chr1:16091391 16091857 -
(1)
OTHER.ip 		(8)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(52)
TESTES

Sense strand
TGGCAACAGGGAAGACCAGATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGGTAAGAAGTTAGTGTTGTTTTTTGAGACAGAATCTATTTCTGGCAATCGCAAAACTATGTGTAGACTCACCTAGTTTTGAATTCAAAACTTGATTGACGGCTTTTCTGTTGAGTGCGGATTGGGTATATTGTTAAGTGTTTTTTGTTTTGTGTTTTTTGAGAGGGGGTTTGTCTGTATAACTCAAATCCGCCTGCCTCTGCCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCGTGTGCCCCCACGCCCGACCAGACATTACATTTTACTTTGGGGAAATGTGTCTTTAATGGAAGTGTGCTCCTTTACGGGGGGGTGCTGATGTGCGGCTTGGAAGACAGTCTCTAACTCGTGTGTTTTTTCCCTTTCAGGTGTCACCCATTGTATTTTTGTAATCTGGTCAGTTAATAAACAGTCACAG


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 163.00 163.00 - 51.67 46.33 23.17 16.17 16.83 0.17 - - 0.33 0.33 1.83 1.33 0.33 0.17 - 1.33 0.17 0.17 - 0.33 - 0.50 - 0.33 - - 0.17 - - - - - - - - 0.17 - 0.17 - 0.17 0.17 - - - 0.33 - - - - 0.17 0.17 - -
.............................................................................CAGAATCTATTTCTGGCAATCGCAAAACTATGTGTAGACTCACCTAGTTTTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 52 1 137.00 137.00 137.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 41.83 41.83 - 12.67 11.83 3.33 5.33 4.50 - - 0.17 0.17 - 1.83 - - 0.17 - 0.33 0.17 0.17 - 0.17 0.17 - - - - - - - - - 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - 0.17 0.17 - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 6 39.50 39.50 - 12.83 10.33 5.67 4.00 4.50 - - - - - - 0.33 0.17 0.17 - - 0.17 0.17 - 0.33 - - - - - 0.17 - 0.17 - - - - - - - 0.17 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 6 14.33 14.33 - 0.50 0.33 7.83 0.17 0.67 - - 0.67 - - - - 0.50 0.17 - - 0.17 0.17 - 0.50 - - - - 0.50 0.50 - 0.83 - 0.50 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 10.67 10.67 - 3.00 3.33 1.67 0.33 0.83 - - 0.17 0.17 - 0.17 - - 0.17 - 0.17 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GTTGAGTGCGGATTGGGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 7.00 7.00 - - - - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 t 6.83 163.00 - 2.17 3.17 0.17 0.83 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAAC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 6 5.33 5.33 - 2.67 0.83 0.33 0.17 0.50 - - - - - - - - 0.17 - 0.33 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 6 4.83 4.83 - 2.00 1.00 1.33 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 t 4.17 14.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - 0.67 0.67 - 0.17 - 0.50 - - - - - - 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTTTTTGAGAGGGGGTgt....................................................................................................................................................................................................................................................... 18 gt 4.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 6 3.83 3.83 - 1.17 0.83 0.50 0.33 0.17 - - - - - - 0.17 - 0.17 - - 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 6 3.67 3.67 - - - 1.17 - - - - 0.17 - - - 0.50 0.50 - - - - 0.17 - 0.17 - - - - 0.17 0.17 - 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAAC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 3.67 3.67 - 0.83 1.00 1.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 3.67 10.67 - 0.50 1.00 1.67 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 6 3.50 3.50 - 0.67 0.67 0.50 0.50 0.50 - - - - 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 6 2.67 2.67 - 0.67 0.67 0.83 - - - - - - - - - - 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 2.67 2.67 - 0.33 0.33 0.17 0.33 0.33 - - - 0.17 - 0.33 0.33 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - -
......................AACAGGCTTATTAGACGGATGAACTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 6 2.67 2.67 - 0.17 0.83 0.67 - 0.17 - - - - - - 0.17 - 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 6 2.50 2.50 - 0.67 0.17 1.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 6 2.33 2.33 - 0.67 0.50 0.33 0.17 0.33 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTTTTTGAGAGGGGGTgtt...................................................................................................................................................................................................................................................... 19 gtt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GACCAGATAAACAGGCTTATTAGACGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 1.83 1.83 - 0.33 0.50 0.17 0.33 - 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - -
......................AACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 6 1.83 1.83 - 0.50 0.33 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - 0.17 - - 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GATAAACAGGCTTATTAGACGGATGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 6 1.67 1.67 - 0.33 0.50 0.50 - - 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GATAAACAGGCTTATTAGACGGATG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 6 1.67 1.67 - 0.17 0.33 - - - 0.33 - - - 0.17 0.17 - - 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................ATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAAC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 1.67 1.67 - 0.33 0.67 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 6 1.50 1.50 - 0.50 0.17 0.50 - - - - - - - - 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 6 1.50 1.50 - 0.50 0.33 0.33 - 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GGCTTATTAGACGGATGAACTAAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 6 1.33 1.33 - 0.50 - 0.33 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTATTTTTGTAATCTGGTCAGTTAA............. 27 4 1.25 1.25 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAACT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 6 1.17 1.17 - 0.33 0.50 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.17 5.33 - 0.33 0.50 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GCTTATTAGACGGATGAACTAAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 7 1.14 1.14 - 0.29 0.29 0.29 - 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGcgtg........................................................................................................................................................................................... 28 cgtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAACTCGTGTGTTTTTTCCCTTTCAG.................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTAATCTGGTCAGTTAATAAACAGcc.... 27 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGcac..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 cac 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TGATTGACGGCTTTTCTGTTGAGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCGTagt....................................................................................................................................................................................... 27 agt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTATTAGACGGATGAACTAtt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 tt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAcct.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 cct 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTAACTCGTGTGTTTTTTCCCTTTCAG.................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TCTGGCAATCGCAAAACTATGTGTAGACT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................TGCCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAGGata.............................................................................................................................................................................................. 29 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GGAAGACCAGATAAACAGGCTTATTAGt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGGCTTGGAAGACAGTC.............................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ACAGGCTTATTAGACGGATGAAata................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TAGACGGATGAACTAAacc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 acc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTTGTAATCTGGTCAGTTAATAAcag....... 28 cag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 41.83 - 0.50 - 0.17 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCGTGCGTatta...................................................................................................................................................................................... 23 atta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GACGGATGAACTAAGGTAAGAAGTgtc..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gtc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................ATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 6 1.00 1.00 - - 0.33 0.50 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AACAGGCTTATTAGACGGATGAACT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 6 0.83 0.83 - - - - - - 0.17 - - - - 0.17 - - - - 0.33 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 6 0.83 0.83 - 0.33 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 t 0.83 39.50 - 0.33 0.17 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 6 0.83 0.83 - - 0.33 0.17 - - - - - - - - - - 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTATTTTTGTAATCTGGTCAGTTAAT............ 28 4 0.75 0.75 - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTATTTTTGTAATCTGGTCAGTT............... 25 4 0.75 0.75 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTATTTTTGTAATCTGGTCAGTTA.............. 26 4 0.75 0.75 - 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 t 0.67 1.83 - - 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 6 0.67 0.67 - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................ATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.67 0.67 - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 t 0.67 4.83 - 0.17 - 0.33 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CAGATAAACAGGCTTATTAGACGGATG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 6 0.50 0.50 - 0.17 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 6 0.50 0.50 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............AGACCAGATAAACAGGCTTATTAGACGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.50 0.50 - - 0.17 - 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 6 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 6 0.50 0.50 - 0.17 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 t 0.50 2.67 - - - 0.33 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.50 0.50 - 0.17 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GGCTTATTAGACGGATGAACTAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 6 0.50 0.50 - - 0.17 - - 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.50 0.50 - 0.17 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TAGACGGATGAACTAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 9 0.44 0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.44 - - - - - - - - - - - - - -
.................................TAGACGGATGAACTAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 9 0.44 0.44 - - - - - - - - - - - - 0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CTTATTAGACGGATGAACTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 8 0.38 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGATAAACAGGCTTATTAGACGGATG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 6 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAAata................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 ata 0.33 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACc.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 c 0.33 5.33 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAtt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tt 0.33 10.67 - 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACaa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 aa 0.33 5.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 g 0.33 41.83 - 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ACCAGATAAACAGGCTTATTAGACGGAT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.33 0.33 - 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ACCAGATAAACAGGCTTATTAGACGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 6 0.33 0.33 - - 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ACCAGATAAACAGGCTTATTAGACGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.33 0.33 - 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAAC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.33 0.33 - 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GCAACAGGGAAGACCAGATAAACAGGCTT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - - - - -
...CAACAGGGAAGACCAGATAAACAGGCT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 7 0.29 0.29 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GGAAGACCAGATAAACAGGCTTATTAGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - 0.14
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCACCCATTGTATTTTTGTAATCTGGTCAGTT............... 33 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - -
............................CTTATTAGACGGATGAACTAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTATTTTTGTAATCTGGTCAGTTAATAAA......... 30 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - -
................CAGATAAACAGGCTTATTAGACGGATGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.17 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 tt 0.17 14.33 - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GATAAACAGGCTTATTAGACGGAT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAaa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 aa 0.17 39.50 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAtt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 tt 0.17 163.00 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 6 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGGCTTATTAGACGGATGAACTAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTtt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tt 0.17 41.83 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAAt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 0.17 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GACCAGATAAACAGGCTTATTAGACG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GGCTTATTAGACGGATGAACTAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 6 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AACAGGCTTATTAGACGGATGAACTt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 0.17 0.83 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGGa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 a 0.17 3.67 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 0.17 0.83 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAcg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 cg 0.17 163.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 0.17 1.67 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGGCTTATTAGACGGATGAACTAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AAGACCAGATAAACAGGCTTATTAGACGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 0.17 2.67 - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 a 0.17 14.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GATAAACAGGCTTATTAGACGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AACAGGCTTATTAGACGGATGAAC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - -
......................AACAGGCTTATTAGACG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 17 6 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAtc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tc 0.17 10.67 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGATAAACAGGCTTATTAGACGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 ttt 0.17 10.67 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................ATAAACAGGCTTATTAGACGGATGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTcagg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 cagg 0.17 41.83 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............AGACCAGATAAACAGGCTTATTAGACGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CCAGATAAACAGGCTTATTAGACGGATG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 6 0.17 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ACAGGCTTATTAGACGGATGAACT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAAtta................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tta 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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....................TAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 a 0.17 39.50 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTTGTAATCTGGTCAGTTAATAAAC........ 27 12 0.17 0.17 - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - -
..................GATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAAa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 a 0.17 0.33 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 0.17 1.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGGCTTATTAGACGGAT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 -
.....................AAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAtt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 tt 0.17 4.83 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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......................AACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 a 0.17 3.67 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CAGGCTTATTAGACGGATGAACT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - -
.................AGATAAACAGGCTTATTAGACGGATGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGGg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 g 0.17 3.50 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGGCTTATTAGACGGATG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 6 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CAGATAAACAGGCTTATTAGACGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 6 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CCAGATAAACAGGCTTATTAGACGGAT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 32 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...CAACAGGGAAGACCAGATAAACAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - -
...........................GCTTATTAGACGGATGAACTAAGGTgaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 gaa 0.14 1.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...........................GCTTATTAGACGGATGAACTAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 7 0.14 0.14 - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AACAGGGAAGACCAGATAAACAGGCTTATT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.....ACAGGGAAGACCAGATAAACAGGCTTATTAGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 32 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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..............................TATTAGACGGATGAACTAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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............................CTTATTAGACGGATGAACTAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 8 0.12 0.12 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTATTAGACGGATGAACTAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - -
..................................AGACGGATGAACTAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 17 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - -
...............CCAGATAAACAGGCTTATT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............AGACCAGATAAACAGGCTTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 10 0.10 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.....................................................................TTTTGAGACAGAATCTAT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTTGTAATCTGGTCAGTTAATAAACAG...... 29 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAATCTGGTCAGTTAATAAACA....... 30 11 0.09 0.09 - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTAATCTGGTCAGTTAATAAACAGT..... 27 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAATCTGGTCAGTTAATAA.......... 27 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTAATCTGGTCAGTTAATAAACAGTC.... 27 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAATCTGGTCAGTTA.............. 23 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAATCTGG..................... 16 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGGCAACAGGGAAGACCAGATAAACAGGCTTATTAGACGGATGAACTAAGGTAAGAAGTTAGTGTTGTTTTTTGAGACAGAATCTATTTCTGGCAATCGCAAAACTATGTGTAGACTCACCTAGTTTTGAATTCAAAACTTGATTGACGGCTTTTCTGTTGAGTGCGGATTGGGTATATTGTTAAGTGTTTTTTGTTTTGTGTTTTTTGAGAGGGGGTTTGTCTGTATAACTCAAATCCGCCTGCCTCTGCCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCGTGTGCCCCCACGCCCGACCAGACATTACATTTTACTTTGGGGAAATGTGTCTTTAATGGAAGTGTGCTCCTTTACGGGGGGGTGCTGATGTGCGGCTTGGAAGACAGTCTCTAACTCGTGTGTTTTTTCCCTTTCAGGTGTCACCCATTGTATTTTTGTAATCTGGTCAGTTAATAAACAGTCACAG


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
.............................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCTGCCTTCCAAGTGCTctgt............................................................................................................................................................................................................ 26 ctgt 5.00 0.00 - 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................CCGCCTGCCTCTGCCTTCCAAGgg................................................................................................................................................................................................................ 24 gg 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................GCCTCTGCCTTCCAAGTGCTGGGATTAta..................................................................................................................................................................................................... 29 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................CCGCCTGCCTCTGCCTTCCAAGTGgtg.............................................................................................................................................................................................................. 27 gtg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................GCCTGCCTCTGCCTTCCAAGTGCTGGtt.......................................................................................................................................................................................................... 28 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAtat................................................................................................................................................................................................... 28 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTTCCAAGTGCTGGtacg.......................................................................................................................................................................................................... 22 tacg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................GCCTCTGCCTTCCAAGTGCTGGGATTAtt..................................................................................................................................................................................................... 29 tt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAtt................................................................................................................................................................................................... 27 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TGCCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAttt................................................................................................................................................................................................... 27 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCTGCCTTCCAAGTGCTctc............................................................................................................................................................................................................ 25 ctc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTTCCAAGTGCTGGGATTAtt..................................................................................................................................................................................................... 25 tt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCTGCCTTCCAAGTGCTctta............................................................................................................................................................................................................ 26 ctta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................GCCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAggtg................................................................................................................................................................................................... 27 ggtg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAac................................................................................................................................................................................................... 28 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCTGCCTTCCAAGTGCctgt............................................................................................................................................................................................................. 25 ctgt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................CGCCTGCCTCTGCCTTCCAAGTGtt.............................................................................................................................................................................................................. 25 tt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................CCGCCTGCCTCTGCCTTCCAAGTGgtaa.............................................................................................................................................................................................................. 28 gtaa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTTTGTGTTTTTTGAtacg................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 tacg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................CCGCCTGCCTCTGCCTTCCAAggt................................................................................................................................................................................................................. 24 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAgggt................................................................................................................................................................................................... 26 gggt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTAATCTGGTCAGTTAATAAACAGTCACA. 29 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -