(8)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(8)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(37)
TESTES

Sense strand
TACCTTTAAGTAAGGTGTGTATAACGTGAAGGTTGTGGGCATGAACGCTGCATCTCCAGTAGAGCTTTCGGGAACGACGGAGATGCTAGATGCTGCCGGTTTGAGTGGGTGACAGTTTTAACGTAGTTCTGAGCACCTAGTGTGTGTGATACATCACCAGGAAGTTTTTTGACCTACTAGTAATTCTCTACAAACAACAGAGAGAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAACCCTTAAGAAAAAGG
..................................................(((((..((((...((.(((....))).))...))))))))).............((((((.(((..(((...)))..)))..))))))...............................................................................................................
..................................................51.........................................................................................142..........................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
......................................................TCCAGTAGAGCTTTCGGGAACGACGG.......................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TCCAGTAGAGCTTTCGGGAACGACGGA......................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TAGAGCTTTCGGGAACGACGGAGAT...................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GAGAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGT....................... 26 9 2.33 2.33 0.44 0.11 0.22 0.11 - - 0.33 - - - - 0.11 0.11 - - - - 0.22 0.11 - 0.22 - - - - - - - - 0.11 - - - 0.11 - - - 0.11
......TAAGTAAGGTGTGTATAACGTGAAGGT......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TACAAACAACAGAGAGAAGAAAAAGAA................................... 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................GAGCTTTCGGGAACGACGGAGATGC.................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GAGAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTG...................... 27 8 1.75 1.75 - - 0.12 - - - 0.12 - - - 0.88 - - - - - - 0.12 - - - - 0.12 - - - - - - 0.12 - - 0.25 - - - - -
...................................................................................................................TTTTAACGTAGTTCTGAGCACCTAGTG............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TAACGTAGTTCTGAGCACCTAGTGTGT......................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AGTAGAGCTTTCGGGAACGACGGAG........................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................ATGCTGCCGGTTTGAGTGG.............................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................ACCTACTAGTAATTCTCTACAAACAACAG.................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................GACCTACTAGTAATTCTCTACAAACAACAG.................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................CAGTAGAGCTTTCGGGAACGACGGA......................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGt..................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......TAAGTAAGGTGTGTATAACGTGAAG........................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................GTAGAGCTTTCGGGAACGACGGAG........................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGgc.................... 27 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAACt............. 32 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGCTGCCGGTTTGAGTGGG............................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGAGTGGGTGACAGTTTTAACGTAGTT.......................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGca............... 29 ca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................ATCTCCAGTAGAGCaaaa..................................................................................................................................................................................... 18 aaaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................CTGCCGGTTTGAGTtgtg............................................................................................................................................ 18 tgtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TGACCTACTAGTAATTCTCTACA.......................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TGAAGGTTGTGGGCATGAACGCTG........................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCgag.................. 26 gag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAG.................. 26 7 1.00 1.00 0.29 0.14 - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - -
...........................................................TAGAGCTTTCGGGAACGACGGAGATG..................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGTATAACGTGAAGGTTGTGGGCATG............................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GGGTGACAGTTTTAACGTAGTTCTGAG..................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGATGCTGCCGGTTTGAGTGGGTGAC......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TTGACCTACTAGTAATTCTCTACAAACAACAG.................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAG.................. 27 7 0.71 0.71 0.29 - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAAC.............. 27 6 0.67 0.67 0.17 - - - - 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCC.................... 27 8 0.62 0.62 0.38 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AGAGAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGT....................... 27 8 0.62 0.62 - - - - - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGCCACTGTGCCAGGAACCCTTAAGAAA.... 28 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - 0.20 - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGCCACTGTGCCAGGAACCCTTAAG....... 25 5 0.60 0.60 - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAA............... 26 6 0.50 0.50 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AGAGAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTG...................... 28 7 0.43 0.43 - - - 0.14 - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................CTGTGCCAGGAACCCTTAA........ 19 5 0.40 0.40 - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TGTGCCAGGAACCCTTAAG....... 19 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGCCACTGTGCCAGGAACCCTTAAGAA..... 27 5 0.40 0.40 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GCCACTGTGCCAGGAACCCTTAAGA...... 25 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCA................... 28 8 0.38 0.38 0.12 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCA................... 25 8 0.38 0.38 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AGAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGC..................... 27 8 0.38 0.38 - - - - - - 0.25 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGC..................... 26 8 0.38 0.38 - - - - - 0.25 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCA................... 27 8 0.38 0.38 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAAC.............. 30 6 0.33 0.33 - - 0.17 - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAACC............. 28 6 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGG................. 26 6 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGA................ 26 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - 0.17 -
.................................................................................................................................................................................................................AAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAACCC............ 29 6 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAG.................. 28 7 0.29 0.29 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AGAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTG...................... 26 8 0.25 0.25 0.12 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GAGAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGC..................... 28 8 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AGAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGT....................... 25 9 0.22 0.22 - - - - - - - - 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGCCACTGTGCCAGGAACCCTTAAc....... 25 c 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CACTGTGCCAGGAACCCTTAAGAAAAAG. 28 5 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AGGAACCCTTAAGAAA.... 16 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGCCACTGTGCCAGGAACCCTTAA........ 24 5 0.20 0.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGCCACTGTGCCAGGAACCCTTAAGA...... 26 5 0.20 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GTTGCCACTGTGCCAGGAACCCTTA......... 25 5 0.20 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAAC.............. 28 6 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGA................ 25 6 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAACCCT........... 31 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAAC.............. 26 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAACCCT........... 30 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAAC.............. 25 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGG................. 25 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAACC............. 27 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAG.................. 29 7 0.14 0.14 - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGC..................... 25 8 0.12 0.12 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCC.................... 26 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AAGGTTGCCACTGTGCCA................... 18 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GAAGGTTGCCACTGTGCCA................... 19 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AGAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCC.................... 28 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GAGAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGt..................... 28 t 0.12 1.75 - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAAAAAGAAGGTTGCCACTGT....................... 21 9 0.11 0.11 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AGAAAAAGAAGGTTGCCACTG........................ 21 10 0.10 0.10 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GAGAAGAAAAAGAAGGTTGCCAC.......................... 23 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAAGAAGGTTGCCACT......................... 16 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TACCTTTAAGTAAGGTGTGTATAACGTGAAGGTTGTGGGCATGAACGCTGCATCTCCAGTAGAGCTTTCGGGAACGACGGAGATGCTAGATGCTGCCGGTTTGAGTGGGTGACAGTTTTAACGTAGTTCTGAGCACCTAGTGTGTGTGATACATCACCAGGAAGTTTTTTGACCTACTAGTAATTCTCTACAAACAACAGAGAGAAGAAAAAGAAGGTTGCCACTGTGCCAGGAACCCTTAAGAAAAAGG
..................................................(((((..((((...((.(((....))).))...))))))))).............((((((.(((..(((...)))..)))..))))))...............................................................................................................
..................................................51.........................................................................................142..........................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
..................................................CATCTCCAGTAGAGCTTTCGGGAACGA............................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................CATCTCCAGTAGAGCTTT...................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GCCGGTTTGAGTGGGTGACAGTTTTA.................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................AGTTCTGAGCACCTtaaa................................................................................................................ 18 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGCCGGTTTGAGTGGGTGACAGTTTTA.................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GCCACTGTGCCAGGAACCCTTAAGAA..... 26 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - -