chr1:162968156 162968405 +
(1)
OTHER.ip 		(12)
OTHER.mut 		(5)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(56)
TESTES

Sense strand
TCTGAATTTCAAAGTAAGTCTGTCACTTGTTTTTGTACAGATTGTAATATAGCTTGTAACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATACAAAGTGATATCACCTTTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTTACTATACTAACATGTAAAATTTAACTACTCTAAGCCAGAGAAGTAAGTCAGTCTTTGTTTTCTTAGGGCTCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAGGT
............................................................(((.((((.((((..((........))......(((....))).............)))).)))).))).........................................................................................................................
..................................................51...............................................................................132....................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATACAAAGTGATATCACCTTTAA............................................................................................................................................. 52 1 9263.00 9263.00 7006.00 2257.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATACAAAGTGATATCACCTTTAAA............................................................................................................................................ 52 1 2137.00 2137.00 1750.00 387.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGC................. 27 1 280.00 280.00 - - 74.00 78.00 27.00 30.00 14.00 13.00 - - - 2.00 3.00 1.00 4.00 - - 6.00 10.00 7.00 - 4.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCAC............... 29 1 242.00 242.00 - - 85.00 73.00 30.00 30.00 - 13.00 - - - - - - - 1.00 - 5.00 - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACC.............. 30 1 181.00 181.00 - - 30.00 34.00 39.00 27.00 - 14.00 - - - - - - 5.00 4.00 - 9.00 - 7.00 - 3.00 - 1.00 4.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACC.............. 28 1 175.00 175.00 - - 55.00 36.00 20.00 25.00 - 10.00 - - - - - - 2.00 5.00 - 4.00 8.00 5.00 - 1.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCT............. 29 1 112.00 112.00 - - 37.00 31.00 17.00 10.00 - 7.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAA...................................................................................................................................................................... 27 1 110.00 110.00 - - - - - - 35.00 - 4.00 5.00 5.00 - 4.00 11.00 6.00 3.00 6.00 2.00 - 1.00 2.00 3.00 2.00 1.00 8.00 1.00 - - - - 2.00 1.00 - 1.00 2.00 1.00 - 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCC......................................................................................................................................................................... 24 1 110.00 110.00 - - - - - - 29.00 - 19.00 6.00 - - 1.00 9.00 9.00 3.00 3.00 2.00 - - 1.00 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - 2.00 3.00 10.00 - 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTG........................................................................................................................................................................... 22 1 108.00 108.00 - - - - - - 24.00 - 10.00 3.00 5.00 11.00 2.00 7.00 6.00 6.00 - 4.00 5.00 4.00 6.00 5.00 1.00 1.00 - - - 1.00 5.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGC.......................................................................................................................................................................... 23 1 80.00 80.00 - - - - - - 16.00 - 18.00 2.00 17.00 1.00 2.00 2.00 3.00 2.00 1.00 - - 2.00 2.00 2.00 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 2.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTT............ 30 1 73.00 73.00 - - 13.00 14.00 19.00 13.00 - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCA................ 28 1 66.00 66.00 - - 19.00 20.00 11.00 11.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATACAAAGTGATATCACCTTTA.............................................................................................................................................. 52 1 58.00 58.00 58.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAA....................................................................................................................................................................... 26 1 55.00 55.00 - - - - - - 7.00 - 7.00 2.00 - - 4.00 13.00 - 1.00 2.00 - - - 2.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 4.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 4.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGA................................................................................................................................................................... 30 1 54.00 54.00 - - - - - - - - - 3.00 23.00 13.00 5.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAAT..................................................................................................................................................................... 28 1 53.00 53.00 - - - - - - 11.00 - 2.00 4.00 - - - 1.00 3.00 5.00 5.00 1.00 - 3.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 4.00 - - - - 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCA........................................................................................................................................................................ 25 1 50.00 50.00 - - - - - - 9.00 - 2.00 6.00 2.00 - 4.00 14.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - 2.00 4.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCAC............... 27 1 44.00 44.00 - - 11.00 15.00 6.00 4.00 - 2.00 - - - - - - - - - 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAGG. 27 1 43.00 43.00 - - 13.00 11.00 5.00 5.00 - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTG.................. 26 2 41.50 41.50 - - 12.50 12.00 6.00 5.50 0.50 1.50 - - - - 0.50 - 0.50 - - 0.50 - - - 0.50 - - 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCT............................................................................................................................................................................ 21 1 41.00 41.00 - - - - - - 12.00 - - 7.00 - 14.00 - 3.00 - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATA................................................................................................................................................................. 32 1 40.00 40.00 - - - - - - - - 5.00 - - 6.00 8.00 - 4.00 5.00 - 1.00 - - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTC............................................................................................................................................................................. 20 1 33.00 33.00 - - - - - - 1.00 - 2.00 - 2.00 1.00 - - 2.00 1.00 - 1.00 - - 5.00 - 3.00 - - - 5.00 2.00 - 3.00 - - - 1.00 - - - 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGACATGCAGTGACTGCACCTTTGT......... 26 1 33.00 33.00 - - 9.00 9.00 5.00 6.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGACATGCAGTGACTGCACCTTTGTT........ 27 1 29.00 29.00 - - 6.00 12.00 6.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATT.............................................................................................................................................................................. 19 1 27.00 27.00 - - - - - - 4.00 - - - 1.00 3.00 - - 1.00 - 6.00 - - 1.00 1.00 - 2.00 - - - 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTC...... 26 1 26.00 26.00 - - 10.00 6.00 3.00 - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGC.......................................................................................................................................................................... 22 1 22.00 22.00 - - - - - - 1.00 - 4.00 2.00 1.00 - - 1.00 2.00 - 3.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTG........................................................................................................................................................................... 21 1 19.00 19.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 3.00 4.00 - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGAT.................................................................................................................................................................. 31 1 18.00 18.00 - - - - - - - - 1.00 2.00 1.00 - - - 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 4.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCC......................................................................................................................................................................... 23 1 17.00 17.00 - - - - - - 1.00 - 3.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 3.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGAT............................................................................................................................................................................... 18 1 17.00 17.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 4.00 - - - - 1.00 5.00 - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTC...... 29 1 17.00 17.00 - - 4.00 4.00 3.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGAC.................... 27 3 15.33 15.33 - - 3.00 6.00 1.00 1.00 - 2.33 - - - - - - - 0.33 - 0.33 - 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAA...................................................................................................................................................................... 26 1 15.00 15.00 - - - - - - 2.00 - 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATT.............................................................................................................................................................................. 18 1 14.00 14.00 - - - - - - - - - - 3.00 2.00 - - 2.00 1.00 3.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTT........... 31 1 14.00 14.00 - - - - - - - 13.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTT....... 26 1 14.00 14.00 - - 6.00 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCT..... 27 1 13.00 13.00 - - 2.00 4.00 2.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATAC................................................................................................................................................................ 33 1 13.00 13.00 - - - - - - - - 1.00 5.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATG.................................................................................................................................................................... 29 1 13.00 13.00 - - - - - - - - 4.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGACATGCAGTGACTGC................. 18 1 12.00 12.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 12.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................ACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTT........... 29 1 11.00 11.00 - - 2.00 1.00 2.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGA................................................................................................................................................................................ 17 1 11.00 11.00 - - - - - - 3.00 - - - - - 3.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTT....... 28 1 11.00 11.00 - - 1.00 4.00 3.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................CAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTT........... 28 1 10.00 10.00 - - 2.00 2.00 2.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GTTCCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 23 1 10.00 10.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGAT.................................................................................................................................................................. 30 1 10.00 10.00 - - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCT............. 31 1 10.00 10.00 - - 1.00 - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATG.................................................................................................................................................................... 28 1 10.00 10.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAAT..................................................................................................................................................................... 27 1 9.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 3.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTT............ 29 1 9.00 9.00 - - 2.00 2.00 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGa.......................................................................................................................................................................... 23 a 9.00 108.00 - - - - - - 6.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGA..................... 26 5 8.60 8.60 - - 2.60 3.40 0.20 1.20 - 0.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCttgt...................................................................................................................................................................... 27 ttgt 8.00 80.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTGT......... 28 1 8.00 8.00 - - 1.00 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATA................................................................................................................................................................. 31 1 8.00 8.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCAC............... 28 1 8.00 8.00 - - 1.00 3.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AACCGTTCCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 24 1 8.00 8.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTC...... 27 1 8.00 8.00 - - 1.00 2.00 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAG.. 27 1 7.00 7.00 - - 1.00 1.00 - 2.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GTGATGATTCTGCCAAATG.................................................................................................................................................................... 19 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTGT......... 27 1 7.00 7.00 - - 3.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CGTTCCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 24 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAA....................................................................................................................................................................... 25 1 7.00 7.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGC................. 25 1 7.00 7.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 4.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGA................................................................................................................................................................... 29 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 25 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 18 4 6.25 6.25 - - - - - - 2.25 - - - - 0.25 0.25 - - 0.25 1.00 0.25 - 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25
..................................................................................................................................................................................................................ACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTT............ 28 1 6.00 6.00 - - 1.00 1.00 - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGaa......................................................................................................................................................................... 24 aa 6.00 108.00 - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CGTTCCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 21 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................AGTGATGTGATGATTCTGCCAAAT..................................................................................................................................................................... 24 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTCTGCCA........................................................................................................................................................................ 26 1 6.00 6.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATAC................................................................................................................................................................ 32 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTCTGC.......................................................................................................................................................................... 24 1 6.00 6.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GTGATGTGATGATTCTGCC......................................................................................................................................................................... 19 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - 4.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACC.............. 29 1 5.00 5.00 - - 2.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGATGATTCTGCCAAATGA................................................................................................................................................................... 19 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTT........... 27 1 5.00 5.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................CATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAG.. 29 1 5.00 5.00 - - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGC................. 30 1 5.00 5.00 - - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCA................ 26 1 5.00 5.00 - - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTT............ 32 1 5.00 5.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................ATGTGATGATTCTGCCAA....................................................................................................................................................................... 18 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..............................................................................................................CCGTTCCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 22 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACT................... 28 3 5.00 5.00 - - 1.33 1.00 - 1.33 - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGC................. 28 1 4.00 4.00 - - 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAGG. 28 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATACA............................................................................................................................................................... 34 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACC.............. 27 1 4.00 4.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................ATGTGATGATTCTGCCAAATG.................................................................................................................................................................... 21 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTT.................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGC................. 26 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 20 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATa.............................................................................................................................................................................. 19 a 4.00 17.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTG.......... 26 1 4.00 4.00 - - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAG.. 28 1 4.00 4.00 - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTG.......... 27 1 4.00 4.00 - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACT................... 25 3 4.00 4.00 - - 0.33 1.00 0.67 0.33 0.67 0.33 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 19 2 3.50 3.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 0.50 - - 0.50 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTCTG........................................................................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGAa............................................................................................................................................................................... 18 a 3.00 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCAt............... 27 t 3.00 5.00 - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TTTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 31 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GTGATGATTCTGCCAAATGAT.................................................................................................................................................................. 21 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CCGTTCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTGT......... 29 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................ACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGA... 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTCTGCC......................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGATTCTGCCAAATGATACAAAGTGATATCAC................................................................................................................................................... 32 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CTTTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TCCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 21 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATACA............................................................................................................................................................... 33 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATACAAA............................................................................................................................................................. 36 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCT..... 30 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATG................................................................................................................................................................................. 16 2 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGA................................................................................................................................................................... 31 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATA................................................................................................................................................................. 33 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCCA........................................................................................................................................................................ 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 20 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTCCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 19 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAtc...................................................................................................................................................................... 27 tc 3.00 50.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GTTCCATTTTATTTCTGAGGTT.................................................................................................................... 22 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAG.. 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCtt............... 29 tt 3.00 280.00 - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCT............................................................................................................................................................................ 20 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTT........... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGAC.................... 26 3 2.67 2.67 - - 1.00 1.00 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACT................... 26 3 2.33 2.33 - - 0.67 0.33 - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GTTCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................CATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGA... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCAa............... 29 a 2.00 66.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTT.................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGAaaa................................................................................................................................................................................ 18 aaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TCTGCCAAATGATACAAAGTGATATCACCTTTAA............................................................................................................................................. 34 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................ATGTGATGATTCTGCCAAATGA................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCT............. 30 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GTGATGTGATGATTCTGCCAA....................................................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGAa.................................................................................................................................................................. 31 a 2.00 54.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTa............................................................................................................................................................................. 20 a 2.00 27.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCca....................................................................................................................................................................... 26 ca 2.00 110.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCt................ 28 t 2.00 280.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGt... 27 t 2.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTactg................... 25 actg 2.00 0.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAGt. 29 t 2.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................CATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCT..... 26 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GATGATTCTGCCAAATGATACAAAGTGATATCA.................................................................................................................................................... 33 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................CAGTGATGTGATGATTCT............................................................................................................................................................................ 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GTTCCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CTTTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AAAGTGATATCACCTTTAAACCGTTCCAT................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................ATGTGATGATTCTGCCAAA...................................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAca...................................................................................................................................................................... 27 ca 2.00 50.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAGt. 28 t 2.00 7.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGA... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTG.......... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCAat.............. 30 at 2.00 66.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGa.......................................................................................................................................................................... 22 a 2.00 19.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGTGATGATTCTGCCAAATGA................................................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTC............................................................................................................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CTTTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................CAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTG.......... 29 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACt.............. 30 t 2.00 242.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATG.................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACC.............. 31 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GGACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTT....... 27 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGTGATGATTCTGCCAAATGATACA............................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TCTGCCAAATGATACAAAGT........................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGA..................... 25 5 1.80 1.80 - - 0.20 - 0.20 - - 0.40 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 17 6 1.33 1.33 - - - - - - 1.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 17 4 1.25 1.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - 0.75 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ATTTTATTTCTGAGGTT.................................................................................................................... 17 9 1.11 1.11 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - 0.22 - - - 0.33 - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................ACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCT............. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGTGATGATTCTGCCAAATGATACAAAGTGA......................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCAact............. 29 act 1.00 5.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGaaga....................................................................................................................................................................... 26 aaga 1.00 108.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTCT............................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................CAGTGATGTGATGATTCTG........................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCccc.............. 28 ccc 1.00 7.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATaa............................................................................................................................................................................. 20 aa 1.00 17.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTG.... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TCCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CTGTGACAAGTGGACATGCAGTGAC.................... 25 3 1.00 1.00 - - - - - - - 0.67 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTtac.................... 27 tac 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAg....................................................................................................................................................................... 25 g 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGA................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CTCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGAC.................... 28 3 1.00 1.00 - - 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGcta................................................................................................................................................................. 32 cta 1.00 13.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CCTGTGACAAGTGGACATGCAGggac.................... 26 ggac 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCT............. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGACTGCACCTTTG.......... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTa............ 30 a 1.00 112.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGACATGCAGTGACTGCAC............... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................AGTGATGTGATGATTCTGCCA........................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGATGTGATGATTCTGCCAAA...................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGACATGCAGTGACTGCA................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GTGGACATGCAGTGACTGCACCT............. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCAac.............. 28 ac 1.00 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................ACCTTTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTaaag.......................................................................................................................................................................... 23 aaag 1.00 27.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GTTCCATTTTATTTCTGAGttta................................................................................................................... 23 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................AGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATA................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GTGATGATTCTGCCAAATGA................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GTGATGTGATGATTCTGCCAAATGAT.................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GTGATGTGATGATTCTG........................................................................................................................................................................... 17 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GGACATGCAGTGACTGCACCTTTGTT........ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCtaa....................................................................................................................................................................... 26 taa 1.00 80.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TCCATTTTATTTCTGAG....................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAc...................................................................................................................................................................... 27 c 1.00 55.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TCTGCCAAATGATACAAAGTGATATC..................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGATGATTCTGCCAAATGATACAAAGTGATAT...................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACT................... 27 3 1.00 1.00 - - 0.33 - 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................ACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTT....... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTt...... 27 t 1.00 14.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATG................................................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGA... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAta...................................................................................................................................................................... 27 ta 1.00 50.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAGGTt 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGACTGCACCTTTGT......... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AACCGTTCCATTTTATTTCTGA........................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TTTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGGCTCCTGTGACAAGTGGACATG........................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ACATGCAGTGACTGCACCTTTGTT........ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGACATGCAGTGACTGCACCTTTtt......... 26 tt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCc............. 29 c 1.00 175.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTT....... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................AGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGAT.................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGAaa................................................................................................................................................................. 32 aa 1.00 54.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGA..................... 23 5 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 0.80 - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTCCATTTTATTTCTGAGGTT.................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CCTTTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................ACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTGT......... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................CAGTGATGTGATGATTCTGCCAAA...................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGt.......................................................................................................................................................................... 23 t 1.00 108.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAGt. 27 t 1.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CGTTCCATTTTATTTCTGAGGTT.................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCa......................................................................................................................................................................... 24 a 1.00 80.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................ATGTGATGATTCTGCCAAATGAT.................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCAt............... 29 t 1.00 66.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GATGTGATGATTCTGCCAAAT..................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAA...................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GTGATGATTCTGCCAAAT..................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................CAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTT............ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGATGTGATGATTCTGCCAAATGATACAAA............................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTC............................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAAT..................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................CCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAA...................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAGGT 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................AGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAGGT 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGA................................................................................................................................................................................ 16 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAA....................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GATGATTCTGCCAAATGA................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CGTTCCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCcaa...................................................................................................................................................................... 27 caa 1.00 110.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................ACCGTTCCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................AGTGACTGCACCTTTGTT........ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAGG. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GCAGTGACTGCACCTTTGTT........ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CCTTTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTT.................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TTTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTt.......... 27 t 1.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................AGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAGGcg 27 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGTGATGATTCTGCCAAAT..................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................CAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGA................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GTGATGTGATGATTCTGC.......................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATACAA.............................................................................................................................................................. 35 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCaa........................................................................................................................................................................ 25 aa 1.00 80.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACt.............. 28 t 1.00 44.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CCATTTTATTTCTGAGGTT.................................................................................................................... 19 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCT..... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GCCAAATGATACAAAGTGATATC..................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGg................. 27 g 1.00 41.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACTGtaaa.............. 28 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GTGATGATTCTGCCAAATGATACAAAGT........................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTCCATTTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGATTCTGaaa........................................................................................................................................................................ 24 aaa 1.00 19.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
............................................................................................................................................................................................................CCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGC................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGAC.................... 24 3 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 -
