| Gene: AK144617 | ID: uc007cfx.1_intron_0_0_chr1_100486235_f.5p | SPECIES: mm9 | 
![]()  | 
    
    ![]()  | 
  
| 
  (1)  OTHER.ip  | 
  
  
  (6)  OTHER.mut  | 
  
  
  (1)  OVARY  | 
  
  
  (10)  PIWI.ip  | 
  
  
  (3)  PIWI.mut  | 
  
  
  (1)  TDRD1.ip  | 
  
  
  (36)  TESTES  | 
  
  
| AAGAGGTTCAGAACTTTCTGCAATCAGGGTCTGTCAACAGGATGAGTACGGTAAGTAACTCACTATCCCAGGATTGGGATTAGGCTCTCAGTAAAGAGACAATAAGGCTCTCGGTAAAGAAACAAATAGGCTCTCCGGCTCTGGAGACAATAAAGGCTCTCTCTGGCTCAGGAGATGAGAAAGTGAAAGTAAGAGGGTAGTGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTATGGGTTACTTTCTTTTTCTA .........................................................................................................((((....((......)).....))))((((((((..(((((..........)))))..))))..))))............................................................................ .................................................................................................98...............................................................................179.....................................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)  | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)  | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..................TGCAATCAGGGTCTGTCAACAGGATG.............................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 11.00 | 11.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 3.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................TGCAATCAGGGTCTGTCAACAGGAT............................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................TAAGGCTCTCGGTAAAGAAACAAATAGGC....................................................................................................................... | 29 | 1 | 6.00 | 6.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAG........................ | 26 | 15 | 4.20 | 4.20 | 1.13 | 1.47 | - | 1.33 | - | - | - | 0.07 | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAt........................ | 26 | t | 4.00 | 0.00 | - | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................TAAAGAAACAAATAGGCTCTCCGGCTC............................................................................................................. | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGT....................... | 27 | 15 | 3.00 | 3.00 | 0.87 | 1.00 | - | 0.80 | - | 0.07 | - | 0.07 | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | 0.07 | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................................AATAGGGACAGTCggg................... | 16 | ggg | 3.00 | 0.00 | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTC...................... | 28 | 14 | 2.79 | 2.79 | 0.93 | 1.00 | - | 0.86 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................TAAGGCTCTCGGTAAAGAAACAAATAGG........................................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................TCTCGGTAAAGAAACAAATAGGCTCTCCGG................................................................................................................ | 30 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................GGCTCTCGGTAAAGAAACAAATAGGCT...................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................GGCTCTCGGTAAAGAAACAAATAGGCTC..................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................TAAGGCTCTCGGTAAAGAAACAAATA.......................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................TCTGCAATCAGGGTCTGTCAACAGGATG.............................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................TGGGATTAGGCTCTCAGTAAAGAGACA..................................................................................................................................................... | 27 | 13 | 1.54 | 1.54 | 0.38 | 0.38 | - | 0.54 | - | - | - | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCT..................... | 29 | 14 | 1.50 | 1.50 | 1.07 | 0.14 | - | 0.21 | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................TAAAGGCTCTCTCTGGCTCAGGAGA........................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................CGGTAAGTAACTCACTATCCCAGGATTG.............................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................TGCAATCAGGGTCTGTCAACAGGATGAG............................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACtgtc...................... | 28 | tgtc | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................TCTGCAATCAGGGTCTGTCAACAGGA................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................CTCAGGAGATGAGAAAGTGAAAGTAAG......................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................TAAAGGCTCTCTCTGGCTCAGGAG............................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................TGCAATCAGGGTCTGTCAACAGGATGAGT........................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................GCTCTCGGTAAAGAAACAAATAGGC....................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................TCTGGAGACAATAAAGGCTCTCTCTGGCT.................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................AGGCTCTCGGTAAAGAAACAAATAGGCTC..................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................TGCAATCAGGGTCTGTCAACAGGATGA............................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................TCTGCAATCAGGGTCTGTCAACAGGAT............................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................................ATAGGGACAGTCgtgg.................. | 16 | gtgg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................AGGATGAGTACGGTAAGTAACTtaca.......................................................................................................................................................................................... | 26 | taca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................GACAATAAGGCTCTCGGTAAAGAAAC............................................................................................................................... | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..GAGGTTCAGAACTTTCTGCAATCAGGG............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..GAGGTTCAGAACTTTCTGCAATCAGGGT............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................AAGGCTCTCGGTAAAGAAACAAATAGGC....................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................................................TAATAGGGACAGTCgggg.................. | 18 | gggg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................TCTGCAATCAGGGTCTGTCAACAG.................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................................AATAGGGACAGTCgggg.................. | 17 | gggg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........GAACTTTCTGCAATCAGGGTCTGTCAAC.................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGATAATAGGGACAGTCTATGt................. | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................GTGAAAGTAAGAGGGTAGTGAAAGa........................................... | 25 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................TGTCAACAGGATGAGTACGGTAAGT.................................................................................................................................................................................................. | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................TGCAATCAGGGTCTGTCAACAGGA................................................................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................AAGAGACAATAAGGCTCTCGGTAAAaaa................................................................................................................................. | 28 | aaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................TGGCTCAGGAGATGAGAAAGTGAAAG............................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................AATAAAGGCTCTCTCTGGCTCAGGAG............................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................AGACAATAAGGCTCTCGGTAAAGAgat............................................................................................................................... | 27 | gat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................TCGGTAAAGAAACAAATAGGCTCTCCGGC............................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................TAAGGCTCTCGGTAAAGAAACAAATAGGCT...................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................................AATAGGGACAGTCTgggg................. | 18 | gggg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................TAACTCACTATCCCAGGATTGGGATTAGGCT.................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGGTAGTGAAAGTAAGt....................................... | 28 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTA.................... | 27 | 14 | 0.86 | 0.86 | 0.43 | 0.07 | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................TAGGGACAGTCTATGGGTTACTTTCT....... | 26 | 17 | 0.65 | 0.65 | 0.29 | 0.18 | - | 0.06 | 0.06 | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTAT................... | 28 | 14 | 0.57 | 0.57 | 0.36 | 0.07 | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................TGGGATTAGGCTCTCAGTAAAGAGACAA.................................................................................................................................................... | 28 | 11 | 0.55 | 0.55 | 0.09 | 0.18 | - | 0.09 | - | - | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................GAGACAATAAGGCTCTCGGTAAAGAAAC............................................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................TCTGTCAACAGGATGAGTACGGTAAG................................................................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......TTCAGAACTTTCTGCAATCAGGG............................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................AGACAATAAGGCTCTCGGTAAAGAAAC............................................................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................GACAATAAGGCTCTCGGTAAAGAAACA.............................................................................................................................. | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......TTCAGAACTTTCTGCAATCAGGGT............................................................................................................................................................................................................................ | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................AGGATTGGGATTAGGCTCTCAGTAAAGAGAC...................................................................................................................................................... | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................TAGGGACAGTCTATGGGTTACTTTCTT...... | 27 | 17 | 0.47 | 0.47 | 0.35 | 0.06 | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGATAATAGGGACAGTCTATGG................. | 27 | 13 | 0.38 | 0.38 | 0.31 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................TGGGATTAGGCTCTCAGTAAAGAGACAAT................................................................................................................................................... | 29 | 11 | 0.36 | 0.36 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTC...................... | 25 | 14 | 0.36 | 0.36 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................................................TAATAGGGACAGTCTATGGGTTACTTTC........ | 28 | 17 | 0.35 | 0.35 | 0.06 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | 
| ..........................................................................................................................CAAATAGGCTCTCCGGCTCTGGAGACA..................................................................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................TGAGAAAGTGAAAGTAAGAGGGTAGT................................................. | 26 | 13 | 0.31 | 0.31 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................TTAGGCTCTCAGTAAAGAGACAATAAGGC.............................................................................................................................................. | 29 | 13 | 0.31 | 0.31 | - | - | 0.15 | - | - | - | 0.08 | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................TAGGGACAGTCTATGGGTTACTTTC........ | 25 | 17 | 0.29 | 0.29 | 0.06 | - | - | 0.06 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................................................TAATAGGGACAGTCTATGGGTTACTTTCT....... | 29 | 17 | 0.29 | 0.29 | 0.18 | - | - | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................TAGGGACAGTCTATGGGTTACTTTCTTT..... | 28 | 17 | 0.29 | 0.29 | 0.12 | 0.12 | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................AAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTA.................... | 28 | 14 | 0.29 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTA.................... | 30 | 14 | 0.29 | 0.29 | 0.21 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGATAATAGGGACAGTCTATGGt................ | 28 | t | 0.23 | 0.38 | 0.15 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................GAGGATAATAGGGACAGTCTATGGGTT.............. | 27 | 13 | 0.23 | 0.23 | 0.15 | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................................................AGAGGATAATAGGGACAGTCTATGG................. | 25 | 13 | 0.23 | 0.23 | 0.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGATAATAGGGACAGTCTATGGGT............... | 29 | 13 | 0.23 | 0.23 | 0.23 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................................................AGAGGATAATAGGGACAGTCTATGGGTTA............. | 29 | 13 | 0.23 | 0.23 | 0.23 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGATAATAGGGACAGTCTAT................... | 25 | 14 | 0.21 | 0.21 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................TAGGGACAGTCTATGGGTTACTTTCTTTT.... | 29 | 17 | 0.18 | 0.18 | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................TTGGGATTAGGCTCTCAGTAAAGAGACA..................................................................................................................................................... | 28 | 12 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................TTGGGATTAGGCTCTCAGTAAAGAGAC...................................................................................................................................................... | 27 | 12 | 0.17 | 0.17 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................................................AGAGGATAATAGGGACAGTCTATGGG................ | 26 | 13 | 0.15 | 0.15 | 0.08 | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................TGGGATTAGGCTCTCAGTAAAGAGAC...................................................................................................................................................... | 26 | 13 | 0.15 | 0.15 | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................................................AGAGGATAATAGGGACAGTCTATGGGTT.............. | 28 | 13 | 0.15 | 0.15 | 0.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................................................AGAGGATAATAGGGACAGTCTATGGGT............... | 27 | 13 | 0.15 | 0.15 | 0.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................AGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTA.................... | 26 | 14 | 0.14 | 0.14 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................GAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTA.................... | 29 | 14 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTATG.................. | 29 | 14 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTt...................... | 28 | t | 0.13 | 3.00 | - | 0.07 | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................GAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGT....................... | 26 | 15 | 0.13 | 0.13 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................................................TAATAGGGACAGTCTATGGGTTACTTT......... | 27 | 18 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................AAGAGACAATAAGGCTCTCGGTAAAGA.................................................................................................................................. | 27 | 19 | 0.11 | 0.11 | - | 0.05 | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................GAGATGAGAAAGTGAAAGTAAGAGGGTAGT................................................. | 30 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................TGAGAAAGTGAAAGTAAGAGGGTAGTG................................................ | 27 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................TTGGGATTAGGCTCTCAGTAAAGAGA....................................................................................................................................................... | 26 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................................................ATAATAGGGACAGTCTATGGGTTACTTTC........ | 29 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGATAATAGGGACAGTCTATGGGT............... | 28 | 13 | 0.08 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................GGATAATAGGGACAGTCTATGGGTTACTTT......... | 30 | 13 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGATAATAGGGACAGTCTATGGGTa.............. | 30 | a | 0.08 | 0.23 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................................................AGAGGATAATAGGGACAGTCTATGGaa............... | 27 | aa | 0.08 | 0.23 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................TGGGATTAGGCTCTCAGTAAAGAGACActa.................................................................................................................................................. | 30 | cta | 0.08 | 1.54 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................TAGGCTCTCAGTAAAGAGACAATAAGGC.............................................................................................................................................. | 28 | 13 | 0.08 | 0.08 | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................GAGGATAATAGGGACAGTCTATGGGTTA............. | 28 | 13 | 0.08 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................................................AGGATAATAGGGACAGTCTATGGGTT.............. | 26 | 13 | 0.08 | 0.08 | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGATAATAGGGACAGTCTATGGG................ | 27 | 13 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................GAGGATAATAGGGACAGTCTATGGGT............... | 26 | 13 | 0.08 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................GAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTC...................... | 27 | 14 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGATAATAGGGACAGTCTAT................... | 24 | 14 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTt.................... | 27 | t | 0.07 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................AAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTC...................... | 26 | 14 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................GAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCT..................... | 28 | 14 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTATt.................. | 29 | t | 0.07 | 0.57 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................GTGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCT..................... | 30 | 14 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................AGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTAT................... | 27 | 14 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCa..................... | 29 | a | 0.07 | 2.79 | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................AAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCT..................... | 27 | 14 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTAT................... | 31 | 14 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTATGt................. | 30 | t | 0.07 | 0.14 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCc..................... | 29 | c | 0.07 | 2.79 | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCT..................... | 26 | 14 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................TAAAGAGACAATAAGGCTCTCGGTAAAGA.................................................................................................................................. | 29 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................GTGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGT....................... | 28 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGct...................... | 28 | ct | 0.07 | 4.20 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGa....................... | 27 | a | 0.07 | 4.20 | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................TAGGGACAGTCTATGGGTTACTTTCTTTTT... | 30 | 17 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................TAGGGACAGTCTATGGGTTACTTTCc....... | 26 | c | 0.06 | 0.29 | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................................GACAGTCTATGGGTTACTTTCTTTT.... | 25 | 17 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................AGGGACAGTCTATGGGTTACTTTCTTTT.... | 28 | 17 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................GGACAGTCTATGGGTTACTTTCTTTT.... | 26 | 17 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................ACAGTCTATGGGTTACTTTCTTTTT... | 25 | 17 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................TAGGGACAGTCTATGGGTTACTTT......... | 24 | 18 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................................................TAATAGGGACAGTCTATGGGTTACT........... | 25 | 18 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................AAGAGACAATAAGGCTCTCGGTAAAGAgat............................................................................................................................... | 30 | gat | 0.05 | 0.11 | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................CAATAAGGCTCTCGGTAAAGA.................................................................................................................................. | 21 | 19 | 0.05 | 0.05 | - | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| AAGAGGTTCAGAACTTTCTGCAATCAGGGTCTGTCAACAGGATGAGTACGGTAAGTAACTCACTATCCCAGGATTGGGATTAGGCTCTCAGTAAAGAGACAATAAGGCTCTCGGTAAAGAAACAAATAGGCTCTCCGGCTCTGGAGACAATAAAGGCTCTCTCTGGCTCAGGAGATGAGAAAGTGAAAGTAAGAGGGTAGTGAAAGTAAGAGGATAATAGGGACAGTCTATGGGTTACTTTCTTTTTCTA .........................................................................................................((((....((......)).....))))((((((((..(((((..........)))))..))))..))))............................................................................ .................................................................................................98...............................................................................179.....................................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)  | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)  | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...............................................................................................................................................................TCTCTGGCTCAGGAGATGAGAAAGTGAA............................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........AACTTTCTGCAATCAGGGTCTGTCAACA................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................TCACTATCCCAGGATTGGGATTAGGCTCTCA................................................................................................................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................GCAATCAGGGTCTGTCAACAGG................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................CAGGATGAGTACGGTAAGTAAc................................................................................................................................................................................................ | 22 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................CTCAGTAAAGAGACAATAAGGCTCTCGGTAt...................................................................................................................................... | 31 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..GAGGTTCAGAACTTTCTGCAATCAGG.............................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................TATCCCAGGATTGGGATTAGGCTCTCAGTA............................................................................................................................................................. | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................GGTCTGTCAACAGGATGAGTACGGTAAGTAA................................................................................................................................................................................................ | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................AAGAGACAATAAGGCTCTCGGTAAAGA.................................................................................................................................. | 27 | 19 | 0.05 | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |