(1)
OTHER.ip
(10)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(8)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(43)
TESTES

Sense strand
GAGACAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAATGGAGGTCCAGAAAGGGTTAAGGACTTCTTAGGGTCACATGATCTGTAAGTGACAAGGCTTGGTCAAGAACCAGAGTCTCCTCCCCACCTGTGGGAGGCTCTGTGGAGGAGAGAGGTGTGGTGCTGGGCAGTCGCCGCCCGGTCTCTAGGA
....................................................((.(((((....((.(((((.............))))).))......))))).))...............................................................................................................................................
..................................................51.............................................................114......................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatt............................................................................................................................................................................................................ 26 att 75.00 0.00 6.00 3.00 4.00 31.00 8.00 5.00 2.00 1.00 5.00 - 5.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaaaa........................................................................................................................................................................................................... 27 aaaa 36.00 0.00 2.00 5.00 2.00 10.00 3.00 4.00 - - 5.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaat............................................................................................................................................................................................................ 26 aat 28.00 0.00 2.00 - - 13.00 1.00 2.00 2.00 1.00 - - - 2.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttt................................................................................................................................................................................. 29 ttt 21.00 0.00 2.00 1.00 5.00 - 6.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTagt............................................................................................................................................................................................................ 26 agt 16.00 0.00 2.00 1.00 - - - 6.00 - - 4.00 - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGttt....................................................................................................................................................................... 24 ttt 12.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 8.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..............................................................................................................................................................................................TGGGAGGCTCTGTGGAGGAGAGAGGT.................................. 26 1 11.00 11.00 2.00 4.00 - - - 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGGGAGGCTCTGTGGAGGAGAGAGG................................... 25 1 11.00 11.00 1.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................TGAGTTCGAGGCCAGCCgctc............................................................................................................................................................................................................... 21 gctc 11.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 5.00 - 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtta................................................................................................................................................................................. 29 tta 10.00 0.00 3.00 - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatta........................................................................................................................................................................................................... 27 atta 10.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00 2.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTattt........................................................................................................................................................................................................... 27 attt 9.00 0.00 1.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaaaa........................................................................................................................................................................................................... 29 aaaa 8.00 0.00 - 1.00 4.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatt............................................................................................................................................................................................................ 28 att 7.00 0.00 - - 1.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt....................................................................................................................................................................... 26 ttt 6.00 0.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttt................................................................................................................................................................................. 28 ttt 6.00 0.00 2.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt...................................................................................................................................................................... 25 tttt 6.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGAAAATGGAGGTCCAGAAAGGGTTA................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaaga........................................................................................................................................................................................................... 27 aaga 5.00 0.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTagaa........................................................................................................................................................................................................... 32 agaa 4.00 0.00 - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGGGAGGCTCTGTGGAGGAGAGAGGTG................................. 27 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTagt............................................................................................................................................................................................................ 28 agt 4.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtttt................................................................................................................................................................................ 30 tttt 3.00 0.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCggaa................................................................................................................................................................................................................ 28 ggaa 3.00 0.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaat............................................................................................................................................................................................................ 27 aat 3.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CAGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt...................................................................................................................................................................... 26 tttt 3.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatt............................................................................................................................................................................................................ 27 att 3.00 0.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TCTGTAAGTGACAAGGCTTGGTCAAG................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttc....................................................................................................................................................................... 26 ttc 3.00 0.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................CAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttt................................................................................................................................................................................. 27 ttt 3.00 0.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaata........................................................................................................................................................................................................... 27 aata 3.00 0.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CATGATCTGTAAGTGACAAGGCTTGGTC...................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaat............................................................................................................................................................................................................ 28 aat 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTagaa........................................................................................................................................................... 36 agaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGATCTGTAAGTGACAAGGCTTGGTC...................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttta...................................................................................................................................................................... 27 ttta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TCACATGATCTGTAAGTGACAAGGCTT.......................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAttt........................................................................................................................................................................ 25 ttt 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTAAGTGACAAGGCTTGGTCAAGAA................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt....................................................................................................................................................................... 28 ttt 2.00 0.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTAAGTGACAAGGCTTGGTCAAGAAC................................................................................ 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtaat................................................................................................................................................................................ 30 taat 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGATCTGTAAGTGACAAGGCTTGGTCA..................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatta........................................................................................................................................................................................................... 29 atta 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt...................................................................................................................................................................... 27 tttt 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TCTGTGGAGGAGAGAGGTGTGGTGCT.......................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAtaa...................................................................................................................................................................................................... 30 taa 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGtgta......................................................................................................................................................................................... 21 tgta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACccag...................................................................................................................................................................................... 24 ccag 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatga........................................................................................................................................................................................................... 27 atga 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAtttt....................................................................................................................................................................... 26 tttt 2.00 0.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCatt................................................................................................................................................................................................................. 27 att 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtaga................................................................................................................................................................................ 26 taga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtta................................................................................................................................................................................. 28 tta 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcatt............................................................................................................................................................................................................ 26 catt 2.00 0.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCgta................................................................................................................................................................................................................. 28 gta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaatt........................................................................................................................................................................................................... 29 aatt 2.00 0.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCgaaa............................................................................................................................................................................................................... 28 gaaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................CAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgagc................................................................................................................................................................................... 25 gagc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAtaaa..................................................................................................................................................................................................... 33 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCTGTGGAGGAGAGAGGT.................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCTGTGGAGGAGAGAGta.................................. 28 ta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GATCTGTAAGTGACAAGGCTTGGTCAA.................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAttta..................................................................................................................................................................................................... 31 ttta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtaaa................................................................................................................................................................................ 30 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................ATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatt............................................................................................................................................................................................................ 29 att 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCga.................................................................................................................................................................................................................. 25 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCggta.......................................................................................................................................................................................................... 28 ggta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgtta.......................................................................................................................................................................................................... 27 gtta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt....................................................................................................................................................................... 29 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtatt...................................................................................................................................................................... 27 tatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAtaaa..................................................................................................................................................................................................... 31 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TATACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAATGGAt.................................................................................................................................................. 31 t 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGttt..................................................................................................................................................................... 26 ttt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgaag.......................................................................................................................................................................................................... 26 gaag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................ATGATCTGTAAGTGACAAGGCTTGG........................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt....................................................................................................................................................................... 25 ttt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCga................................................................................................................................................................................................................. 26 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACAGCCAGGGCTATACAGAGttat.................................................................................................................................................................... 24 ttat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................AAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtta................................................................................................................................................................................. 26 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGGGAGGCTCTGTGGAGGAGAGAGt................................... 25 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AGTGACAAGGCTTGGTCAAGAACCAG............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgact.......................................................................................................................................................................................................... 27 gact 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................ATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaat............................................................................................................................................................................................................ 29 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCggcg.......................................................................................................................................................................................................... 26 ggcg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtttt................................................................................................................................................................................ 31 tttt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACcggg...................................................................................................................................................................................... 24 cggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................................................................................................................TAAGGACTTCTTAGGGTCACATGATCTG......................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCgcg................................................................................................................................................................................................................ 24 gcg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAATGG.................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGcgt......................................................................................................................................................................................................................... 25 cgt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcaat............................................................................................................................................................................................................ 26 caat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtta....................................................................................................................................................................... 29 tta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGtca..................................................................................................................................................................... 28 tca 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGtag....................................................................................................................................................................... 24 tag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TCTGTAAGTGACAAGGCTTGGTCAAGA.................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtaat...................................................................................................................................................................... 28 taat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCTGTGGAGGAGAGAGa................................... 27 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttta................................................................................................................................................................................ 30 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCctt................................................................................................................................................................................... 28 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGATCTGTAAGTGACAAGGCTTGGTCAA.................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGtgct......................................................................................................................................................................................... 21 tgct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGAAAATGGAGGTCCAGAAAGGGTT.................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCac................................................................................................................................................................ 34 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TATACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAATGGA................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgcg........................................................................................................................................................................................................... 26 gcg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGATCTGTAAGTGACAAGGCTTGGcc...................................................................................... 26 cc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt....................................................................................................................................................................... 32 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................AAGGACTTCTTAGGGTCACATGATCTG......................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTgttt........................................................................................................................................................................................................... 27 gttt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttg................................................................................................................................................................................. 29 ttg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaatt........................................................................................................................................................................................................... 28 aatt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TGTGGAGGAGAGAGGTGTGGTGCTG......................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TGTGGAGGAGAGAGGTGTGGTGCTa......................... 25 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTgata........................................................................................................................................................................................................... 27 gata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCatt................................................................................................................................................................................................................. 28 att 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCcgt................................................................................................................................................................................... 28 cgt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGtttt.................................................................................................................................................................... 30 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgata................................................................................................................................................................................... 27 gata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaaaa........................................................................................................................................................................................................... 31 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCatgt................................................................................................................................................................................................................ 28 atgt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGtata.................................................................................................................................................................... 28 tata 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAtaga..................................................................................................................................................................................................... 33 taga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGtttc......................................................................................................................................................................................... 21 tttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGGGAGGCTCTGTGGAGGAGAGAGGTa................................. 27 a 1.00 11.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGcgt....................................................................................................................................................................... 29 cgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtaaa................................................................................................................................................................................ 29 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtatt................................................................................................................................................................................ 30 tatt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACAGCCAGGGCTATACAGAGttt..................................................................................................................................................................... 23 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCaata................................................................................................................................................................................................................ 29 aata 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTattt........................................................................................................................................................................................................... 32 attt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GGATTTCTGAGTTCGAGGCgat..................................................................................................................................................................................................................... 