(7)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(2)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(23)
TESTES

Sense strand
AGAAGTAGAGGGGAAGGACCTACCAGAACATGCTGTCCTCAAGATGAAAGGCAAGGAATTCACTTTATTTTTACTGTCTTAAGTACGGTTTGGGGATTTATACCTAGAAAATATCTTCACACTTAGAGATTATATTAATCTGCTAAATAGAAACTTGTATGGTTATTATACAAAGAATGTGATGAAGGCCGTGACCAGATAACTGAAAGTTGAAAGAATTAAACACATTCAGAGATAAAGTTTATAGAATTTACATGTTCATAATTGATTTATAAGTTTGACTTGATTCCCTGTAGGAAACTTCACCCTTCCAGAGGTTGCAGAATGCTTTGATGAAATAACCTAT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
..............................................................................................................................................................................GAATGTGATGAAGGCCGTGACCAGATAACTGA............................................................................................................................................ 32 1 12.00 12.00 - 3.00 - 4.00 - - - - - - 2.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGAGGTTGCAGAATGC.................. 20 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................GAATGTGATGAAGGCCGTGACCAGATAACTGAAA.......................................................................................................................................... 34 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............GAAGGACCTACCAGAACATGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.............AAGGACCTACCAGAACATG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AGAGGGGAAGGACCTACC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................ACCTACCAGAACATGCTGTCCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TACCAGAACATGCTGTCCTCAAGATG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - -
.............AAGGACCTACCAGAACATGCTGTC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................GAATGTGATGAAGGCCGTGACCAGATAACTGAA........................................................................................................................................... 33 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GTAGAGGGGAAGGACC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCCTTCCAGAGGTTGCAGAATGCT................. 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCCTTCCAGAGGTTGCAGAATG................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................ATGCTGTCCTCAAGATGAAAGGa...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAGGTTGCAGAATGCTTTGA............. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGTTGCAGAATGCTTTGA............. 20 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GGAAGGACCTACCAGAACATGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TACCAGAACATGCTGTCCTCAAGATGt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......AGAGGGGAAGGACCTACCAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAGAACATGCTGTCCTCAAGATGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GACCTACCAGAACATGCTGTCCTtttt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tttt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGAGGTTGCAGAATGt.................. 20 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGAACATGCTGTCCTCAAGATGAAAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGTTGCAGAATGCTTT............... 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGTTGCAGAATGCTT................ 18 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CTACCAGAACATGCTGTCCTCAAGATGAAAGGaaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 35 aaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCCTTCCAGAGGTTGCAGAATGt.................. 24 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTCCAGAGGTTGCAGAATGCTTT............... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCCTTCCAGAGGTTGCAGAATGCTT................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GTAGAGGGGAAGGACCT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TACCAGAACATGCTGTCCTCAAGATGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....................TACCAGAACATGCTGTCCTCAAGAT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AGGACCTACCAGAACATGCT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TACCAGAACATGCTGTCCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCCAGAGGTTGCAGAATGC.................. 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GTAGAGGGGAAGGACCTACCAGAACATGt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGAGGTTGCAGAATGCTT................ 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GAGGGGAAGGACCTACCAGAACATGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ACCAGAACATGCTGTCCTCAAGATGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.....................ACCAGAACATGCTGTCCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCTTCCAGAGGTTGCAGAATGC.................. 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCCTTCCAGAGGTTGCAGAA..................... 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGTTGCAGAATGCTTTGATGAAATAACC... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...........................................................................................................................................................................................GCCGTGACCAGATAACTGAAAG......................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................AATGTGATGAAGGCCGTGACCAGATAACTGA............................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TACCAGAACATGCTGTCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGAGGTTGCAGAAT.................... 18 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GAAGGACCTACCAGAACATGCTGTC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGAATGCTTTGATGAAATAACC... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CATGCTGTCCTCAAGATGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGAGGTTGCAGAATGCTT................ 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAGGTTGCAGAATGCTT................ 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AGGACCTACCAGAACATGCTG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCCTTCCAGAGGTTGCAGAATGCTTTGATGA.......... 33 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACTTCACCCTTCCAGAGGTT........................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGAACATGCTGTCCTCAAGATa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAGTAGAGGGGAAGGACCTACCAGAACATG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TTATTTTTACTGTCTTAAGTACGGTTTGGG............................................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGAGGTTGCAGAATGCTTTG.............. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GTAGAGGGGAAGGACCTACCAGAAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTTGCAGAATGCTTTGATGAAATAACC... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................AGGCCGTGACCAGATAACTGAAA.......................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........AGGGGAAGGACCTACCAGAACATGCTGTC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....GTAGAGGGGAAGGAC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 8 0.12 0.12 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGAAGTAGAGGGGAAGGACCTACCAGAACATGCTGTCCTCAAGATGAAAGGCAAGGAATTCACTTTATTTTTACTGTCTTAAGTACGGTTTGGGGATTTATACCTAGAAAATATCTTCACACTTAGAGATTATATTAATCTGCTAAATAGAAACTTGTATGGTTATTATACAAAGAATGTGATGAAGGCCGTGACCAGATAACTGAAAGTTGAAAGAATTAAACACATTCAGAGATAAAGTTTATAGAATTTACATGTTCATAATTGATTTATAAGTTTGACTTGATTCCCTGTAGGAAACTTCACCCTTCCAGAGGTTGCAGAATGCTTTGATGAAATAACCTAT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
...............................................................TTTTTACTGTCTTActta......................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 ctta 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCCTCAAGATGAAAGttcc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 ttcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................ATAATTGATTTATAAactt....................................................................... 19 actt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ATTTTTACTGTCTTAtttt......................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -