| Gene: Ndufs1 | ID: uc007bfu.1_intron_3_0_chr1_63195146_r.5p | SPECIES: mm9 |
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(1) OTHER.ip |
(7) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(6) PIWI.ip |
(1) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(33) TESTES |
| TTGTATCACGCGACAGGACTTGCCAAAGGATTGTTTCATTGTTTATCAAGGTAAGTAGCAACTTGGCAGTAGAAACAAAAGAGAGCTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCCAGGACAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAACAGAACAAAACAAGAAACAAAAGAGAATCATACCTGATGCATACTAAGAGGTGTTTGAT ......................................................(((((..((((((.(((((.........((((((((((.((........))....))))))))))((((....)))).))))).......(((....))).))))))))))).................................................................................... ..................................................51..................................................................................................................167................................................................................. |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR363964(GSM822766) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| .......................CAAAGGATTGTTTCATTGTTTATCAAGGac..................................................................................................................................................................................................... | 30 | ac | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAtttt............................................................................. | 28 | tttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ......................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttg....................................................................................... | 29 | ttg | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................................................................................TCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTatc........................................................................................................................................ | 28 | atc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...................TTGCCAAAGGATTGTTTCATTGTTTAT............................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..........CGACAGGACTTGtgga................................................................................................................................................................................................................................ | 16 | tgga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
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| ....ATCACGCGACAGGACTTGCCAAAGGAT........................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................CTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATaa........................................................................................................................................... | 26 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TCACGCGACAGGACTTGCCAAAGGA............................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................................................................................................AGATTTCTGAGTTCCAGGACAGCCTGagc.................................................................................................................... | 29 | agc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACcaga............................................................................................ | 24 | caga | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TCACGCGACAGGACTTGCCAAAGGAT........................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................TTTCTGAGTTCCAGGACAGCaagg...................................................................................................................... | 24 | aagg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............ACAGGACTTGCCAAAGG............................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtcc....................................................................................... | 28 | tcc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgat.......................................................................................... | 26 | gat | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................GGCAGGCAGATTTCTGAGTTCCAtg............................................................................................................................... | 25 | tg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCctt......................................................................................... | 28 | ctt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttta...................................................................................... | 30 | ttta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................CAAAGGATTGTTTCATTG................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGtgct............................................................................................... | 21 | tgct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................AGGCAGATTTCTGAGTTCCAGGAtt............................................................................................................................ | 25 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GAGCTCGGGAGGCAGAGGCAGGgaa............................................................................................................................................... | 25 | gaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................AGGATTGTTTCATTGTTTATCAAGGa...................................................................................................................................................................................................... | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| TTGTATCACGCGACAGGACTTGCCAAAGGATTGTTTCATTGTTTATCAAGGTAAGTAGCAACTTGGCAGTAGAAACAAAAGAGAGCTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCCAGGACAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAACAGAACAAAACAAGAAACAAAAGAGAATCATACCTGATGCATACTAAGAGGTGTTTGAT ......................................................(((((..((((((.(((((.........((((((((((.((........))....))))))))))((((....)))).))))).......(((....))).))))))))))).................................................................................... ..................................................51..................................................................................................................167................................................................................. |
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| ..................................................................................................................................................................................................................GAGAATCATACCgca......................... | 15 | gca | 3.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................ACAGCCTGGTCTACAAAGTGAagaa.......................................................................................................... | 25 | agaa | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ........................................................................................................................ACAGCCTGGTCTACAAAGTGAata.......................................................................................................... | 24 | ata | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................................................................................................................................................................GAGAATCATACCggta......................... | 16 | ggta | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................ACAGCCTGGTCTACAAAGTGAaat.......................................................................................................... | 24 | aat | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................AGGACAGCCTGGTCTACAAAGTGAat.......................................................................................................... | 26 | at | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......................................................................................................................GACAGCCTGGTCTACAAAGTGAata.......................................................................................................... | 25 | ata | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................GAGAATCATACCgat......................... | 15 | gat | 2.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................GAGAATCATACCgcg......................... | 15 | gcg | 2.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................GACAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTtcg....................................................................................................... | 28 | tcg | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................GAGAATCATACCTggt........................ | 16 | ggt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................GACAGCCTGGTCTACAAAGTGAaga.......................................................................................................... | 25 | aga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................................................................................................................GGACAGCCTGGTCTACAAAGTGAcga.......................................................................................................... | 26 | cga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................GGACAGCCTGGTCTACAAAGTGgcgg........................................................................................................... | 26 | gcgg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................ACAGCCTGGTCTACAAaagt............................................................................................................... | 20 | aagt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .....................................................................................................................AGGACAGCCTGGTCTACAAAGTGAata.......................................................................................................... | 27 | ata | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................GGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAgca....................................................................................................................................... | 26 | gca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................GACAGCCTGGTCTACAAAGTGAttaa.......................................................................................................... | 26 | ttaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................GAGAATCATACCTgc........................ | 15 | gc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................ACAGCCTGGTCTACAAAGTGAaca.......................................................................................................... | 24 | aca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................GACAGCCAGGGCTACACAGAGAAAgtaa........................................................................... | 28 | gtaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................GAGCTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTctg............................................................................................................................................ | 31 | ctg | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................AGGACAGCCTGGTCTACAAAGTGAattt.......................................................................................................... | 28 | attt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................GGACAGCCTGGTCTACAAAGTGactt........................................................................................................... | 26 | actt | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................GAGAATCATACCgctg......................... | 16 | gctg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................AGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCaaaa................................................................................................................................... | 26 | aaaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................ACAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTaac....................................................................................................... | 27 | aac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................AGGACAGCCTGGTCTACAAAGTGAacaa.......................................................................................................... | 28 | acaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................GACAGCCTGGTCTACAAAGTGAGtcga......................................................................................................... | 27 | tcga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................GAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCatat................................................................................................................................... | 27 | atat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................GAGAATCATACCTgct........................ | 16 | gct | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................CCAGGACAGCCTGGTCTACAAAGTGAc.......................................................................................................... | 27 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAaaaa....................................................................................................................................... | 27 | aaaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................AGGCAGGCAGATTTCTacct......................................................................................................................................... | 20 | acct | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................ACAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTaag....................................................................................................... | 27 | aag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................AGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCCAaaga................................................................................................................................. | 28 | aaga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................GACAGCCTGGTCTACAAAGTGAaatt.......................................................................................................... | 26 | aatt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................GGACAGCCTGGTCTACAAAGTGAata.......................................................................................................... | 26 | ata | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAataa....................................................................................................................................... | 27 | ataa | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................AGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCCAct................................................................................................................................. | 28 | ct | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................GAGAATCATACCgcta......................... | 16 | gcta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................CGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTcggc......................................................................................................................................... | 30 | cggc | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAagta....................................................................................................................................... | 27 | agta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................GACAGCCAGGGCTACACAGAGAAAgtga........................................................................... | 28 | gtga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................GACAGCCTGGTCTACAAAGTGAaaaa.......................................................................................................... | 26 | aaaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................GGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTaat..................................................................................................................................... | 28 | aat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GCTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATgctt............................................................................................................................................. | 29 | gctt | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................GGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAaga.............................................................. | 31 | aga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................GTCTCGAAAAAACAGgggg........................................................ | 19 | gggg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................GACAGCCTGGTCTACAAAGTGAGtcta......................................................................................................... | 27 | tcta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................AGGACAGCCTGGTCTACAAAGTGAGat......................................................................................................... | 27 | at | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................ACAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAactt.................................................................................................... | 31 | actt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................ACAGCCTGGTCTACAAAGTGAaaat.......................................................................................................... | 25 | aaat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| .............................................................................................AGGCAGGCAGATTTCTGAGTTaaaa.................................................................................................................................... | 25 | aaaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................CAGGACAGCCTGGTCTACAAAGTGAta.......................................................................................................... | 27 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................AGCTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATa............................................................................................................................................. | 27 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GAGCTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCT......................................................................................................................................... | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GAGCTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTT........................................................................................................................................... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GAGCTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGAT............................................................................................................................................. | 27 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AGAGCTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGA.............................................................................................................................................. | 27 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GAGCTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGA.............................................................................................................................................. | 26 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |