(7)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(3)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(21)
TESTES

Sense strand
ATCTGGCATCAAATCCTAGTTTTGCCACAAATTATGATATGATAGCATATTACCAAGACTTTATGCTTTTTCATTTATAGAATGGGAATAATACCATCTGCTTATATGAGTATTGAGGGCTTCAGTCCACATGACACACAGAGAAATATTCAGGACAAACCAGCTTTCGATGAATATCAACTGCCCTTTTTCTTTTTTAGAATTCCAGATGCATTTCCTGAAGACACTGGCTCTAGATGGTGAAATAATC
..........................................................................................................((((((((..((((....))))...((.....))....))))))))..................................................................................................
...................................................................................................100.............................................................163.....................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
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testes_rep4. (testes)
........................................................................................................TATGAGTATTGAGGGCTTCAGTCCAC........................................................................................................................ 26 1 8.00 8.00 - 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGAATTCCAGATGCATTTCCTGAAG........................... 26 1 7.00 7.00 - - - - - 4.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TTCAGGACAAACCAGCTTTCGATGAA............................................................................ 26 1 6.00 6.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - -
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...................................................................................................................................TGACACACAGAGAAATATTCAGGACAAA........................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGAATTCCAGATGCATTTCCTGAAGAC......................... 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TCCTGAAGACACTGGCTCTAGATGG.......... 25 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGAATTCCAGATGCATTTCCTGAAGACA........................ 29 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TATGAGTATTGAGGGCTTCAGTCCACA....................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGAAGACACTGGCTCTAGATGG.......... 22 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCTTTTTCATTTATAGAATGGGAATA................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TATTCAGGACAAACCAGCTTTCGATGAA............................................................................ 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TGACACACAGAGAAATATTCAGGACAAAC.......................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TTCAGGACAAACCAGCTTTCGATGAATA.......................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TATGAGTATTGAGGGCTTCAGTCCA......................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
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..........................................................................................................................................................................................................................TGAAGACACTGGCTCTAGATGGTGAA...... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TCCTGAAGACACTGGCTCTAGATGGT......... 26 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.....................................................................................................TTATATGAGTATTGAGGGCTTCAGT............................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
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..................................................................................................TGCTTATATGAGTATTGAGGGCTTC............................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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......................TGCCACAAATTATGATATGATAGCATA......................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
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Antisense strand
ATCTGGCATCAAATCCTAGTTTTGCCACAAATTATGATATGATAGCATATTACCAAGACTTTATGCTTTTTCATTTATAGAATGGGAATAATACCATCTGCTTATATGAGTATTGAGGGCTTCAGTCCACATGACACACAGAGAAATATTCAGGACAAACCAGCTTTCGATGAATATCAACTGCCCTTTTTCTTTTTTAGAATTCCAGATGCATTTCCTGAAGACACTGGCTCTAGATGGTGAAATAATC
..........................................................................................................((((((((..((((....))))...((.....))....))))))))..................................................................................................
...................................................................................................100.............................................................163.....................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
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mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
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cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
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10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014234(GSM319958)
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mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
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mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
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Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
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testes_rep4. (testes)
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