACATTTTCCCCTCAAG.................................................. 23 1 7.00 7.00 - - 3.00 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CTTTAACATTTTCCCCTCAAG.................................................. 21 1 6.00 6.00 - - 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................CGTCTTTAACATTTTCCCCTCAAG.................................................. 24 1 5.00 5.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - -
...................................................................................................................TCTTTAACATTTTCCCCTCAAG.................................................. 22 1 5.00 5.00 - - 1.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................GTCTTTAACATTTTCCCCTCAAGA................................................. 24 1 4.00 4.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
............................GCGAAATTTTATTCTGGATCAG......................................................................................................................................... 22 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CAAATGTGTCTGCTGCTGCCCAG.......................... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TTTATTCTGGATCAGGTA...................................................................................................................................... 18 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGTAGCTTTGAAGTTAAAGAGA............................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGTAGCTTTGAAGTTAAAGAGAGA........................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGAAGCGAAATTTTATTCTGGATCAGac....................................................................................................................................... 28 ac 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................AACGTCTTTAACATTTTCCCCTCAAG.................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TAAGAAGCGAAATTTTATTCTGGATCA.......................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................ACGTCTTTAACATTTTCCCCTCAAG.................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GTGTCTGCTGCTGCCCAGAGA....................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAGAAGCGAAATTTTATTCTGGATCAG......................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCGAAATTTTATTCTGGATCAGac....................................................................................................................................... 24 ac 1.00 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TAAGAAGCGAAATTTTATTCTGGATCAGac....................................................................................................................................... 30 ac 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..........................................................................................................................................CAAATGTGTCTGCTGCTGCCCAtctc....................... 26 tctc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.......TGAAATTGCTGCCCGTAAGAAGCGAAATT....................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................CATTAACGTCTTTAACATTTTCCCCTCAAGA................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................................................................................ACGTCTTTAACATTTTCCCCTCAAGA................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
........................AGAAGCGAAATTTTATTCTGGATCAG......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
............................................................................................................................................................CCCAGAGAAGAAAAATGTGCCTGTT...... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTAACGTCTTTAACATTTTCCCCTCAAGA................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATGTGTCTGCTGCTGCCCAGAGAAGA.................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........................AGCGAAATTTTATTCTGGATCAGacaa..................................................................................................................................... 27 acaa 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CTGCCCGTAAGAAGCGAAATTTTA.................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TCTTTAACATTTTCCCCTCAAGA................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGCTGCCCAGAGAAGAAAAATGTGC........... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TAAGAAGCGAAATTTTATTCTGGATCAGaca...................................................................................................................................... 31 aca 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.....................................................AGTAGTAGCTTTGAAGTTAAAGAGAGAA.......................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGCTGCCCAGAGAAGAAAAATGTGCCT......... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................AAGCGAAATTTTATTCTGGATC........................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TAAGAAGCGAAATTTTATTCTGGATCAG......................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TATTGAAATTGCTGCCCGTA................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGCTGCTGCCCAGAGAAGAAAAATGTGC........... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CAAATGTGTCTGCTGCTGCCCAGAG........................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..........................AAGCGAAATTTTATTCTGGA............................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AATGTGTCTGCTGCTGCCCAGAGAAGAAAAATG.............. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGCGAAATTTTATTCTGGATCAG......................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GTCTGCTGCTGCCCAGAGA....................... 19 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGTAGCTTTGAAGTTAAAGA............................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TATTGAAATTGCTGCCCGTAAGA................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAGAAGCGAAATTTTATTCTGGATCAGaca...................................................................................................................................... 30 aca 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................GTAAGTAGTAGCTTTGAAGTTAAAGAG.............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGTAGCTTTGAAGTTAA.................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................ATTTTATTCTGGATCAG......................................................................................................................................... 17 3 0.67 0.67 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - -
.................................ATTTTATTCTGGATCAGa........................................................................................................................................ 18 a 0.67 0.67 - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AATGTGTCTGCTGCTGCC............................. 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................AACATTTTCCCCTCAAG.................................................. 17 4 0.25 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGTTTATTGAAATTGCTGCCCGTAAGAAGCGAAATTTTATTCTGGATCAGGTAAGTAGTAGCTTTGAAGTTAAAGAGAGAAATCAACTGATAATTGGTAAGGTGTAACATTAACGTCTTTAACATTTTCCCCTCAAGACAAATGTGTCTGCTGCTGCCCAGAGAAGAAAAATGTGCCTGTTTGCAGG
....................................................((((....))))....((((((((((....)).(((.......))).................))))))))................................................................
..................................................51....................................................................................137................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
.....................GAAGCGAAATTggga....................................................................................................................................................... 15 ggga 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -