| (2) AGO1.ip | (1) AGO2.ip | (7) B-CELL | (4) BRAIN | (4) CELL-LINE | (2) DCR.mut | (4) EMBRYO | (11) ESC | (2) HEART | (1) KIDNEY | (2) LIVER | (1) LUNG | (5) LYMPH | (16) OTHER | (4) OTHER.mut | (1) PIWI.ip | (11) SPLEEN | (8) TESTES | (4) THYMUS | (2) TOTAL-RNA |
| CTAGTCACTTCCTTCCCACCCCTGAGGCAGCCAGACCTGCTCCCCATCCCGTGAGTATCCCCCAACTCCGTCCCTTGGGTCTACTGTGCCTCTCCACCTTCTAGGTTGGGGAGGCGCTTTTTCCTGGTTGTCTTGCTCCCAGAGTCCTACCTAGACGTAATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGGAGATCCCCACAGCCCCTTGGGGGTTCCCATCGGATGCCATCTTCCCAGC .....................................................((((...(((((.........)))))..))))(((((((((((((.....))).))))))))))......((((..(((.......(((((...(((......)))..)))))......)))..)))).................................................. ..................................................51................................................................................................................................181................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR042464(GSM539856) mouse CD4+CD8+ T cells (thymus) [09-002]. (thymus) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR042466(GSM539858) mouse CD8+ T cells (spleen) [09-002]. (spleen) | SRR042470(GSM539862) mouse Th17 cells [09-002]. (lymph) | SRR042468(GSM539860) mouse Th1 cells [09-002]. (lymph) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR042465(GSM539857) mouse CD4+ T cells (spleen) [09-002]. (spleen) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | SRR042458(GSM539850) mouse basophil cells [09-002]. (b cell) | SRR042467(GSM539859) mouse T cells activated in vitro with Concanavalin A [09-002]. (spleen) | SRR059766(GSM562828) DN3_Drosha. (thymus) | SRR042472(GSM539864) mouse iTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR042483(GSM539875) mouse muscle tissue [09-002]. (muscle) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (gland) | mjLiverWT2() Liver Data. (liver) | SRR346414(SRX098255) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Spleen) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR042457(GSM539849) mouse mast cells [09-002]. (bone marrow) | SRR095853(SRX039174) "sequencing of miRNA from wild type and disea. (heart) | SRR059770(GSM562832) Treg_Dicer. (spleen) | SRR685340(GSM1079784) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (dicer cell line) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR525237(SRA056111/SRX170313) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (Blood) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR042456(GSM539848) mouse hematopoetic progenitor cells [09-002]. (bone marrow) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR525241(SRA056111/SRX170317) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago1 Blood) | SRR394084(GSM855970) "background strain: C57BL6/SV129cell type: KR. (dicer cell line) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR042444(GSM539836) mouse pre B cells [09-002]. (b cell) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042447(GSM539839) mouse mature B cells (spleen) replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR042463(GSM539855) mouse natural killer cells [09-002]. (spleen) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR042450(GSM539842) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 3 [09-002]. (b cell) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR042455(GSM539847) mouse plasma cells [09-002]. (blood) | GSM510450(GSM510450) newborn_rep6. (total RNA) | SRR042454(GSM539846) mouse germinal center B cells (lymph node) [09-002]. (b cell) | SRR042487(GSM539879) mouse BclXL B activated with LPS/IL4 [BalbC] [09-002]. (spleen) | SRR042478(GSM539870) mouse lung tissue [09-002]. (lung) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | SRR023850(GSM307159) ZHBT-c40hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR525239(SRA056111/SRX170315) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago1 Blood) | SRR346413(SRX098254) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Heart) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR042459(GSM539851) mouse neutrophil cells replicate 1 [09-002]. (blood) | SRR525238(SRA056111/SRX170314) Second IgG control. (Blood) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR059772(GSM562834) CD4_Drosha. (spleen) | SRR042445(GSM539837) mouse immature B cells [09-002]. (b cell) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGAA................................................ | 24 | 1 | 221.00 | 198.00 | 23.00 | 21.00 | 22.00 | 17.00 | 16.00 | 11.00 | 18.00 | 16.00 | 7.00 | 2.00 | 4.00 | 7.00 | - | - | 6.00 | 6.00 | 5.00 | 14.00 | 1.00 | - | 4.00 | - | 1.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAG.................................................. | 22 | 1 | 198.00 | 198.00 | 33.00 | 31.00 | 17.00 | 24.00 | 6.00 | 10.00 | 6.00 | 3.00 | 2.00 | 5.00 | 3.00 | 3.00 | 11.00 | 6.00 | 2.00 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | 7.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 4.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
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| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCA................................................... | 21 | 1 | 13.00 | 13.00 | 1.00 | - | 4.00 | - | 1.00 | - | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................AATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGAA................................................ | 25 | 1 | 13.00 | 43.00 | - | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................CGTGAGTATCCCC......................................................................................................................................................................... | 13 | 9 | 8.89 | 8.89 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 8.89 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGGA................................................ | 24 | 1 | 6.00 | 6.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................AATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGT................................................. | 24 | 1 | 5.00 | 43.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCC.................................................... | 20 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGTA................................................ | 24 | 1 | 5.00 | 198.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......CTTCCTTCCCACCCCTGAGGCAGCCAGA.................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAT.................................................. | 22 | 1 | 4.00 | 13.00 | - | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGAAAA.............................................. | 26 | 1 | 4.00 | 198.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCATA................................................. | 23 | 1 | 3.00 | 13.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................TCTGACCTTTGGCTTCCAGA................................................. | 20 | 1 | 3.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTT...................................................... | 18 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................AATCTCTGACCTTTGGCTT...................................................... | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGAC................................................ | 24 | 1 | 2.00 | 198.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................GACGTAATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGAA................................................ | 30 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGTT................................................ | 24 | 1 | 2.00 | 198.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................TAATCTCTGACCTTTGGCTTCCAG.................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................TCTGACCTTTGGCTTCCAG.................................................. | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGAAG............................................... | 25 | 1 | 2.00 | 198.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................AATCTCTGACCTTTGGCTTCCA................................................... | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................TAATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGAA................................................ | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................TCTGACCTTTGGCTTCCAGAA................................................ | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGC................................................. | 23 | 1 | 2.00 | 198.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| .TAGTCACTTCCTTCCCACCCCTGAGGCAA......................................................................................................................................................................................................... | 29 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTC..................................................... | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................AATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGAAAA.............................................. | 27 | 1 | 1.00 | 43.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................AATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGTA................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 43.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................CGTAATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGA................................................. | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................TCTGACCTTTGGCTTCCAGT................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................CCCTTGGGGGTTCCCGGG.................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................................................................CCATCGGATGCCATCTTCCCA.. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGTTT............................................... | 25 | 1 | 1.00 | 198.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTACAG.................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCATT................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 13.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................TATCCCCCAACTCCGATT.............................................................................................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................AATCTCTGACCTTTGGCTTCCCGA................................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................................................................ACGTAATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGAA................................................ | 29 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................TCTGACCTTTGGCTTCCATAA................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................TACTGTGCCTCTCCACCTTCTA................................................................................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................TAATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGA................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGG................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................TCTCTGACCTTTGGCTTCCAGAA................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGCT................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 198.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGAG................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 198.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCCGAA................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................TCTAGGTTGGGGAGGCGCTTT............................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................CCCCTTGGGGGTTCCGCA................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCATAA................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 13.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................AATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGAT................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 43.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGGAAA.............................................. | 26 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................ATCCCCACAGCCCCTTGGGGGTTTCCA.................... | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................AATCTCTGACCTTTGGCTTCCTT.................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................TCTCTGACCTTTGGCTTCCAG.................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................TACTGTGCCTCTCCACCTTCTAG............................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GGGGAGGCGCTTTTTTT........................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................GTAATCTCTGACCTTTGGCTTCCAG.................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................TCCAGGAGATCCCCAAGAA.................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................ATCTCTGACCTTTGGCTTCCCG.................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 5.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................GGGGGTTCCCATCGGA............... | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| CTAGTCACTTCCTTCCCACCCCTGAGGCAGCCAGACCTGCTCCCCATCCCGTGAGTATCCCCCAACTCCGTCCCTTGGGTCTACTGTGCCTCTCCACCTTCTAGGTTGGGGAGGCGCTTTTTCCTGGTTGTCTTGCTCCCAGAGTCCTACCTAGACGTAATCTCTGACCTTTGGCTTCCAGGAGATCCCCACAGCCCCTTGGGGGTTCCCATCGGATGCCATCTTCCCAGC .....................................................((((...(((((.........)))))..))))(((((((((((((.....))).))))))))))......((((..(((.......(((((...(((......)))..)))))......)))..)))).................................................. ..................................................51................................................................................................................................181................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR042464(GSM539856) mouse CD4+CD8+ T cells (thymus) [09-002]. (thymus) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR042466(GSM539858) mouse CD8+ T cells (spleen) [09-002]. (spleen) | SRR042470(GSM539862) mouse Th17 cells [09-002]. (lymph) | SRR042468(GSM539860) mouse Th1 cells [09-002]. (lymph) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR042465(GSM539857) mouse CD4+ T cells (spleen) [09-002]. (spleen) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | SRR042458(GSM539850) mouse basophil cells [09-002]. (b cell) | SRR042467(GSM539859) mouse T cells activated in vitro with Concanavalin A [09-002]. (spleen) | SRR059766(GSM562828) DN3_Drosha. (thymus) | SRR042472(GSM539864) mouse iTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR042483(GSM539875) mouse muscle tissue [09-002]. (muscle) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (gland) | mjLiverWT2() Liver Data. (liver) | SRR346414(SRX098255) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Spleen) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR042457(GSM539849) mouse mast cells [09-002]. (bone marrow) | SRR095853(SRX039174) "sequencing of miRNA from wild type and disea. (heart) | SRR059770(GSM562832) Treg_Dicer. (spleen) | SRR685340(GSM1079784) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (dicer cell line) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR525237(SRA056111/SRX170313) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (Blood) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR042456(GSM539848) mouse hematopoetic progenitor cells [09-002]. (bone marrow) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR525241(SRA056111/SRX170317) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago1 Blood) | SRR394084(GSM855970) "background strain: C57BL6/SV129cell type: KR. (dicer cell line) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR042444(GSM539836) mouse pre B cells [09-002]. (b cell) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042447(GSM539839) mouse mature B cells (spleen) replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR042463(GSM539855) mouse natural killer cells [09-002]. (spleen) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR042450(GSM539842) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 3 [09-002]. (b cell) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR042455(GSM539847) mouse plasma cells [09-002]. (blood) | GSM510450(GSM510450) newborn_rep6. (total RNA) | SRR042454(GSM539846) mouse germinal center B cells (lymph node) [09-002]. (b cell) | SRR042487(GSM539879) mouse BclXL B activated with LPS/IL4 [BalbC] [09-002]. (spleen) | SRR042478(GSM539870) mouse lung tissue [09-002]. (lung) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | SRR023850(GSM307159) ZHBT-c40hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR525239(SRA056111/SRX170315) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago1 Blood) | SRR346413(SRX098254) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Heart) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR042459(GSM539851) mouse neutrophil cells replicate 1 [09-002]. (blood) | SRR525238(SRA056111/SRX170314) Second IgG control. (Blood) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR059772(GSM562834) CD4_Drosha. (spleen) | SRR042445(GSM539837) mouse immature B cells [09-002]. (b cell) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..................CCCCTGAGGCAGCCAGAGCA................................................................................................................................................................................................. | 20 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................CTTTTTCCTGGTTGTTGAA................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................CGTAATCTCTGACCTTTGGCTT...................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TCACTTCCTTCCCACCCCTGAA............................................................................................................................................................................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................GTCTTGCTCCCAGAGTCCTA.................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................GACGTAATCTCTGACCTTTGGCTTCCA................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................TAATCTCTGACCTTTGGC........................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................CTTGGGTCTACTGTGCCT............................................................................................................................................ | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - |
| ....................CCTGAGGCAGCCAGAC................................................................................................................................................................................................... | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 |
| .........................................................................................................................................CCCAGAGTCCTACCTA.............................................................................. | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - |