| Gene: EG619597 | ID: uc007cet.1_intron_0_0_chr1_95887260_f.3p | SPECIES: mm9 |
|
|
|
(10) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(9) PIWI.ip |
(3) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(43) TESTES |
| ATACTGTCCTGTCTGTTCCCAGTGGCATGAAAGTAGATGGTATCTTCTTCCTGTTTAGACCCTGTAAACCACAGAGAATCCAGTGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGGGACCTGACTATATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGCCTTCTGGGCCACTGCCATTATGGAGCAACTAAAGTATCATCAGATTTTTTTTTAGGGGAAGGCACAGAAGATCCACTCTGACCCTGTGTGTCT ..............................................................................(((((....))))).(((.....))).(((((((((((..((.(((((...((.....))))))).))...)).)).)))))))........................................................................................ ..............................................................................79...................................................................................164.................................................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGT.......................................................................................................................................... | 29 | 2 | 104.00 | 104.00 | 25.50 | 23.00 | 17.00 | 19.00 | 5.50 | - | - | 1.50 | 3.00 | 2.50 | 2.00 | 1.00 | - | 0.50 | 2.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................TGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGC........................................................................................................................................ | 26 | 2 | 22.00 | 22.00 | 4.00 | 6.50 | 3.50 | 1.50 | 0.50 | 1.00 | 0.50 | 2.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGG............................................................................................................................................ | 27 | 2 | 17.00 | 17.00 | 4.50 | 3.00 | 1.50 | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 1.50 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGG........................................................................................................................................... | 28 | 2 | 12.50 | 12.50 | 4.00 | 2.50 | 2.00 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | 1.00 | - | - | - | 0.50 | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................GAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGT.......................................................................................................................................... | 28 | 2 | 9.00 | 9.00 | 2.50 | 1.50 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GTGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGA.............................................................................................................................................. | 26 | 2 | 7.00 | 7.00 | 1.50 | 3.00 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTG......................................................................................................................................... | 30 | 2 | 5.50 | 5.50 | - | - | 0.50 | - | 1.00 | - | - | 0.50 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGC........................................................................................................................................ | 31 | 2 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................TGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGCG....................................................................................................................................... | 27 | 2 | 4.00 | 4.00 | 1.50 | - | 1.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGt........................................................................................................................................ | 31 | t | 4.00 | 5.50 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................TATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGCCTT.......................................................................................... | 27 | 3 | 3.67 | 3.67 | - | - | - | - | - | 0.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................TATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGCCTTC......................................................................................... | 28 | 3 | 3.33 | 3.33 | - | - | - | - | - | 0.67 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGtt.......................................................................................................................................... | 29 | tt | 3.00 | 17.00 | 2.00 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTG................................................................................................................................. | 25 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................AACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTG......................................................................................................................................... | 28 | 2 | 3.00 | 3.00 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGG................................................................................................................................ | 26 | 2 | 2.50 | 2.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGA.............................................................................................................................................. | 25 | 2 | 2.50 | 2.50 | 0.50 | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TGACTATATGTGTCCTGGGCAATCTGC................................................................................................ | 27 | 3 | 2.33 | 2.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................TATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGCCTTCT........................................................................................ | 29 | 3 | 2.33 | 2.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGt............................................................................................................................... | 27 | t | 2.00 | 2.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................AACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGC........................................................................................................................................ | 29 | 2 | 2.00 | 2.00 | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAG............................................................................................................................................. | 26 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................TGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTG......................................................................................................................................... | 25 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GTGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAG............................................................................................................................................. | 27 | 2 | 2.00 | 2.00 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TGACTATATGTGTCCTGGGCAATCTGCT............................................................................................... | 28 | 3 | 2.00 | 2.00 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................TGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGGGACaa.......................................................................................................................... | 27 | aa | 1.50 | 0.50 | - | - | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................AACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGT.......................................................................................................................................... | 27 | 2 | 1.50 | 1.50 | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................TTCCTGTTTAGACCCTGTAAACCACAGA............................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGt........................................................................................................................................... | 28 | t | 1.50 | 17.00 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................CTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGC........................................................................................................................................ | 27 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TATATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGC............................................................................................. | 26 | 3 | 1.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGGta............................................................................................................................. | 29 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTT.................................................................................................................................. | 24 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TGACTATATGTGTCCTGGGCAATCTtc................................................................................................ | 27 | tc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................TGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGCGA...................................................................................................................................... | 28 | 2 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................TAGACCCTGTAAACCACAGAGAATCCAG....................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TGTTCCCAGTGGCATGAAAGTAGATGGTA................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................GAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGC........................................................................................................................................ | 30 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................GAAGAGGGTGCGAGTTTGGGGAaa........................................................................................................................... | 24 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................AACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGG........................................................................................................................................... | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TGACTATATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGt............................................................................................. | 30 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................TGTAAACCACAGAGAATCCAGTGAAC.................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................CTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTG......................................................................................................................................... | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................TGGAGCAACTAAAGTATCATCAGATTT.............................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................ACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTG......................................................................................................................................... | 27 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TGCGAGTTTGGGGACCTGACTATATGT................................................................................................................ | 27 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................TAGGGGAAGGCACAGAAGATCCACTCT.............. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GTGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGG............................................................................................................................................ | 28 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - |
| .....................................................................................................TGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGGGtcc........................................................................................................................... | 26 | tcc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ACCTGACTATATGTGTCCTGGGCAATat.................................................................................................. | 28 | at | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AGTGAACTGGAACCATAGCCTGGAAG............................................................................................................................................... | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................CAGAAGATCCACTCTGACCCTGTGTGT.. | 27 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 |
