chr1:168326797 168327046 -
(1)
OTHER.ip 		(10)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(50)
TESTES

Sense strand
CAGCTGTGCACATGGGTACATGCCACGTCTGCTCTTCCAGTTGTTAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGGGAAGTGATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAAACCACCTCCTGTTACAGAATAGTATACTGCTTTGTTAAAGACATCCAGACTGATTCCTACTCAGGTTCTCTCTGTTTTCCAGAAAATGGAACTGTGATGGAAACAGTTGGGAGGAAAACTTGTAAGAGGATG
.................................................................................................(((((((((((..((.......))....((((.....(((((((...(((...((((...))))..))))))).))).....)))).......)))))))).)))................................................
...................................................................................84.........................................................................................................................207.........................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCAT....................................................................................................................................... 27 1 544.00 544.00 182.00 178.00 69.00 44.00 18.00 7.00 8.00 11.00 10.00 3.00 5.00 - - 2.00 3.00 - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCATT...................................................................................................................................... 28 1 488.00 488.00 154.00 149.00 62.00 71.00 18.00 8.00 5.00 3.00 4.00 - 3.00 - - 5.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCA........................................................................................................................................ 26 1 330.00 330.00 106.00 101.00 38.00 36.00 7.00 10.00 6.00 4.00 6.00 - 6.00 - - 1.00 3.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGG.................................................................................................................................................... 26 1 263.00 263.00 86.00 86.00 33.00 33.00 5.00 3.00 2.00 4.00 1.00 2.00 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGA................................................................................................................................................... 27 1 232.00 232.00 72.00 64.00 31.00 29.00 16.00 2.00 5.00 2.00 - 2.00 5.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAA.................................................................................................................................................. 28 1 120.00 120.00 39.00 39.00 12.00 16.00 8.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AACAAGATTCGGAAGACACAGGCATT...................................................................................................................................... 26 1 91.00 91.00 25.00 37.00 4.00 12.00 6.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAG................................................................................................................................................. 29 1 34.00 34.00 6.00 8.00 4.00 3.00 2.00 - 2.00 2.00 4.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TCCAGAAAATGGAACTGTGATGGAAAC............................ 27 1 31.00 31.00 6.00 12.00 2.00 6.00 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGG.................................................................................................................................................... 27 1 30.00 30.00 9.00 12.00 - 4.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TTCGGAAGACACAGGCATTAAACCACCTC............................................................................................................................ 29 1 27.00 27.00 10.00 5.00 5.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGG..................................................................................................................................................................................... 25 1 27.00 27.00 4.00 1.00 1.00 2.00 - 7.00 5.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGGGA................................................................................................................................................................................... 27 1 23.00 23.00 7.00 7.00 3.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGGG.................................................................................................................................................................................... 26 1 22.00 22.00 3.00 2.00 - - - 1.00 2.00 2.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.................................................................................................TTCGGAAGACACAGGCATTAAACCACCT............................................................................................................................. 28 1 21.00 21.00 7.00 8.00 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCATTA..................................................................................................................................... 29 1 21.00 21.00 9.00 3.00 2.00 1.00 - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TTCGGAAGACACAGGCATTAAACCACC.............................................................................................................................. 27 1 18.00 18.00 5.00 8.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGC......................................................................................................................................... 25 1 17.00 17.00 - 5.00 3.00 1.00 - 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................GACAGACATGAACAAGATTCGGAAGAC............................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 4.00 4.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGATGGAGACAGACATGAACAAGATTC...................................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 3.00 3.00 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TACTCAGGTTCTCTCTGTTTTCCAGAAA............................................... 28 1 12.00 12.00 - - - - - - - - - - - 11.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTCCTACTCAGGTTCTCTCTGTTTTC..................................................... 26 1 12.00 12.00 - - - - - - - - - - 1.00 2.00 7.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGTTAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGG..................................................................................................................................................................................... 28 1 11.00 11.00 1.00 1.00 - - 1.00 - 3.00 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................CAGACATGAACAAGATTCGGAAGACACA............................................................................................................................................ 28 1 11.00 11.00 5.00 4.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGt................................................................................................................................................... 27 t 10.00 263.00 6.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TAGTATACTGCTTTGTTAAAGACATCC...................................................................................... 27 1 10.00 10.00 3.00 3.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TTCCAGTTGTTAGGATCTTTGTACAGC............................................................................................................................................................................................. 27 1 10.00 10.00 1.00 - - - - 2.00 - 1.00 3.00 - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGAT........................................................................................................................................................ 22 1 9.00 9.00 4.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................CAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAAACC................................................................................................................................. 29 1 8.00 8.00 1.00 2.00 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAt.................................................................................................................................................. 28 t 8.00 232.00 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................AGACAGACATGAACAAGATTCGGAAG................................................................................................................................................. 26 1 8.00 8.00 3.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................GACAGACATGAACAAGATTCGGAAGA................................................................................................................................................ 26 1 8.00 8.00 1.00 2.00 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TACTCAGGTTCTCTCTGTTTTCCAGAA................................................ 27 1 8.00 8.00 - - - - - - - - - - - 3.00 4.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................GATTCGGAAGACACAGGCATTAAACCACC.............................................................................................................................. 29 1 8.00 8.00 2.00 2.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TCGGAAGACACAGGCATTAAACCACCTCC........................................................................................................................... 29 1 8.00 8.00 3.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................GACATGAACAAGATTCGGAAGACACAGG.......................................................................................................................................... 28 1 7.00 7.00 2.00 3.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGC......................................................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 1.00 1.00 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACAC............................................................................................................................................. 28 1 7.00 7.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACACA............................................................................................................................................ 29 1 6.00 6.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................GGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAG................................................................................................................................................. 28 1 6.00 6.00 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GAACAAGATTCGGAAGACACAGGCAT....................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 2.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGGAAAACTTGTAAGAGGATG 25 1 6.00 6.00 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TCAGGTTCTCTCTGTTTTCCAGAAAATGt........................................... 29 t 6.00 0.00 2.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGA................................................................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 2.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TACAGCTTCTGGGGGAAGTGATGGAG......................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGG.................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GAACAAGATTCGGAAGACACAGGCATT...................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGG.................................................................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAt................................................................................................................................................. 29 t 4.00 120.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................GGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAA.................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................AGATTCGGAAGACACAGGCATTAAACCACC.............................................................................................................................. 30 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TCCAGAAAATGGAACTGTGATGGAAA............................. 26 1 4.00 4.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGTTAGGATCTTTGTACAGCTTCTGG....................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TACAGCTTCTGGGGGAAGTGATGGA.......................................................................................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................GACAGACATGAACAAGATTCGGAAG................................................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 1.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGtt.................................................................................................................................................. 28 tt 4.00 263.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGTTAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGG...................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACAC............................................................................................................................................. 31 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAGt................................................................................................................................................ 30 t 3.00 34.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAAAGACATCCAGACTGATTCCTACTC...................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................CAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAAA................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGGAACTGTGATGGAAACAGTTGGGAG................... 27 2 3.00 3.00 1.00 0.50 1.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AACAAGATTCGGAAGACACAGGCAT....................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TTCTGGGGGAAGTGATGGAGACAGACAT................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................CAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAA.................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TGCCACGTCTGCTCTTCCAGTTGTTA............................................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TCGGAAGACACAGGCATTAAACCACCTC............................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TTCGGAAGACACAGGCATTAAACCACCTCt........................................................................................................................... 30 t 3.00 27.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGC......................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TAGTATACTGCTTTGTTAAAGACATCCA..................................................................................... 28 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGGGAA.................................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGGGGGAAGTGATGGAGACAGACATG................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGATGGAGACAGACATGAACAAGATT....................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................ACAAGATTCGGAAGACACAGGCATTA..................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ATTCGGAAGACACAGGCATTAAACCACC.............................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TCCTGTTACAGAATAGTATACTGCTTT................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGCTCTTCCAGTTGTTAGGATCTTTG................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGTTTTCCAGAAAATGGAACTGTGATG................................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CAGTTGGGAGGAAAACTTGTAAGAGG... 26 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................AGATTCGGAAGACACAGGCATTAAACCA................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAG................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TACTCAGGTTCTCTCTGTTTTCCAGAAAA.............................................. 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................AAGATTCGGAAGACACAGGCATTAAACC................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TAGTATACTGCTTTGTTAAAGACATC....................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCCTACTCAGGTTCTCTCTGTTTTC..................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TTAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGG..................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................AGACAGACATGAACAAGATTCGGAAGA................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACA.............................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATGGAGACAGACATGAACAAGATTCG..................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................ACAGCTTCTGGGGGAAGTGATGGA.......................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACA.............................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGA................................................................................................................................................ 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTGCACATGGGTACATGCCACGTCT............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGAAACAGTTGGGAGGAAAACTTG.......... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CATGCCACGTCTGCTCTTCCAGTTG............................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GTGATGGAAACAGTTGGGAGGAAAACTTG.......... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................AAACAGTTGGGAGGAAAACTTGTAAG...... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................AAGATTCGGAAGACACAGGCATTAAACCA................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGGAAAACTTGTAAGAGGATGgt 27 gt 2.00 6.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTTACAGAATAGTATACTGCTTTGT................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACATGAACAAGATTCGGAAGACACAG........................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGCTCTTCCAGTTGTTAGGATCTTTGT.................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................AGACAGACATGAACAAGATTCGGAAGAC............................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TCCAGAAAATGGAACTGTGATGGAA.............................. 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCA........................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGA................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAA.................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................CAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAAAC.................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................GACATGAACAAGATTCGGAAGACACAG........................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGATGGAGACAGACATGAACAAGAT........................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAAAGACATCCAGACTGATTCCTACT....................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATGGAGACAGACATGAACAAGATTC...................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAA.................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CACGTCTGCTCTTCCAGTTGTTAGGATC....................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACACA............................................................................................................................................ 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................CCAGACTGATTCCTACTCAGGTTCTCTCT........................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGGAACTGTGATGGAAACAGTTGGGA.................... 26 2 2.00 2.00 1.00 - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TCCAGTTGTTAGGATCTTTGTACAGC............................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TTCGGAAGACACAGGCATTAAACCACCTCC........................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TCTGGGGGAAGTGATGGAGACAGACAT................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGttt................................................................................................................................................. 29 ttt 2.00 263.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTCCTACTCAGGTTCTCTCTGTTTTCC.................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AACAAGATTCGGAAGACACAGGCATTA..................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CATCCAGACTGATTCCTACTCAGt................................................................... 24 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - -
..............................................GGATCTTTGTACAGCTTCTGGGGGAAG................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACATGAACAAGATTCGGAAGACACAGG.......................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..................................................................................CAGACATGAACAAGATTCGGAAGACAC............................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAtt................................................................................................................................................. 29 tt 2.00 232.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................ACAGCTTCTGGGGGAAGTGATGGAa......................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TCAGGTTCTCTCTGTTTTCCAGAAAATGG........................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................AAGTGATGGAGACAGACATGAACAAG.......................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCtt....................................................................................................................................... 27 tt 1.00 17.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAAATGGAACTGTGATGGAAACAGTT........................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................GGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAGAC............................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCG..................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGt................................................................................................................................................... 28 t 1.00 30.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGG...................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TCTCTGTTTTCCAGAAAATGGAACTGTGATG................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGCTCTTCCAGTTGTTAGGATCTTT.................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TACTGCTTTGTTAAAGACATCCAGAttg................................................................................ 28 ttg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AGTTGGGAGGAAAACTTGTAAGAGGAT. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGGGg................................................................................................................................................................................... 27 g 1.00 22.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGtg..................................................................................................................................................................................... 25 tg 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAGAC............................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TCCAGTTGTTAGGATCTTTGTACAGCTT........................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTTACAGAATAGTATACTGCTTTGTTAA.............................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TCCAGAAAATGGAACTGTGATGGAAACA........................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGGGA................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................GACATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGa......................................................................................................................................... 29 a 1.00 7.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................GACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACAC............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CTTCCAGTTGTTAGGATCTTTGTACA............................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCCTACTCAGGTTCTCTCTGTTTTCC.................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATGGAGACAGACATGAACAAGAT........................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TCCAGACTGATTCCTACTCAGGTTCTC.............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................CAGACTGATTCCTACTCAGGTTCTCTCT........................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................ATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCA........................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTGCACATGGGTACATGCCACGTCTGC.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................ACAAGATTCGGAAGACACA............................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TACAGCTTCTGGGGGAAGTGATG............................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TTCCAGTTGTTAGGATCTTTGgaca............................................................................................................................................................................................... 25 gaca 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................CAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAAACCACC.............................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGTTTTCCAGAAAATGGAACTGTGATGGA............................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAG................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TTCTGGGGGAAGTGATGGAGACAGAa................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACAC............................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................CCTACTCAGGTTCTCTCTGTTTTCC.................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................GACAGACATGAACAAGATTCGGAcga................................................................................................................................................ 26 cga 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAAATGGAACTGTGATGGAAAC............................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................AGACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACA.............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TACAGAATAGTATACTGCTTTGTTtt.............................................................................................. 26 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CATCCAGACTGATTCCTACTCAGGTTCTCT............................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TTGTTAGGATCTTTGTACAGCTTCTG........................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGTTAGGATCTTTGTACAGCTTCT......................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................CAGACATGAACAAGATTCGGAAGACACAG........................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGAAAATGGAACTGTGATGGAAttta.......................... 26 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TACTCAGGTTCTCTCTGTTTTCCAGA................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TTCCAGTTGTTAGGATCTTTGTACA............................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TTAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGGGA................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAGA................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGt.................................................................................................................................................... 27 t 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGGAACTGTGATGGAAACAGTTGGG..................... 25 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGt.................................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCA........................................................................................................................................ 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCt..................................................................................................................................................... 25 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TCGGAAGACACAGGCATT...................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGGAAAACTTGTAAGAGGATGgctt 29 gctt 1.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................AGACAGACATGAACAAGATTCGGAA.................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................ACAAGATTCGGAAGACACAGGCATT...................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............................................................................................AGATTCGGAAGACACAGGCATTAAACCAC............................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................ATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCAT....................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGaa........................................................................................................................................ 26 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAAATGGAACTGTGATGGAAACAGT......................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TACTCAGGTTCTCTCTGTTTTCCAGAca............................................... 28 ca 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................ACAGACATGAACAAGATTCGGAAG................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCg........................................................................................................................................ 26 g 1.00 17.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................CCAGAAAATGGAACTGTGATGGAAAC............................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGGAAAACTTGTAAGAGGATGt 26 t 1.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................CACCTCCTGTTACAGAATAGTATACTGCTT.................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.............................................................TTCTGGGGGAAGTGATGGAGACAGACA.................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TCGGAAGACACAGGCATTAAACCACCTCCTt......................................................................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.........................................................................................................................................TAGTATACTGCTTTGTTAAAa............................................................................................ 21 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGaat....................................................................................................................................... 27 aat 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GAACAAGATTCGGAAGACACAGGCA........................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGAAACAGTTGGGAGGAAAACTTGTAAG...... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................CAGGTTCTCTCTGTTTTCCAGAAAATGG........................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCt........................................................................................................................................ 26 t 1.00 17.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATGGAGACAGACATGAACAAGAatct..................................................................................................................................................... 26 atct 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TACAGAATAGTATACTGCTTTGTTAAA............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGtt.................................................................................................................................................. 29 tt 1.00 30.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGAAACAGTTGGGAGGAAAACTTGT......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGATGGAAACAGTTGGGAGGAAAACTT........... 27 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TCCAGAAAATGGAACTGTGATGGA............................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGCTCTTCCAGTTGTTAGGATCTTTGTA................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGA......................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AGACATGAACAAGATTCGGAAGACAC............................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CTGCTCTTCCAGTTGTTAGGATCTTTGT.................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AGACATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGC......................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAAAC.................................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CAGTTGGGAGGAAAACTTGTAAGAGGATG 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................CAGACATGAACAAGATTCGGAAGACA.............................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGTTAAAGACATCCAGACTGATTCCTA......................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGa......................................................................................................................................... 28 a 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TTAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGGG.................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGGGAAG................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TTGTTAAAGACATCCAGACTGATTCC........................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGc................................................................................................................................................... 27 c 1.00 263.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTGCACATGGGTACATGCCACGTCTG........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................GACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACA.............................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................GACATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGC......................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACA.............................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TTGTTAGGATCTTTGTACAGCTTCT......................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AACAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAA.................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTtgg.................................................................................................................................................... 26 tgg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................GACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACACA............................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TCTTTGTACAGCTTCTGGGGG.................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TTCTGGGGGAAGTGATGGAGACAGAtt.................................................................................................................................................................. 27 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TTAAACCACCTCCTGTTACAGAATAGT............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGa.................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGGAAAACTTGTAAGAGGATGtct 28 tct 1.00 6.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGATTCCTACTCAGGTTCTCTCTGTT........................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................CAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAAACCAC............................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TGTTAGGATCTTTGTACAGCTTCTGtg...................................................................................................................................................................................... 27 tg 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TCCAGTTGTTAGGATCTTTGTACAGCTTCTtt....................................................................................................................................................................................... 32 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TACTCAGGTTCTCTCTGTTTTCCAaaa................................................ 27 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AACAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAAACt................................................................................................................................. 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCt........................................................................................................................................ 29 t 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCTGTTTTCCAGAAAATGGAACTGTGATa................................. 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGta.................................................................................................................................................. 28 ta 1.00 263.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGTTTTCCAGAAAATGGAACTGTGATGG................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........ATGGGTACATGCCACGTCTGCTCTTCC.................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TACAGCTTCTGGGGGAAGTGATGG........................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGGAAAACTTGTAAGAGGAT. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGAGACAGACATGAACAAGATTCag.................................................................................................................................................... 26 ag 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGtg.................................................................................................................................................................................... 26 tg 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................AAGATTCGGAAGACACAGGCATT...................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................AGACAGACATGAACcgg.......................................................................................................................................................... 17 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAt.................................................................................................................................... 30 t 1.00 21.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CAGTTGGGAGGAAAACTTGTAAGAGGA.. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGGAAAACTTGTAAGAGGATGga 27 ga 1.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GAAACAGTTGGGAGGAAAACTTGTAA....... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................ATTCCTACTCAGGTTCTCTCTGTTTTCC.................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TCCTGTTACAGAATAGTATACTGCTTTG.................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................AGTGATGGAGACAGACATGAACA............................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AGACATGAACAAGATTCGGA................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................ACATGCCACGTCTGCTCTTCCAGgtg............................................................................................................................................................................................................... 26 gtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGGGAt.................................................................................................................................................................................. 28 t 1.00 23.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TGCCACGTCTGCTCTTCCAGTTGTTAGGATC....................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TTGTACAGCTTCTGGGGGAAGTGATGG........................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTCCAGAAAATGGAACTGTGATGGAAACA........................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TTCGGAAGACACAGGCATTAAACCACCTa............................................................................................................................ 29 a 1.00 21.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGt................................................................................................................................................... 29 t 1.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTTCCAGAAAATGGAACTGTtatg................................. 25 tatg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGAAAATGGAACTGTG.................................... 17 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67
....................................................................................................................................................................................................................TGATGGAAACAGTTGGGAGGAAAACT............ 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGATGGAAACAGTTGGGAGGAAAA.............. 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAACTGTGATGGAAACAGTTGGGAGGA................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CAGCTGTGCACATGGGTACATGCCACGTCTGCTCTTCCAGTTGTTAGGATCTTTGTACAGCTTCTGGGGGAAGTGATGGAGACAGACATGAACAAGATTCGGAAGACACAGGCATTAAACCACCTCCTGTTACAGAATAGTATACTGCTTTGTTAAAGACATCCAGACTGATTCCTACTCAGGTTCTCTCTGTTTTCCAGAAAATGGAACTGTGATGGAAACAGTTGGGAGGAAAACTTGTAAGAGGATG
.................................................................................................(((((((((((..((.......))....((((.....(((((((...(((...((((...))))..))))))).))).....)))).......)))))))).)))................................................
...................................................................................84.........................................................................................................................207.........................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
.............................................................................................................ATTAAACCACCTCCTGtaga......................................................................................................................... 20 taga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -