chr1:90171417 90171666 -
(1)
OTHER.ip 		(4)
OTHER.mut 		(5)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(35)
TESTES

Sense strand
GAGTTTGGGGAGGAAAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGGTATTTGCCATCAGGTTTGCCGCCTTCCTGCTTTACTCTAGTGTGTTGGTGGGACTGCATCCCAGCGCCAGAGAGCCCGGAGGCCGGTGTGCTCTGTGATGGGATGACCTCCTCCTCTGCCCTTACCCCTCCTGTGTGAAGATAAACTGAGAAGTGTTTCTTCCACCTCCTGGCTCTTGTCTGCTATTTCTTCATCATAG


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCA......................................................................................................................................................................................................... 28 1 155.00 155.00 43.00 36.00 15.00 22.00 19.00 5.00 4.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTC.......................................................................................................................................................................................................... 27 1 134.00 134.00 42.00 28.00 10.00 9.00 14.00 6.00 7.00 3.00 - 5.00 1.00 - 1.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAG........................................................................................................................................................................................................ 29 1 14.00 14.00 2.00 4.00 2.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TGGGGAGGAAAGCTGATGAAGAAGGA........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 11.00 11.00 - - - - - - - - 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
........................................................................................TAGTGTGTTGGTGGGACTGCATCCCAGC...................................................................................................................................... 28 1 7.00 7.00 - - - - - - 2.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGAA................................................................................................................................................................................................................. 26 1 7.00 7.00 4.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATACAC............................................................................................................................................................................................................ 25 1 6.00 6.00 1.00 - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAG........................................................................................................................................................................................................ 27 1 6.00 6.00 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................GAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGG....................................................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................TGATGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTC.......................................................................................................................................................................................................... 30 1 5.00 5.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........GGAGGAAAGCTGATGAAGAAGGA........................................................................................................................................................................................................................... 23 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGA.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGATGAAGAAGGAAGACAAGGAATACA............................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GGAAAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAG.................................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGA.................................................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCt......................................................................................................................................................................................................... 28 t 3.00 134.00 - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGATGAAGAAGGAAGACAAGGAATAC.............................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..........AGGAAAGCTGATGAAGAAGGAAGACA...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCA......................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GAAGGAAGACAAGGAATACACTCAG........................................................................................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGG....................................................................................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGa....................................................................................................................................................................................................... 26 a 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGAAT................................................................................................................................................................................................................ 27 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGATGAAGAAGGAAGACAAGGAATACAC............................................................................................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGAA................................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................ACAAGGAATACACTCAG........................................................................................................................................................................................................ 17 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................ACTGCATCCCAGCGCCAGAGA.............................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGGAAGACAAGGAATACACTCAGGTg..................................................................................................................................................................................................... 26 g 2.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TAGTGTGTTGGTGGGACTGCATCCCAG....................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGAAGACAAGGAATACACTCAGGcga.................................................................................................................................................................................................... 26 cga 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAG........................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAG........................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GGAAAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGG................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACT........................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAa........................................................................................................................................................................................................ 29 a 2.00 155.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGAATA............................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGAAGACAAGGAATACACTCAGGTga.................................................................................................................................................................................................... 26 ga 2.00 0.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGAATAC.............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAGAAGGAAGACAAGGAATA............................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATACA............................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TCTAGTGTGTTGGTGGG................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGGAAGACAAGGAATACACTCcggt...................................................................................................................................................................................................... 25 cggt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGat...................................................................................................................................................................................................... 27 at 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GAAAGCTGATGAAGAAGGAAGACAA..................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGGa...................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGG....................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................GCGCCAGAGAGCCCGGAGGCCGGggt.............................................................................................................. 26 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TTTACTCTAGTGTGTTGGTGGGACTG............................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGGT...................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGGCCGGTGTGCTCTGTGA..................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAa........................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGGAAGACAAGGAATACACTCAGaac..................................................................................................................................................................................................... 26 aac 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TTACCCCTCCTGTGTGAAGA.......................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGaac..................................................................................................................................................................................................... 28 aac 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................CTAGTGTGTTGGTGGGACTGCA............................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TAGTGTGTTGGTGGGACTGCATCCC......................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TGGGGAGGAAAGCTGATGAAGAAGG............................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AGTGTGTTGGTGGGACTGCATCCC......................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................AAGGAAGACAAGGAATACACTCAGctgc.................................................................................................................................................................................................... 28 ctgc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................CTAGTGTGTTGGTGGGACTGCAT............................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTATTTGCCATCAGGTTTGCCGCCTTC............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................GAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGGc...................................................................................................................................................................................................... 27 c 1.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATAa.............................................................................................................................................................................................................. 23 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGAATt............................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GAAGACAAGGAATACACTCAGGcga.................................................................................................................................................................................................... 25 cga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GTTTGGGGAGGAAAGCTGATGAAG................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGAAT................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTTGGGGAGGAAAGCTGATGAAGAAGGt........................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGGAAGACAAGGAATACACTCA......................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TTGGGGAGGAAAGCTGATGAAGAAGGA........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................AAGGAAGACAAGGAATACACTCAGGc...................................................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GGAAAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGt................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGATGAAGAAGGAAGACAAGGAA................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ATGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCA......................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................AAGGAAGACAAGGAATACACTCAGGTg..................................................................................................................................................................................................... 27 g 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGG....................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGAAT................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGTGCTCTGTGATGGGATGACCTCCTC...................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGGAAGACAAGGAATACACTCAGGTA..................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........GGAAAGCTGATGAAGAAGGAAGACA...................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TACTCTAGTGTGTTGGTGGGACTGC.............................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GAAGAAGGAAGACAAGGAATACAC............................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGAAGACAAGGAATACACTCAGGTgat................................................................................................................................................................................................... 27 gat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGGAAGACAAGGAATACACTCAGGTga.................................................................................................................................................................................................... 27 ga 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TACTCTAGTGTGTTGGTGGGACTGCATC........................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TCCTGTGTGAAGATAAACTGAGAAGTGTT.......................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGa....................................................................................................................................................................................................... 30 a 1.00 14.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GAAGGAAGACAAGGAATA............................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GCTGATGAAGAAGGAAGAC....................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TTTACTCTAGTGTGTTGGTGGGtctg............................................................................................................................................... 26 tctg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GAGGAAAGCTGATGAAGAAGGAAGAC....................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TCCTGTGTGAAGATAAACTGAGAAGTG............................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGt....................................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 14.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGATGAAGAAGGAAGACAAGGAATACAaa........................................................................................................................................................................................................... 29 aa 1.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TAGTGTGTTGGTGGGACTGCATCCCA........................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AGGAAAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAG.................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GAAAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGG................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GAAGACAAGGAATACACTCAGattc.................................................................................................................................................................................................... 25 attc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGTGTTGGTGGGACTGCATCCCAGCG..................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGGAAGACAAGGAATACACTCAGGT...................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAA................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GGAAAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGAAT................................................................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AAAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGAA................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CAGGTATTTGCCATCAGGTTTGCCGCC................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...................GATGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCA......................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
............................GGAAGACAAGGAATACACTCAG........................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAttt...................................................................................................................................................................................................... 31 ttt 1.00 155.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................AAGGAAGACAAGGAATACACTCAGGT...................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GAAGAAGGAAGACAAGGA.................................................................................................................................................................................................................. 18 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TGGGGAGGAAAGCTGA..................................................................................................................................................................................................................................... 16 8 0.12 0.12 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GAGTTTGGGGAGGAAAGCTGATGAAGAAGGAAGACAAGGAATACACTCAGGTATTTGCCATCAGGTTTGCCGCCTTCCTGCTTTACTCTAGTGTGTTGGTGGGACTGCATCCCAGCGCCAGAGAGCCCGGAGGCCGGTGTGCTCTGTGATGGGATGACCTCCTCCTCTGCCCTTACCCCTCCTGTGTGAAGATAAACTGAGAAGTGTTTCTTCCACCTCCTGGCTCTTGTCTGCTATTTCTTCATCATAG


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
..................................................................................................................................................................................................................TTCCACCTCCTGGCTCTTGTCTGCTA.............. 26 1 6.00 6.00 - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................CCTGGCTCTTGTCTGCTATTTCTTCA...... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCTTCCACCTCCTGGCTCTTGTCTG................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..............................................................................................................GCGCCAGAGAGCCaatg........................................................................................................................... 17 aatg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGGCTCTTGTCTGCTaaac............... 19 aaac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00