22 gat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCgtc................................................................................................................................................................................................................ 24 gtc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcatt............................................................................................................................................................................................................ 24 catt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGctt....................................................................................................................................................................... 24 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGccgc............................................................................................................................................................................................................ 25 ccgc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGtgta.................................................................................................................................................................... 27 tgta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGctaa............................................................................................................................................................................................................ 24 ctaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAtttt....................................................................................................................................................................... 28 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgaaa................................................................................................................................................................................... 27 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGCgt...................................................................................................................................................................................................................... 25 gt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAttt........................................................................................................................................................................ 27 ttt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgttt.......................................................................................................................................................................................................... 28 gttt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCaatt................................................................................................................................................................................................................ 28 aatt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACcaga...................................................................................................................................................................................... 24 caga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCTGTGGAGGAG........................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTact............................................................................................................................................................................................................ 27 act 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGggt.................................................................................................................................................................................................... 32 ggt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAGGGTCACATGATCTGTAAGTGACA................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtcc................................................................................................................................................................................. 28 tcc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaaaa........................................................................................................................................................................................................... 32 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAtagt....................................................................................................................................................................... 28 tagt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................CAGCCAGGGCTATACAGAcca...................................................................................................................................................................... 21 cca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGccat............................................................................................................................................................................................................ 31 ccat 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgat.................................................................................................................................................................................... 26 gat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcaca............................................................................................................................................................................................................ 26 caca 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGAGTTCGAGGCCAGCCggta............................................................................................................................................................................................................... 23 ggta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGttat.................................................................................................................................................................... 27 ttat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcgc............................................................................................................................................................................................................. 27 cgc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TCTTGAAAATGGAGGTCCAGAAAGG....................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GAGACAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAATGGAGGTCCAGAAAGGGTTAAGGACTTCTTAGGGTCACATGATCTGTAAGTGACAAGGCTTGGTCAAGAACCAGAGTCTCCTCCCCACCTGTGGGAGGCTCTGTGGAGGAGAGAGGTGTGGTGCTGGGCAGTCGCCGCCCGGTCTCTAGGA
....................................................((.(((((....((.(((((.............))))).))......))))).))...............................................................................................................................................
..................................................51.............................................................114......................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcgt.................................................................................................................................................................................................... 27 gcgt 148.00 0.00 59.00 43.00 1.00 - - 1.00 21.00 19.00 - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGaaa............................................................................................................................................................................................................................ 26 aaa 16.00 0.00 1.00 1.00 4.00 2.00 - - - 1.00 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGata............................................................................................................................................................................................................................ 26 ata 15.00 0.00 - 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 3.00 - 2.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtt.................................................................................................................................................................................................... 26 gtt 12.00 0.00 5.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgta.................................................................................................................................................................................................... 26 gta 11.00 0.00 3.00 5.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgcgt................................................................................................................................................................................................... 28 gcgt 11.00 0.00 4.00 6.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGaaaa............................................................................................................................................................................................................................ 27 aaaa 10.00 0.00 2.00 2.00 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcat.................................................................................................................................................................................................... 27 gcat 9.00 0.00 4.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGattt.......................................................................................................................................................................................................................... 29 attt 8.00 0.00 - 2.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGaaat............................................................................................................................................................................................................................ 27 aaat 8.00 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGaaa.......................................................................................................................................................................................................................... 28 aaa 8.00 0.00 3.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcta.................................................................................................................................................................................................... 27 gcta 7.00 0.00 3.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGatt.......................................................................................................................................................................................................................... 28 att 7.00 0.00 1.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgcgt..................................................................................................................................................................................................... 26 gcgt 7.00 0.00 1.00 2.00 - - - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CAGGCGGATTTCTGAGTTCGAaaa........................................................................................................................................................................................................................... 24 aaa 6.00 0.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAaaa........................................................................................................................................................................................................................... 27 aaa 6.00 0.00 - - - - - - - - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGatt............................................................................................................................................................................................................................ 26 att 6.00 0.00 - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GACAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCa............................................................................................................................................................................................................................. 28 a 5.00 0.00 - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGattt............................................................................................................................................................................................................................ 27 attt 5.00 0.00 - 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtaa.................................................................................................................................................................................................... 27 gtaa 5.00 0.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGgaa.......................................................................................................................................................................... 28 gaa 4.00 0.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcgg.................................................................................................................................................................................................... 27 gcgg 4.00 0.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGaaaa.......................................................................................................................................................................................................................... 29 aaaa 4.00 0.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGtat.......................................................................................................................................................................................................................... 30 tat 4.00 0.00 - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.........................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGActa.................................................................................................................................................................................................... 29 cta 4.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAata........................................................................................................................................................................................................................... 27 ata 3.00 0.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGata.......................................................................................................................................................................................................................... 28 ata 3.00 0.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGActaa.................................................................................................................................................................................................... 30 ctaa 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGaga............................................................................................................................................................................................................................ 26 aga 3.00 0.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGataa............................................................................................................................................................................................................................ 27 ataa 3.00 0.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGgga................................................................................................................................................................................................................. 31 gga 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAaaga........................................................................................................................................................................................................................... 28 aaga 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgtta..................................................................................................................................................................................................... 26 gtta 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAgatt........................................................................................................................................................................... 28 gatt 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGaga.......................................................................................................................................................................................................................... 28 aga 2.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
CAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAaaaa........................................................................................................................................................................................................................... 31 aaaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTgcta...................................................................................................................................................................................................... 25 gcta 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CAGGCGGATTTCTGAGTTCGAaaaa........................................................................................................................................................................................................................... 25 aaaa 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTAaaaa............................................................................................................................................................................................................ 36 aaaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGtatt.......................................................................................................................................................................................................................... 31 tatt 2.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.........................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcga.................................................................................................................................................................................................... 29 cga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAaat...................................................................................................................................................................................................................... 30 aat 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAaga........................................................................................................................................................................................................................... 27 aga 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGagga............................................................................................................................................................................................................................ 27 agga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtta.................................................................................................................................................................................................... 27 gtta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGgtca.......................................................................................................................................................................................................................... 27 gtca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTgcgg...................................................................................................................................................................................................... 25 gcgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtta.................................................................................................................................................................................................... 26 gtta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTgcgt.................................................................................................................................................................................................. 29 gcgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
GACAGAGGCAGGCGGATTTCTGaa.................................................................................................................................................................................................................................. 24 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGaca............................................................................................................................................................................................................................ 26 aca 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgcgg..................................................................................................................................................................................................... 26 gcgg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgagt.................................................................................................................................................................................................... 27 gagt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAaaaa........................................................................................................................................................................................................................... 28 aaaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.CAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGaag............................................................................................................................................................................................................................ 29 aag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................GGACAGCCAGGGCTATACAGgggt.......................................................................................................................................................................... 24 gggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgtta................................................................................................................................................................................................... 27 gtta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTata.............................................................................................................................................................................................................................. 24 ata 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGaata............................................................................................................................................................................................................................ 27 aata 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgat.................................................................................................................................................................................................... 25 gat 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AGACAGAGGCAGGCGGATTTCTGaa.................................................................................................................................................................................................................................. 25 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................GGACAGCCAGGGCTATACAGAGAgggg....................................................................................................................................................................... 27 gggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
ACAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGaaa............................................................................................................................................................................................................................ 30 aaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGac..................................................................................................................................................................................................... 31 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgga.................................................................................................................................................................................................... 30 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................GGCTATACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAaaa........................................................................................................................................................ 31 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAga...................................................................................................................................................................................................................... 29 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAgtaa.............................................................................................................................................................................................. 32 gtaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
CAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGatat............................................................................................................................................................................................................................ 30 atat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.CAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGata............................................................................................................................................................................................................................ 29 ata 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCaaat............................................................................................................................................................................................................................. 26 aaat 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGgact.......................................................................................................................................................................................................................... 27 gact 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgat.................................................................................................................................................................................................... 30 gat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AGACAGAGGCAGGCGGATTTCTGAaa................................................................................................................................................................................................................................. 26 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGatta.......................................................................................................................................................................................................................... 29 atta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcatt.................................................................................................................................................................................................... 30 catt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGacta............................................................................................................................................................................................................................ 27 acta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgccg................................................................................................................................................................................................... 28 gccg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgga..................................................................................................................................................................................................... 25 gga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AGACAGAGGCAGGCGGATTTCTat................................................................................................................................................................................................................................... 24 at 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgttt.................................................................................................................................................................................................... 27 gttt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGcttt..................................................................................................................................................................................................... 29 cttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgtt................................................................................................................................................................................................... 27 gtt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAact........................................................................................................................................................................................................................... 27 act 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAagc........................................................................................................................................................................................................................... 27 agc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTgtgt.................................................................................................................................................................................................. 29 gtgt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgga.................................................................................................................................................................................................... 26 gga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgctt..................................................................................................................................................................................................... 26 gctt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcag.................................................................................................................................................................................................... 27 gcag 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCaaaa............................................................................................................................................................................................................................. 26 aaaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgggg.................................................................................................................................................................................................... 31 gggg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGcga....................................................................................................................................................................................................... 26 cga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgg................................................................................................................................................................................................... 30 gg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcat.................................................................................................................................................................................................... 29 cat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AGACAGAGGCAGGCGGATTTCTGaatt.................................................................................................................................................................................................................................. 27 aatt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
ACAGAGGCAGGCGGATTTCTGAaaa................................................................................................................................................................................................................................. 25 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTaaa.............................................................................................................................................................................................................................. 24 aaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAggc.................................................................................................................................................................................................... 26 ggc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAtat........................................................................................................................................................................................................................... 29 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtcta.......................................................................................................................................................................... 28 tcta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcagt.................................................................................................................................................................................................... 30 cagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.CAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGacc............................................................................................................................................................................................................................ 29 acc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgcta..................................................................................................................................................................................................... 26 gcta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
ACAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGtta.......................................................................................................................................................................................................................... 32 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGgaaa.......................................................................................................................................................................... 29 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGgaa......................................................................................................................................................................................................................... 28 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGatat............................................................................................................................................................................................................................ 27 atat 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtaa.................................................................................................................................................................................................... 26 gtaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAatt........................................................................................................................................................................................................................... 27 att 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAgg.............................................................................................................................................................................................. 30 gg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAgtt.............................................................................................................................................................................................. 32 gtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
......CAGGCGGATTTCTGAGTTCGacta............................................................................................................................................................................................................................ 24 acta 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGaata.......................................................................................................................................................................................................................... 29 aata 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
GACAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTatt.............................................................................................................................................................................................................................. 29 att 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAcga......................................................................................................................................................................................................... 24 cga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GGCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAgttt...................................................................................................................................................................................................................... 28 gttt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
ACAGAGGCAGGCGGATTTCTGAgaaa................................................................................................................................................................................................................................. 26 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAAgca..................................................................................................................................................................... 28 gca 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................GGACAGCCAGGGCTATACAGgaac.......................................................................................................................................................................... 24 gaac 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgat.................................................................................................................................................................................................... 26 gat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGagaa.......................................................................................................................................................................................................................... 29 agaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgaaa.................................................................................................................................................................................................... 26 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAAgaa..................................................................................................................................................................... 28 gaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTgtt...................................................................................................................................................................................................... 24 gtt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgaat.................................................................................................................................................................................................... 27 gaat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGgtt.......................................................................................................................................................................................................................... 26 gtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGttg.......................................................................................................................................................................................................................... 30 ttg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AGACAGAGGCAGGCGGATTTat..................................................................................................................................................................................................................................... 22 at 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgctt.................................................................................................................................................................................................... 27 gctt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgta................................................................................................................................................................................................... 27 gta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcaa.................................................................................................................................................................................................... 26 gcaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATAgaa............................................................................................................................................................................. 25 gaa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtgg.................................................................................................................................................................................................... 27 gtgg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AGACAGAGGCAGGCGGATTTCTGaaa.................................................................................................................................................................................................................................. 26 aaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcaaa.................................................................................................................................................................................................... 30 caaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGattt.......................................................................................................................................................................................................................... 26 attt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGatta............................................................................................................................................................................................................................ 27 atta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAgtta.............................................................................................................................................................................................. 32 gtta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
........................CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcata.................................................................................................................................................................................................... 30 cata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -