(5)
OTHER.mut
(6)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(33)
TESTES

Sense strand
CATAGCCTTACTAGCAAAAGTTAAATGGCTCAAGAAGTGATTATACTTCTGTTGAGGTGGGATTTGTGTGATGGAACATCACTTACAGTGGGTGATTGGTAATTTTTTTCATTGTTAGTATTTGTCTCTCCTTAAATATTGTCTCTTGAGTAAAACTTGCTGTAATGATGACATATCTACCTACTTATTTTTACTTTCAGTAAACATGGAGAGCCCAGTCCATTTTACTGAAGTTGTATTCATCTTCAGC
.....................................................................((((...(((((.((((((..(((..............((((....(((((((((........))))))))).....))))....)))..)))))))))))...)))).........................................................................
..........................................................59....................................................................................................................177.......................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
..................................................................................................................................................TGAGTAAAACTTGCTGTAATGATGACA............................................................................. 27 1 18.00 18.00 6.00 4.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..................................................................................................................................................TGAGTAAAACTTGCTGTAATGATGACAT............................................................................ 28 1 12.00 12.00 3.00 6.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAGTAAAACTTGCTGTAATGATGACATA........................................................................... 29 1 7.00 7.00 1.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AAACTTGCTGTAATGATGACATATCTACC..................................................................... 29 1 6.00 6.00 3.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAGTAAAACTTGCTGTAATGATGAC.............................................................................. 26 1 5.00 5.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAAAACTTGCTGTAATGATGACATATCTACCT.................................................................... 32 1 5.00 5.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAGTAAAACTTGCTGTAATGATGACt............................................................................. 27 t 4.00 5.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AAACTTGCTGTAATGATGACATATCTACCT.................................................................... 30 1 4.00 4.00 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TACTTCTGTTGAGGTGGGATTTGTGT..................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAAAACTTGCTGTAATGATGACATATCT........................................................................ 28 1 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TTGCTGTAATGATGACATATCTACCTA................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAAAACTTGCTGTAATGATGACATATCTAC...................................................................... 30 1 3.00 3.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAAAACTTGCTGTAATGATGACATATCTACC..................................................................... 31 1 3.00 3.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................GGGATTTGTGTGATGGAAC............................................................................................................................................................................. 19 1 3.00 3.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGCTGTAATGATGACATATCTACCTA................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TATACTTCTGTTGAGGTGGGATTTGTG...................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TACTTCTGTTGAGGTGGGATTTGTGTGt................................................................................................................................................................................... 28 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TACTTCTGTTGAGGTGGGATTTGTG...................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AAAACTTGCTGTAATGATGACATATCTAC...................................................................... 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................CTTGAGTAAAACTTGCTGTAATGATGAC.............................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGAGGTGGGATTTGTGTGA................................................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TTGTGTGATGGAACATCACTTACAGTG................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................GAGTAAAACTTGCTGTAATGATGACAT............................................................................ 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................CTTCTGTTGAGGTGGGATTTGTGTGA................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GTAAAACTTGCTGTAATGATGACATA........................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGTTGAGGTGGGATTTGTGTGATGG................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................ACTTGCTGTAATGATGACATATCTACCT.................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TACAGTGGGTGATTGGTAATTTTT............................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TACTAGCAAAAGTTAAATGGCTCAAGAA...................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAGTAAAACTTGCTGTAATGATGACATt........................................................................... 29 t 1.00 12.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................ACAGTGGGTGATTGGTAATTTTTTTCATTG........................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................AACTTGCTGTAATGATGACATATCTAC...................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TACTTTCAGTAAACATGGAGAGCC................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...................................................................................................TAATTTTTTTCATTGTTAGTATTTGTCTCT......................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TAGCAAAAGTTAAATGGCTCAAGAAGTGt.................................................................................................................................................................................................................. 29 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGATTATACTTCTGTTGAGGTGGGATT.......................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................AACTTGCTGTAATGATGACATATCTACC..................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TAAATGGCTCAAGAAGTGATTATACTTC......................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...............................................TCTGTTGAGGTGGGATTTGTGTGATGGA............................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.............GCAAAAGTTAAATGGCTCAAGAAGTG................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................AACTTGCTGTAATGATGACATATCTACtt.................................................................... 29 tt 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AAACTTGCTGTAATGATGACATATCTAC...................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AAAAGTTAAATGGCTCAAGA....................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.......................................................................................................................................................AAAACTTGCTGTAATGATGACATATCTACCTA................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.......................................................................................................................................................AAAACTTGCTGTAATGATGACATATCTA....................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................ATTTGTCTCTCCTTAAATATTGTCTCT........................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGCTGTAATGATGACATATCTACCTACT................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGACATATCTACCTACTTATTTTTACTTT..................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TTGCTGTAATGATGACATATCTACCT.................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TAGCAAAAGTTAAATGGCTCAAGAAGTG................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................AAAGTTAAATGGCTCAAGAAGTGAT................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TTCAGTAAACATGGAGAGCCCAGTCC............................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGTTGAGGTGGGATTTGTGTGATGGA............................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................GAGTAAAACTTGCTGTAATGATGACATATCaa....................................................................... 32 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.................................................TGTTGAGGTGGGATTTGTGTGATG................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................AGTAAAACTTGCTGTAATGATGACATAT.......................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAAAACTTGCTGTAATGATGACATATCTA....................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AAAACTTGCTGTAATGATGACATATCTACC..................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AAAACTTGCTGTAATGATGACATATCTACCT.................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TTGAGTAAAACTTGCTGTAATGATGACA............................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TACAGTGGGTGATTGGTAATTTTTTTCA........................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGGGATTTGTGTGATGGAACATCACTT...................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.........................................................................................................................................................AACTTGCTGTAATGATGACATATCTACCT.................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TTAGTATTTGTCTCTCCTTAAATATT.............................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CATAGCCTTACTAGCAAAAGTTAAATGGCTCAAGAAGTGATTATACTTCTGTTGAGGTGGGATTTGTGTGATGGAACATCACTTACAGTGGGTGATTGGTAATTTTTTTCATTGTTAGTATTTGTCTCTCCTTAAATATTGTCTCTTGAGTAAAACTTGCTGTAATGATGACATATCTACCTACTTATTTTTACTTTCAGTAAACATGGAGAGCCCAGTCCATTTTACTGAAGTTGTATTCATCTTCAGC
.....................................................................((((...(((((.((((((..(((..............((((....(((((((((........))))))))).....))))....)))..)))))))))))...)))).........................................................................
..........................................................59....................................................................................................................177.......................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248523(GSM733811)
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SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029040(GSM433292)
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SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.................................................................................ACAGTGGGTGATTGtcc........................................................................................................................................................ 17 tcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -