chr1:59761545 59761794 +
(12)
OTHER.mut 		(4)
OVARY 		(10)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(51)
TESTES

Sense strand
TACAGTCATGGTTGGAGAATTAGTTGGAGCACGGCTTATTGCTCATGCAGGTGACAGTTTTAATGTGATTTGTAAGGACTAAAGACCATGTGTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGTTCTCTTTGAATAATGAGGGCAGCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGACACCGTGGTCCTTGGTCAAAAGGATAAAATTAGTTCACATTATCATGTTTAAGTCTTAAGCTCAGTCCTCAGGATCAAAA
.........................................................................................(((((((..((......((((.((..(((((..((((.....)))).....))))))).))))........))...)))).))).............................................................................
......................................................................................87.....................................................................................174..........................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGTTCTCTTTGAATAATGAGGG........................................................................................................... 52 1 413.00 413.00 329.00 - - - - - - - - 84.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATG.......................................................................................................................................... 21 1 317.00 317.00 - 115.00 34.00 35.00 5.00 21.00 - 26.00 30.00 - 16.00 5.00 20.00 - - - 2.00 - - - - - 3.00 1.00 - 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGA............................................................................................................................................ 19 1 268.00 268.00 - 67.00 43.00 29.00 4.00 27.00 21.00 14.00 12.00 - 11.00 11.00 5.00 3.00 - 2.00 1.00 - 9.00 - - 1.00 1.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATG.......................................................................................................................................... 20 1 171.00 171.00 - 18.00 34.00 42.00 6.00 16.00 1.00 31.00 2.00 - 6.00 12.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTG............................................................................................................................................. 18 1 126.00 126.00 - 39.00 46.00 11.00 - 17.00 - 7.00 3.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGC......................................................................................................................................... 22 1 94.00 94.00 - 11.00 15.00 6.00 26.00 3.00 7.00 5.00 14.00 - - - - 2.00 - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TCAGTCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 22 1 49.00 49.00 - 4.00 1.00 - 4.00 1.00 17.00 1.00 4.00 - 1.00 2.00 - 9.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTG..................................................................................................................................... 26 1 36.00 36.00 - 11.00 3.00 2.00 2.00 6.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - 1.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTCAGTCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 23 1 35.00 35.00 - - 2.00 - 10.00 1.00 3.00 - 1.00 - 3.00 2.00 - 9.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCT........................................................................................................................................ 23 1 33.00 33.00 - 2.00 5.00 1.00 - 5.00 8.00 1.00 3.00 - 1.00 - - 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGT.............................................................................................................................. 33 1 29.00 29.00 - - - - - - 1.00 - 4.00 - 9.00 3.00 - 3.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGAT........................................................................................................................................... 20 1 29.00 29.00 - 2.00 10.00 - - - - - 1.00 - 5.00 6.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGT.............................................................................................................................. 32 1 24.00 24.00 - - - - - - 4.00 - - - 3.00 2.00 3.00 - 7.00 - - - - 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGAaa.......................................................................................................................................... 21 aa 23.00 268.00 - 3.00 3.00 1.00 - 6.00 - 3.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGAa........................................................................................................................................... 20 a 23.00 268.00 - 5.00 4.00 3.00 - 2.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 24 1 19.00 19.00 - - - - 4.00 - 3.00 - 1.00 - 5.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGC.................................................................................................................................... 27 1 18.00 18.00 - - 5.00 - 9.00 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTC............................................................................................................................................... 16 2 16.50 16.50 - 3.50 9.00 1.50 - 2.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 25 1 14.00 14.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - 3.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAG............................................................................................................................... 32 1 13.00 13.00 - - - - - - - - - - - 3.00 7.00 - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCC................................................................................................................................... 28 1 13.00 13.00 - 2.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................ACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 16 3 12.67 12.67 - - 6.67 1.33 - 2.33 - 2.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTT...................................................................................................................................... 25 1 12.00 12.00 - 3.00 - - - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TCTTTGAATAATGAGGGCAGC....................................................................................................... 21 1 10.00 10.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGA................................................................................................................................ 31 1 10.00 10.00 - - - - 8.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGAaaa......................................................................................................................................... 22 aaa 10.00 268.00 - 4.00 4.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CAGTCACTACCTCTTCTGAGACA.............................................................................. 23 1 9.00 9.00 - - - 1.00 - - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CAGTCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 21 1 9.00 9.00 - - - - - - 7.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGA............................................................................................................................................ 18 1 9.00 9.00 - 3.00 2.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATa.......................................................................................................................................... 21 a 8.00 29.00 - - 3.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATGC......................................................................................................................................... 21 1 8.00 8.00 - 1.00 3.00 - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTT....................................................................................................................................... 24 1 8.00 8.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAG............................................................................................................................... 31 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 -
................................................................................................................................................AGCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 26 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CAGCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 27 1 7.00 7.00 - - - - - - 3.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGT.............................................................................................................................. 24 1 7.00 7.00 - - - - - - 5.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GTCACTACCTCTTCTGAGACA.............................................................................. 21 1 6.00 6.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GTCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 19 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TCAGTCACTACCTCTTCTGAGACA.............................................................................. 24 1 6.00 6.00 - - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................................................................................................................CTTTGAATAATGAGGGCAG........................................................................................................ 19 1 6.00 6.00 - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................AGTCACTACCTCTTCTGAGACA.............................................................................. 22 1 5.00 5.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TTTGAATAATGAGGGCAGC....................................................................................................... 19 1 5.00 5.00 - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGCACGGCTTATTGCTCATG........................................................................................................................................................................................................... 20 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TCTTTGAATAATGAGGGC.......................................................................................................... 18 1 5.00 5.00 - - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGACA.............................................................................. 27 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTT................................................................................................................................................ 15 8 4.62 4.62 - 1.00 0.38 0.38 - 2.62 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCT.............................................................................................................................................. 17 2 4.50 4.50 - 0.50 2.00 0.50 - 0.50 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TTTGAATAATGAGGGC.......................................................................................................... 16 2 4.50 4.50 - - - - 4.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................AGTCACTACCTCTTCTGA.................................................................................. 18 1 4.00 4.00 - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTG................................................................................................................................. 30 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AATGATGATTTCTGATG.......................................................................................................................................... 17 1 4.00 4.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................AGTCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 20 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTAGTTGGAGCACGGCTTATTGCTCAT............................................................................................................................................................................................................ 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GCCTGAGTTCTCTTTGAATA.................................................................................................................. 20 1 4.00 4.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................AGGGCAGCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 31 1 4.00 4.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TTTGAATAATGAGGGCAG........................................................................................................ 18 1 4.00 4.00 - - - - 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AATAATGAGGGCAGCTTC.................................................................................................... 18 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................ACTACCTCTTCTGAGACA.............................................................................. 18 2 3.00 3.00 - 1.00 1.00 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TCATGGTTGGAGAATTAGTTGGAGCAC.......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....TCATGGTTGGAGAATTAGTTGGAGC............................................................................................................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGTTCAATGATGATTTCTGA............................................................................................................................................ 20 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGTTCAATGATGATTTCTGATG.......................................................................................................................................... 22 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ATTTCTGATGCTTTGCCT.................................................................................................................................. 18 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGTTC............................................................................................................................ 34 1 3.00 3.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGA................................................................................................................................ 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AATGATGATTTCTGATGC......................................................................................................................................... 18 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGTTCT........................................................................................................................... 36 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTCAGTCACTACCTCTTCTGAGACA.............................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCT.................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGGTTGGAGAATTAGTTGGAGCACGGCT...................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GATGATTTCTGATGCTTTGC.................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TTGAATAATGAGGGCAGC....................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CCTGAGTTCTCTTTGAATAATG............................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AATGATGATTTCTGATGCT........................................................................................................................................ 19 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGTTCAATGATGATTTCTGATGC......................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGAC............................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATaaa........................................................................................................................................ 23 aaa 2.00 29.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GTCACTACCTCTTCTGAGAC............................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTTCTGATGCTTTGCCTGAGTTCT........................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................AGGGCAGCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGACA.............................................................................. 33 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TTGGAGAATTAGTTGGAGCACG......................................................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................ATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGT.............................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGAT........................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTGGAGCACGGCTTATTG................................................................................................................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TTTGAATAATGAGGGCAGCT...................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGAaa.......................................................................................................................................... 20 aa 2.00 9.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAGTTGGAGCACGGCTTATTGCTCATG........................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TTGGAGAATTAGTTGGAGCACGGCTT..................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATGCTTTG..................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGT.............................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................AGTCACTACCTCTTCTGAGAC............................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CTGAGTTCTCTTTGAATAATGAGGGCAGC....................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TTGAATAATGAGGGCAGCT...................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CACTACCTCTTCTGAGACA.............................................................................. 19 2 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CTTTGCCTGAGTTCTCTTTGAATAATGAGGGC.......................................................................................................... 32 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATGCTT....................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................ACTACCTCTTCTGAGACAC............................................................................. 19 2 1.50 1.50 - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 18 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGTT............................................................................................................................. 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ATAATGAGGGCAGCTTCAGTCAC.............................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................ATGATTTCTGATGCTTTGa.................................................................................................................................... 19 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ATGATGATTTCTGATGCTTTG..................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TCTGATGCTTTGCCTGAGTTCTCTT........................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTG................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AATAATGAGGGCAGCTTCAGTC................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGA................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................ATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGTT............................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGGAGAATTAGTTGGAGCACGGCTTA.................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATa.......................................................................................................................................... 20 a 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGt................................................................................................................................ 31 t 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................GAGTTCTCTTTGAATAATGAGGGCAGCTT..................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GTCACTACCTCTTCTGcgac............................................................................... 20 cgac 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAGTTGGAGCACGGCTTATTGCTCAT............................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATGCT........................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGGTTGGAGAATTAGTTGGAGCACGGC....................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GATGATTTCTGATGCTTTG..................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGCCTGAGTTCTCTTTGAAT................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CAGTCACTACCTCTTCTGAGAC............................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................ATTAGTTGGAGCACGGCTT..................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGTT............................................................................................................................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ATGATGATTTCTGATGCTTTGC.................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGaa........................................................................................................................................ 23 aa 1.00 317.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CAGCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGAC............................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGATGATTTCTGATGCTTTGCCT.................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TGATGCTTTGCCTGAGTTCTCT......................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CAATGATGATTTCTGATG.......................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTTCTGATGCTTTGCCTGAGTT............................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGCCTGAGTTCTCTTTGAATAATG............................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TCTTTGAATAATGAGGGCAG........................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TAAGGACTAAAGACCATGTGTTCAATG....................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTa...................................................................................................................................... 25 a 1.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GAGAATTAGTTGGAGCACG......................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AATGAGGGCAGCTTCAGTC................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CAGTCACTACCTCTTCTGAGACAC............................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TGAGTTCTCTTTGAATA.................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TCAATGATGATTTCTGA............................................................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGTTCTC.......................................................................................................................... 37 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AATAATGAGGGCAGCTTCAGTCACTAC........................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGAATTAGTTGGAGCACGGCTTATTG................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TCACTACCTCTTCTGAGACA.............................................................................. 20 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GCCTGAGTTCTCTTTGAA.................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TCAGTCACTACCTCTTCTGAGAC............................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CCTGAGTTCTCTTTGAATAATGAGGGC.......................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CATGGTTGGAGAATTAGTTGGAGCACGG........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CTGAGTTCTCTTTGAATAA................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GCAGCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGACA.............................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTTCTGATGCTTTGCCTGA................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGAATAATGAGGGCAGCTTCAGT................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CTTCTGAGACACCGTGa........................................................................ 17 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................CTTTGAATAATGAGGGCA......................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTG................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CCTGAGTTCTCTTTGAATAATGAGG............................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CAGTCACTACCTCTTCTGAG................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGctgc......................................................................................................................................... 22 ctgc 1.00 126.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CTGAGTTCTCTTTGAATAATG............................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GAATAATGAGGGCAGCTTCAGTCA............................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGc............................................................................................................................................ 19 c 1.00 126.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGTCATGGTTGGAGAATTAGTTGGAGC............................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGACAC............................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................................................................................................................CTGAGTTCTCTTTGAATAATGAG............................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................ATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGTTC............................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGAaaaa........................................................................................................................................ 23 aaaa 1.00 268.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TCTGAGACACCGTGGa....................................................................... 16 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TTTGAATAATGAGGGCAGCTTC.................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGATGATTTCTGATGCTTTGCCTG................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CCTGAGTTCTCTTTGAATA.................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GAGGGCAGCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................ATTAGTTGGAGCACGGCTTATTGCTCA............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TTGAATAATGAGGGCAGCTT..................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GCAGCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTTCTGATGCTTTGCCTGAGTTa............................................................................................................................ 23 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....TCATGGTTGGAGAATTAGTTGGAGCACGGC....................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................CTCTTTGAATAATGAGGGC.......................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CTGAGTTCTCTTTGAATA.................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................CTCTTTGAATAATGAGG............................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGCCTGAGTTCTCTTTGAATA.................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTTGCCTGAGTTCTCTTTGAATAATGAGGG........................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TCTTTGAATAATGAGGGCAGCT...................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAG............................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGagt.................................................................................................................................. 29 agt 1.00 36.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................ACTACCTCTTCTGAGAC............................................................................... 17 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGTTa............................................................................................................................ 35 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GTTGGAGCACGGCTTATTGCTCATGCAGG....................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTcag............................................................................................................................... 32 cag 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGCTTTGCCTGAGTTCTCTTTGAA.................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGcgt.............................................................................................................................. 33 cgt 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TCATGGTTGGAGAATTAGTTGGAGCACGGCT...................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGACAC............................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ATGGTTGGAGAATTAGTTGGAGCACGGCT...................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTTTAATGTGATTTGggaa.............................................................................................................................................................................. 19 ggaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGctg.......................................................................................................................................... 21 ctg 1.00 126.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................AGTTCTCTTTGAATAATGAGGG........................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGATaaaa....................................................................................................................................... 24 aaaa 1.00 29.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAtt.............................................................................................................................. 32 tt 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGGAGAATTAGTTGGAGCACGGCTT..................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGACA.............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AATGATGATTTCTGATGCTTTGCCT.................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TTGCCTGAGTTCTCTTTGA..................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GAATAATGAGGGCAGCTTCAGTC................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGTCATGGTTGGAGAATTAGTTGGAGa............................................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGATGCTTgag.................................................................................................................................... 26 gag 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTGttgc......................................................................................................................................... 22 ttgc 1.00 126.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................ATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGTTCT........................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTG............................................................................................................................................. 17 3 0.67 0.67 - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TCAGTCACTACCTCTT...................................................................................... 16 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TACCTCTTCTGAGACAC............................................................................. 17 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TCACTACCTCTTCTGAGAC............................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTat............................................................................................................................................ 19 at 0.50 4.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTCTcatg.......................................................................................................................................... 21 catg 0.50 4.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CACTACCTCTTCTGAGAC............................................................................... 18 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GAATAATGAGGGCAGCT...................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AATGATGATTTCTGAT........................................................................................................................................... 16 5 0.40 0.40 - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTTCAATGATGATTTatg............................................................................................................................................. 18 atg 0.38 4.62 - - 0.12 - - 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................GAGTTCTCTTTGAATA.................................................................................................................. 16 3 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGATGATTTCTGATGC......................................................................................................................................... 16 3 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CACTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 17 3 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTCAATGATGATTTCTGgtg.......................................................................................................................................... 20 gtg 0.33 0.67 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CAATGATGATTTCTGA............................................................................................................................................ 16 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................ACTACCTCTTCTGAG................................................................................. 15 8 0.12 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TTTGAATAATGAGGG........................................................................................................... 15 10 0.10 0.10 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CTACCTCTTCTGAGA................................................................................ 15 14 0.07 0.07 - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TACAGTCATGGTTGGAGAATTAGTTGGAGCACGGCTTATTGCTCATGCAGGTGACAGTTTTAATGTGATTTGTAAGGACTAAAGACCATGTGTTCAATGATGATTTCTGATGCTTTGCCTGAGTTCTCTTTGAATAATGAGGGCAGCTTCAGTCACTACCTCTTCTGAGACACCGTGGTCCTTGGTCAAAAGGATAAAATTAGTTCACATTATCATGTTTAAGTCTTAAGCTCAGTCCTCAGGATCAAAA
.........................................................................................(((((((..((......((((.((..(((((..((((.....)))).....))))))).))))........))...)))).))).............................................................................
......................................................................................87.....................................................................................174..........................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
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Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
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16.5 dpc total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
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16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037900(GSM510436)
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Ovary total. (ovary) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)