| ..............................................................................................................................................................................................................................AGAAGATCCACTCTGACCCTGTGTGTC. | 27 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................CTGGGCAATCTGCTGCCTTCTGGGCCACT................................................................................ | 29 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................CTATATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGCC............................................................................................ | 28 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................TCCTGTTTAGACCCTGTAAACCACAGA............................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TGCGAGTTTGGGGACCTGACTATAT.................................................................................................................. | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................AACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGt........................................................................................................................................ | 29 | t | 0.50 | 3.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................TTCCTGTTTAGACCCTGTAAACCACAGAGA............................................................................................................................................................................. | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGGGA............................................................................................................................. | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................GAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGG............................................................................................................................................ | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGtct.............................................................................................................................. | 28 | tct | 0.50 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................TTCCTGTTTAGACCCTGTAAACCACAGAGAta........................................................................................................................................................................... | 32 | ta | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGt................................................................................................................................ | 26 | t | 0.50 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TGCGAGTTTGGGGACCTGACTATATG................................................................................................................. | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGtt....................................................................................................................................... | 32 | tt | 0.50 | 5.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................CTGTTTAGACCCTGTAAA...................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGtt.............................................................................................................................. | 28 | tt | 0.50 | 2.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGa................................................................................................................................ | 26 | a | 0.50 | 3.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................ACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGC........................................................................................................................................ | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGaa.............................................................................................................................. | 28 | aa | 0.50 | 2.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................AACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGcgc........................................................................................................................................ | 29 | cgc | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................AGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGG............................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................GAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGT.................................................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................CAGTGAACTGGAACCATAGCCTGGAAG............................................................................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................TGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGCaa...................................................................................................................................... | 28 | aa | 0.50 | 22.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................ACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGt........................................................................................................................................ | 28 | t | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGa.......................................................................................................................................... | 29 | a | 0.50 | 12.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................CCATAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTT................................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGaaca............................................................................................................................. | 29 | aaca | 0.50 | 3.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGtggc............................................................................................................................. | 29 | tggc | 0.50 | 3.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TGCGAGTTTGGGGACCTGACTATA................................................................................................................... | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GTGAACTGGAACCATAGCCTGGAAG............................................................................................................................................... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................CGAGTTTGGGGACCTGACTATATGTG............................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................GCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGG................................................................................................................................ | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGcg......................................................................................................................................... | 30 | cg | 0.50 | 12.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGta.............................................................................................................................. | 28 | ta | 0.50 | 2.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGTTTAGACCCTGTAAACCACAGAGAATCC......................................................................................................................................................................... | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................TGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGGGACa........................................................................................................................... | 26 | a | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGg.......................................................................................................................................... | 29 | g | 0.50 | 12.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................GAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTG......................................................................................................................................... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................TGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGT.......................................................................................................................................... | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGtgt.......................................................................................................................................... | 29 | tgt | 0.50 | 2.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................GAGGGTGCGAGTTTGGGGACCTGA........................................................................................................................ | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GTGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGT.......................................................................................................................................... | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................TCCTGTTTAGACCCTGTAAACCACAGAGA............................................................................................................................................................................. | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................TGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGGGA............................................................................................................................. | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................TGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGGGAC............................................................................................................................ | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGta....................................................................................................................................... | 32 | ta | 0.50 | 5.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................GAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGCGA...................................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TGACTATATGTGTCCTGGGCAATCTG................................................................................................. | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................GAAGATCCACTCTGACCCTGTGTGTC. | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................CAGAAGATCCACTCTGACCCTGTGTG... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................ATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGCCTTC......................................................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................CAGAAGATCCACTCTGACCCTGTGT.... | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................TATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGCCTTCa........................................................................................ | 29 | a | 0.33 | 3.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TATATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGCCT........................................................................................... | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................AGAAGATCCACTCTGACCCTGTGTGT.. | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................GCAATCTGCTGCCTTCTGGGCCACTGC.............................................................................. | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................CTATATGTGTCCTGGGCAATCTGCTG.............................................................................................. | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................TATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGC............................................................................................. | 24 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................TATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGCCT........................................................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................CAGAAGATCCACTCTGACCCTGTGTGTC. | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................TATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGCCTTCTG....................................................................................... | 30 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TGTGTCCTGGGCAATCTGCTGCCTTCT........................................................................................ | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ATACTGTCCTGTCTGTTCCCAGTGGCATGAAAGTAGATGGTATCTTCTTCCTGTTTAGACCCTGTAAACCACAGAGAATCCAGTGAACTGGAACCATAGCCTGGAAGAGGGTGCGAGTTTGGGGACCTGACTATATGTGTCCTGGGCAATCTGCTGCCTTCTGGGCCACTGCCATTATGGAGCAACTAAAGTATCATCAGATTTTTTTTTAGGGGAAGGCACAGAAGATCCACTCTGACCCTGTGTGTCT ..............................................................................(((((....))))).(((.....))).(((((((((((..((.(((((...((.....))))))).))...)).)).)))))))........................................................................................ ..............................................................................79...................................................................................164.................................................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) |
|---|