(5)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(4)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(20)
TESTES

Sense strand
CCCATATACACACAGGCACGCATATATACATAACAACAACAACAACAACAATAGTAACAATAGTAACGGAGGAGGCAAAGAGAGAAACCAGGTGACACAAGGAGAAATGGAGCAGTCAGCACTCTCTGTCTTTTCCCTCCTGCAGCGGAGGCCCCCATCCCACTCTGGGTTAAGCATAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCAATGCGGGCCTGGGTCCACTCAGCTCCTGTCCTCCTGTCTACTG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
............................................................................................TGACACAAGGAGAAATGGAGCAGTCAGC.................................................................................................................................. 28 1 8.00 8.00 - 7.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGACACAAGGAGAAATGGAGCAGTC..................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TGACACAAGGAGAAATGGAGCAGTCA.................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGTAACAATAGTAACGGAGGAGGCAA............................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGTAACAATAGTAACGGAGGAGGCA............................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TAGTAACGGAGGAGGCAAAGAGAGAA.................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TAGTAACGGAGGAGGCAAAGAGAGA..................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TAGTAACGGAGGAGGCAAAGAGAG...................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................AGTAACGGAGGAGactg............................................................................................................................................................................ 17 actg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................................TGACACAAGGAGAAATGGAGCAGT...................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GCCCTTCAGGAAACCAATGCGGGCCTG................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
............................................................................................TGACACAAGGAGAAATGGAGCAGTCAG................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CACTCTGGGTTAAGCATAGCAAGTa................................................................. 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...........................................AACAACAATAGTAACAATAGTAACGGA.................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTGACACAAGGAGAAATGGAGCAGTC..................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................TATACATAACAACAACAACAAC............................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
............................................................................................TGACACAAGGAGAAATGGAGCAGTCAa................................................................................................................................... 27 a 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.............................................................................................GACACAAGGAGAAATGGAGCAGTCAGC.................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CCCATATACACACAGGCACGCATATATACATAACAACAACAACAACAACAATAGTAACAATAGTAACGGAGGAGGCAAAGAGAGAAACCAGGTGACACAAGGAGAAATGGAGCAGTCAGCACTCTCTGTCTTTTCCCTCCTGCAGCGGAGGCCCCCATCCCACTCTGGGTTAAGCATAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCAATGCGGGCCTGGGTCCACTCAGCTCCTGTCCTCCTGTCTACTG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.......................................................................................................................................................................................TCCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCAA.......................................... 25 1 8.00 8.00 - 7.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....TATACACACAGGCACGCATATATACATA.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................CCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCAA.......................................... 24 1 5.00 5.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCAGGA................................................ 26 1 4.00 4.00 - - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CCACTCAGCTCCTGTCCTCCTGTCTAC.. 27 1 4.00 4.00 - - - - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................AGTCCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCA........................................... 26 1 4.00 4.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.............AGGCACGCATATATACATAACAACAAC.................................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................CAACAACAATAGTAACAATAGTAACGGA.................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................AGTCCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCAA.......................................... 27 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............AGGCACGCATATATACATAACAACAACA................................................................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TATACACACAGGCACGCATATATACA............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CCCATCCCACTCTGGGTTAAGCATAGCA..................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GCACGCATATATACATAACAACAACA................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
......TACACACAGGCACGCATATATACATAAC........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TCAGCACTCTCTGTCTTTTCCCTCCT............................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TAAGCATAGCAAGTCCT............................................................... 17 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - -
.CCATATACACACAGGCACGCATATA................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - -
............................CATAACAACAACAACAACAACAATAGTA.................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................GTCCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCAA.......................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....TATACACACAGGCACGCATATATACATAAC........................................................................................................................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................AAGCATAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCA................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................AGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCAGGA................................................ 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................AAGTCCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCA........................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GCCTGGGTCCACTCAGCTCCTGTCCT........... 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AACAACAACAACAATAGTAACAATAGTA......................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............CGCATATATACATAACAACAACggcc.................................................................................................................................................................................................................. 26 ggcc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AACAACAACAATAGTAACAATAGTAACGGA.................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................ACTCTGGGTTAAGCATAGCAAGTCCTC.............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................AACAACAATAGTAACAATAGTAACGGA.................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........ACAGGCACGCATATATACATAACAACAaa.................................................................................................................................................................................................................... 29 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GCACGCATATATACATAACAACAACAAC............................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........ACAGGCACGCATATATACATAACAACAACA................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...........AGGCACGCATATATACATAACAACAtt.................................................................................................................................................................................................................... 27 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CCACTCAGCTCCTGTCCTCCTGTCTA... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................CAAGTCCTCTCTGCCCTTCAGGAAAC............................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ATAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCAGGA................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................AGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCAGGAAAC............................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GCATAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCAa................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............CAGGCACGCATATATACATAACAACAAC.................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ACACACAGGCACGCATATATACATAACAA...................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CACACAGGCACGCATATATACATAACA....................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................CCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCAAT......................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TCCACTCAGCTCCTGTCCTCCTGTC..... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCAGGAA............................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................CATAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCA................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................GCAAGTCCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCA........................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TACATAACAACAACAACAaa.............................................................................................................................................................................................................. 20 aa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................AGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCActgc................................................... 26 ctgc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........ACAGGCACGCATATATACATAACAAC..................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
............CAGGCACGCATATATACATAACAACAA................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TCAGCTCCTGTCCTCCTGTCTAC.. 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................ATAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCAc................................................... 25 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GCATAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCA................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CCCCCATCCCACTCTGGGTTAAGCATAGCa...................................................................... 30 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AGGCCCCCATCCCACTCTGGGTTAAGCAa.......................................................................... 29 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TACACACAGGCACGCATATATACATAACAaa....................................................................................................................................................................................................................... 31 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................GCGGAGGCCCCCATCCCACTCTGGGTTAA............................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TAAGCATAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCA................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGCCTGGGTCCACTCAGCTCCTGa............... 24 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................AGTCCTCTCTGCCCTTCAGGAAACC............................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................AACAACAATAGTAACAATAGTAACGGAt.................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CGCATATATACATAACAACAACAA................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCAGGAAAC............................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................GTCCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCA........................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........ACAGGCACGCATATATACATAACAACAAC.................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TCCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCA........................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TCCTCTCTGCCCTTCAGGAAACCAAg.......................................... 26 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................ACGCATATATACATAACAACAACAACA.............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.................................CAACAACAACAACAACAATAGTAACAAT............................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....ATACACACAGGCACGCATATATACATA.......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ATAGCAAGTCCTCTCTGCCCTTCAGGAA............................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TATACACACAGGCACGCATATATACATAa.......................................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GTCCACTCAGCTCCTGTCCTCCTGTCTA... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
................CACGCATATATACATAACAACAACAA................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CTCTGCCCTTCAGGAAACCAAcgcc.......................................... 25 cgcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
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