........................................................TAACCAGTGATGTGATGct............................................................................................................................................................................... 19 ct 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATAta............................................................................................................................................................... 34 ta 1.00 40.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................ATGTGATGATTCTGCCAAAT..................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGATGTGATGATTCTGCCA........................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CTCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCAC............... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GTGATGTGATGATTCTGCCAAATGA................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................ACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTG.......... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GATGATTCTGCCAAATGAT.................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGATGTGATGATTCTGaaa........................................................................................................................................................................ 19 aaa 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AACCAGTGATGTGATGATTCTGat......................................................................................................................................................................... 24 at 1.00 108.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCAac.............. 30 ac 1.00 66.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GTGGACATGCAGTGACTGCACCTTT........... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATG................................................................................................................................................................................. 15 6 0.83 0.83 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 0.17 - - - 0.17 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CTCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGA..................... 27 5 0.80 0.80 - - 0.40 - - - 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CTCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTG...................... 26 5 0.80 0.80 - - - 0.20 0.40 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CCATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 18 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTGACAAGTGGACATGCAGTGAC.................... 23 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTtcac............... 29 tcac 0.67 4.00 - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAG........................ 20 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CTGTGACAAGTGGACATGCAGTGA..................... 24 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGa................. 27 a 0.50 41.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CATTTTATTTCTGAGGTT.................................................................................................................... 18 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGaa................ 28 aa 0.50 41.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGgaa............... 29 gaa 0.50 41.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GTGATGTGATGATTCTGa.......................................................................................................................................................................... 18 a 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGgat............... 29 gat 0.50 41.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGtt................ 28 tt 0.50 41.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTG.................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGATGATTCTGCCAA....................................................................................................................................................................... 15 10 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGaacc.............. 30 aacc 0.50 41.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGtttt.............. 30 tttt 0.50 41.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGttt............... 29 ttt 0.50 41.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGATGTGATGATTCTG........................................................................................................................................................................... 16 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCCTGTGACAAGTGGACATG........................... 20 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTGACAAGTGGACATGCAGTGA..................... 22 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGAatgc................. 27 atgc 0.40 1.00 - - 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGTGATGATTCTGCCA........................................................................................................................................................................ 16 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GGCTCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGAC.................... 30 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTat................. 27 at 0.33 4.00 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CTCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACT................... 29 3 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGAC.................... 22 3 0.33 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGTGACT................... 23 3 0.33 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACa................... 26 a 0.33 1.00 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GGCTCCTGTGACAAGTGGA............................... 19 6 0.33 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTca................. 27 ca 0.33 4.00 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTGACagc................. 27 agc 0.33 1.00 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTTTATTTCTGAGGTT.................................................................................................................... 16 18 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CCTGTGACAAGTGGACATGCAGTG...................... 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGTGACAAGTGGACATGCAGTG...................... 22 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGAtt................... 28 tt 0.20 8.60 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGACAAGTGGACATGCAGT....................... 19 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CTCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGAa.................... 28 a 0.20 0.80 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GTGGACATGCAGTGACT................... 17 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACCAGTGATGTGATGcgtc............................................................................................................................................................................. 19 cgtc 0.17 0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GCTCCTGTGACAAGTGGA............................... 18 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................CACCTTTGTTTCTGAG.. 16 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GTTCCATTTTATTTCTG......................................................................................................................... 17 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CATTTTATTTCTGAGGT..................................................................................................................... 17 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TTTATTTCTGAGGTTA................................................................................................................... 16 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CATTTTATTTCTGAGG...................................................................................................................... 16 19 0.05 0.05 - - - - - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TCTGAATTTCAAAGTAAGTCTGTCACTTGTTTTTGTACAGATTGTAATATAGCTTGTAACCAGTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATACAAAGTGATATCACCTTTAAACCGTTCCATTTTATTTCTGAGGTTACTATACTAACATGTAAAATTTAACTACTCTAAGCCAGAGAAGTAAGTCAGTCTTTGTTTTCTTAGGGCTCCTGTGACAAGTGGACATGCAGTGACTGCACCTTTGTTTCTGAGGT
............................................................(((.((((.((((..((........))......(((....))).............)))).)))).))).........................................................................................................................
..................................................51...............................................................................132....................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
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Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
..............................................................GTGATGTGATGATTCTGCCAAATGATA................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TTAACTACTCTAAGCCAct............................................................................... 19 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -