(1)
OTHER.ip
(5)
OTHER.mut
(5)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(28)
TESTES

Sense strand
TTCTCCTGTGAAGGTGATTGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTGGTGAGTATCGATAACCCTGTACACAAGTCCTGGGAGCCAATGAGTGTTGCTTTATTAGAAAGGGAGGGTAGGGACAGGGCCCACTTGTCTCCACTGCCGCAGTGTACCCACAAGAGTTCCTCACTGTTTATGTTTTATCTAGATTGCTAAGCAGTATTTTTAAAAACATAAGTTATCGTAAATTGCCCCAGTATGTCCTC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
.........................................................................................................................................................................................TATCTAGATTGCTAAGCAGTATTTTTAAAAACATAAGTTATCGTAAATTGCC............. 52 1 41.00 41.00 41.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGA............................................................................................................................................................................................................. 27 1 16.00 16.00 - 2.00 2.00 2.00 2.00 2.00 1.00 - - - - - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - -
.........................TTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGcgat...................................................................................................................................................................................................... 27 cgat 11.00 0.00 - 1.00 3.00 - 2.00 - 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.........................TTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTGatt..................................................................................................................................................................................................... 28 att 10.00 3.00 - 1.00 1.00 - - 2.00 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAA............................................................................................................................................................................................................ 28 1 8.00 8.00 - 1.00 - - - - - - 4.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - -
..................TGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAG........................................................................................................................................................................................................... 29 1 8.00 8.00 - 2.00 3.00 - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAG........................................................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGcga....................................................................................................................................................................................................... 26 cga 4.00 0.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..........................................................................................TGAGTGTTGCTTTATTAGAAAGGGAGG..................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTGatt..................................................................................................................................................................................................... 27 att 4.00 0.00 - 1.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTGattc.................................................................................................................................................................................................... 28 attc 3.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..................TGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAG.............................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GGTGATTGACAGATTAAATGGGCAAGC................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTG........................................................................................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................................................................TGTACACAAGTCCTGGGAGCCAATGAGT........................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.............GTGATTGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAG........................................................................................................................................................................................................... 34 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................GACAGATTAAATGGGCAAGCT.................................................................................................................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
......................AGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGc......................................................................................................................................................................................................... 27 c 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTGattc.................................................................................................................................................................................................... 29 attc 2.00 3.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAG........................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGTGAAGGTGATTGACAGATTAAATGGG........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGTGAAGGTGATTGACAGATTAAATGG......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TTGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGA............................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGc......................................................................................................................................................................................................... 31 c 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GATTGACAGATTAAATGGGCAAGCTCC................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................GATTAAATGGGCAAGCTCCAGA............................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TAAGTTATCGTAAATTGCCCCActa....... 25 cta 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCA............................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
........................................................ATCGATAACCCTGTACACAAGTCCTGG....................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................CAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGcgat...................................................................................................................................................................................................... 31 cgat 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTGt....................................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........................TAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTGctt..................................................................................................................................................................................................... 27 ctt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GTTCCTCACTGTTTATGTTTTATCTA........................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGc......................................................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTGat...................................................................................................................................................................................................... 26 at 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGATTGACAGATTAAATGGGCAAGCTCC................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TACACAAGTCCTGGGAGCCAATGAG............................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................GATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTG........................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAGTGTTGCTTTATTAGAAAGGGAGGGTA.................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTGG....................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................ATTGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAG.............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................TGGTGAGTATCGATAACCCTGTACACA............................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................CAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGG.......................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TGTACACAAGTCCTGGGAGCCAATGA............................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GGTGATTGACAGATTAAATGGGCAAGCT.................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...................................................................TGTACACAAGTCCTGGGAGCCAATGAG............................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AGGTGATTGACAGATTAAATGGGCAAGC................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................AATGGGCAAGCTCCAGAAGGcgat...................................................................................................................................................................................................... 24 cgat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................TTGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAG........................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCTAGATTGCTAAGCAGTATTTTTAAAAA.................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTTTATCTAGATTGCTAAGCAGTATT.......................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGTATCGATAACCCTGTACACAAGTC........................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTGa....................................................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TACACAAGTCCTGGGAGCCAATGAGT........................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTATCGATAACCCTG..................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................TAAATGGGCAAGCTCCAGc............................................................................................................................................................................................................. 19 c 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAa........................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 8.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GTGATTGACAGATTAAATGGGCAAGC................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................TTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTGat...................................................................................................................................................................................................... 27 at 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGT......................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GCCAATGAGTGTTGCTTTAT................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAGTGTTGCTTTATTAGAAAGGGAGGG.................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGc......................................................................................................................................................................................................... 28 c 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAGTGTTGCTTTATTAGAAAGGGAG...................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................CTGTTTATGTTTTATCTAGATTGCTAAGC................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGA............................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGG.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TTCTCCTGTGAAGGTGATTGACAGATTAAATGGGCAAGCTCCAGAAGGTGGTGAGTATCGATAACCCTGTACACAAGTCCTGGGAGCCAATGAGTGTTGCTTTATTAGAAAGGGAGGGTAGGGACAGGGCCCACTTGTCTCCACTGCCGCAGTGTACCCACAAGAGTTCCTCACTGTTTATGTTTTATCTAGATTGCTAAGCAGTATTTTTAAAAACATAAGTTATCGTAAATTGCCCCAGTATGTCCTC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
..................................................................................................................................................CCGCAGTGTACCCACAAGAGTTCCTCA............................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GTACCCACAAGAGTTCCTCACTGTT........................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -